Бластим: работа и курсы в биотехе

Лаборатория Генетической Инженерии Патогенных Микроорганизмов НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера ищет генетика с опытом в real-time PCR ⚡️ Лаборатория занимается исследованиями в области филогенетики и филодинамики патогенных природно-очаговых вирусов в РФ и Африке, активно публикуется и сотрудничает с международными научными организациями. Обязанности: 🔹 Изучение распространенности вирусов, вызывающих природно-очаговые инфекции в РФ, Африке, Средней Азии, Вьетнаме и Иране. 🔹 Исследование филогенетики, филодинамики и генетических особенностей вирусов. 🔹 Разработка новых средств детекции вирусов, в том числе на основе метода ПЦР в режиме реального времени. 🔹 Написание технической документации, взаимодействие с отделом регистрации. 🔹 После испытательного срока предполагается руководство группой из 2-3 человек. Требования: 🔸 Высшее образование по специальности (предпочтение кандидатам с ученой степенью). 🔸 Опыт работы не менее 5 лет. 🔸 Владение методом Real-time PCR, навыки работы в ламинарном боксе. 🔸 Знание программ для работы с нуклеотидными последовательностями, методов построения филогенетических деревьев, умение подбирать праймеры и анализировать научную литературу. 🔸 Самостоятельность, аккуратность, усидчивость, умение осваивать новые методики. 🔸 Наличие публикаций, индексируемых в базах данных Scopus/WoS. Условия: ▫️ Молодой коллектив и возможность карьерного роста (руководство группой, лабораторией, международными проектами). ▫️ Испытательный срок – 3 месяца. Зарплата: ☑️ Конкурентная заработная плата в зависимости от квалификации (для кандидатов наук от 100 000 рублей). Откликнуться на вакансию можно здесь. #бластим_вакансии

Присоединяйтесь к оплачиваемой лидерской программе от крупнейшего производителя страны Русагро и становитесь востребованными специалистами сразу после вуза! Развивайтесь в направлениях: — молекулярная биотехнология; — продукты питания из растительного сырья и животного происхождения; — ветеринария, зоотехния. Вас ждет: 💸 зарплата от 150 000 рублей в Москве и от 67 500 рублей — в регионах; 🏃 ДМС, помощь с переездом и компенсация спорта; 🚀 личный трек развития и поддержка наставника. На программе вы сможете попробовать себя в разработке инновационных решений по снижению заболеваемости животных и планировать эксперименты по модификации штаммов-продуцентов. Зарабатывайте выше рынка и повышайте квалификацию сразу после вуза — регистрируйтесь >>

Давно мечтали продемонстрировать свои таланты автора в области биологии и смежных наук? 💫 Тогда 14-й сезон конкурса научно-популярных статей о современной биологии — «Био|Мол|Текст» — это то, что нельзя пропустить! Биомолекула приглашает увлекательно рассказать, ярко проиллюстрировать или оригинально снять что-то на биологическом 🥰 «Био|Мол|Текст» – одно из самых авторитетных событий в мире популяризации науки. Конкурс уже не первый год собирает лучших авторов, которые рассказывают о сложном просто 🧬 📅 Работы принимаются с 1 июля по 1 декабря 2024 года включительно. Все подробности на сайте Биомолекулы здесь. Не упустите возможность принять участие в масштабном конкурсе и внести свой вклад в развитие науки и образования 📚 #Биомолтекст2024 #Бластим_рекомендует

Времени достаточно, но его нет ⏰ Блокбастер Бластима — курс «Анализ NGS-данных» — не опять, а снова уже с 9 по 20 сентября! Напомним, почему же этот курс так уважают-обожают? 😍 🔹 Для всех и каждого: от бакалавров до постдоков, от самых мокрых биологов и врачей-клиницистов до программистов 🔸 Новое + легендарное: систематизируем знания о последних технологиях секвенирования, обработке ридов, сборке и аннотации геномов, построении филогенетических деревьев и многом другом 🔹 Понятность сложных концепций: разбираемся в том, что происходит «под капотом» биоинформатических программ, учим применять их осознанно 🔸 Практика на реальных кейсах: отработаем навыки на актуальных задачах из современного научного мира 🔹 Подготовка к старту: уже перед началом курса вы получите необходимые материалы и ссылки для плавного погружения в методы секвенирования, работу с R, Linux и молекулярную биологию 🔸 Звездная команда: преподаватели-эксперты из лучших вузов России и не только 🔹 Гибкость формата: онлайн из любой точки мира и оффлайн в Москве! Мы скучаем по личному общению и очень советуем наши уютные кофе-брейки для нетворкинга Больше подробностей 👉 здесь Чтобы не было про «лето красное пропели», запишитесь на хитовый курс по самой выгодной цене до подорожания 9 июля. А еще бонусы? Перед курсом мы организуем интенсив «Экспресс Linux для NGS». Все, кто сомневается в своих силах, смогут приручить свои страхи и сделать первые шаги в биоинформатике. При покупке курса «Анализ NGS-данных» интенсив «Экспресс Linux для NGS» вы получаете в подарок!

Хотите охладиться? ❄️ 🏔 Мы тоже! Поэтому давайте перенесемся в норвежские фьорды. Глубоко под землей в горном массиве внутри переоборудованной шахты Лефдаль раскинулся огромный дата-центр. Именно там в 2025 году установят самый скоростной суперкомпьютер в стране, и значительные вычислительные ресурсы станут доступны ученым всей Норвегии. Но какова цель? Не отстать в гонке искусственного интеллекта, конечно! Кстати, тоже самое делает и американское правительство. 6 мая Национальный научный фонд в рамках инициативы по поддержке изучения ИИ предоставил 35 лучшим исследователям суперкомпьютерное время на имеющихся в распоряжении государства машинах. 🤖 Хотя многие ИИ-лаборатории США давно получают достойное финансирование, они всё же ограничены в своих исследованиях из-за недоступности передовых компьютеров. Скажем, чтобы обучить GPT-3 понадобилась работа 1024 высокопроизводительных графических процессоров A100 на суперкомпьютере Microsoft в течение месяца. Это обошлось Open AI в несколько миллионов долларов. У вузов таких возможностей не было. Теперь государство, пытаясь сократить разрыв между академией и индустрией, подготовило 6-летний план наращивания ИИ-ресеча стоимостью $2,6 млрд. Среди первых победителей половина связана с науками о жизни. Например, экологическая модель Lake-GPT для прогнозирования влияния климата и землепользования на качество воды в озерах получила 750 тыс. GPU часов на суперкомпьютере Summit. Специалисты из университета Айовы добились себе 920 тыс. GPU часов на машине Frontera для обучения ИИ-системы InsectNet, которая поможет фермерам выявлять сельхоз-вредителей по фото на смартфон 🐛 Другие любопытные проекты: скрининг лигандов асиалогликопротеинового рецептора, базовая модель единичных клеток для биологии растений, мультимодальная модель для онкологических приложений, белковый дизайн с помощью диффузии. Контекст. Суперкомпьютеры построены по тем же принципам, что и обычные ПК, но имеют тысячи мощных центральных и графических процессоров (как раз таких, что Nvidia делает). Для их функционирования требуется специальная инфраструктура, системы отвода тепла. Например, в Норвегии суперкомпьютер будет охлаждать морская вода из фьорда, связанного с ледником, что очень удобно. Суперкомпьютеры могут анализировать гигантские объемы данных и характеризуются невероятной скоростью вычислений. Ключевая характеристика — число операций с плавающей запятой в секунду (или флопс). В 2022 году был запущен первый в мире экзафлопсный компьютер Frontier, который осуществляет 1,2 квинтиллиона операций в секунду и удерживает первенство в рейтинге TOP500 суперкомпьютеров на Земле. К слову, 100% машин из списка работают на операционных системах семейства Linux 🐧 Суперкомпьютеры пользуются спросом в науке: они применяются для прогнозирования погоды, исследований рака, термояда, палеонтологии, поиска лекарств и уже демонстрировали замечательные результаты, когда еще в мире ИИ наблюдалась «зима» 🧊 #выходные_у_бластим

И швец, и жнец, и на дуде игрец! В нашей любимой рубрике #про_карьеру_по_субботам выкладываем ролик про самую универсальную профессию во Вселенной — ТЫЖБИОЛОГ 🐸🦜💊☘️ 🧪🐠 Слышали про такую? А какие обязательства на вас накладывает ваш диплом? 🎓 Оригинал видео в 📱

⚡️ Пятничная подборка вакансий за рубежом 🇨🇭 Постдок, структурная биоинформатика (Швейцария) Лаборатория Pedro Beltrao в ETH Zurich ищет постдоков в проект по исследованию структуры белков современными методами (AlphaFold2). Нужен опыт в структурной биоинформатике, степень PhD, знание методов глубокого обучения и проектирования белков. Дедлайн: 20 июля. 🇺🇸 Машинлернер, нейросайнс (США) Группа Dr. Kinreich применяет ИИ для изучения сетей нейронов, генетики и факторов риска, лежащих в основе заболеваний мозга. Нужна степень PhD или магистра, знание Python и Matlab, опыт в области нейровизуализации, машинного обучения и вычислительного моделирования будет плюсом. 🇬🇧 Биоинформатик в Illumina (Великобритания) Предстоит разрабатывать алгоритмы для молекулярной диагностики рака с помощью NGS. Требования: PhD, знание статистики и методов биоинформатического анализа, опыт в геномике, языков Python или C++. 🇩🇪 Стажировка по биоинформатике в Roche (Германия) Команда генной терапии рекомбинантными AAV компании Roche приглашает студентов на стажировку. Предстоит применять биоинформатические тулы в анализе омиксных данных (метаболомика, протеомика). Требования: знание R и Python, опыт анализа данных, работы с Docker. 🇫🇷 Постдок, биоинформатика (Франция) Проект ESCALATE в Университете Лилля занимается исследованиями рака с помощью РНК-сек. Предстоит оптимизировать алгоритмы количественной оценки РНК. Нужен опыт в области биоинформатики и знание компилируемых языков Rust или С/C++. 👉 Больше вакансий всегда на сайте blastim.ru #бластим_вакансии

🏖 Проект ImageNet известен по огромной базе данных аннотированных картинок, а также конкурсу по распознаванию изображений, где компьютерному зрению предлагалось определить, к какому из 1000 классов принадлежит объект. Как мы рассказывали ранее, в 2012 году соревнование безоговорочно выиграла сверточная нейросеть AlexNet. До этого никто и подумать не мог, что глубокое обучение может опередить другие алгоритмы в такой задаче. Но вот смогло! Конечно, нейросеть AlexNet была несовершенна и допускала ошибки — около 16%. Люди на том же датасете ошибались только в 5% случаев 🤖 Однако спустя 3 года исследователи из Microsoft, многократно нарастив число слоев нейросетки, создали новый инструмент ResNet и довели процент ошибки до менее 4%, превзойдя человеческие способности! И правда: когда люди долго рассматривают картинки, они начинают отвлекаться, уставать и терять концентрацию, а машина нет. Сейчас нейросети со сложной архитектурой умеют не только банально отличать «котиков» от «песиков», но и генерировать уже трудно отличимые от реальных фото картинки. А у нас число слоев зрительной коры так и не увеличилось 🧠 👀 Поэтому в горячую пору отпусков и каникул мы решили проверить, а вы еще можете невооруженным глазом распознать, где реальное фото с отдыха, а где ИИ-творение? Пишите в комментариях:) Правильные ответы — завтра.

Друзья, делимся радостной новостью: вчера вечером стартовал тот самый питон 🎉 Бластим невероятно рад видеть всех участников курса 👋 На первом занятии студентов ждала не только философия Python от Александра Ильина, но и зарядка мотивацией от коуча Инги Егоровой. И, конечно, дзшка! Пусть небольшими, но осмысленными шажками при поддержке тим Бластим участники пройдут весь путь от «Hello, world» до весьма продвинутых биоинформатических тулов. В следующий раз питонический курс состоится не раньше 2025 года, зато пока можно поучиться на других бластимовских программах. А если вы хотите следить именно за нашим летним пайтоном, то мы пообещали делать короткие видеотрансляции с места событий в уютном чатике. Тоже заходите: https://t.me/+f5kx-_ISRnkzMjdi И спасибо, что вы с нами! Не переключайтесь, скоро — еще интереснее

🦅 Ну что, бердвотчеры, видели такую птицу? IBIS летит! IBIS (Inference of Binding Specificities) — международное соревнование по использованию методов биоинформатики и машинного обучения для предсказания ДНК-паттернов, узнаваемых регуляторными белками человека. Челлендж начался в марте, но сейчас еще можно присоединиться (дедлайны продлены). Подробности в свиттере Ивана Кулаковского: ссылка (надо VPN) Для участия пригодятся навыки программирования, анализа данных и базовые знания биоинформатики. Организаторы соревнования — международный консорциум лабораторий из 🇨🇦-🇨🇭-🇩🇪-🇷🇺 📜 Победители станут соавторами публикации в престижном научном журнале, а лучшие методы определят стандарт поиска и представления новых ДНК-паттернов. 🔗 Соревнование полностью онлайн, подробности на сайте: ibis.autosome.org 📱 А вот телегруппа конкурса: https://t.me/ibischallenge P.S. Организаторы будут рады и благодарны ретвитам и репостам и ждут новых участников! #бластим_рекомендует