کمپ بیوانفورماتیک

🤖 آیا برای استفاده از هوش مصنوعی آماده‌ایم؟ 🔹 بسیاری تصور می‌کنند موفقیت در هوش مصنوعی فقط به مدل‌ها و ابزارهای جدید وابسته است؛ اما واقعیت این است که کیفیت داده‌ها مهم‌تر از خود مدل‌هاست. 🔹 در حوزه سلامت و علوم زیستی، داده‌های بالینی، ژنومی و دنیای واقعی باید یکپارچه، استاندارد و قابل اعتماد باشند تا هوش مصنوعی بتواند نتایج ارزشمند تولید کند. 🔹 متخصصان معتقدند آمادگی واقعی برای AI بر پنج پایه استوار است: - داده‌های باکیفیت - حاکمیت و مدیریت داده - امنیت سایبری - استانداردسازی و تعامل‌پذیری داده‌ها - همکاری بین متخصصان حوزه‌های مختلف 🔹 هوش مصنوعی به اندازه داده‌هایی که با آن تغذیه می‌شود هوشمند است. #هوش_مصنوعی ---------- 🆔 @BioinfCamp

🧬 آیا زیرساخت داده‌های زیست‌پزشکی در خطر است؟ 🔹 گروهی از پژوهشگران هشدار داده‌اند که پایگاه‌های داده عمومی مانند PubMed, PDB, and TCGA که ستون فقرات تحقیقات زیست‌پزشکی و توسعه ابزارهای هوش مصنوعی هستند، با مشکلات بودجه و پایداری مواجه‌اند. 🔹 بسیاری از مدل‌های موفق AI در علوم زیستی، از جمله ابزارهای پیشرفته کشف دارو، بر داده‌های عمومی و متن‌باز آموزش دیده‌اند. 🔹 کارشناسان معتقدند این منابع باید مانند زیرساخت‌های حیاتی عمومی، با سرمایه‌گذاری بلندمدت و پایدار حمایت شوند. 🔹 بدون داده‌های عمومی، نوآوری در زیست‌پزشکی و هوش مصنوعی به‌مرور کندتر خواهد شد. #بیوانفورماتیک ---------- 🆔 @BioinfCamp

🤔 آیا تا به حال از خودت پرسیدی در داده‌های سینگل‌سل پروژه‌ات، تعداد بهینه خوشه‌ها چقدر باید باشد؟ دو معیار مهم وجود داره که می‌تونن در انتخاب تعداد مناسب خوشه‌ها به شما کمک کنند: 1️⃣ Gap Statistic این روش تعداد بهینه خوشه‌ها رو با مقایسه پراکندگی داخل خوشه‌ها با یک توزیع مرجع تصادفی پیدا می‌کنه. هرچه مقدار Gap بالاتر باشه خوشه‌بندی بهتر و دور از حالت تصادفی است. 2️⃣ Silhouette Width این معیار، کیفیت خوشه‌ها رو برای هر سلول بررسی می‌کنه. امتیاز نزدیک 1 یعنی سلول به خوبی در خوشه خود قرار گرفته و کمتر از 0 و نزدیک -1 یعنی خوشه‌ها همپوشانی دارند یا اشتباه دسته‌بندی شده‌اند #سینگل_سل #آنالیز_داده ---------- 🆔 @BioinfCamp

🔹 مفهوم Exploratory Data Analysis یکی از مهم‌ترین مراحل در تحلیل داده است که قبل از ساخت مدل‌های آماری و یادگیری ماشین انجام می‌شود. 🔹 در این مرحله، داده‌ها از نظر توزیع، مقادیر گمشده، داده‌های پرت، همبستگی بین متغیرها و الگوهای پنهان بررسی می‌شوند. 🔹 یک EDA مناسب می‌تواند از بسیاری از خطاهای مدل‌سازی جلوگیری کرده و دید بهتری نسبت به داده‌ها در اختیار پژوهشگر قرار دهد. #یادگیری_ماشین #هوش_مصنوعی ---------- 🆔 @BioinfCamp

🔎 برای جستجوی هوشمند در مقالات زیست‌پزشکی، PubTator 3 را امتحان کنید. 🔹 این ابزار رایگان NCBI به شما امکان می‌دهد ژن‌ها، بیماری‌ها، داروها و روابط بین آن‌ها را در بیش از 35 میلیون مقاله و چکیده علمی جستجو کنید. 🔹 مناسب برای مرور متون، یافتن ارتباطات زیستی و پروژه‌های بیوانفورماتیک. 🌐 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/pubtator3/ #بیوانفورماتیک #مقاله ---------- 🆔 @BioinfCamp

همراهان عزیز، در ادامه‌ی برنامه قبلی، از افرادی که خارج از ایران مشغول به تحصیل یا فعالیت پژوهشی هستند و تمایل دارند به «شبکه پژوهشگران ایرانیان خارج از کشور» بپیوندند، دعوت می‌کنیم به ادمین پیام دهند. @MainAdmin در این شبکه، پژوهشگران ایرانی ساکن کشورهای مختلف گرد هم می‌آیند تا زمینه ارتباط، تبادل تجربه و همکاری‌های علمی فراهم شود.

همراهان عزیز، بررسی رزومه‌ها به پایان رسیده و به افرادی که انتخاب شده‌اند پیام ارسال شده است. بنابراین، اگر پیامی دریافت نکرده‌اید، به این معناست که متأسفانه در این مرحله انتخاب نشده‌اید. اگر مایل به دریافت بازخورد هستید، لازم است بدانید که مهم‌ترین دلیل پذیرفته‌نشدن بسیاری از متقاضیان، نداشتن سابقه پژوهشی کافی و متناسب با سطح مورد انتظار بوده است. پیشنهاد می‌کنیم اگر هنوز تجربه پژوهشی ندارید، از برنامه «منتور اختصاصی» استفاده کنید تا با همراهی یک منتور، پروژه اختصاصی خود را آغاز کرده و تجربه لازم را به دست آورید. پس از کسب این تجربه، می‌توانید با رزومه‌ای قوی‌تر برای فرصت‌های آینده درخواست دهید. برای دریافت اطلاعات بیشتر درباره برنامه منتور اختصاصی، می‌توانید به ادمین پیام دهید. @MainAdmin

🧬 وقتی تکامل به کمک طراحی واکسن می‌آید Fitness Landscape 🔹 فرض کنید ویروس 🦠 برای فرار از سیستم ایمنی مجبور به جهش شود. اما همه جهش‌ها یکسان نیستند! 🔹 برخی جهش‌ها تقریباً هیچ هزینه‌ای برای ویروس ندارند، اما بعضی دیگر آن‌قدر به عملکرد ویروس آسیب می‌زنند که عملاً بقای آن را تهدید می‌کنند. 🔹 مفهوم «Fitness Landscape» دقیقاً همین موضوع را بررسی می‌کند: کدام بخش‌های ویروس برای جهش کردن گران هستند و کدام بخش‌ها به‌راحتی تغییر می‌کنند. 🔹 بر اساس این دیدگاه، بهترین اپی‌توپ‌ها لزوماً محافظت‌شده‌ترین (conserved) نواحی نیستند؛ بلکه نواحی‌ای هستند که فرار از آن‌ها برای ویروس هزینه تکاملی بالایی دارد. 🔹 این ایده امروزه در طراحی واکسن‌های HIV و سایر پاتوژن‌های جهش‌پذیر کاربرد گسترده‌ای پیدا کرده است. 📖 برای مطالعه بیشتر: https://doi.org/10.1073/pnas.2022496118 #طراحی_واکسن ---------- 🆔 @BioinfCamp

💼 اگر در جستجوی کار هستید، این را بدانید: 🔹 امروزه حتی بسیاری از افراد باتجربه و ارشد نیز با این واقعیت مواجه می‌شوند که بیش از نیمی از درخواست‌های شغلی‌شان بدون حتی یک مصاحبه رد می‌شود. 🔹 بسیاری از رزومه‌ها ابتدا توسط سیستم‌های خودکار و هوش مصنوعی بررسی می‌شوند. 🔹 عدم دریافت پاسخ از سوی شرکت‌ها (Ghosting) به پدیده‌ای رایج تبدیل شده است. 🔹 رد شدن لزوماً به معنای ضعیف بودن رزومه یا ناکافی بودن توانایی‌های شما نیست. بنابراین اگر درخواستی ارسال کردید و پاسخی نگرفتید یا رد شدید: 🔹 اعتماد به نفس خود را از دست ندهید. 🔹 ارزش حرفه‌ای خود را زیر سؤال نبرید. گاهی رد شدن، بیشتر از آنکه درباره شما باشد، درباره فرآیندهای استخدام و شرایط بازار کار است. #مسیر_شغلی ---------- 🆔 @BioinfCamp

🤖 آیا هوش مصنوعی واقعاً می‌تواند جای برنامه‌نویسان را بگیرد؟ ✨ تجربه بسیاری از توسعه‌دهندگان نشان می‌دهد که ابزارهای هوش مصنوعی در تولید کدهای کوچک و مستقل عملکرد قابل قبولی دارند، اما هرچه پروژه بزرگ‌تر و پیچیده‌تر می‌شود، حفظ انسجام، معماری و کیفیت کلی سیستم دشوارتر می‌شود. پس: 🔹 از هوش مصنوعی برای تولید ایده و پیشنهاد راه‌حل استفاده کنید. 🔹 از هوش مصنوعی برای بررسی و اعتبارسنجی کد بهره ببرید. 🔹 تصمیم نهایی و قضاوت مهندسی را به‌طور کامل به هوش مصنوعی نسپارید. #هوش_مصنوعی #برنامه_نویسی ---------- 🆔 @BioinfCamp

📌 شش اشتباه رایج در اپلای و مصاحبه دکتری ❌ بدون سوال جلسه رو ترک نکن ❌ ادای بلد بودن درنیار! ❌ جهت تحقیق رو تو مشخص نکن ❌ ضعف‌هاتو پنهان نکن ❌ در جلسه مصاحبه از رو نخون ❌ بدون اثبات و مدرک نگو به پروژه‌ “fit هستم” #اپلای ---------- 🆔 @BioinfCamp

🔍 چرا از نمودار Violin استفاده می‌کنیم؟ 💎 مقایسه توزیع داده‌ها بین گروه‌های مختلف 💎 مناسب برای مجموعه‌ داده‌های بزرگ و حجیم 💎 نمایش داده‌های با توزیع غیر نرمال 💎 ترکیب مزایای Box Plot و KDE برای نمایش دقیق‌تر 💎 امکان مشاهده جزئیات مثل چگالی و نقاط پرت 💎 مناسب برای تحلیل‌های آماری و بصری دقیق‌تر #آنالیز_داده ---------- 🆔 @BioinfCamp

فرصت PhD در AI و ژنومیکس در فرانسه 🇫🇷 یک موقعیت دکتری در IGMM – CNRS / University of Montpellier برای پژوهش در حوزه‌های هوش مصنوعی و ژنومیکس ارائه شده است. موضوع پروژه: توسعه روش‌های جدید برای تفسیر داده‌های های ژنومی و پیش‌بینی فنوتیپ و ریسک بیماری. 💶 حقوق: ۲۳۰۰ یورو ناخالص در ماه 📧 ارسال درخواست: daniele.raimondi@igmm.cnrs.fr #اپلای ---------- 🆔 @BioinfCamp

فرصت پست‌دکتری محاسباتی در لتونی 🇱🇻 یک موقعیت پست‌دکتری سه‌ساله در National Institute of Research and Innovation (NIRI) در ریگا، لتونی، برای توسعه روش‌های یادگیری ماشینی جهت ادغام داده‌های Multi-Omics ارائه شده است. 🔗 اطلاعات بیشتر و ثبت درخواست: https://t.co/p1JAwxQBAc #اپلای ---------- 🆔 @BioinfCamp

فرصت پست‌دکتری بیوانفورماتیک در سوئد 🇸🇪 یک موقعیت پست‌دکتری در آزمایشگاه پروفسور Erik Larsson Lekholm در دانشگاه گوتنبرگ برای پژوهش در زمینه‌های زیر ارائه شده است: 1⃣ Cancer Genomics 2⃣ Mitochondrial Genetics اپلای از طریق لینک زیر 👇 https://web103.reachmee.com #اپلای ---------- 🆔 @BioinfCamp

فرصت پست‌دکتری محاسباتی در لتونی 🇱🇻 یک موقعیت Postdoctoral Researcher سه‌ساله در National Institute of Research and Innovation (NIRI) در ریگا، لتونی، برای توسعه روش‌های Machine Learning جهت ادغام داده‌های Multi-Omics ارائه شده است. 🔗 اطلاعات بیشتر و ثبت درخواست: https://t.co/p1JAwxQBAc

📢 همراهان عزیز کمپ بیوانفورماتیک سه فرصت پژوهشی جدید شامل دو موقعیت پست‌دکتری و یک موقعیت دکتری به‌ترتیب در 🇸🇪 سوئد، 🇱🇻 لتونی و 🇫🇷 فرانسه طی 3 روز آینده در کانال منتشر خواهند شد. این موقعیت‌ها از طریق شبکه تخصصی انجمن بیوانفورماتیک و مستقیماً توسط اساتید و سرپرستان گروه‌های پژوهشی مربوطه برای اعضای شبکه اعلام شده‌اند و ما نیز اطلاعات آن‌ها را برای همراهان کمپ بازنشر می‌کنیم. 🌱 امیدواریم انتشار این فرصت‌ها مسیر ورود یکی از همراهان کمپ به یک گروه پژوهشی بین‌المللی را هموار کند. کمپ بیوانفورماتیک

سلام، همراهان عزیز کمپ بیوانفورماتیک 🌱 بعد از رایزنی‌های اخیر، قراره پروژه‌های بین‌المللی کمپ به‌زودی شروع بشه. قصد داریم این همکاری‌ها با مشارکت پژوهشگران و دانشگاه‌های مختلف در اروپا، کانادا، آمریکا، استرالیا و سایر کشورها شکل بگیره و هدفمون اینه که مخاطبانمون که در کشورهای مختلف در حال تحصیل هستند رو در قالب این پروژه‌ها کنار هم جمع کنیم. این برنامه از طریق بخش مستقر در استرالیا و زیر نظر اساتید دانشگاهی در استرالیا پیش خواهد رفت. اگر علاقه‌مند به همکاری هستید، رشته تحصیلی، مقطع تحصیلی و کشور محل تحصیل‌تون رو برای ادمین اصلی ارسال کنید: @MainAdmin

امروز با دو مفهوم جالب آشنا میشیم 👀 🔹 Interpretable AI مدلی که انسان مستقیم می‌فهمه چطور به خروجی رسیده. 🔹 Explainable AI مدل آن‌قدر پیچیده‌ست که ذاتا قابل فهم نیست پس ما باید با ابزارهای مختلف رفتار مدل رو توضیح بدیم. #هوش_مصنوعی ---------- 🆔 @BioinfCamp