Сфероиды и ствижженое

https://lektorij-vdnh.timepad.ru/event/4252197/ Жир, эпигенетика, метаболизм и котики 🐈, рекомендую 25 октября 15:00–16:30 Проспект Мира, 119, стр. 30, музей БИОТЕХ, ВДНХ

Во-вторых, кроме полезной и увлекательной лекции по сфероидам, следом была не менее полезная науч-поп лекция про такой феномен в научной среде как "Кризис воспроизводимости" Разбирали это на примере фотожабов в статьях: графики, микрофотографии, блоты, гистограммы, спектры и даже, прости господи, сыр!! Конечно в моменте это смешно и пару раз аудитория не могла сдержать смех от абсудрности фотошопа, но.... Да, там буквы "Т" вместо доверительных интервалов))) Блин, это ведь ✨Наука✨ - место, где одной из главных целей является получение воспроизводимого результата... Короче, я считаю, что это очень важный вопрос, и тут есть над чем подумать!

Ну во-первых, как можно не знать автора легендарного тгк Сфероиды и ствижженое!???! В общем сегодня на конференции «Генетические технологии в исследованиях природных соединений» Артём Минин рассказывал не сложную, но в то же время супер интересную лекцию про сфероиды и особенности работы с ними методами микроскопии!! Комментарии к заголовкам излишни🤌

Пляж "Стекляшка"

#microscopy Вот я только доделал большую (и с кучей картиночек) лекцию про всячески методы просветления, а Ali Max Erturk напоминает, что они придумали ещё одно новое DISCO. В этот раз они встроили тебе в DISCO РНК-сек, чтобы ты мог секвенировать пока просветляешь! Как отработаю лекцию на добровольцах может устрою какой-нибудь вебинар, там куча красивых картиночек.

Сегодня лечу в солнечный Владивосток на конференцию. С собой пачка пробников штампов (конечно доклад про сфероиды) и едва-начатая презентация с дебильными шуточками в эпиграфах.

Штампы замечены в дикой природе Санкт-Петербурга!

#microscopy #expansion #ribosome Белки делаются в рибосомах, в клетке очень много белков, значит, наверное в клетки и очень много рибосом! Вообщем-то так оно и есть, в картинках с электронной микроскопии куда не ткнешь - попадешь в рибосому. Но я уже не раз сталкивался с тем, что картинки с ТЕМ как-то не очень хорошо укладываются в мозгу и не дают возможности осознать, как оно там напихано, если ты с этим самым ТЕМ постоянно не работаешь. К сожалению рибосомы очень маленькие и визуализировать их в оптику... Да, конечно возможно! Авторы из Стэнфорда разработали методику экспансионной микроскопии и окраски рибосом разных видов и ещё и пронаблюдали тесные и сложные взаимоотношения рибосом и митохондрий.

Хромосомное

#microscopy #mitochondria Самая красивая оптическая микроскопия митохондрий, что я видел. Работа не новая, но я её потерял, а теперь снова нашёл. Задачей авторов было визуализировать митохондрии со STED совместимым красителем и, при этом, чтобы он переживал альдегидную фиксацию. Коммерческие красители не подошли, в итоге авторы сварили свой, на базе Cy3.5, с аминогруппой, которая сшивалась с альдегидами и после этого не вымывалась из клеток. Тоже такое хочу, у меня нет STED, но есть экспансионная микроскопия и там красители с аминогруппой сшиваются с гелем и не вымываются.

Сеанс одновременной игры на двух конфокалах: Zeiss LSM710 и Nexcope NCF2000. Надеюсь скоро получится сделать красивые образцы чтобы устроить сравнение, но пока они оба делают разные задачи.

#microscopy А вот кому мозг мыши с микронными разрешением? Подьехала циклопическая работа от авторов из Китая. Все аннотировано и общедоступно Так же есть удобный онлайн инструмент: https://atlas.brainsmatics.cn/STAM/?lang=en_us Можно крутить, вертеть, изучать, строить коннектом и все такое прочее.

Пробник штампов для изготовления клеточных сфероидов уехал в Уфу. Там уже удивительно много моих собралось.

#WUT #ствижжено у Mark O. Martin ice nucleation protein - белок который моментально вызывает кристаллизацию слегка переохлажденной воды. Используется для создания искусственного снега на лыжных курортах

B̟̭͉̓͒̍͋E̡̗͑̄̋͋͐ͯ̉̏ ̸̶̨̛̛͇͉̼͒ͨ̽̆ͤͧͫ̚͝͠N̶̡̛̘̯̞͂͠O ̵̸̡̗̩̮ͦ͛̾̾ͭ̕͜͠T̡̛̮̤̮̾̅ͭ͌͜ ̉ͤ̂̂͊ͥ͊ͯ̔҉͏̶̢̞͖͕̩͓̯̖͡͠A̔҉҉͢͏̸͜͞͏̬͖͓̞̻͚̼͚̀F̒͊̓͛ͥ͒ ̙̫̺͕̞̜̩̤̕͜ͅȒ̸̴̢̛̜̟̣͇̋ͪ͐͘͞A͇̞͍͖̥ͨ̍̒͒́͡I̢̭͖̘̾̀̎͒͝ͅD̵̴̡̘ͯ̀͘ ̼͍͔̙͔͖̭ #dataviscirme

https://m.youtube.com/watch?v=4g_1_AWOVpI& Для разнообразия #фотожаб делали не авторы статей в топовых журналах, а аутсорс лаба, куда они посылали мозги (и деньги) Смешное: "лаба" расположена на втором этаже торгового центра где-то в Сан Диего. Не смешное, но ожидаемое: авторы статей делают вид, что это не их проблемы.

Эксперимент! Максимум всратости. Пол - единственное плоское и немагнитное место, на которое можно безопасно поставить нехидую такую магнитную систему. Красная подсветка - потому что так сексуальнее.

Для всех любителей Альфафолда и прочих Больцев - серьезные разработки от Сергея Овчинникова (профессор MIT, автор многих замечательных статей по компьютерным методам в структурной биологии)