en
Feedback
Сабина в поисках смысла жизни

Сабина в поисках смысла жизни

Closed channel

Привет, я Сабина! Совмещала стажировку в фарме, работу в лабе и проект по LLM в химии Здесь рассказываю о 🤍 научной работе в области биотехнологий и LLM 🤍учебе на химфаке МГУ 🤍своих успехах и неудачах 🤍осознанном тренировочном процессе

Show more
640
Subscribers
No data24 hours
-57 days
-1930 days
Posts Archive
В общем, я тут поразмыслила и пришла к выводу, что канал надо удалять. Последние полгода я почти ни с кем не общаюсь, кроме самых близких. И то даже с ними особо мне не хочется обсуждать свои дела. Потому что ничего хорошего и приятного я сказать не могу. Потому что то, что происходит и будет происходить ближайшие 1,5 года в МГУ ничем положительным не окрашивается. А я слишком часто выхожу из себя и в такие моменты могу написать сюда какие-нибудь вещи, которые саму меня могут подставить. Вот, да и честно сказать, что я думаю, я вряд ли могу без последствий говорить то, что я думаю. Мои родные мне сказали вчера, что я слишком много стала ругаться матом. А потом послушали, что происходит, и такие: Мда, тут сложно не начать материться. Можно ли не удалять канал? Можно. Только соблазн здесь бомбануть у меня всегда очень велик. А делать вид: «Ой как все классно, как хорошо» и не комментировать ничего я не могу. В общем, я хочу придерживаться принципа « Тише едешь — дальше будешь». Спасибо всем, кто был неравнодушен к моим историям!😳

Сегодня в полной мере "преисполнилась" в своем познании. Чтобы закрыть хвост, нужно было зайти вечером и сдать вопрос. Далее
+1
Сегодня в полной мере "преисполнилась" в своем познании. Чтобы закрыть хвост, нужно было зайти вечером и сдать вопрос. Далее диалог. П:Какая длина генома человека? Я: примерно 3 млрд пар оснований П: неправильно, 10. *я думаю про себя: я, конечно, полгода как перестала самостоятельно ботать молбиол, но не могу я в таких базовых вопросах ошибаться* Далее П: Почему ВИЧ в организме невозможно нейтрализовать антителами? Я: Он сидит внутри лимфоцита, антитело туда залезть не может. *я опять не понимаю, что происходит* Это все было после сдачи 2 праков, 1 контрольной, и бегов между 3мя корпусами МГУ. Я пришла домой, провела занятие и все-таки решила загуглить. Я не знаю, смотрите сами, я не знаю, как еще на этот сюр реагировать. Обычно в таких ситуациях говорят относиться проще. Но у меня это не выходит из головы, слишком вне рамок моего понимания.

А итогов года не будет, автор мечтает уже выпуститься и законно отдыхать с 31 по 9, а не херачить, как черт, перед сессией в
А итогов года не будет, автор мечтает уже выпуститься и законно отдыхать с 31 по 9, а не херачить, как черт, перед сессией в течение 5 лет

когда научрук, сидящий на 2,5 ставке с надбавками за публикации в Q1 и включённый в четыре ГЗ (из них три по дружбе в других лабах), а так же имеющий пассивный доход от сдачи в аренду лишней квартиры в Москве, просит аспиранта посидеть ещё один годик без ЗП, так как пока нет гранта, в который бы его можно было бы включить

Это коротко о том, почему я больше не хочу повторять свой опыт работать все дни недели без выходных в лаборатории за бесплатно

Хочу читать второе, а надо первое((
Хочу читать второе, а надо первое((

Расскажи о своей проблеме в одной фотографии Я первая😾

Не дать химикам, которые делали доклады в течение семестра, 4 и 3 автоматом — это, конечно, сильно. Боже, как я это все ненавижу. Иногда это все кажется бредом в плохом сне, а не явью.

Автор сегодня благополучно закрыла праки по ВМСам и радуется жизни чуть больше Источник мема
Автор сегодня благополучно закрыла праки по ВМСам и радуется жизни чуть больше Источник мема

Совместно со Сбером открываем центр разработки лекарств с помощью искусственного интеллекта 💊 Начиная со следующего года, ис
Совместно со Сбером открываем центр разработки лекарств с помощью искусственного интеллекта 💊 Начиная со следующего года, исследователи будут работать над поиском биомишеней вместе с фармацевтическими партнерами, а также создавать новые молекулы и проводить доклинические исследования🔬 Первоначальные направления работы центра AIDD: терапия онкологии, болезни Альцгеймера, ожирения и диабета. 📎Подробнее читайте в материале ТАСС.

каких-то подробностей пока не видно. Мне интересно с какими компаниями они будут коллабится. Пока я знаю только то, что Сбер в этом направлении сотрудничал с Р-Фармом

Никогда не забывай, ради чего ты сдавала 5 экзаменов и ботала олимпиады: Чтобы на 5 курсе в 11 ночи редактировать перевод статьи о женщине-кристаллографе. Это мое третье доп.задание по ☝️истории химии❤️. До этого мне дали перевод текста 12 века про Хильдегарду фон Бинген. А еще до этого — текст 17 века об алхимике А.Ди. Можно ли не делать эту дурость? Можно. И с большой вероятностью пойти на зачет🥰 Каждый перевод — файл на 15 страниц с офомленными сносками + эссе. Зачем работать/заниматься наукой/учить что-то еще, когда можно делать домашки по истории химии?

Хочу сказать, что ❤️мы с одногруппницей защитили кейсы по биохимии сегодня. Поскольку участвовала не вся команда, было принят
+2
Хочу сказать, что ❤️мы с одногруппницей защитили кейсы по биохимии сегодня. Поскольку участвовала не вся команда, было принято решение частично лепить презу с помощью ИИ. Это было видно, нас слегка поругали, но это был тотальный РЖЕКИЧ. Фото с колбасой у ученого и метаболитической схемой на неизвестном науке языке прилагается. Короче, все настолько закринжевали и угорали, что нас толком не смогли оппонировать и мы счастливые взяли 2 место ❤️сегодня ходила на лекцию от MSU.AI по применению RAG в LLM. В целом было очень полезно, но уж слишком много речи шло про то, как писать промты, что мне и так знакомо ❤️сегодня открылось право выбора трека в Школе 21. Об этом подробнее расскажу завтра. Это просто безумная радость для меня!

Я, кстати, забыла уточнить: парень лектор закончил мехмат МГУ. Вот так вот заканчивай МГУ, а тебя даже не пустят знаниями поделиться со студентами нынешними

История из разряда «Классика МГУ»❤️ Я сегодня приехала в коворкинг 1 ГУМа, чтобы послушать доклады лекторов из Сбера и WB про
+1
История из разряда «Классика МГУ»❤️ Я сегодня приехала в коворкинг 1 ГУМа, чтобы послушать доклады лекторов из Сбера и WB про ML. Так вот, лектор из Сбера не может уже 15 минут начать лекцию, т.к. его банально не пускают в МГУ. Я причем не 1 раз сталкиваюсь с таким, когда на мероприятия зовут лекторов не из МГУ

Некоторые люди заметили, что я ничего не публикую. И это не потому, что публиковать нечего и ничего интересного не происходит. Это потому, что напубликовать что-то, за что мне потом по башке настучат и будут проблемы, я не хочу. Я еще потому что говорить о том, что я на самом деле вижу каждый день и ощущаю, просто не хочется. Признавать, что все последние 7 лет жизни, потраченные на упорный труд, никак не окупились, не хочется. Что все, что было главными ценностями и интересами не несет мне перспектив. Все это разбитые розовые очки и суета. Что поменять ничего нельзя и надо заканчивать начатое. Ну и осознание того, что я сама виновата, что убедила себя, будто упорный труд в учебе и работа за бесплатно в лабораториях мне предоставит билет в светлое будущее. Когда выпускники смежных направлений с красным дипломом, конфами, Сириусами и всем прочим говорили мне, что в итоге самый оптимальный вариант для выживания — это репетиторство, я смотрела на них косо и с недоверием. А теперь сама понимаю, что они были правы. У меня одна надежда лишь на то, что мне хватит мозгов и силы воли, чтобы выкарабкаться из того, во что меня занесло по своей же глупости 5 лет назад. А еще одно из немногого, что я могу, это рассказать что-то, чтобы они не совершили те же ошибки, что и я. Тут вывод один:
прежде чем ввязываться в какую-то историю на несколько лет, поговорите хоть с кем-то, кто это все прошел и что он достиг. А не доверяйте своим иллюзиям: Ммм, звучит хайпово, все должно быть в шоколаде
А, и да, я если что понимаю, что в других сферах свои проблемы, я говорю лишь о своем опыте.

Чисто я предстоящие 1,5 года… С божьей помощью…
Чисто я предстоящие 1,5 года… С божьей помощью…

Repost from Machinelearning
🌟 Boltz-1: открытая модель для предсказания структуры биомолекулярных комплексов. Boltz-1 - первая доступная модель с открыт
🌟 Boltz-1: открытая модель для предсказания структуры биомолекулярных комплексов. Boltz-1 - первая доступная модель с открытым исходным кодом, которая достигает точности AlphaFold3 в прогнозировании 3D-структур белков, РНК, ДНК и небольших молекул. Boltz-1 основана на архитектуре AlphaFold3, но включает ряд модификаций, повышающих точность и общую эффективность модели. Архитектура состоит из модуля множественного выравнивания последовательностей (MSA), модуля PairFormer и диффузионной модели, работающую на двух уровнях разрешения: тяжелые атомы и токены. Токены представляют собой аминокислоты для белков, основания для РНК и ДНК, а также отдельные тяжелые атомы для других молекул. Boltz-1 использует диффузионную модель, аналогичную AlphaFold3, но Boltz-1 использует жесткое выравнивание с помощью алгоритма Кабша после каждого шага процедуры вывода, чтобы гарантировать, что интерполированная структура более похожа на очищенную от шума выборку. Это уменьшает дисперсию потерь денойзинга и предотвращает переобучение модели. Обучение модели проводилось на структурных данных из PDB, выпущенных до 30 сентября 2021 года, с разрешением не менее 9Å. Чтобы ускорить обучение, разработчики Boltz-1 применили алгоритм сопряжения MSA с использованием таксономической информации, унифицированный алгоритм кадрирования и алгоритм определения кармана связывания. Обучение модели заняло 68 тысяч шагов с размером пакета 128, что меньше, чем у AlphaFold3. Оценка Boltz-1 была выполнена на датасете CASP15 и на наборе PDB, специально созданном разработчиками для тестирования. Результаты показали, что Boltz-1 сопоставима по точности с Chai-1, закрытой репликацией AlphaFold3. Обе модели демонстрируют схожие показатели среднего LDDT и среднего TM-score. Boltz-1 продемонстрировала преимущество в предсказании взаимодействия белок-лиганд на наборе данных CASP15. Прикладная реализация инференса, доступная в репозитории на Github, может принимать на вход форматы: 🟢Fasta file, для большинства кейсов использования; 🟢Комплексная YAML-схема для более сложных случаев; 🟢Каталог с файлами для пакетной обработки. Подробные инструкции для процесса прогнозирования и дообучения опубликованы в репозитории с кодом. ▶️Локальный инференс:
# Install boltz with PyPI
pip install boltz

# run inference
boltz predict input_path
📌Лицензирование: MIT License. 🟡Модель 🟡Техотчет 🖥GitHub @ai_machinelearning_big_data #AI #ML #Diffusion #3D #Biomolecular

Ура, наконец-то аналог альфафолда в опенсурсе🌸😌

Я очень сильно устаю каждый день, совмещая все и сразу, но при этом все равно чувствую воодушевление. Учусь не тратить время зря и обращать внимание на неадекватов, а вместо этого фокусироваться на себе. За прошедший год сильно поменялись ценности: хочется просто быть здоровой и заниматься честным трудом в окружении порядочных людей со здоровой психикой. Звучит скучно? Наверное, зато практично😂