Структурный анализ и белковая инженерия
Открыть в Telegram
713
Подписчики
+324 часа
+627 дней
+16030 дней
Загрузка данных...
Похожие каналы
Нет данных
Возникли проблемы? Пожалуйста, обновите страницу или обратитесь к нашему support-менеджеру .
Облако тегов
Входящие и исходящие упоминания
---
---
---
---
---
---
Привлечение подписчиков
октябрь '26окт. '26
октябрь '26
+66
в 1 каналах
сентябрь '26
+110
в 3 каналах
Get PRO
август '26
+11
в 0 каналах
Get PRO
июль '26
+36
в 0 каналах
Get PRO
июнь '26
+48
в 2 каналах
Get PRO
май '26
+22
в 0 каналах
Get PRO
апрель '26
+15
в 0 каналах
Get PRO
март '26
+17
в 0 каналах
Get PRO
февраль '26
+54
в 0 каналах
Get PRO
январь '26
+19
в 1 каналах
Get PRO
декабрь '25
+21
в 1 каналах
Get PRO
ноябрь '25
+12
в 0 каналах
Get PRO
октябрь '25
+26
в 0 каналах
Get PRO
сентябрь '25
+44
в 0 каналах
Get PRO
август '25
+114
в 1 каналах
Get PRO
июль '250
в 0 каналах
Get PRO
июнь '25
+117
в 0 каналах
| Дата | Привлечение подписчиков | Упоминания | Каналы | |
| 07 октября | +3 | |||
| 06 октября | +9 | |||
| 05 октября | +2 | |||
| 04 октября | +6 | |||
| 03 октября | +5 | |||
| 02 октября | +8 | |||
| 01 октября | +33 |
Посты канала
Структуру канального родопсина 2 в открытом (проводящем) состоянии до сих пор никто так и не определил, зато коллеги смогли решить структуру открытого канального родопсина из гигантских вирусов:
Nature Structural & Molecular Biology, 2025
Nature Communications, 2026
В соавторах всех этих работ - профессор Эрнст Бамберг, в лаборатории которого и были открыты канальные родопсины - Нагелем, Хегеманном и остальными. В других премиях, где число лауреатов не так ограничено - Zülch Prize 2012, Brain Prize 2013, Rumford Prize 2019 - Бамберг отмечен как со-разработчик оптогенетики
| 2 |  Все обсуждают Нобелевскую премию по медицине за оптогенетику - а когда-то давно, в 2017, наш Центр участвовал в расшифровке первой структуры канального родопсина 2 - того самого, который и использовался в ключевых работах | 488 |
| 3 |  В подборке в том числе есть канал синхротрона СКИФ - давно хотел запостить красивое видео про него. На 0:51 забавный белковый кристалл - нейросеть как поняла, так и нарисовала) | 595 |
| 4 | #пост_по_регламенту
Итак, наш Зоопарк завершает очередной раунд сбора папок тематических каналов - наслаждайтесь нашими подборками:
Биология, медицина, сельское хозяйство
Науки о Земле
Физики и инженеры-технари (да, решили объединить)
Смотрите, выбирайте, добавляйте по вкусу, а если хотите предложить свой канал, пишите в ЛС или в комменты, но просьба не затягивать, иначе смысл потеряется | 480 |
| 5 | Замечательный с многих точек зрения канал "Зоопарк из слоновой кости" собрал подборки тематических каналов - очень рекомендую и сам канал, и папку по биологии: | 529 |
| 6 |  Антропик хвастаются, что ускорили AlphaFold 3, OpenFold и BindCraft 1 ( последнее видимо уже не так актуально:), показывают примеры сборки комплексов по 10000 аминокислот на 8 видеокарточках H100
юзеры делятся историями, что может ускорения происходят из пользовательских сессий с Claude) но т.к. это не нобелевские открытия, в конечном итоге все довольны
https://www.anthropic.com/research/claude-uplifts-biomolecular-modeling | 1 076 |
| 7 |  Вышел BindCraft2, с новыми возможностями по инженерии байндеров, и работающий чуть ли не в 20 раз быстрее, чем оригинальная версия:
https://github.com/PacesaLab/BindCraft2 | 797 |
| 8 |  Для всех любителей Альфафолда и прочих Больцев - серьезные разработки от Сергея Овчинникова (профессор MIT, автор многих замечательных статей по компьютерным методам в структурной биологии) | 3 564 |
| 9 |  Нет текста... | 1 089 |
| 10 |  Бесплатный и быстрый сервер Альфафолда теперь умеет моделировать белки с разными малыми молекулами по их CCD-кодам | 1 061 |
| 11 |  Интересная методологическая работа с синхротрона DESY PETRA III: с помощью ряда усовершенствований удалось получить структуру белка (рубредоксина из Pyrococcus abyssi) с рекордным разрешением 0.43 Å. При таком разрешении видны даже плотности, соответствующие электронам в центре химических связей (рисунок посередине), и конечно положения атомов водорода упорядоченных молекул воды (рисунок справа). | 1 322 |
| 12 |  У нас новый препринт - с помощью геномного анализа и Альфафолд-моделирования смогли найти новый тип ферритинов (ключевых белков метаболизма железа) - что интересно, в археях Asgard. Найденные белки произвели в E. coli и получили Крио-ЭМ структуру.
В этих новых белках два ферритин-подобных домена объединены в одной белковой цепи, при этом общая упаковка частицы сохранена. Так как ферритины еще часто используются в биотехнологии, например для разработки субъединичных вакцин, то благодаря находке открываются новые возможности - экспонировать на поверхности не 24, а 12 белков слияния, которые благодаря этому можно сделать крупнее. | 885 |
| 13 |  Предсказание пространственной структуры белка — задача, сформулированная еще Кристианом Анфинсеном, — на протяжении десятилетий решалась лишь косвенно. Ситуация радикально изменилась с появлением AlphaFold 1/2. Его успех был настолько значительным, что уже ознаменовался Нобелевской премией (в 2024 г.) и породил ощущение, что проблема в целом «закрыта».
Однако история этим не закончилась: современная версия — AlphaFold 3 — объединяет эволюционный подход, унаследованный от предыдущих поколений, и диффузионные модели, пришедшие из генерации изображений. Такое сочетание позволяет выйти за пределы белковых структур и предсказывать целые «молекулярные сцены» с участием малых молекул или нуклеиновых кислот. Станет ли AlphaFold3 панацеей — или структуры белок-лигандных комплексов требуют новых подходов?
Георгий Куракин, постоянный автор «Биомолекулы», пытается разобраться в этом вопросе с помощью Алексея Орлова, руководителя Лаборатории вычислительной биомедицины и молекулярной диагностики Центрального университета.
Читайте на нашем сайте.
Автор: Георгий Куракин
#Биомолекула_спецпроект | 609 |
| 14 |  Просто красиво: по-разному упакованные ферроксидазы внутри энкапсулинов (Open Access) | 655 |
| 15 |  Интересная работа от лаборатории Бейкера: Designed Isopeptide bond forming ProteinS или DIPS - искусственные белки с автокаталитической триадой, самопроизвольно образующей ковалентную связь между боковыми группами лизина и аспарагина
Белки можно использовать как аналоги известной системы SpyTag-SpyCatcher, ну или например собирать ковалентные колечки, как на рисунке справа (и все это, конечно, экспериментально подтверждено) | 718 |
| 16 |  Будущее (или уже настоящее?) белковой инженерии - ProteinSketch - работа над белками в виртуальной реальности | 1 135 |
| 17 |  +2Если вы всегда хотели помоделировать каротиноиды, но не знали как - теперь у вас есть такая возможность)
Андрей, Ярослав и Вика сделали и протестировали новые AMBER-совместимые параметры, которые покрывают практически все многообразие природных полиенов. Силовое поле "обучено" на более чем 20'000 QM-энергиях и дает превосходные результаты по сравнению с конкурентами. Моделировать конечно можно и комплексы с белками. Подробности - в препринте на bioRxiv | 759 |
| 18 |  Красивые in situ крио-ЭМ структуры в свежей статье в Nature: суперкомплексы фотосистем помогают уложиться тилакоидным мембранам в ровные стопки | 489 |
| 19 |  В Bacillus subtilis нашли новые органеллы - тубеосомы - из которых зарождаются соединяющие разные клетки нанотрубки
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.27.740770v1 | 728 |
| 20 |  +1@Wehg_and_wehg делится скриншотами своей био-игры
Что-то такое я имел ввиду в посте выше - для студентов и синтетических биологов / инженеров метаболизма наверняка было бы увлекательно, да и всем остальным - для лучшего понимания, с какими сложностями сталкивается клетка | 732 |
