Докторские байки
رفتن به کانال در Telegram
Разные истории из лабораторного мира. Старое лабораторное оборудование, олдскульные методики, лайфхаки и красивые картинки из лабораторий. Очистка белков, биохимия, молбиология и прочий хардкор. Связь с автором: @Rafil_Khairullin
نمایش بیشتر2 961
مشترکین
-224 ساعت
+67 روز
+3630 روز
در حال بارگیری داده...
کانالهای مشابه
ابر برچسبها
اشارات ورودی و خروجی
---
---
---
---
---
---
جذب مشترکین
سپتامبر '26
سپتامبر '26
+38
در 5 کانالها
اوت '26
+61
در 5 کانالها
Get PRO
ژوئیه '26
+69
در 4 کانالها
Get PRO
ژوئن '26
+54
در 5 کانالها
Get PRO
مه '26
+78
در 10 کانالها
Get PRO
آوریل '26
+44
در 3 کانالها
Get PRO
مارس '26
+90
در 4 کانالها
Get PRO
فوریه '26
+73
در 3 کانالها
Get PRO
ژانویه '26
+89
در 7 کانالها
Get PRO
دسامبر '25
+363
در 4 کانالها
Get PRO
نوامبر '25
+136
در 6 کانالها
Get PRO
اکتبر '25
+84
در 5 کانالها
Get PRO
سپتامبر '25
+141
در 6 کانالها
Get PRO
اوت '25
+47
در 6 کانالها
Get PRO
ژوئیه '25
+73
در 2 کانالها
Get PRO
ژوئن '25
+63
در 4 کانالها
Get PRO
مه '25
+64
در 1 کانالها
Get PRO
آوریل '25
+248
در 7 کانالها
Get PRO
مارس '25
+78
در 2 کانالها
Get PRO
فوریه '25
+84
در 2 کانالها
Get PRO
ژانویه '25
+152
در 4 کانالها
Get PRO
دسامبر '24
+93
در 4 کانالها
Get PRO
نوامبر '24
+54
در 2 کانالها
Get PRO
اکتبر '24
+71
در 2 کانالها
Get PRO
سپتامبر '24
+151
در 5 کانالها
Get PRO
اوت '24
+76
در 3 کانالها
Get PRO
ژوئیه '24
+54
در 2 کانالها
Get PRO
ژوئن '24
+63
در 2 کانالها
Get PRO
مه '24
+115
در 4 کانالها
Get PRO
آوریل '24
+73
در 2 کانالها
Get PRO
مارس '24
+71
در 5 کانالها
Get PRO
فوریه '24
+73
در 4 کانالها
Get PRO
ژانویه '24
+87
در 2 کانالها
Get PRO
دسامبر '23
+102
در 3 کانالها
Get PRO
نوامبر '23
+38
در 3 کانالها
Get PRO
اکتبر '23
+97
در 2 کانالها
Get PRO
سپتامبر '23
+530
در 0 کانالها
| تاریخ | رشد مشترکین | اشارات | کانالها | |
| 22 سپتامبر | 0 | |||
| 21 سپتامبر | +1 | |||
| 20 سپتامبر | +1 | |||
| 19 سپتامبر | +2 | |||
| 18 سپتامبر | +1 | |||
| 17 سپتامبر | +4 | |||
| 16 سپتامبر | +1 | |||
| 15 سپتامبر | +1 | |||
| 14 سپتامبر | +2 | |||
| 13 سپتامبر | 0 | |||
| 12 سپتامبر | +1 | |||
| 11 سپتامبر | +8 | |||
| 10 سپتامبر | +3 | |||
| 09 سپتامبر | +1 | |||
| 08 سپتامبر | +2 | |||
| 07 سپتامبر | +1 | |||
| 06 سپتامبر | 0 | |||
| 05 سپتامبر | 0 | |||
| 04 سپتامبر | +3 | |||
| 03 سپتامبر | +2 | |||
| 02 سپتامبر | +1 | |||
| 01 سپتامبر | +3 |
پستهای کانال
| 2 | Сефадекс как аффинный сорбент
Удивительное - рядом! Сорбенты семейства сефадекс (Sephadex) производства легендарной фирмы Pharmacia чаще всего используются для гельфильтрации - разделение биомолекул по размеру. Есть и ионообменные сефадексы (Sephadex A50/A25 С50/С25) - но их сейчас применяют значительно реже.
Но, оказывается, сефадекс G50 можно использовать и для аффинной очистки важного для хроматографии гликопротеинов лектина - конкавалина А! Причем без всякой модификации. Сефадекс - это кросс-сшитый полимер декстрана и практически целиком состоит из множества остатков альфа-D-глюкозы. А конкавалин А способен специфически связывать остатки альфа-D-глюкозы и альфа-D-маннозы.
Получают конканавалин А (ConA) из семян растения Canavalia ensiformis (Jack bean). Значит, для очистки конкавалина А нужно всего лишь экстрагировать белок из порошка семян, осадить сульфатом аммония и дочистить на сефадексе G50.
А конкавалин А в хозяйстве очень полезный белок - если пришить его к носителю можно получить аффинный сорбент для очистки гликопротеинов.
На озоне с появлением китайских продавцов, наконец, стали доступны семена Canavalia ensiformis. Теперь добывать конкавалин А стало еще проще!
P.S. Прикрепляю описание очистки из замечательной книги Tijssen, P. (1985) Practice and theory of enzyme immunoassays. | 1 226 |
| 3 |  Самый горячий тиофен | 1 370 |
| 4 |  Вся очистка - в таблице
При очистке белков обычно ведут таблицу очистки, которая позволяет оценить эффективность каждого этапа по выходу, чистоте и степени обогащения целевого белка. К сожалению, во многих дипломных работах и даже диссертациях, где описана очистка белков, такие таблицы не приводятся.
Какие параметры указывают в таблице очистки ферментов или белков с измеряемой биологической активностью:
Объем раствора.
Общий белок. Его можно определить колориметрическими методами: Лоури, Брэдфорд, BCA-assay. Определение концентрации по A280 на начальных этапах очистки нецелесообразно, поскольку присутствует слишком много мешающих компонентов.
Общая активность. Для ферментов активность измеряют в единицах активности. Для некоторых ферментов можно сразу определить и количество активного белка. Например, для трипсина можно провести титрование активного центра и установить зависимость между активностью и количеством трипсина.
Если белок обладает измеряемой биологической активностью, ее выражают в биологических единицах активности, основанных на функциональном тесте (EC50, IC50, биологическая активность, нейтрализующая активность).
Удельная активность. Это самый важный показатель степени очистки фермента. Рассчитывается как отношение общей активности к общему количеству белка. Чем выше удельная активность, тем чище препарат.
Выход, %. Показывает, какая доля целевого белка сохранилась после данного этапа очистки. Рассчитывается как отношение общей активности на данном этапе к общей активности исходного лизата.
Степень очистки. Показывает, во сколько раз увеличилась удельная активность по сравнению с исходным материалом.
Таблицу очистки проще строить, если белок обладает какой-либо биологической активностью. Но если белок не является ферментом и не проявляет измеримую активность, классическая колонка «удельная активность» уже теряет смысл. В этом случае вместо параметров активности используют показатели чистоты.
Самый простой и распространенный способ определения чистоты — денситометрия SDS-PAGE гелей (в Bio-Rad Image Lab это делается очень просто). Также можно использовать капиллярный электрофорез или ВЭЖХ (HPLC).
Таблица очистки является аналогом баланса материального потока в химической технологии. Такая таблица позволяет оценивать эффективность отдельных стадий и всего протокола в целом, выявлять узкие места, сравнивать различные протоколы и оценивать воспроизводимость методики.
Энжойте и чистите белочки эффективно и воспроизводимо! | 2 311 |
| 5 |  Все мы знаем, для чего на самом деле нужен новый айфон! | 1 546 |
| 6 | Водка без лабы - деньги на ветер!
Водка в лабе - вещь полезная, и для банкета, и для отмывки гелей годится.
А в ТГ канале Лаба дорогого брата автор поделился опытом, как они использовали водку в качестве реакционной среды. Что добру продпадать! | 1 453 |
| 7 | Водка без лабы - деньги на ветер!
Водка в лабе - вещь полезная, и для банкета, и для отмывки гелей годится.
А в ТГ канале Лаба дорогого брата автор поделился опытом, как они использовали водку в качестве реакционной среды. Что добру продпадать! | 6 |
| 8 |  Когда б вы знали, из какого сора растут статьи, не ведая стыда
Спойлер: статья из скриншота вовсе не про химию!
Разве для публикации статьи всегда нужны эксперименты? Вовсе нет! Ловите лайфхак: просто описываете клинический случай, когда пациент приняв водку пассатижами выдрал у себя зуб. И статья в кармане! | 3 296 |
| 9 |  Хочешь сеять - отломи кончик пипетки!
Когда я учился на биофаке, в микробиологических лабах можно было увидеть стеклянные пипетки с отломанными кончиками. Не из-за неаккуратности студентов, а для удобства посева. В те времена в ходу был mouth pipetting и широкое отверстие пипетки значительно облегчал процесс. А уменьшением точности дозирования можно было пренебречь.
Сейчас, я думаю, такой подход уже в прошлом и это славно! | 1 759 |
| 10 |  بدون متن... | 2 193 |
| 11 |  Волосы это не только ценный мех, но и цистеин для ваших багетов
Посещая парикмахерскую я думаю про китайский биотех прошлых лет.
Исторически в Китае человеческие волосы использовали как одно из видов кератинового сырья для получения цистеина. Человеческие волосы примерно на 90% состоят из кератиновых белков. Кератины волос богат цистеиновыми остатками, значительная часть которых соединена дисульфидными связями и представлена в форме аминокислоты цистина. Из килограмма волос можно извлечь 50-100 г цистеина. И все это богатство в наших краях попадает в отходы!
Чтобы извлечь цистеин из кератина его вначале нужно гидролизовать в соляной кислоте, осадить и перекристаллизовать, осветлить активированным углем и выделить цистин, а потом восстановить цистин и получить цистеин. Процесс довольно грязный, требует большого расхода кислот и солей и создает много отходов. Поэтому сейчас постепенно вытесняется биотехнологическими методами.
А при чем же здесь багеты? Дело в том, что цистеин широко применяется в хлебопечении. Цистеин выступает как восстановитель и частично разрывает дисульфидные связи между молекулами клейковины (глютена). Тесто становится мягче, проще раскатывается - это облегчает машинную обработку. Особенно это полезно для стандартизации свойств муки с разным содержанием глютена.
Цистеин также применяют как предшественник пищевых ароматизаторов. При нагревании цистеин реагирует с восстанавливающими сахарами (реакция Майяра). А это - запах жаренного лука и мяса и другие приятные ароматы.
В Евросоюзе цистеин из человеческих волос запрещен из-за этических причин и рисков безопасности. Раньше в Китае цистеин из волос применялся для получения цистеина для пищевой промышленности, но с 2016 года среди разрешенных источников цистеина значатся только гидролизаты шерсти животных и перьев птиц. Человеческий волосы как источник цистеина сейчас явно не разрешены, но для других целей-то использовать не запрещено! Несмотря на недостатки сырья (трудности с прослеживаемостью и сертификацией, доп. расходами на очистку) кератин волос все еще остается ценным источником для получения цистеина.
А уж в постапокалипсисе цены не будет! | 5 203 |
| 12 |  +4Источник фоток олдовых лабораторных девайсов
Недавно читая олдовую книгу по биохимическим методам наткнулся на фотографию устройства для нарезания гелей фирмы Био-Рад. Про похожее самодельное устройство из МГУ я уже писал. Фотка в книге была плохого качества, на сайте этот прибор уже нельзя найти, он очень древний.
И тут я вспомнил про отличный источник фотографий винтажных лабораторных приборов. На помощь пришел eBay! Там продают много лабораторных прибор разных эпох, в том числе очень древние. И можно достать фотки приличного качества в разных ракурсах.
На фото - устройство для нарезания гелей для последующей детекции радиоизотопов. Меченые белки разгоняются, гель разрезается и определяется радиоактивный сигнал.
Энжойте! | 1 720 |
| 13 |  Зебра в роторе!
А вы замечали концентрические полоски на донышке роторов для ультрацентрифуг? Задумывались ли для чего они?
А нужны они для решения двух задач - для того, что ультрацентрифуга узнавала ротор и для определения скорости вращения ротора.
На современных бекмановских центрифугах есть целых три датчика определения скорости вращения. Первая - это определение скорости вращения ротора при помощи инфракрасного датчика, который как раз считывает по частоте прохождения темных полосок. В старые времена для этого использовали стробоскопы, а сейчас - инфракрасные датчики. Поэтому, если полоски поцарапать, то центрифуга может выдать ошибку.
Два других датчика - это датчики Холла. Один считывает частоту вращения ротора по магнитам, которые находятся под этим кольцом с полосками. А второй - считывает частоту вращения вала, на который вешают ротор. И если все три значения скорости совпадают, значит работает исправно.
Теперь вы знаете, для чего зебра на роторе ультры, энжойте! | 1 895 |
| 14 |  Пока вы жалуетесь, что МСК мало выделяются, тут их контейнерами возят! | 1 866 |
| 15 |  Имитация стерильности
И еще про горелку - когда случается популяризация, горелкой можно обжигать пластиковые наконечники.
Из канала некого Репича в запрещенной соцсети. | 2 377 |
| 16 |  Как Бунзен не позволил мухе испортить эксперимент
В середине августа вышла статья американских ученых, в которой они подвергают сомнению способность горелки Бунзена обеспечивать стерильность при пересеве микроорганизмов. Как водится, все это быстро разлетелось по твиттеру и всяким запрещенным соцсетям. Но, сдается мне, авторы просто не умеют пользоваться горелкой.
А сам Роберт Бунзен был очень интересным ученым и героем многих курьезных историй. Он был известен своей педантичностью и требовательностью к точности экспериментов. Однажды он определял содержание бериллия в образце руды. После длинной серии химических превращений все свелось к самому важному этапу: взвешиванию небольшого количества осадка на фильтре. Именно от этой массы зависел результат анализа.
И тут случилось непредвиденное. На фильтр села муха, собрала на лапки часть драгоценного порошка и улетела. Увидев это, Бунзен издал такой крик, что в лабораторию сбежались студенты. Муху быстро поймали и принесли профессору. Бунзен поместил насекомое в платиновый тигель, сжег его, выделил из золы оксид бериллия, который муха успела похитить, и после взвешивания вернул потерянное вещество в расчеты. Эксперимент был спасен!
Будьте внимательны и не пускайте мух в лабу! Ну или, по крайней мере, набирайте ловких студентов! | 2 466 |
| 17 |  Для чего в кофе-машину заливать ацетонитрил вместо воды?
Представьте: ученый приходит в лабораторию и заливает в кофе-машину не чистую воду, а 40% раствор ацетонитрила.
Нет, это не сюжет фильма ужасов про психопата, которому осточертели коллеги, а обычный рабочий день ученого-аналитика, которому нужно быстро и дешево экстрагировать аналиты из образцов почвы, растений или продуктов питания.
В 2016 году испанский ученый Sergio Armenta с коллегами в статье Hard Cap Espresso Machines in Analytical Chemistry: What Else? описал использование обычной эспрессо-машины для экстракции полициклических ароматических углеводородов из образцов почвы и донных отложений. Позже появились работы, в которых с помощью кофе-машин экстрагировали фарм препараты из почв, капсаицин из перца чили и другие биоактивные вещества из растений (в том числе и те самые из тех самых растений).
Сравнительные эксперименты показывают, что кофе-машина все же не дотягивает до возможностей специализированных приборов. Однако своя ниша у нее есть: это дешево, быстро и достаточно эффективно для решения ряда аналитических задач. В первой работе экстракция занимала всего 11 секунд, а результаты были сопоставимы с референсными методиками.
Энжойте и успешных экстракций! | 2 831 |
| 18 |  Запас уплотнительных колец же бесконечный | 2 273 |
| 19 |  Спрашивайте в лучших озонах города | 3 897 |
| 20 |  Цветные картинки без химпрома
Совсем о детях не думают капиталисты! Ну вот поддались экоактивистам, а как сейчас экспы с детьми ставить без нормальных синтетических красителей в скиттлсах!? | 2 613 |
