Сфероиды и ствижженое
前往频道在 Telegram
Хаотичные научные картинки и анимации. Свои и ворованные из твиттера и других мест. Иногда обсуждение всратых научных фейков.
显示更多2 067
订阅者
+224 小时
+87 天
+3730 天
数据加载中...
吸引订阅者
七月 '26
七月 '26
+23
在6个频道中
六月 '26
+65
在9个频道中
Get PRO
五月 '26
+68
在8个频道中
Get PRO
四月 '26
+350
在13个频道中
Get PRO
三月 '26
+64
在8个频道中
Get PRO
二月 '26
+265
在11个频道中
Get PRO
一月 '26
+47
在5个频道中
Get PRO
十二月 '25
+74
在6个频道中
Get PRO
十一月 '25
+88
在7个频道中
Get PRO
十月 '25
+99
在7个频道中
Get PRO
九月 '25
+84
在9个频道中
Get PRO
八月 '25
+383
在17个频道中
Get PRO
七月 '25
+354
在18个频道中
Get PRO
六月 '25
+107
在8个频道中
Get PRO
五月 '25
+69
在4个频道中
Get PRO
四月 '25
+199
在9个频道中
Get PRO
三月 '250
在8个频道中
Get PRO
二月 '25
+147
在5个频道中
| 日期 | 订阅者增长 | 提及 | 频道 | |
| 13 七月 | +3 | |||
| 12 七月 | +2 | |||
| 11 七月 | +1 | |||
| 10 七月 | +5 | |||
| 09 七月 | 0 | |||
| 08 七月 | +1 | |||
| 07 七月 | +6 | |||
| 06 七月 | 0 | |||
| 05 七月 | +1 | |||
| 04 七月 | 0 | |||
| 03 七月 | 0 | |||
| 02 七月 | +3 | |||
| 01 七月 | +1 |
频道帖子
#microscopy #clearing
В комментах принесли шикарную статью про просветление, в данном случае всякой морской живности.
Протокол просветления люди, проявив великую фантазию, назвали Sea-Star. Идея где-то между экспансионной микроскопией и классическим просветлением: пропитываем образец акриламидом, потом просветляем буфером с SDS, вымывающим все, что не связалось с гелем (липиды, всякую окрашенную низкомолекулярщину). Белки и ДНК, по идее, остаются на месте. Для морских звезд и всяких таких штук, само собой, ещё нужна декальцификация.
Не представляю, почему бы этому протоколу и не сработать на тканях млекопитающих. Спасибо @avkalachev за статью.
| 2 |  #space
Космос - последний рубеж!
И человеку там, в целом, не очень уютно. И речь не только о опасности для конкретного человека, а для вида, в том контексте, что с размножением проблемы. Есть множество исследований, где эмбрионы животных неправильно развиваются в отсутствии гравитации.
В свежей работе рассказывают о развитии червяков c.elegans в экспериментах на МКС. Авторы пишут о том, что некорректное развитие во многом связано с эффектами рецептора с дивным названием gentle-touch mechanoreceptor MEC-4, дерегуляция которого влияет на длину червяков и дефекты развития соединительной ткани, когда он недостаточно стимулируется.
А если подбросить маленьким червякам маленький мячиков, специальных микросфер, которые стимулировали их механически, развитие идет более-менее нормально.
А как контроль в этих экспериментах были так же черви с мутантным рецептором, которые развивались как и положено.
Так что у людей будущего два варианта - генные модификации или играть с мячиками. | 594 |
| 3 |  #microscopy
Спасибо коллегам, теперь у меня в коллекции есть глиобластома с GFP. В норме она, говорят, образует в культуре сфероиды.
И, как оказалось, пакманов. | 628 |
| 4 |  Невозможный кристалл
Сегодня у нас запрещёнка!
По глубоким убеждениям кристаллографов XIX-XX веков таких объектов, которые вы видите на этом снимке, в природе быть не должно. Согласно правилам кристаллографии, выведенным ещё в конце XIX века русским математиком и кристаллографом Шубниковым, все кристаллы обладают некоторой симметрией. Одни имеют плоскость симметрии, подобно человеку, у которого есть лево и право, другие имеют ось, вокруг которой они могут совместиться 3, 4 или 6 раз за один полный оборот. Все возможные комбинации Шубников кропотливо просчитал и получил всего 230 возможных вариантов. Все известные кристаллы на тот момент в эти варианты укладывались. Некоторые ещё не были обнаружены в природе, но со временем открывались и чётко вписывались в эту систему.
Но вот чего не могло быть точно, так это кристаллов с осью симметрии 5 порядка. И дело не в том, что мы не можем из атомов сложить симметричный пятигранник. Дело в том, что этим пятигранником нужно замостить всё пространство – ведь кристаллы это по сути периодически повторяющийся в трёх направлениях рисунок из некоей кучки атомов. Такую кучку кристаллографы называют элементарной ячейкой. В действительности, попробуйте замостить пятигранной плиткой пол – у вас неизбежно останутся зазоры.
Как-то так и рассуждали кристаллографы, пока в 1984 году не пришёл Дан Шехтман и не представил неопровержимые доказательства обратного. Отстоять свою точку зрения, даже имея все экспериментальные данные, было очень непростой задачей. Его самую цитируемую ныне статью приняли только с третьего раза. Чего только он не слышал в свой адрес, например: «Квазикристаллов не бывает, бывают квазиученые».
Но доказательства были неумолимы: природа гораздо изобретательнее того, что мы о ней думаем. Она справляется с задачей замощения пространства с изяществом, создавая апериодичные мозайки. Почитайте про мозаику Пенроуза – довольно занятное изобретение. С тех пор квазикристаллы стали обнаруживать в сплавах, горных породах и даже метеоритах. А порой и в съёмках 50-летней давности: видели, но не смогли осознать.
Я же, когда увидел эту частицу интерметаллида Al и Mn на экране своего микроскопа, вначале очень удивился тому, как хаотично в ней разбросаны атомы … а спустя пару секунд, едва не свалился со стула, осознав, что передо мной настоящий Квазикристалл! Моему удивлению не было предела, хотелось с каждым поделиться: «Смотрите, это же он, квазикристалл!». Это был один из последних снимков, сделанных на том микроскопе – настоящий подарок на прощание!
На снимке: Квазикристалл AlxMny в магниевом сплаве МА2 | 642 |
| 5 |  Боитесь ли вы тараканов?
Боитесь ли вы дистанционно-управляемых тараканов киборгов?
Боитесь ли вы дистанционно-управляемых амфибийных тараканов-киборгов? | 2 101 |
| 6 |  #clinical_trials
Mr. A was very fearful he would die of the overdose. He had received this bottle the previous day and had impulsively taken all of the remaining 29 capsules.
Mr. A was pale and diaphoretic with a blood pressure of 80/40 and heart rate of 110. He was tremulous, and respirations were rapid.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17484949/ | 703 |
| 7 |  Ещё одно... интересное применение ИИ. Делать оригами-схемы различных штук!
Препринт от Google DeepMind | 870 |
| 8 |  #microscopy
Красивая картинка-сравнение разных видов сверхразрешающей микроскопии на кардиомиоцитах.
Думаем с коллегами попробовать сделать последние два варианта, их интересует всякая внутренняя требуха в клетках сердца. | 842 |
| 9 |  #microscopy
Чем дальше идёт изучение иммунной системы, тем больше функций у неё находят. Сейчас мы уже знаем, что она чертовски важна для развития эмбриона. Насколько важна?
Ну.. У рыбки killfish (нет, это не от того слова, о котором вы подумали) нейтрофилы (желтые, быстро ползают) формируются одними из первых и яростно начинают делать свои нейтрофильные дела по всему эмбриону. Как оказалось даже раньше, чем мезодерма (голубая) из которой они, по идее, должны происходить. | 1 109 |
| 10 |  Я уже пару раз приносил статьи, где использовалось DISCO - метод просветления органов, тканей или цельных организмов. Одно дело как это выглядит на микроскопии - и совсем другое - как реально выглядит обработанная мышка.
#Ствижжено у Danielle Beckman | 1 203 |
| 11 |  Сфероиды из МСК здоровых доноров и доноров с Альцгеймером. Окраска на митохондрии с потенциал-чувствительным зондом JC-1. Красный - поляризованные митохондрии, зеленый - деполяризованные.
Свежая статья в которой изучались #сфероиды - органоиды из пациентов с нейродегенеративными заболеваниями. Во первых - сфероиды получились, во вторых - анализируя в них митохондрии можно изучать развитие этих самых заболеваний. И да, ямки для формирования этих сфероидов делались печатными штампами. | 871 |
| 12 |  Finally shared what I've been working on!
We obtained the highest-resolution 3D images of the human brain ever taken from outside the skull. We did that using ultrasound and injected microbubbles as a contrast agent.
Read more here: https://x.com/levchizhov/status/2070185887238066482 | 781 |
| 13 |  Листва орторомбическая
Во второй половине XX века металловеды задались вопросом: «А можно ли титановые сплавы сделать ещё легче, ещё прочнее и выдерживающими температуру на 200-300 °С больше. И для этого они решили добавить в них… алюминий! Один из самых легкоплавких конструкционных материалов, будучи добавленный в нужной пропорции к титану, делает сплав значительно прочнее и выдерживающим жару авиационных двигателей.
Но есть и обратная сторона – хрупкость. При резком увеличении нагрузки такой сплав может неожиданно для всех разрушиться, что повлечёт большую беду. Со временем металловеды нашли оптимальные составы сплавов, которые уже применяются в составе современных авиационных двигателей. Такие сплавы могут работать при температурах до 800 °С, обладая меньшим удельным весом и предсказуемым поведением.
В данном случае, кроме алюминия добавили ещё и ниобий (Nb): сплав стал потяжелее, но зато не такой хрупкий и спокойно выдерживающий 700-градусную жару в течение долгих полётов истребителей. Залог прочности и в то же время пластичности таких сплавов лежит в двух составляющих: прочных интерметаллидах (тёмные листочки Ti2AlNb) и вязкой связке (светлые прожилки, β матрица). Но для того, чтобы получить такую структуру, металловед должен хорошенько сплав продеформировать, потом правильно охладить, потом подержать в печи при строго заданной (и порой одному ему известной) температуре, и тогда наш сплав отрастит вот такие интерметаллидные листочки и будет успешно нести нагрузку, которую на него возложили инженеры.
На снимке: интерметаллидный титановый сплав системы Ti-Al-Nb | 918 |
| 14 |  #ствижженое у Аквариума Киото
Если верить автопереводу - это типичный конфликт между угрями Heteroconger hassi | 959 |
| 15 |  Кольцоид из клеток HEK-293t, z-контраст (разные цвета по высоте). Изначальный диаметр около 800 мкм.
Чтобы получить эту картинку пришлось использовать множество магических практик.
Во первых изначально он, как и сфероиды, слишком толстый, чтобы его просветить моим конфокальником, поэтому я использовал экспансионную микроскопию как способ просветления.
Во вторых после экспансии он стал слишком большой (порядка 3 мм в диаметре), поэтому снимал я его 9 кусочками, которые потом склеивал при помощи BigStitcher в ImageJ.
А в третьих он ещё и в геле лежал под углом, поэтому в том же ImageJ его пришлось поворачивать.
Муторно, но результат мне нравится, когда разберусь с текущими делами поколдую с тем, чтобы из этих картинок поизвлекать какие-нибудь умные данные: расстояние между клетками, зернистость хроматина, все такое.
В комментах ещё картинки и сравнение с непросветленным сфероидом. | 2 202 |
| 16 | Редкая и неприятная история 🧐
Nature Medicine отозвал статью о III фазе клиники онкопрепарата. Т.е. речь не лабораторном результате - а об уровне, на котором предполагают менять медицинскую практику.
Статья вышла менее полугода назад и утверждала очень эффектный (и якобы эффективный) трюк: если давать пациентам иммунотерапию в определённое время дня, результаты лечения резко улучшаются. Дескать, иммунная система живёт по внутренним "биологическим часам" - значит, лекарство тоже лучше сработает "по расписанию". Врачи получают по сути бесплатный способ улучшить терапию - поменяв время инфузии.
Но вскоре после публикации появились серьёзные вопросы к минимумвсему: редакторы указали на расхождения между регистрацией испытаний, протоколом, описанием endpoints, критериями включения пациентов, финальной статьёй - а объяснения авторов не убедили ⬅️ (сугубое имхо - цифры и графики там реально удивительно кхм "гладкие")
Историю сию, уже называют претендентом на "главное научное разочарование года". Почему так срезонировало? На исследованиях III фазы строятся клинические рекомендации, инвестиционные решения, новые исследования, да попросту доверие к БиоМеду. Когда рушится работа такого уровня, это не просто "ошибка в статье" - а удар по всей цепочке доказательной медицины.
Есть и специфический политико-научный слой. Исследование было проведено в Китае - история наверняка станет аргументом для тех, кто скептически относится к китайским клиническим результатам. Это не значит, что "китайскому биомеду нельзя доверять" - но теперь к тамошним исследованиям с очень "громкими" эффектами будут относиться жёстче: повышать прозрачность протоколов, требовать независимый аудит, и ждать подтверждения в разных институциях и странах. | 1 260 |
| 17 |  Meowtabolism - новая игра в Steam про структурную биологию 🧬🐈
Immerse yourself in a hand crafted microscopic world built using experimental data from cryogenic electron microscopy/tomography, volume electron microscopy, X-ray crystallography, and sequence based structure prediction.
https://store.steampowered.com/app/4045010/Meowtabolism__Examining_Feline_Behavior_within_Unicellular_Algae/
У игры есть бесплатная демка. Не является рекламой) | 1 064 |
| 18 |  Котлетоиды лёгких!
Сейчас уже куча протоколов к выращиванию органоидов самых различных органов: кишки, сердца, даже мозга и глаз. Однако лёгкие долго и упорно сопротивлялись.
Делать нечто похожее из соответствующих тканей научились-то давно, однако такие органоиды напрочь отказывались образовывать правильную ветвистую структуру, с бронхиолами и всем прочим.
Наконец авторы из Китая подобрали сложный компот из малых молекул позволяющих добиться правильной дифференцировки стоволовых клеток извлеченных из мышиного эмбрирона (на очень конкретный момент развития) в красивые и ветвистые лёгкие. | 2 114 |
| 19 |  Дизентерийная амёба, кушающая меченные флуорофором частицы. Маджента - актин в клетках.
Амёбы - красивые! Шикарная видяшка. А в статье что-то про сигналинг, RhoGEF, пиноцитоз и миграцию. Честно я просто восхищен иллюстрацией выше.
#microscopy | 1 359 |
| 20 |  +4Халатность в очистке, или первый в мире Ni-IDA халат
Всем известны методы очистки рекомбинантных белков с гис-тэгом на IMAC-сорбентах на основе сефарозы или полиметакрилата. А как вам такое - чистить белки с помощью лабораторного халата?
Конечно, сам по себе халат не сильно поможет в очистке, а вот если его модифицировать металлохелатными лигандами - это другое дело. Меня впечатлила история Руслана про использование для активации сефарозы обычного советского разбавителя эпоксидного клея с Ozon.
Для активации нужен правильный русхимовский разбавитель - будьте внимательны, не все разбавители подходят. Нужен 1,4-диглицидиловый эфир бутандиола. Халат подходит строго из хлопчатобумажной ткани. По природе это целлюлоза, гидроксильные группы есть, можно активировать.
Протокол получения халатного сорбента:
1. Найти хлопчатобумажный халат.
2. Отрезать лоскуток (~0,5 г) и прокипятить 15 мин в растворе карбоната натрия для удаления загрязнений.
3. Поместить лоскуток в раствор для активации: 20 мл 0,6 М NaOH, 2 мг/мл боргидрида натрия, 20 мл разбавителя для эпоксидного клея и 10 мл ДМСО. Это удобно делать в фальконе на 50 мл.
4. Хорошо встряхнуть и инкубировать на качалке 8 ч при комнатной температуре.
5. Слить раствор и тщательно промыть водой (5-6 смен воды).
6. Добавить 40 мл 0,5 М карбонат-бикарбонатного буфера pH 10 с 250 мг иминодиуксусной кислоты (IDA). Я довел pH раствора карбоната натрия башкирской содой, но можно и не доводить - будет pH ~11, что, вероятно, даже лучше.
7. Инкубировать на качалке 24 ч.
8. Тщательно отмыть водой.
9. Зарядить IDA-халат никелем или медью (подойдут любые водорастворимые соли, можно растворить на глаз). 10. Затем отмыть водой, 0,5 М NaCl и снова водой.
11. Вы великолепны - получили IDA-халат для IMAC!
Для теста почистил GFP - Ni-IDA-халат работает! Емкость пока не очень высокая, есть что оптимизировать. Но начало хорошее.
Еще один протокол для энциклопедии юных постапокалиптических сурков готов!
Энжойте! | 1 200 |
