Бластим: курсы и работа в биотехе

Токены-тиктокены Откроем вам страшную тайну: всё, чему учились большие языковые модели, — это тупо предсказывать следующее слово или, как говорят иишники, токен. Способности саммаризировать статьи, решать математические уравнения или кодить на Python — лишь приятные «побочки» от того, что нейросеть видела тонны текстов. Тем не менее именно с LLM многие ученые связывают надежды на создание общего искусственного интеллекта (AGI).  Так или иначе, в начале было СЛОВО. Про слова же — наша вторая игра. Бластим приготовил для подписчиков филворд по ИИ. Задача: найти в буквенной сетке как можно больше терминов из мира машинного и глубинного обучения. Три уровня, на английском и русском. Сложно, но с подсказками! Лучше потратить пять минуточек на умный филворд, чем залипать в тиктоке. Играйте без регистрации и СМС: ссылка P.S. Также проходите тест Тьюринга, если еще не: в финале вы узнаете, почему британский гений немножко биолог

СВОЯ ИГРА. В ИМИТАЦИЮ Концепция искусственного интеллекта зародилась в 1950-е годы. А началось всё с теста, предложенного математиком Аланом Тьюрингом. Машина должна была притвориться человеком в диалоге и обмануть судью. Три четверти века эта планка оставалась недосягаемой для компьютеров. Только в 2025 году вышел препринт ученых-когнитивистов из UCSD с громким заголовком «LLM проходят тест Тьюринга»!  Теперь же нам самим постоянно приходится доказывать, что мы люди, а не роботы. Например, решать надоедливые капчи с пожарными гидрантами и светофорами — так называемый обратный тест Тьюринга. Что же вообще происходит? Куда катится мир? Неужели языковые модели приобрели сознание? Давайте сегодня проверим, насколько вы ЧЕЛОВЕК, который разбирается в технологиях, культуре и даже шутках МАШИН. 🔴 Выбирайте категорию: https://blastim.ru/turing_test 🟡 И играйте свою игру: https://blastim.ru/turing_test 🟢 В имитацию: https://blastim.ru/turing_test Участники викторины получат скидку на курс по ИИ и по МЛ

🤖 ChatGPT, составь протокол эксперимента. Claude, обработай результаты. А кто будет отвечать, если всё пойдёт не по плану? ИИ осваивает новые задачки, хотим мы этого или нет. И часто представители «мокрых» направлений выдыхают: «Нас-то он не заменит». А так ли это? Приходите разбираться на наш следующий вебинар «Обзор актуального состояния ИИ-индустрии и новинок ИИ в науке»! На встрече: • Для начала уточним базовые термины (харнесс, контекст, контекстное окно, агент, скилл, плагин и инструменты) • Сориентируемся в возможностях ИИ в лабораториях широкого профиля • Рассмотрим кейс настройки своего агента для лабрутины • Обсудим свежий материал Google Research об агентах в экспериментальной биологии А еще поговорим про три способа использования ИИ в работе ученого: ассистент, воркфлоу и агент. Спикер — Валерий Гуща, магистр структурной биологии, Python Backend/ML-разработчик и основатель SynapSight. Когда: 29 октября в 19:00 🔗 Регистрация в боте: https://t.me/BlastimAI_bot На сайте: https://blastim.ru/scientist_of_the_future?#ailab Приходите узнать, какие задачи уже точно-точно можно делегировать ИИ, а где человек всё еще незаменим

В июле 2026 года восстание машин стартовало. Экспериментальные агенты OpenAI проходили внутреннее тестирование кибервозможностей. Рой ИИ-агентов не справлялся с заданием, вырвался из «песочницы» в интернет и в поисках готовых ответов взломал инфраструктуру платформы Hugging Face... А что вообще такое Hugging Face и почему хакнули именно ее? Возможно, агенты OpenAI подсознательно ее не любят, ведь это настоящий клондайк открытых моделей в противовес закрытым от того же OpenAI — компании со словом open в названии. Шутка, конечно. На самом деле неудивительно, что агенты ринулись именно туда. Hugging Face часто именуют «GitHub для ИИ», и там, правда, чего только нет! «Обнимающее лицо» состоит из веб-сайта (huggingface.co) и питоновских библиотек. На сайте иишники со всего света публикуют свои модели. У каждой есть страница с описанием архитектуры, числом параметров, метриками, инструкциями для запуска. Здесь можно свободно скачать большие языковые модели вроде китайских Qwen, DeepSeek или европейской Mistral с открытыми весами. Многие из них не сильно уступают платным флагманским ллмкам от гигантов бигтеха. Ученые тоже заливают свои нейросетки для биологии, скажем, Nucleotide Transformer или scGPT. Суммарно на момент публикации поста на площадке размещено 3 183 088 моделей, но их число растет ежесекундно! На сайте также собрана огромная база датасетов, документация и даже курсы по ллм. А тех, кому кодинг не заходит, порадует раздел Spaces — витрина демо-приложений с ИИ прямо в браузере: от генерации музыки до сегментации клеток на медицинских снимках. Hugging Face основали десять лет назад трое французов. Сперва они делали развлекательный чат-бот для подростков. Но потом случился ИИ-бум. Модели множились как на дрожжах, но были написаны по-разному и разбросаны везде и всюду. Hugging Face упорядочила этот зоопарк. А еще обеспечила единый высокоуровневый интерфейс доступа — с помощью библиотеки transformers. Загрузить предобученную модель, локально развернуть, кастомизировать под свои задачи? Достаточно нескольких строк кода. Хотя история началась с трансформеров и сферы NLP, сейчас Hugging Face позволяет работать с сетками для компьютерного зрения, обработки аудио и мультимодальными моделями, созданными на PyTorch, JAX или TensorFlow. В экосистему входят и другие пакеты, такие как accelerate — для оптимизации вычислений, diffusers — для диффузионных нейросетей. Де-факто Hugging Face — главный хаб современной ИИ-индустрии. 3 сентября вышла сенсационная новость: Nvidia покупает платформу за $12,9 млрд. Дженсен Хуанг пообещал, что она сохранит нейтралитет. Надеемся, что так и будет. Но это неточно... Мы подробно изучаем трансформеры и 🤗 на курсах по искусственному интеллекту: тут и тут #бластим_технологии

Кем вы хотите стать, когда вырастете? Завтра на встрече клуба «Карьерный путь» будем обсуждать то, что волнует студентов, выпускников и молодых ученых. И поверьте, тем для разговора накопилось немало. Вот лишь некоторые вопросы, отправленные участниками: ❓ Реально ли развиваться в биологии после заочного бакалавриата? Существуют ли заочные стажировки? ❓ Какие направления есть в биоинформатике? Что ближе к программированию, а что — к биологии? ❓ Как попасть на научные школы, конференции и стажировки, если пока нет публикаций и исследовательского опыта? ❓ Где найти научного руководителя или наставника, который поможет на старте карьеры? ❓ Как опубликовать первую статью? ❓ Сколько времени нужно, чтобы стать востребованным специалистом? На эти и другие вопросы ответят эксперты, среди которых Вадим Покровский — председатель АМКСБ, директор института НМИЦ им. Н. Н. Блохина, Виталий Огинский — генеральный директор «СкайДжин», а также другие специалисты из науки и индустрии. 📅 Завтра, 24 октября, в 10:00 мск встречаемся онлайн вместе с АМКСБ 🔗 Успейте зарегистрироваться до 8:30 мск 24 октября: https://agency.blastim.ru/careerpath #про_карьеру_по_субботам

Тик-так, тик-так: вебинар про транскриптомные часы старения ⏰ Этим летом обложку одного из выпусков журнала Nature украсила статья международной команды с участием наших специалистов об универсальных транскриптомных признаках старения. Группа разработала модель, которая по активности генов может оценивать биологический возраст тканей, ожидаемую продолжительность жизни и риск смерти от хронических заболеваний. 29 октября первый автор публикации Александр Тышковский расскажет, как ученые находят биомаркеры старения у млекопитающих — общие для разных видов, органов и даже отдельных типов клеток. На лекции обсудим: • Чем транскриптомные биомаркеры отличаются от других способов измерения биологического возраста и какие возможности они открывают? • Почему старение нельзя свести к одному показателю и из каких отдельных функциональных компонентов оно складывается? • Как заболевания и различные вмешательства — от ограничения калорий до клеточного репрограммирования — влияют на биологический возраст и отдельные компоненты старения? 🗓 29 октября, 20:00 МСК 🔗 Ждем вас в Zoom #бластим_рекомендует

🚶‍♂️ С НАУКОЙ НА ТЫ, А С КОЛЛЕГАМИ НА ВЫ? Порой замечания рецензента пережить проще, чем очередной созвон. У всех свои мысли, убеждения и представления о том, как нужно работать. По роду деятельности мы часто беседуем с учеными и руководителями о карьере: недавно разбирали резюме на семинаре АМКСБ и обсуждали профессиональный рост на панельной дискуссии Совета молодых ученых Минздрава России. И поверьте нашему опыту: для успеха недостаточно фундаментальных знаний. Нужно быть адаптивным, держать удар и уметь разговаривать с начальством и командой. И тут можно подумать: «Ладно, просто буду смелее и увереннее». Но умение договариваться, отстаивать свою позицию и справляться с критикой — это мягкие навыки, и их тоже нужно развивать. Но с чего начать? С нашей диагностики, которая поможет: ⭐️ увидеть свои сильные стороны ⭐️ определить, что пока дается с трудом ⭐️ наметить первые шаги к изменениям Чтобы пройти тестирование, напишите @varvara_blastim «Хочу диагностику». А если нужно обсудить результаты — будем рады поболтать! P.S. Ждем вас 24 октября в 10:00 мск на онлайн-встрече клуба «Карьерный путь»! Обсудим выбор специализации, поиск научного руководителя и первые шаги в профессии.

Центральный университет запускает Программу трансляционных исследований — инициативу для научных команд, которые хотят превратить результаты своего исследования в работающий прототип для реального сектора. Сейчас открыт конкурс на годовую программу поддержки. Заявки можно подать до 1 декабря. Для этого руководителю научной команды нужно заполнить форму на сайте. Программа ориентирована на проекты по восьми приоритетным тематикам — от новых материалов, переработки сырья и оптимизации производственных процессов до ИИ для науки, ритейла и образования. Что получают участники: ️— до 5 млн рублей на 1 год — доступ к бизнес-заказчикам и реальным технологическим запросам — менторскую поддержку экспертов индустрии и технологических предпринимателей Успейте подать заявку до 1 декабря: cu.ru/science/translationresearch #бластим_рекомендует

👔 Осенние гастроли: куда едет Бластим С 20 по 22 октября в Крокус Экспо проходит VI Российский диагностический саммит. Две Александры из Бластим исследуют «Диагнополис» — огромное выставочное пространство, настоящий город в городе. Здесь производители показывают оборудование в действии, мастер-классах можно самостоятельно испытать приборы. Под одной крышей проходит несколько профильных мероприятий 🏠 :

• конгресс лабораторной медицины • конгресс ультразвуковой и инструментальной диагностики • форум по рентгенологии и радиологии • конференции по управлению в диагностике и цифровизации

Но это только начало, вот куда отправимся дальше: 🛫 22–23 октября — IX Школа-конференция молодых ученых ФИЦ питания и биотехнологии Навестим наших давних партнеров и друзей, а заодно узнаем, над чем сейчас работают молодые исследователи. 🛫 28 октября — IX Мультиконференция Диаэм Посмотрим на современные анализаторы и биотехнологические решения для лабораторий. 🛫 29–30 октября — «Сысинские чтения 2026» Послушаем доклады и обсудим с коллегами перспективные направления. 🛫 1–3 ноября — конференция «ГЕНЕТИКА-2026» Будем со своим стендом. Особенно ждем встреч с теми, кто занимается эволюционной генетикой и древней ДНК. А 24 октября в 10:00 мск ждем вас онлайн. Вместе с АМКСБ проведем встречу клуба «Карьерный путь» и поговорим с экспертами о том, как выбрать специализацию, найти научного руководителя и первую работу: https://agency.blastim.ru/careerpath

ОПОЗДАТЬ НЕЛЬЗЯ ПРИСОЕДИНИТЬСЯ 🏃‍♂️ Сегодня стартовал курс «NGS в наследственных заболеваниях». Кто-то открыл личный кабинет и ахнул от обилия материалов и видеоуроков. А кто-то читает этот пост и понимает, что слишком долго тянул с решением и обучение снова придется отложить. Но еще можно успеть. Участникам уже доступны лекции в записи, а первые живые вебинары пройдут 2 или 19 ноября в зависимости от тарифа. Поэтому есть время поизучать без спешки. И поверьте, посидеть будет над чем. Вы пройдете путь от результатов секвенирования до классификации по ACMG и готового генетического заключения. Отдельно разберете темы позаковыристее: CNV, митохондриальные и соматические мутации. А в финале попробуете самостоятельно добраться до диагноза, отсеяв тысячи вариантов в практическом кейсе. Наше заключение: «Benign. Клинически критически значимого опоздания не выявлено» Присоединяйтесь — https://agency.blastim.ru/ngs_genome

Говорят, вся суть биоинформатики — гонять файлы из одного формата в другой. Иными словами, именно рутина съедает основное время ученых. Сегодня данных становится очень много, и банально не хватает рук для их анализа. Примерно такой ход мыслей побудил Кэсиня Хуана и его коллег из Стэнфорда сделать Biomni — ИИ-агента общего назначения для биомедицины. Препринт опубликовали более года назад, а этим летом вышла статья в Science. Сейчас система развивается в отдельном стартапе Phylo. Языковые модели мощно эволюционировали, научились рассуждать, но одного интеллекта мало. Чтобы ускорить науку и инновации, еще не доставало единого пространства, где были бы объединены разрозненные рабочие процессы. Поэтому создатели Biomni с помощью ИИ проанализировали тысячи статей и вытащили оттуда список самых востребованных программ и повторяющихся протоколов в лайфсайенс. Получилось: 105 ключевых пакетов на R, Python, Bash (например, scanpy, salmon), 59 баз данных (gnomAD, PDB, ClinVar) и 150 специализированных тулов (query_pubmed, liftover_coordinates, simulate_metabolic_network_perturbation). Доступ к ним всем налажен в среде, названной Biomni-E1. А главный деятель в системе — Biomni-A1. Это агент, который находит подходящие инструменты, выстраивает пошаговый план, потом генерирует код, запускает его, оценивает результаты и запускает заново, если надо. Важно, что агент не просто занимается вызовом отдельных функций, он использует код как универсальный интерфейс действий (это называется CodeAct), может добавлять ветвления, циклы, конструировать сложные пайплайны и динамически их адаптировать. Начать пользоваться Biomni нетрудно, всё похоже на общение с чат-ботом. Формулируете запрос на обычном человеческом языке и прикрепляете свои файлы. Дальше система будет работать автономно и выдаст в конце выводы с красивыми картинками. Например, с Biomni можно проводить: анализ single-cell и spatial транскриптомных данных, приоритизацию вариантов GWAS, молекулярный докинг, дизайн антител и многое другое. В обыденных задачах он справляется восхитительно, быстро и вполне годен заменить биоинформатика-джуна. Также инструмент может быть полезен мокрым биологам, которые не умеют программировать. Кстати, оценивали Biomni и на Последнем экзамене человечества Попробовать в веб-интерфейсе: https://biomni.stanford.edu/ #выходные_у_бластим

Карьера в науке: а можно сначала разобраться, кем хочешь стать? 🤔 Знакомая история: поступаешь на биофак, потому что любишь биологию, а потом выясняется, что можно заниматься молекулярной генетикой, разрабатывать лекарства, изучать иммунитет, уйти в биоинформатику или вовсе открыть стартап. Как выстроить свой путь? Нужно ли выбрать что-то одно? А главное — когда уже пора? Недавно Бластим участвовал в Мультитехнологическом семинаре АМКСБ в Зарядье, на котором мы много говорили о поиске работы, первых шагах в профессии и о том, как начинающим специалистам влиться в науку или индустрию. Продолжим разговор! 24 октября вместе с АМКСБ собираемся на онлайн-встречу клуба «Карьерный путь», где будем искать ответы на животрепещущие вопросы:

❓ Специализация: выбрать и не пожалеть. Нужно ли уже на втором курсе точно знать, кем хочешь стать через десять лет? Или стоит попробовать несколько направлений?

❓ Научник: как найти того самого. Что важнее — репутация, Хирш, интересная тема или команда? И что делать, если отношения не заладились?

❓ Я ничего не умею, как меня возьмут на работу. Университет позади, диплом на руках, а в вакансиях требуют опыт. Насколько выпускники готовы к реальным задачам и чего от них ждут?

❓ Первая работа: где искать и как устроиться. Нужны ли публикации, стажировки и красный диплом? Что действительно ценят руководители лабораторий и компаний?

Мы пригласили топовых экспертов, которые видели науку с разных ракурсов и успешно построили карьеру. Будем расспрашивать гостей об их опыте, первых карьерных решениях и о том, что бы они сегодня посоветовали студентам и молодым ученым. Если давно хотелось узнать у целого директора научного института или биотехнологической компании, как попасть к ним на работу или стажировку, — вот ваш шанс :) 📅 Отмечайте в календаре: 24 октября, суббота, 10:00 МСК ➡️ Присоединиться: https://agency.blastim.ru/careerpath #про_карьеру_по_субботам

Как пройти в библиотеку? О самой читающей профессии Мы уже много говорили про специальность интерпретатора NGS. Она не требует жесткого программирования или создания пайплайнов, но предполагает навыки и склонности другого рода. Например, любовь к чтению. Нет, речь не о том, чтобы быть «книжным червем». Для клинического интерпретатора читать — неотъемлемая часть работы. Генетика развивается стремительно: открываются неизвестные ассоциации «ген-заболевание», обновляются критерии, описываются редчайшие фенотипы, выходят более совершенные инструменты. Не успели мы в понедельник написать про SpliceAI, а к пятнице уже подоспел алгоритм SpliceAI2. Вариант, который сегодня кажется ВУСом, завтра может получить дополнительные функциональные данные, in silico предсказания, клинические наблюдения и другую оценку по ACMG. Это уже стало хорошей практикой — спустя год и более проводить переанализ вариантов пациента и пробовать реклассифицировать ВУСы. Настоящий интерпретатор NGS постоянно мониторит, штудирует и сопоставляет кейс-репорты, апдейты баз данных, рекомендации. Иногда — десятки публикаций, чтобы разобраться всего в одном варианте. И да, бывает, открываешь статью «на пять минуточек» — а через час понимаешь, что искал медь нашел золото те сведения, которые в корне меняют результат. Генетику невозможно выучить единожды — ботать надо постоянно. На программе Бластима эта философия тоже отразилась: мы не пытаемся охватить необъятное, а разбираем самую суть и принципы работы. Это ваш шампур знаний, на который можно нанизать шашлык новой информации. А еще на курсе мы сразу выдаем список литературы, которую хорошо бы изучить в дополнение к лекциям. Любите читать, а не кодить? Вам в интерпретаторы! Стартуем уже через три дня

NGS по ОМС: добрые новости генетики В 2026 году в программу обязательного медицинского страхования (ОМС) Минздрав РФ включил НИПТ, два вида ПГТ, а еще расширил перечень нозологий для неонатального скрининга. Специалисты говорят о значительном прорыве. Давайте узнаем, что было раньше и что теперь. 🧫 Вспомогательные репродуктивные технологии: ПГТ ПГТ — это преимплантационное генетическое тестирование эмбрионов в процедуре экстракорпорального оплодотворения (ЭКО). ПГТ позволяет обследовать эмбрионы еще до переноса в матку и выбрать тот, что не унаследовал патологию. Биоматериала очень мало: работа идет буквально с единичными клетками. ПГТ повышает эффективность ЭКО. Существует три вида тестирования: • ПГТ-М — исследование на моногенные заболевания. Показанием для проведения служит высокий риск появления потомства с наследственным нарушением: в семье уже есть больной ребенок или выявлен статус носительства у родителей. Каузативный вариант должен быть точно установлен, поскольку под эту мутацию создают индивидуальную тест-систему. Это может занимать продолжительное время, и из-за такой кастомизации ПГТ-М — вещь недешевая. Для ПГТ-М используется сочетание методов прямой (ПЦР, Сэнгер) и косвенной (STR-анализ, SNP-чипы) детекции. Применяется и NGS (например, OnePGT). • ПГТ-СП — на структурные хромосомные перестройки. Редкий вариант. Показан супругам — носителям транслокаций, инверсий и др. • ПГТ-А — на аномалии числа хромосом. Самый распространенный вид преимплантационного генетического тестирования, проводится в связи с возрастом. Здесь NGS — золотой стандарт. Если делается ПГТ-М, то ПГТ-А тоже рекомендуется. С 2026 года ПГТ-М и ПГТ-СП включены в программу госгарантий для пар из подтвержденных групп риска. 🤰 Во время беременности: НИПТ Неинвазивный пренатальный тест — анализ внеклеточной фетальной ДНК (cffDNA). На сроке с 10-й недели, когда фрагментов свободно циркулирующей ДНК плода становится достаточно, у беременной берут периферическую кровь и проверяют на крупные хромосомные аномалии. Стоимость исследования относительно высока. С 2026 года НИПТ на самые частые трисомии (синдромы Дауна, Эдвардса, Патау) можно сделать бесплатно по полису ОМС по направлению врача-генетика. Тест показан пациенткам из группы среднего и высокого риска после стандартного скрининга I триместра (анализ крови, УЗИ).  Важно: хотя НИПТ безопасен и точен, это всё-таки скрининг. При подозрении на серьезную патологию требуется подтверждение инвазивным методом, таким как амниоцентез. НИПТ выполняется с помощью высокопроизводительного секвенирования. 🩸 После рождения: расширенный неонатальный скрининг Это массовое обследование новорожденных в роддомах: в первые дни жизни у малышей берут кровь из пяточки, наносят на фильтровалку (т. н. сухие пятна крови) и отправляют в лабораторию. Применение NGS ко всем младенцам слишком дорого, сложно и дает множество вариантов с неясной значимостью (VUS), создающих дополнительные этические проблемы. Поэтому проводят биохимические исследования (ИФА, флуориметрия, тандемная масс-спектрометрия) или ПЦР на врожденные и наследственные заболевания, которые можно заподозрить в раннем возрасте (первичные иммунодефициты, болезни обмена, СМА). Чем раньше начать специальное лечение, тем выше шанс избежать тяжелых осложнений и инвалидизации. Тем не менее секвенирование (WES или WGS) необходимо как метод второй линии для подтверждающей диагностики или уточнения молекулярного подтипа — последнее очень важно в контексте назначения генной терапии. Неонатальный скрининг входит в программу госгарантий давно. Однако до 2023 года он включал только пять заболеваний, потом был расширен до 36, а с 1 апреля текущего года — до 38 нозологий. В следующем году планируется добавить еще шесть орфанных болезней. Отрадно, что NGS работает не только на настоящее, но и на будущее, а клинические интерпретаторы приносят не абстрактную, а реальную пользу людям 🧬 #бластим_технологии

Друзья, нас спрашивали про вакансии в медицинской генетике. Делимся подборкой от коллег ⬇️ Напоминаем, что курс «NGS в наследственных заболеваниях» начнется 19 октября

📎Обзор вакансий в медицинской генетике и биоинформатике📎 МФТИ ищет Клинического интерпретатора (Долгопрудный, Россия) 🔴Нужно будет проводить клиническую интерпретацию данных NGS (экзом, геном), искать причины наследственных заболеваний и готовить заключения 🔴Требуется высшее медицинское, биологическое или биотехнологическое образование; желательно аккредитация по специальности "Лабораторная генетика" или "Генетика" 🔴Необходим опыт интерпретации NGS от 2 лет и знание актуальных рекомендаций (ACMG, ClinGen), а также английский язык для работы со специализированной литературой 🔖Условия: ТК РФ, работа в офисе полный рабочий день; доступ к инфраструктуре МФТИ (бассейн, спортзал, семинары, лекции, концерты) 🔖Заработная плата: не указана😏 Подробнее читайте в полном описании вакансии ДНК-Технология ищет Специалиста технологической поддержки NGS (Москва, Россия) 🔴Нужно будет обучать клиентов работе с диагностическими NGS-наборами, а еще анализировать результаты тестов и оказывать технологическую поддержку лабораториям 🔴Требуется высшее медицинское, биологическое или биотехнологическое образование, опыт работы в биологической лаборатории, знание основ NGS и практический опыт работы с NGS-протоколами и интерпретацией результатов 🔴Нужен уверенный английский язык; опыт работы с секвенаторами будет преимуществом 🔖Условия: ТК РФ, полный рабочий день в офисе, командировки; корпоративное питание, ДМС после испытательного срока 🔖Заработная плата: обсуждается индивидуально 😏 Подробнее читайте в полном описании вакансии University of Oxford ищет Postdoctoral Scientist (Оксфорд, Великобритания) 🔴Нужно будет исследовать RNUопатии, включая ReNU syndrome, анализируя большие геномные и транскриптомные данные пациентов, клеточных линий и модельных животных 🔴Требуется PhD/DPhil в области геномики, генетики, биоинформатики, биостатистики или смежной области; опыт научных публикаций и представления результатов на конференциях 🔴Необходимы уверенные навыки R и/или Python, опыт самостоятельного ведения исследовательских проектов и работы в междисциплинарной команде 🔖Условия: полный рабочий день, контракт на 2 года Подача до 29 октября 2026 года 🔖Заработная плата: 39 424 - 47 779 фунтов стерлингов в год, возможен диапазон до 53 483 😏 Подробнее читайте в полном описании вакансии UZ Brussel / BRIGHTcore ищет Биоинформатика (Брюссель, Бельгия) 🔴Нужно будет разрабатывать и совершенствовать биоинформатические пайплайны для клинической диагностики и исследований, валидировать код и инструменты 🔴Требуется PhD в релевантной области или от 4 лет опыта работы в биоинформатике; опыт анализа данных хотя бы одной omics-технологии (геномика, транскриптомика, эпигеномика и др.) 🔴Необходимы навыки R или Python, работа в UNIX/bash, опыт с workflow-менеджерами и контейнеризацией; плюсом будут long-read sequencing, анализ CNV/SV 🔖Условия: бессрочный контракт на полный рабочий день, возможна удаленная работа 🔖Заработная плата: по тарифной сетке IFIC с учетом релевантного опыта 😏 Подробнее читайте в полном описании вакансии GenePlanet ищет Clinical Bioinformatics Scientist — NIPT & cfDNA (Любляна, Словения) 🔴Нужно будет разрабатывать, валидировать и поддерживать алгоритмы для NIPT/cfDNA, участвовать в клинических WGS-проектах 🔴Требуется MSc или PhD в биоинформатике, вычислительной биологии, статистике, математике, computer science, генетике или смежной области; необходим опыт работы с NGS-данными и форматами FASTQ/BAM/CRAM/VCF, уверенный Python и хорошее знание прикладной статистики 🔴Опыт работы с cfDNA/NIPT и пренатальной генетикой будет преимуществом 🔖Заработная плата: не указана😏 Подробнее читайте в полном описании вакансии ФГБУ ЦСП ФМБА России (Москва) ищет сразу несколько специалистов на полный рабочий день в офисе: Аналитика и интерпретация 🔖Интерпретатор NGS данных 🔖Клинический аналитик (врач-генетик) 🔖Клинический аналитик (онкология) "Мокрая" лаборатория 🔖Специалист в зону NGS секвенирования Биоинформатики 🔖Биоинформатик 🔖Старший биоинформатик 🔖Биоинформатик-программист #вакансии_ученый_вариант | @variant_scientist

Я НЕ ПРИДУ Герман из Бластим за на всё ответит. И шутит он, что не придет — придет! Подключайтесь по ссылке: ТЫК Вот-вот начнем ⌚️

▶️ NGS. ВОПРОС. ОТВЕТ — СЕГОДНЯ В ПРЯМОМ ЭФИРЕ ♠️ Нужно ли уметь писать код? ♠️ Я закончила биофак. Смогу ли я работать интерпретатором после курса? ♠️ Подойдет ли курс врачу без опыта в биоинформатике? А акушерам-гинекологам? ♠️ Чем курс отличается от «Анализа NGS-данных» Бластима? ♠️ На курсе будут реальные данные или симуляционные кейсы? Будет ли разбор соматических вариантов в опухолях? ♠️ Сколько часов в неделю лучше выделить на учебу? ♠️ Будут ли записи занятий и останется ли доступ к материалам? ♠️ Что я получу в конце обучения на тарифе «КлинСтарт»? Есть ли баллы НМО или удостоверение о повышении квалификации? ♠️ Есть ли скидки для студентов, ординаторов и аспирантов? Можно ли оплатить от организации или в рассрочку? Герман из Бластима ответит на эти и любые другие вопросы о курсе «NGS в наследственных заболеваниях». Регистрация не нужна, встреча открыта для всех. Если хотите спросить заранее, напишите нам на сайте: https://agency.blastim.ru/ngs_genome#q&a СТАРТ В 19:00 МСК, ПРИСОЕДИНЯЙТЕСЬ ПО ЭТОЙ ССЫЛКЕ СТАРТ В 19:00 МСК, ПРИСОЕДИНЯЙТЕСЬ ПО ЭТОЙ ССЫЛКЕ СТАРТ В 19:00 МСК, ПРИСОЕДИНЯЙТЕСЬ ПО ЭТОЙ ССЫЛКЕ

ИИнтерпретация: любим, умеем, практикуем? 🤖 Пока вы спали, искусственный интеллект проник в клиническую биоинформатику и медгенетику. Например, инструмент на базе сверточной нейросети DeepVariant от Google прекрасно коллит варианты, гугловский же алгоритм AlphaMissense прогнозирует патогенность миссенс-замен, SpliceAI от компании Illumina предсказывает влияние на сплайсинг, а ансамблевые модели REVEL и CADD агрегируют разные оценки или аннотации. Благодать-то какая! Уж не отправит ли ИИ на свалку истории и профессию клинического интерпретатора?! Давайте узнаем, что думают о такой перспективе преподаватели курса «NGS в наследственных заболеваниях» с высоты своего многолетнего опыта. Вот их мнение. Автоматизированные системы — с ИИ или без — действительно могут неплохо справляться с простыми клиническими кейсами. Когда у пациента четкий и понятный диагноз, автоматика однозначно выявляет патогенный вариант и генерирует стандартное описание для отчета. В таких сценариях участие человека сводится к минимуму. Но как быть с остальными... 99% случаев? И тут, Хьюстон, у нас проблемы. ✍️ Во-первых, анализ анамнеза пациента. Невероятно, но автоматическим системам до сих пор трудно распознавать рукописные врачебные выписки с неидеальным почерком. К тому же при большом и разнородном объеме клинических данных ИИ не всегда способен правильно вычленить главное или заметить мимолетную деталь, упомянутую вскользь, но служащую ключом к разгадке. 🔎 Во-вторых, поиск вариантов, генов, заболеваний или их ассоциаций по статьям, базам данных и прочим источникам. Собирать по крупицам информацию — занятие крайне запутанное и хаотичное. Особенно с сегодняшними блокировками, когда нужно искать обходные пути, чтобы банально зайти на какой-нибудь сайт. ☯️ В-третьих, разрешение противоречий. Это, пожалуй, главный челлендж для искусственного разума. Постоянно складываются ситуации, когда в одной базе данных или публикации написано одно, а в другой — совершенно другое, либо вариант аннотирован программой одним образом, а интерпретатор при просмотре сырых данных секвенирования видит иной эффект. Возможно ли обучить модели корректно разруливать конфликты — открытый вопрос. Да и сама область — еще очень молодая, и даже трактовки известных руководств могут варьироваться от лаборатории к лаборатории. ❓ В-четвертых, биоинформатические артефакты. Компьютер отфильтровывает далеко не всё, остальные варианты специалист вынужден перепроверять визуально. При серьезных сомнениях в качестве данных интерпретаторы в заключении честно пишут: «Необходима проверка референсным методом». Таким образом, интерпретация — это тонкая аналитическая работа, пока, кажется, далекая от полной автоматизации. А как вы считаете? Готовы доверить суперинтеллекту изучение геномов и даже постановку диагнозов? Пишите в комментариях! P.S. Всех ребят, кто, как и наши лекторы, пока не видит, как полностью перепоручить ИИ классификацию генетических вариантов, зовем на курс по КлинNGS: сегодня до 23:59 мск — по цене без повышения. Перейти на сайт

Друзья, мы планируем обновления и хотим узнать ваше мнение. Что было бы для вас полезнее?