کمپ بیوانفورماتیک

🧬 موجودات آینه‌ای؛ ایده‌ای جذاب اما شاید بسیار خطرناک! 🔹 تمام حیات شناخته‌شده از مولکول‌هایی با جهت‌گیری مشخص ساخته شده است؛ مثلاً پروتئین‌های ما از L-amino acids تشکیل شده‌اند. 🔹 اما تصور کنید بتوان موجود زنده‌ای ساخت که تمام این مولکول‌ها تصویر آینه‌ای حالت طبیعی باشند؛ چیزی که به آن Mirror Life گفته می‌شود. 🔹 دانشمندان در مقاله‌ای در Science هشدار می‌دهند که اگر روزی باکتری‌های آینه‌ای ساخته شوند، ممکن است بسیاری از مکانیسم‌های سیستم ایمنی و حتی دشمنان طبیعی مثل فاژها نتوانند به‌خوبی آن‌ها را شناسایی و کنترل کنند؛ موضوعی که می‌تواند خطرات جدی برای انسان و اکوسیستم‌ها ایجاد کند. 🔗 مطالعه‌ی مقاله: science.org/doi/10.1126/science.ads9158 #مقاله #تکنولوژی ---------- 🆔 @BioinfCamp

🧬 پزشکی شخصی و Multi-omics در سندرم داون 🔹 یک مطالعه جدید با بررسی 356 فرد مبتلا به سندرم داون و ترکیب داده‌های - Transcriptomics - Proteomics - Metabolomics - Immune profiling نشان داد که بیماری‌های همراه می‌توانند امضاهای مولکولی متفاوتی ایجاد کنند. 🔹 مهم‌ترین یافته‌ها: - چاقی بیشترین اثر را بر proteome و metabolome داشت - نقایص مادرزادی قلبی حتی پس از درمان، اثرات مولکولی پایداری بر transcriptome و سیستم ایمنی داشتند - تشنج قوی‌ترین تغییرات multi-omics را در میان شرایط عصبی ایجاد کرد 🔗 مطالعه‌ی مقاله: https://doi.org/10.1038/s41467-026-72946-z #مقاله ---------- 🆔 @BioinfCamp

🧬 آیا می‌توان اطلاعات مولکولی‌ای را که اصلاً اندازه‌گیری نشده‌اند، پیش‌بینی کرد؟ 🔹 محققان در چارچوب هوش مصنوعی PULSE را معرفی کرده‌اند که با استفاده از آزمایش‌های معمول پزشکی و تاریخچه ویزیت‌های قبلی بیمار، می‌تواند داده‌های مولکولی گمشده مثل proteomics و metabolomics را بازسازی کند. 🔹 جالب اینکه در برخی آزمایش‌ها، داده‌های بازسازی‌شده برای پیش‌بینی بیماری عملکردی نزدیک به داده‌های واقعی داشتند. 🔗 مقاله اصلی: https://doi.org/10.1038/s43588-026-01024-7 #مقاله ---------- 🆔 @BioinfCamp

سلام و احترام دانشجویان و همراهان گرامی کمپ بیوانفورماتیک، به اطلاع می‌رسانیم که سایت مجموعه در حال حاضر با یک مشکل فنی مواجه شده است و تیم فنی در حال بررسی و رفع این مشکل است. از صبر و شکیبایی شما تا زمان برطرف شدن مشکل سپاسگزاریم. همچنین، در صورت تمایل به ثبت‌نام در دوره‌های جدید، می‌توانید از طریق پیام به ادمین مجموعه اقدام فرمایید. @MainAdmin با احترام کمپ بیوانفورماتیک

🧬 محدودیت کالری فقط بیان ژن‌ها را تغییر نمی‌دهد؛ نحوه Splicing آن‌ها را هم تغییر می‌دهد! 🔹 در یک مطالعه جدید، پژوهشگران با استفاده از RNA-seq اثر سه ماه محدودیت کالری (10 تا 40٪) را در شش بافت مختلف موش بررسی کردند. 🔹 نتیجه جالب این بود که تغییرات Alternative Splicing (AS) با شدت محدودیت کالری افزایش پیدا می‌کرد، اما تا حد زیادی مستقل از تغییرات Gene Expression بود؛ حدود 94٪ ژن‌هایی که Differential Transcript Usage داشتند، Differentially Expressed نبودند. 🔗 مطالعه‌ی مقاله: https://doi.org/10.1093/lifemeta/loaf046 #مقاله ---------- 🆔 @BioinfCamp

🤖 هوش مصنوعی می‌تواند بیان ژن را از روی توالی DNA پیش‌بینی کند! 🔹 مدل جدیدی به نام ExoShorkie با استفاده از Transfer Learning طراحی شده تا فقط از روی توالی DNA، میزان RNA-seq coverage توالی‌های خارجی (exogenous DNA) واردشده به مخمر را پیش‌بینی کند. 🔗 مطالعه‌ی مقاله https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btag369 #مقاله #هوش_مصنوعی ---------- 🆔 @BioinfCamp

🧬 ترکیب Long-read و RNA-seq برای شناسایی دقیق‌تر ایزوفرم‌ها 🔹 پژوهشگران با ترکیب PacBio Iso-Seq و Illumina RNA-seq دو مرجع جدید به نام‌های PotatoRTD و TomatoRTD برای سیب‌زمینی و گوجه‌فرنگی ساخته‌اند. 🔹 این منابع می‌توانند تحلیل alternative splicing و isoform switching را دقیق‌تر کنند 🔹 این مطالعه نشان می‌دهد ترکیب short-read + long-read sequencing می‌تواند تصویر بسیار کامل‌تری از transcriptome ارائه دهد. 🔗 مطالعه‌ی مقاله : https://doi.org/10.1038/s41597-026-07792-1 #مقاله ---------- 🆔 @BioinfCamp

📊 تحلیل هوشمند داده‌ها برای بهبود کیفیت کارآزمایی‌های بالینی 🔹 شرکت CluePoints، توسعه‌دهنده نرم‌افزارهای بررسی داده‌های بالینی، به مرحله نهایی جوایز Fierce Life Sciences Innovation Awards 2026 در بخش تحلیل داده و هوش تجاری راه یافته است. 🔹 این پلتفرم با ترکیب روش‌های آماری و هوش مصنوعی، به تیم‌های پژوهشی کمک می‌کند مشکلات احتمالی داده‌ها و ریسک‌های مطالعات را زودتر شناسایی کنند و بررسی انسانی را بر موارد مهم‌تر متمرکز کنند. #هوش_مصنوعی #کارآزمایی_بالینی #سلامت_دیجیتال ---------- 🆔 @BioinfCamp

🏆 جوایز نوآوری علوم زیستی Fierce 🔹 این جوایز توسط ناشران Fierce Biotech و Fierce Pharma برای معرفی فناوری‌های نوآورانه در حوزه‌هایی مانند هوش مصنوعی، زیست‌فناوری، تحلیل داده و سلامت دیجیتال برگزار می‌شود. 🌐 برای آشنایی با بخش‌های رقابت و شرکت‌های فینالیست، به وب‌سایت رسمی جوایز سر بزنید و بیشتر بخوانید. #زیست_فناوری #نوآوری #هوش_مصنوعی ---------- 🆔 @BioinfCamp

🧬 توالی‌یابی کل ژنوم با کمتر از ۶۰۰ دلار 🔹 شرکت Human Longevity سرویس جدید Genomics for All را با قیمت 599 دلار معرفی کرده است. ▪️ توالی‌یابی کل ژنوم انسان با عمق 30× ▪️ بررسی بیش از 10,000 واریانت ژنتیکی مرتبط با بیماری‌ها ▪️گزارش اطلاعات Pharmacogenomics و بیماری‌های ارثی ▪️ تعسیر نتایج با کمک AI #تکنولوژی ---------- 🆔 @BioinfCamp

# اطلاعیه/4 # کنگره ICBMB2027 # فرآخوان _دوم_ ارسال مقالات # مشارکت حداکثری   👈 نوزدهمین کنگره ملی و دهمین کنگره بین ­المللی بیوشیمی و بیولوژی مولکولی (ICBMB2027)  📆 تاریخ برگزاری: ۱۳ الی ۱۵ بهمن  ۱۴۰۵ ⏳ پایان مهلت ارسال خلاصه مقالات: ۱۵ آذر ۱۴۰۵ 📍مکان برگزاری: تهران، دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی                  دبیرخانه کنگره ICBMB2027 ----------‐-------------------------------------------------------- 🌐 وب سایت کنگره http://icbmb.ir/ 🌐 وب سایت انجمن بیوشیمی ایران https://biochemiran.com/ 🆔 کانال و گروه تلگرامی کنگره https://t.me/ICBMB https://t.me/ICBMB2020 🆔 کانال تلگرامی انجمن https://t.me/Iran_Biochemical_Society 🆔 کانال واتساپی انجمن https://B2n.ir/n49556

دانشجویان گرامی، به اطلاع می‌رسانیم که سامانه صدور مدارک با مشکل فنی مواجه شده بود که خوشبختانه امروز با پیگیری تیم فنی سایت برطرف شد. به همین دلیل، صدور و ارسال مدارک دوره‌های پیشین نیز با تأخیر همراه بوده است. مدارک مربوط به ماه گذشته، فردا به دست شما عزیزان خواهد رسید. از صبر و شکیبایی شما سپاسگزاریم. با احترام، کمپ بیوانفورماتیک

🧠 ارتباط سیستم ایمنی با اثر سریع داروهای ضدافسردگی 🔹 پژوهش‌های جدید نشان می‌دهند داروهایی مانند Ketamine و Psilocybin ممکن است در برخی بیماران، به‌ویژه افراد مبتلا به سرطان و افسردگی، اثرات ضدافسردگی سریعی ایجاد کنند. 🔹 در این مطالعات، IL-15 و IL-7 به‌عنوان دو نشانگر ایمنی مهم شناسایی شده‌اند که می‌توانند با پاسخ بهتر به درمان مرتبط باشند. 🔗 مطالعه‌ی مقاله: https://www.nature.com/articles/s41380-026-03777-z #مقاله ---------- 🆔 @BioinfCamp

🧬 ورود AI Co-Scientist جدید به کشف دارو 🔹 شرکت Schrödinger از Bunsen یک Agentic AI برای تحقیقات مولکولی رونمایی کرد. این سیستم می‌تواند: - اهداف علمی را درک کند - استراتژی‌های محاسباتی طراحی کند - شبیه‌سازی‌های مولکولی را اجرا کند - نتایج را تحلیل و تفسیر کند 🔹 نشانه‌ای دیگر از رشد سریع هوش مصنوعی در زیست‌شناسی و کشف دارو 🤖 #طراحی_دارو ---------- 🆔 @BioinfCamp

🧬 سرمایه‌گذاری ۱۰۰ میلیون دلاری روی AI در کشف دارو 🔹 شرکت Aureka Biotechnologies موفق به جذب ۱۰۰ میلیون دلار سرمایه شد تا مدل‌های کشف داروی خود را توسعه دهد. 🔹 تمرکز این فناوری‌ها بر: - طراحی مولکول‌های جدید - مدل‌سازی ساختارهای زیستی - پیش‌بینی عملکرد مولکولی - اتصال AI به آزمایش‌های واقعی 🔹 نشانه‌ای دیگر از رشد سریع هوش مصنوعی در زیست‌شناسی و کشف دارو 🤖 #طراحی_دارو ---------- 🆔 @BioinfCamp

وقتی از اتاق استادم میام بیرون 😄 #زنگ_تفریح ---------- 🆔 @BioinfCamp

آیا با Agentic Engineering آشنا هستید؟ 🔹 برخلاف vibe coding که تفریح و نمونه‌سازی سریع است و کدها بدون بررسی پذیرفته می‌شوند، در agentic engineering انسان معماری، بررسی کد، تست و کیفیت را کنترل می‌کند و AI فقط کارهای تکراری و تولید اولیه کد را انجام می‌دهد. 🔹 این روش سرعت توسعه را بالا می‌برد اما نیاز به تجربه و درک عمیق از اصول برنامه‌نویسی و سیستم دارد. #برنامه‌نویسی #هوش_مصنوعی ---------- 🆔 @BioinfCamp

آشنایی با Data Leakage در یادگیری ماشین 🔹 یکی از خطاهای خطرناک در پروژه‌های یادگیری ماشین، نشت داده یا Data Leakage است، یعنی اطلاعاتی که نباید در مرحله آموزش در اختیار مدل باشد، به‌صورت ناخواسته وارد فرآیند آموزش یا ارزیابی می‌شود. 🔹 چند نمونه رایج: - استفاده از اطلاعات آینده برای پیش‌بینی گذشته - انجام نرمال‌سازی یا انتخاب ویژگی روی کل داده قبل از تقسیم Train/Test - وجود نمونه‌های مشابه یا تکراری بین آموزش و تست 🔹برای جلوگیری از Data Leakage: - ابتدا داده را به Train/Test تقسیم کنید. - تمام مراحل پردازش را فقط روی Train انجام دهید. - ارزیابی مدل را با داده‌های کاملاً مستقل انجام دهید #یادگیری_ماشین ---------- 🆔 @BioinfCamp

🤖🧬 چندی پیش EMBL-EBI پایگاه جدید BioAIrepo را معرفی کرده است؛ مخزنی برای اشتراک‌گذاری و استفاده مجدد از مدل‌های یادگیری ماشین در علوم زیستی. 🔹 این پلتفرم به پژوهشگران اجازه می‌دهد مدل‌های AI را پیدا، منتشر و cite کنند و به اطلاعاتی مانند کد، وزن مدل، داده‌های آموزشی و مستندات دسترسی داشته باشند. 🔹 هدف BioAIrepo ایجاد یک زیرساخت دسترس‌پذیر، قابل تعامل و استفاده مجدد برای مدل‌های AI زیستی است. 🔗 https://www.ebi.ac.uk/biostudies/bioairepo #هوش_مصنوعی #یادگیری_ماشین ---------- 🆔 @BioinfCamp

🔹 گامی نو در درک تعاملات مولکولی، با افزودن میلیون‌ها ساختار کمپلکس پروتئینی که ساختار آن‌ها با استفاده از هوش مصنوعی پیش‌بینی شده و در پایگاه‌داده‌ی AlphaFold قرار دارند. 🔹 هم‌اکنون AlphaFold DB از یک منبع ساختار پروتئین‌های منفرد به یک نقشه بزرگ‌تر از شبکه تعاملات پروتئینی تبدیل شده است. مسیری که می‌تواند آینده طراحی دارو و زیست‌شناسی محاسباتی را متحول کند. 🔗 https://alphafold.ebi.ac.uk/ #پایگاه_داده #پروتئین #هوش_مصنوعی ---------- 🆔 @BioinfCamp