Будь как архея!

🎙Вышел подкаст у Бориса Веденского в канале Основа, где мы говорим про архей! Получилось ничего так))) https://www.youtube.com/watch?v=nN3BoNqCHXI

Тут прошёл не только Хэллоуин, но и День тёмной материи (31 октября) 🎃🌌 При чём тут археи? Микробиологи позаимствовали этот термин у астрофизиков. С приходом молекулярных методов, когда о микробе можно судить лишь по фрагментам 🧬 выяснилось, что разнообразие прокариот изучено лишь на 5%😳 Всё остальное — «МИКРОБНАЯ ТЁМНАЯ МАТЕРИЯ». Эти микробы известны нам только по последовательностям ДНК. Как они выглядят, что на самом деле делают в природе и как влияют на планету и её обитателей, остаётся загадкой❓ Обиднее всего то, что многие доминирующие в природе микроорганизмы, то есть явно очень важные, по большей части остаются именно в Тёмной материи. Они заправляют целыми экосистемами пока еще в режиме «инкогнито» для нас🥸 Чтобы надёжно узнать, чем они занимаются, их нужно физически достать из природы и «приручить». Это задачка со 🌟, особенно если речь про архей. Иногда это удаётся, но на это могут уйти годы. Вспомните историю первой асгардархеи. В нашем институте как раз занимаются тем, что понемногу включают свет в этой темноте💡. И вполне успешно: мы здесь одни из лучших в мире. Почитать можно тут, тут и тут. Архесветлой всем недели!

#археМЕМчики

#чисто_архейно Хэллоуин у архей🎃 В глубоководных гидротермальных источниках живут термококки — археи, которым и в аду было бы норм — их любимая температура 85–100 °C 🔥 И, судя по их геномам, с нечистью они встречаются регулярно!🧟 Напомню: у прокариот есть иммунная система CRISPR-Cas, которая может сохранять в геноме фрагменты ДНК вирусов🦠после встречи с ними. Если, конечно, встречу удалось пережить💀 Прочитав эти «досье», можно частично восстановить историю вирусных атак. Так вот, у термококков нашли следы 6️⃣2️⃣0️⃣ различных вирусов 😳 которые объединили в 1️⃣9️⃣ неизвестных ранее семейств. Эти вирусы получили имена персонажей, связанных… со смертью💀. Например, сатанавирус, астаротвирус, вельзевулвирус (Satanviridae, Astarothviridae, Beelzebubviridae). Есть ещё осирисвирус и анибусвирус (Osirisviridae, Anubisviridae); самедивирус и маманвирус (в честь Барона Самеди и Маман Брижит — вы знаете эту парочку по Дню мёртвых в Мексике); ангравирус (Ангра-Майнью, начало зла в зороастризме); ямавирус (Яма, владыка царства мёртвых в индуизме и буддизме) и т.д.😈 Какой-то список приглашённых на шабаш, а не таксономия💀 Хорошо, что мы не термококки. Подхватишь вельзевула — и поди разберись, врача вызывать или экзорциста Археспокойных вам выходных!

#архея_дня Архею «Ca. Sukunaarchaeum mirabile» нашли внутри мелкой одноклеточной динафитовой водоросли. Ну как нашли? Выделили ДНК🧬, саму архею никто не видел. Что она там делает? — непонятно. По геному поняли, что умеет в основном копировать свою ДНК и делать РНК и белки (базовый минимум, короче). И на этом всё: весь геном — 238 тысяч пар оснований🤏

Чтобы поразиться, насколько это мало — вот сравнение: если записать ДНК буквами, по байту на каждую, то на человеческий геном понадобится около 4 ГБ. А Sukunaarchaeum займет 1/6 старой дискеты на 1,44 Mb (олды помнят: на такую сохраняли реферат). К слову, у некоторых вирусов геном больше.

  Как выглядит этот малёк и зачем водоросли такой жилец — никто не знает. Но он явно тянет на минимальный формат индивидуальности😇 сам почти ничего не умеет, но родословную хранит! Назвали паразита в честь маленького японского 🇯🇵 божества Сукуна-бико-на (мои читатели уже поняли, что называть архей божественными именами — любимая фишка микробиологов).   Кажется, оставаться собой — не значит обязательно быть самодостаточным. Главное — помнить свои корни. А то, что без другого не обойтись, ещё не отменяет твоего собственного “я”   Спасибо подписчику @orkHelge за свежайшую статью❤️ 💙Будь как архея!

#archaepeople Никогда не бывали в пещере?🏔 Сейчас исправим. Даже обувь не испачкаете. Совместная экспедиция с коллегами из Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН (Оренбург) и Государственного природного биосферного заповедника «Шульган-Таш» (Башкирия) в рамках междисциплинарного гранта РНФ. В съемках задействованы кадры из археклассного историко-культурного музея-заповедника "Пещера Шульган-Таш". Археительных выходных всем! 💙Будь как архея!

Ещё две недели назад я была в экспедиции в пещере Шульган-Таш в Башкирии🏔 Изучаем мы там микробов, которые растут по стенам и в водоемах пещеры. Небольшим бонусом у экспедиции в темноте, духоте и грязи — потрясающие РЕАЛЬНЫЕ рисунки древнего человека 🔥 найденные в этой пещере. Им около 18 тысяч лет! Археология (не путать с изучением архей) — одна из самых романтизированных наук: раскопки, черепа, Индиана Джонс🥇… Но узнать многое о древних людях можно и не очень романтично — покопавшись в их зубном налёте🦷 По остаткам ДНК, найденным под этим затвердевшим материалом, смогли определить меню неандертальцев📋 И там не только «сегодня опять мамонт»: у одних — шерстистые носороги и дикие бараны🐳; у других — грибы💘, кедровые орешки и мох. Но главное — в зубном камне нашли ДНК археи Methanobrevibacter oralis. ДНК было достаточно много, чтобы суметь восстановить значительную часть древнего генома возрастом около 48 тысяч лет! А теперь проведите языком по зубам: представители этого же вида археи живут и во рту современного человека! Возможно, неандертальцы передали эту архею, пока жили с Homo sapiens на одной территории. Как передали? — геном нам об этом не расскажет, но пофантазировать никто не мешает😎   В общем, целуйтесь почаще! Вдруг через 50 тысяч лет кто-нибудь напишет об этом научную статью   💙Будь как архея!

#архея_дня, #дедАрхей Архея с самым уютным именем этой осени 🍂 Знакомьтесь: Nerearchaeum marumarumayae. Давайте медленно: Не-ре-ар-хЕ-ум ма-ру-ма-ру-мА-й-я. Песня ведь, правда? Её нашли в строматолите на западном берегу Австралии🇦🇺   Строматолиты — это слоистые карбонатные холмики, которые давным-давно построили цианобактерии. До наших дней они дожили как живые окаменелости, почти как микробные динозавры💪 Именно в Австралии находится крупнейшее в мире скопление таких построек. Так что у героини квартира в историческом центре, да ещё и с видом на океан 🤩   Род назван в честь Нерея, бога морей, у которого было 50 дочерей-нереид, а ещё он дедушка Ахиллеса 🔱 Но видовое имя, marumarumayae, просто мёд для ушей😎 Попробуйте снова произнести — марумарумайя... Чувствуете, как вы превращаетесь в котика и начинаете мурлыкать? 😍 На языке мальгана, коренных жителей тех мест, вы только что сказали «старинный дом».   Так и хочется теперь немного "помарумарумАить" на выходных: сидеть дома в пледе, наслаждаться осенью и никуда не торопиться 💙Будь как архея!

Москва сразу замотала делами, а ведь в Ярославле было чудесно!😍 Спасибо НКО "Ярославская школа–33" за теплый приём! Архейной вам стрессоустойчивости и долголетия😎

#архе_новости Наш канал «Будь как архея!» занял 1-е место в номинации «Научно-популярный блог» конкурса «Формула слова»!😀 Вот так неожиданно из человека с пробирками я превращаюсь в матёрого блогера с регалиями😎 Спасибо, что читаете, ставите ❤️ и не разбегаетесь при слове «метаногенез». Без вас это было бы похоже на "записки сумасшедшего". Вы археительны!😎

#археи_в_большом_городе На этой неделе Нобелевскую премию 🏅по физиологии и медицине получили Карл Дейссерот, Петер Хегеман и Георг Нагель — за открытия в области светоуправляемых ионных каналов и оптогенетики. Оптогенетика позволяет включать и выключать 🔛 нейроны светом, чтобы точнее выяснять, как работает мозг 🧠 Один из её главных инструментов — каналородопсины — светочувствительные белки одноклеточной водоросли Chlamydomonas. Встраиваем такой белок в нейрон — получаем клетку с управлением от фонарика 🔦(ну, если совсем просто). Но начало у этой истории, конечно же, архейное 😎 В 1971 году Дитер Остерхельт и Вальтер Стекениус открыли у галоархеи Halobacterium halobium бактериородопсин — протонный насос на солнечной энергии (именно этот белок дает ярко-пурпурную 💗 окраску солёных озер, т.к. там живёт очень много галоархей). С него началось изучение микробных родопсинов, позднее ставших инструментами оптогенетики. И еще одна ниточка: нынешний нобелевский лауреат Петер Хегеман был учеником Остерхельта и защитил в свое время диссертацию по белкам архей 😉   С прошедшим днем учителя! Спасибо тем, кто зажёг в нас любопытство. Даже без родопсина 💙Будь как архея!

Ярославль на связи! В ближайший понедельник 12 октября 15:00 ЯГПУ им. Ушинского. Приходите, поговорим про самое интересное из жизни архей среди людей!

#дедАрхей Пока админ буквально самым грязным способом добывает материал для будущих постов — ползает с научными целями по пещере Шульган-Таш 🏔 в Башкирии, — предлагаю посмотреть на, возможно, самое древнее движение с участием настоящего клеточного скелета💀 На видео «танец» асгардархеи — близкой родственницы тех архей, из которых когда-то выросла вся сложная жизнь: с митохондриями, ядрами и прочими излишествами (ищите посты с хэштегом #дедАрхей). Её белки движения — локиактины — стали предшественниками актинов, важнейших белков клеточного скелета у всех-всех-всех эукариот. В следующий раз, когда будете неловко танцевать на корпоративе, помните: это не вы — это ваша архейная сущность вышла из-под контроля Архединамичной всем недели!💃 📹credit Philipp Radler

#архея_дня Археи и их котята Из горячих океанических пород у берегов Исландии учёные вытащили замечательную архею. Мало того, что у нее совершенно уникальное строение (об этом, может, как-нибудь расскажу), она любит жить при 90С, не зависит от органической пищи и Солнца, так еще умудряется в таких условиях быть радушной хозяйкой. Её так и назвали — Ignicoccus hospitalis — "огненный гостеприимный шарик". Гость у неё, правда, своеобразный: крошечная Nanoarchaeum equitans, или «мелкая архея-наездница». Сидит на хозяйке — одна, с сестрой, а то и вдесятером — и получает от неё всё, чего сама произвести не может (т.е. практически всё). Но самое интересное — хозяйка не жалуется. Готовит и на себя, и на мелких козявок. А когда те активно размножаются, I. hospitalis замедляет собственное деление. Только нужен тесный контакт с хозяйкой: напрямую или через тонкие нити — фибриллы. Выглядит это архемило (см. фото). В чём выгода хозяйки — загадка. Впрочем, жить ей это не мешает. К чему я это? Месяц назад у меня тоже завёлся мелкий зверь. Постоянно голоден, уже закопал все ценное во все горшки с цветами, ну и ветеринары не бесплатные... А ещё требует непрерывного контакта: сидит на коленях, голове или шее и тычется своими тонкими фибриллами мне в лицо.Только, в отличие от Ignicoccus, совершенно понятно, зачем он мне ❤️ 💙Будь как архея!

#пост_по_регламенту Итак, наш Зоопарк завершает очередной раунд сбора папок тематических каналов - наслаждайтесь нашими подборками: Биология, медицина, сельское хозяйство Науки о Земле Физики и инженеры-технари (да, решили объединить) Смотрите, выбирайте, добавляйте по вкусу, а если хотите предложить свой канал, пишите в ЛС или в комменты, но просьба не затягивать, иначе смысл потеряется

Друзья, Зоопарк из слоновой кости снова любезно поместил мой канал в рекомендательную папку по "Биологии, с/х и медицина". Там ещё много классных каналов, заходите, ищите подходящее себе и подписывайтесь! А смотрителям просто большой респект за их канал, если вы работаете в науке, да ещё и в России — must have.

#архея_дня Археи в аквариумах Если вы держите дома аквариум🐟, знайте — там живут замечательные археи, которые обеспечивают безопасность вашим рыбкам. Рыбки🤩 в процессе жизнедеятельности образуют аммиак (его все образуют) и если его становится много — рыбкам конец 😵 (собственно, тоже самое происходит в любом водоеме, только за аквариумный мир отвечаете лично вы и тут приходится быть богом контролировать тонну факторов, что не просто). Чтобы аммиак не накапливался, его нужно окислить (легче всего кислородом). Называется процесс — "нитрификация". Этим занимаются исключительно прокариоты 🔣 Вот например, милейшая (см. картинку) археюшка 'Nitrosotenuis aquarius' (в переводе "аквариумная малышка, окисляющая аммиак"🌟) была выделена из фильтра пресного аквариума, где как раз этим и занималась. И если раньше считалось, что за нитрификацию в аквариумах отвечают только бактерии, то с развитием молекулярных методов в биологии стало понятно, что археи в этом процессе отнюдь не статисты ❤️   Не забывайте аэрировать аквариум: кислород нужен не только рыбам, но и тем, кто убирает за ними аммиак. С людьми, кстати, примерно так же — тем, кто помогает всем остальным не задохнуться от проблем, тоже иногда надо дать подышать   Археительной всем недели! 💙Будь как архея!

Как и у нас, у архей (и бактерий) есть иммунитет🔺 И именно изучение архей, а конкретнее галофильной археи Haloferax mediterranei, живущей в испанских солончаках🧂, помогло разглядеть одну из самых эффектных его версий: CRISPR/Cas. Затем похожие системы обнаружили у множества бактерий и архей. После встречи с новым вирусом 🌟клетка записывает кусочек вирусной ДНК в геном, в специальный "чёрный список"🗒 ✍️ Эти записи разделяются друг от друга одинаковыми палиндромными повторами CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats). Палиндром, помните? То, что читается в обе стороны одинаково: "шалаш", "потоп"..., только здесь запись в ДНК. Если вирус вернётся, клетка узнает его по записи в «чёрном списке» 😐 и с помощью РНК-наводчика направит белок Cas к совпадающему участку вирусной ДНК. Тот разрежет ДНК налётчика — инфекция остановлена🙃 На основе этой системы разработали крутейшую технологию редактирования генома — «молекулярные ножницы»✂️🧬 CRISPR/Cas9, за которую в 2020 году дали Нобелевскую премию. С её помощью можно прицельно менять геном: например, создавать устойчивые к вирусам йогуртовые закваски или лечить наследственные болезни. Любители футурологических триллеров уже ждут эпоху «дизайнерских детей»👀   Микробы просто собирали компромат на вирусы, чтобы защитить себя. Люди подсмотрели этот приёмчик и превратили его в инструмент, который уже меняет медицину и наши представления о возможном. Пожалуй, это одна из самых красивых историй современной науки 💙Будь как архея!

Админ сейчас слёг из-за мерзкого вируса. Поэтому пост будет короткий. Про вирусы архей. Они у них тоже есть. Только красивые (реально) и никого, кроме архей не заражают, за что им большое спасибо! Приглашаю понаслаждаться некоторыми из них (реально, таких вирусов больше ни у кого нет). 🖼doi:10.1038/nrmicro.2017.125, doi: 10.1007/s00705-002-0895-2 💙Будь как архея!

#археМЕМчики