Бластим: курсы и работа в биотехе

Бластим утомился и отчаливает в отпуск — в круиз на Южный полюс Однажды в зоопарке мужчину за палец укусил пингвин, и он заразился «пингвинитом». Это опасное заболевание выражается в постоянных мыслях о пингвинах и острых приступах любви к милым птицам. Тем человеком был Линус Торвальдс, который выбрал маскотом созданной им ОС Linux пингвина по имени Tux, объевшегося селедкой🥸 Мы тоже обожаем нелетающих пернатых. Поэтому в последний летний уикенд, 29–30 августа, отправляемся в экспресс-путешествие по Linux. За штурвалом — капитан Андрей Томаровский, к.б.н., специалист в области геномики животных и опытный сисадмин. Почему зовем с нами?

Большинство биоинформатического софта написано для командной строки Линукс. На серверах, кластерах и суперкомпьютерах — везде Линукс. Анализировать тяжелые NGS-данные в графическом интерфейсе с кнопочками и окошечками не получается. В ворде или блокноте вы не откроете файл с геномом человека, потому что компьютер просто зависнет. А с помощью консольных программ с Big Data работается удобно и автоматизированно.

За два дня Андрей даст жизненно необходимую IT-базу для начинающих биоинформатиков: 🐧 философия Линукс, ключевые команды, хоткеи 🐧 файловая система, пути, права доступа 🐧 взаимодействие с сервером по SSH 🐧 потоки данных, пайплайны 🐧 синтаксис Bash: переменные, условия, циклы и скрипты 🐧 процессы, мониторинг, параллельные вычисления 🐧 работа с текстом, регулярки, nano, vim 🐧 виртуальные окружения, tmux 🚢 Билеты в круиз: agency.blastim.ru/expresslinux

Приятный бонус: если после мини-интенсива вы решите продолжить обучение и зарегистрируетесь на большой курс «Анализ NGS-данных», вы получите дополнительную скидку в размере стоимости интенсива (4 900 руб.)

▶️ Продолжаем разбираться в основах секвенирования Второе занятие недели бесплатного предобучения по курсу «Анализ NGS-данных уже доступно! На этот раз говорим об основных методах: какие платформы существуют, чем они отличаются друг от друга и какие ошибки характерны для разных приборов. И обязательно сделайте ДЗ. Так вы не просто посмотрите очередной видосик, а сможете проверить себя и закрепить материал. Вопросы для самоконтроля:

Что такое UMI? Что такое base calling? В какой технологии секвенирования используется мостиковая ПЦР? А в какой работает метод катящегося кольца? В чем отличие технологий секвенирования 2-го и 3-го поколения? Как рассчитывается покрытие генома? Какие основные этапы включает NGS-пайплайн?

Напоминаем, чтобы получить доступ к урокам, нужно зарегистрироваться в личном кабинете: https://agency.blastim.ru Приятного просмотра!

🔈 Бесплатные занятия по NGS До старта нашего флагманского курса «Анализ NGS-данных» осталось 2 недели, и мы открываем подготовительные уроки для всех желающих! Эти материалы смело можно отнести к мастхэв современной науки, особенно если вы работаете с генетическими данными или интересуетесь биоинформатикой. Минимум академической пыли, максимум того, что пригодится на практике: • познакомитесь с QC и критериями, которые помогут быстро понять, стоит ли продолжать работу с ДНК или библиотекой • заглянете в мир Oxford Nanopore • освежите знания или освоите основы Python и R, без которых анализ данных становится все менее удобным • получите задания, чтобы не просто посмотреть видео, а сразу проверить, что удалось усвоить Для доступа нужно зарегистрироваться в личном кабинете: https://agency.blastim.ru Увидимся завтра 🥰

Клинтриалы в России: онлайн-встреча завершилась, но разговор продолжается Сегодняшний вебинар получился очень насыщенным — обсудили много вопросов, но, конечно, осталось еще немало интригующих тем. И теперь нам хочется вернуться к одному из моментов, который не всегда становится предметом открытого обсуждения: ❓ Сталкивались ли вы со скепсисом в отношении клинических исследований в России? С тем, что отечественным центрам заранее приписывают более низкое качество и воспринимают их как менее подготовленные по сравнению с зарубежными? Но насколько это действительно так? Отвечает Михаил Камха, преподаватель программы ДПО по системе менеджмента от ФББ МГУ:

Коллеги, позвольте задать вам принципиальный вопрос, который часто обсуждается в профессиональном сообществе. Неужели мы, наши врачи и наши научные школы чем-то хуже наших коллег в США, Европе или Китае? Безусловно, нет. Уровень нашей клинической мысли и медицинской экспертизы находится на высочайшем мировом уровне. Однако если мы говорим об управленческих подходах к качеству клинических исследований, здесь нам предстоит сократить определенный разрыв. Мировая практика уже совершила переход от реактивного подхода — постоянного «тушения пожаров», в котором мы порой застреваем, — к проактивной философии Quality by Design и риск-ориентированному управлению. В российском контексте этот вызов имеет свою специфику. Мы активно используем данные из различных медицинских информационных систем в качестве первичной документации. Но как отмечается в современных аналитических обзорах, отсутствие их формальной валидации по стандартам GAMP 5 создает скрытые регуляторные риски и ставит под вопрос соответствие данных принципам ALCOA+ при международных инспекциях. Это не приговор. Это точка роста. А обновленные правила GCP ЕАЭС и гармонизация с ICH E6(R3) дают нам четкий вектор. На нашем курсе я предлагаю вам не просто теорию, а практическую дорожную карту. Мы разберем, как адаптировать международные стандарты ISO и GAMP 5 к российским реалиям, чтобы ваши исследовательские центры не просто соответствовали требованиям, а задавали стандарты качества для всего евразийского пространства и рынков БРИКС.

От обилия новых терминов закружилась голова? Понимаем вас! На этот случай Бластим вместе с Михаилом Камха подготовили гайд «20 красных флагов исследовательского центра», где мы расшифровали бюрократические аббревиатуры и снабдили сложные концепции неформальными пояснениями. Забрать материалы от спикера можно, заполнив форму на сайте: ссылка

🍬 Голая правда про управление качеством в клинтриалс RBQM, CtQ, QTL, KPI, KQI и ALCOA+ — для одних страшный набор букв, а для других — работа, от которой зависит, дойдет ли новый препарат до пациентов. Сегодня в прямом эфире Михаил Камха, преподаватель Передовой инженерной школы МГУ, честно расскажет, как обстоят дела с организацией клинических исследований в российских центрах: что работает, где слабые места и почему привычные подходы нужно менять. А заодно объяснит, какая магия скрывается за сложными терминами и почему без них современная фарма уже не обходится. Начинаем уже в 13:00 мск Каждый зарегистрировавшийся участник получит гайд «20 красных флагов исследовательского центра» от спикера 🤖 Быстрая запись в боте: https://t.me/fbbmsu_bot 🔗 Или на сайте: https://agency.blastim.ru/qms

АНТОН ТИХОНОВ. БОЛЬШОЕ ИНТЕРВЬЮ 💊💊💊 Готово ли человечество к эпидемии хантавируса? Пророчества Бориса Черного сбываются в фарме? Как Брайан Джонсон прошляпил аутоиммунку? Чем ЗОЖ отличается от лонжевити? Почему давление — это классная штука? В июле Вита Степанова встретилась с добрым другом Бластима и опытным экспертом в области RnD лекарств Антоном Тихоновым из «Петровакса». Разговор зашел о самых горячих темах последних лет: Клод Коде и Оземпике, продлении жизни и фармлобби, молекулярных клеях и даже Трое. ➡️ Только на нашем сайте: https://agency.blastim.ru/media/tpost/g82bcv8hb1-intervyu-s-antonom-tihonovim Читайте. Комментируйте. Делитесь #про_карьеру_по_субботам

Индустрия дизайна детей в 2026 году 🗓 Вторник, 25 августа, 20:00 МСК 🎤 Марина Уткина Пока общество спорит, допустимы ли такие технологии с этической точки зрения, услуга уже продаётся. Несколько американских компаний предлагают парам, проходящим ЭКО, ранжировать эмбрионы не только по риску наследственных заболеваний, но и по прогнозируемому интеллекту, росту и продолжительности жизни. На лекции разберём: • полигенный отбор эмбрионов и его реальные возможности; • генетику интеллекта и ограничения генетических прогнозов; • редактирование генома человека; • ПГТ-А, ПГТ-М и ПГТ-P: чем медицинское тестирование отличается от отбора по желаемым признакам; • компании, уже продающие подобные услуги: их продукты, цены и инвесторы; • получение яйцеклеток и сперматозоидов из стволовых клеток и то, как эта технология может изменить репродукцию; • регулирование технологии в США и Великобритании; • происхождение используемых клеток, законодательные ограничения и реальную стоимость процедур. Главный вопрос лекции: где заканчивается доказательная медицина и начинается индустрия обещаний? 🔗 Подключайтесь по ссылке

Онлайн-встреча с Михаилом Камха: от слов к делу Мы уже говорили о том, почему привычные подходы к организации клинических проектов постепенно меняются и зачем исследовательским площадкам переходить к более современным моделям работы. Но закономерно возникает следующий вопрос: а как именно их внедрять на практике? Предлагаем обсудить это в прямом эфире вместе с Михаилом Камха — преподавателем Передовой инженерной школы МГУ на базе ФББ МГУ — уже в это воскресенье, 23 августа, на бесплатном вебинаре в 13:00 мск: «Как провести клиническое исследование в центре так, чтобы "и волки были целы, и овцы сыты", а у аудитора перестал дергаться глаз» Разберемся, как выстраивать процессы, чтобы требования к качеству не оставались только на бумаге, а система действительно работала — и для команды, и для спонсора, и, конечно, для аудитора. Эта встреча будет полезна не только тем, кто уже руководит клинтриалами или исследовательскими центрами. Если вы только начинаете свой путь, учитесь или просто хотите лучше понимать, как устроена эта сфера изнутри, — вам тоже будет интересно! Регистрация в боте: https://t.me/fbbmsu_bot Если не работает, то записывайтесь на сайте: https://agency.blastim.ru/qms#kamkhaweb

🥹 И от бабушки ушел, и от дедушки ушел, а от нас не уйдет. Кто? Хроматин ChIP-seq, ATAC-seq, MNase-seq, DNase-seq — методы изучения хроматина: какие участки ДНК открыты, где сидят белки, как уложены нуклеосомы. У каждого своя логика и свой характерный след в данных. Именно поэтому одна и та же подозрительная картина в одном эксперименте знаменует фиаско, а в другом — ровно то, что вы могли искали. Сегодня в 19:00 мск Александра Галицына расскажет, как отличить шум от настоящего сигнала и на что обращать внимание при контроле качества. 🔗 Моментальная регистрация в боте: https://t.me/BlastimWeb_bot ⚠️ Записи вебинара не будет — ждем онлайн

🎵 Изучайте программу и слушайте аудиоверсию подкаста Михаила Круга Камхи в Бластим

💊 Лучшее в организации клинических исследований — враг хорошего или необходимость? Современный фармацевтический рынок предъявляет к исследовательским центрам новые требования: на первый план выходят понятность процессов и системное управление. Но так ли нужны изменения уже в привычной практике и как перейти к актуальным моделям организации? Об этом нам рассказал Михаил Кахма, преподаватель Передовой инженерной школы МГУ на базе ФББ МГУ:

Уважаемые коллеги, давайте честно взглянем на то, как исторически складывалась практика клинических исследований в наших медицинских организациях и в нашей стране. Долгое время исследования приходили в клинику благодаря личному авторитету главных исследователей, их профессиональным связям или стратегическим целям — например, включению препарата в перечень ЖНВЛП или клинические рекомендации. И мы должны признать: на определенном этапе эта модель работала. Однако парадигма глобального фармацевтического рынка необратимо изменилась. Сегодня, в эпоху внедрения ICH E6(R3), спонсоры и международные CRO перестали оценивать центр исключительно по именам в штатном расписании. Их главный запрос — операционная зрелость и предсказуемость. Если ранее качество данных часто оставалось на откуп личной ответственности врача-исследователя, то современный стандарт требует иного. GCP больше не может существовать изолированно. Это часть сложной матрицы, включающей риск-ориентированное управление качеством (RBQM), валидацию компьютеризированных систем по GAMP5 и строгое соблюдение принципов ALCOA+. Моя задача как преподавателя и практика — не критиковать прошлый опыт, а дать инструменты для будущего. На нашем курсе мы разбираем, как трансформировать исторически сложившуюся практику в отлаженную интегрированную систему управления качеством — систему, которая защитит репутацию вашей клиники, обеспечит безупречное прохождение аудитов и сделает ваш центр магнитом для серьезных исследовательских проектов.

🔗 А если вы впервые слышите о программе ДПО по направлению «Менеджмент» от ФББ МГУ, который упоминает Михаил, — самое время познакомиться с ней поближе: https://agency.blastim.ru/qms

У нас пополнение: к команде легендарного курса «Анализ NGS-данных» присоединилась Александра Галицына 🎉 Друзья, отличные новости: Александра не только прочтет вводный вебинар, но и будет вести основные занятия на самой востребованной программе Бластим. Ура! Александра Галицына — вычислительный биолог мирового уровня и, без всяких преувеличений, человек, находящийся на переднем крае науки о трехмерной организации генома. Еще в школе она увлекалась математикой и биологией, поэтому поступила на ФББ МГУ. Со второго курса Александра занимается хроматином и регуляцией генов. Старт ее академической карьеры практически совпал с активным внедрением Hi-C. Так Александра оказалась среди пионеров области в России.  Саша защитила PhD в Сколтехе. Ее диссертация была посвящена пространственной структуре хроматина в единичных клетках (scHi-C) дрозофилы. Поясним: обычные Hi-C матрицы — это «средняя температура по больнице», сигнал от целого образца. Поэтому ТАДы, хорошо видимые на агрегированной карте, не обязаны существовать в отдельных клеточках. Это требует пристального внимания и особых вычислительных подходов для анализа разреженных single-cell данных. Также в аспирантуре Александра изучала, как меняется хроматин при формировании плодового тела социальной амебы Dictyostelium. Огромный опыт Александра приобрела в постдокторантуре Массачусетского технологического института. В США Александра исследовала фонтаны — необычные паттерны, перпендикулярные главной диагонали на Hi-C картах, которые казались странным исключением, но потом нашлись у многих позвоночных в раннем эмбриогенезе. Также она была вовлечена в проект по расшифровке роли хроматина в иммунитете. В феврале 2026 года публикация про когезин в функционировании дендритных клеток украсила обложку журнала Science Immunology. Александра использует современные методы и интегрирует разные омики — Hi-C, ChIP-seq, ATAC-seq, bulk и scRNA-seq. Также ученая вносит вклад в разработку новаторских биоинформатических инструментов. Например, при ее участии был создан пакет pairtools для удобной трансформации сырых данных секвенирования в хромосомные контакты. Мы очень рады, что Александра будет преподавать в Бластиме. Приходите 20 августа познакомиться и подружиться!

Генетика предполагает, эпигенетика располагает, а NGS всё это раскрывает 🧬 На первый взгляд, начальный этап пайплайна анализа NGS максимально однообразен: получаем риды, базово смотрим качество, картируем на референс. Что может пойти не так? На самом деле очень многое зависит от дизайна исследования. Например, где-то мы хотим равномерное покрытие, а где-то, наоборот, стремимся к ярким пикам. В одном случае мы должны бить в набат, увидев высокий процент дубликатов, а в ином — такой результат ожидаем. Что для определенного протокола может быть важным биологическим сигналом, для другого — признаком жутких технических проблем. Хороший биоинформатик обязан ориентироваться в этой теме как рыба в воде. 20 августа на вебинаре мы научимся читать NGS-данные и использовать разные характеристики ридов для интерпретации эксперимента. Разбираться будем на примере разных «секов» для изучения эпигенома, таких как ChIP-seq, ATAC-seq, MNase-seq, DNase-seq. Бластим пригласил спикера с невероятно богатым опытом в этой области, Александру Галицыну (ФББ, Сколтех, MIT). Не пропустите! Адженда: ➜ Всегда ли нестандартный QC-профиль это плохо? ➜ Чем отличается работа с одним ридом и с парой? ➜ Почему картирование дает отнюдь не только координату в геноме? ➜ Какие показатели почти всегда указывают на артефакты, а когда нужно учесть метод? ➜ Как перейти от сырых данных к осмысленным выводам? Кому пригодится: всем новичкам в бионфе, специалистам, интересующимся эпигенетикой и логикой контроля качества Регистрация по ссылке: https://t.me/BlastimWeb_bot Если не работает, то тут: https://agency.blastim.ru/ngs#galitsyna

ЯМР-вакансии за рубежом Собрали подборку актуальных позиций — от тех, где требуется базовый опыт работы с ЯМР, до предложений для специалистов с глубокой экспертизой в интерпретации данных и управлении ЯМР-инфраструктурой. 🇩🇪 PhD Students | TUM School of Natural Sciences ЯМР белков, misfolding & aggregation, твердотельный ЯМР → ссылка 🇩🇰 Academic Technical Position | Aarhus University LC-MS/MS + NMR, organic & medicinal chemistry Дедлайн: 23 августа → ссылка 🇸🇪 Staff Scientist | Lund University Все основные области химии Дедлайн: 31 августа → ссылка 🇬🇧 Research Associate | University of Manchester High-resolution NMR & J-spectroscopy Дедлайн: 31 августа → ссылка 🇺🇸 NMR Director & Lecturer | Ohio State University Требования: минимум Bachelor’s degree и 2+ лет релевантного опыта → ссылка А если вы на старте карьерного пути или хотите систематизировать свои знания, еще есть последняя возможность попасть на программу ДПО МГУ «Структурная интерпретация спектров ЯМР». 📕 И напоминаем, что для руководителей ЯМР-лабораторий у нас есть бесплатная методичка «Аудит компетенций ЯМР-лаборатории». Она поможет оценить уровень компетенций команды, выявить потенциальные риски и определить точки роста. Забрать практический чек-лист можно просто написав нам @edu_blastim

📚 Объявление: одинокая клетка ищет своего биоинформатика Кажется, что single-cell RNA-seq — это что-то для лабораторий с дорогим оборудованием, большой командой и отдельным биоинформатиком? Не обязательно. Да, экспериментальная часть single-cell действительно не из дешевых и технически сложная. Однако это не отговорка, чтобы его не применять. Например, вы проводите обычное bulk RNA-seq исследование и находите интересный ген. А в каких именно клетках он экспрессируется? Можно обратиться к уже опубликованным scRNA-seq данным и открытым датасетам. Например, найти закономерности, которые не заметили авторы, сравнить результаты разных исследований между собой или использовать их как дополнительный уровень подтверждения собственных находок. А можно пойти еще дальше — разрабатывать на их основе новые методы анализа. Причем даже если большую часть рутины со временем будут делать ИИ-агенты, всё равно важно понимать, что происходит с данными между файлом с матрицей экспрессии и красивым UMAP на последнем слайде. Поэтому мы в Бластим вместе с преподавателями сделали небольшую методичку: «Single-cell RNA-seq анализ: от А до Б», где собрали актуальные инструменты для базовых и более продвинутых задач и полезные ссылки, с которых можно начать самостоятельно. ✏️ Хотите обрадовать своего научника и коллег? Пишите Варваре @varvara_blastim «СИНГЛ СЕЛЛ» и мы пришлем методичку

Резонансная. Магнитная. Ядерная Что? Разумеется, программа курса «Структурная интерпретация спектров ЯМР» от ФББ МГУ им. М.В. Ломоносова! ЯМР — мощный инструмент исследования веществ на молекулярном уровне. Он широко применяется в физике, химии, биологии и фарме. В сентябре наши коллеги проводят курс ДПО, который гармонично сочетает фундаментальные знания о методе с экспериментами на современном оборудовании в условиях, максимально близких к реальности. Итак, расписание: 7–14 сентября | онлайн

Теория пройдет на образовательной платформе ПИШ МГУ. Участники слушают лекции в записи в удобное время и выполняют тесты по каждому блоку.

22–23 сентября | офлайн

Практика состоится на базе ФГБУ «Научный центр экспертизы средств медицинского применения» Минздрава России. Студенты научатся получать качественные спектры на приборе Agilent DD2 NMR System (600 МГц) под менторством опытных экспертов.

Что именно освоят слушатели: 🟢 теоретические основы резонансных методов, ЯМР и импульсной спектроскопии; 🟢 структурную интерпретацию спектров ¹H, ¹³C и ³¹P: анализ химических сдвигов, мультиплетности и интегральной интенсивности, а также работу со сложными спектрами; 🟢 применение современных 2D-корреляционных методов; 🟢 количественное измерение компонентного состава смесей и определение соотношения мономеров в полимерах; 🟢 возможности твердотельного ЯМР для решения специфических задач. Сайт курса: nmr Задавайте вопросы на почту mail@blastim.ru или аккаунт @edu_blastim Регистрация до: 20 августа Осталось: 6 мест

Приходите на семинар 1 + 1 ≠ 2 Математика взаимодействий в терапии старения 🗓 13 августа, 20:00 МСК Спикеры: Максим Лихтер и Лиза Игнатова Пятьсот лет назад алхимики искали эликсир бессмертия. Они смешивали вещества, наблюдали за результатом и пытались разгадать скрытые законы материи. Сегодня у нас есть секвенирование, CRISPR, single-cell omics и эпигенетические часы. Но когда мы объединяем несколько вмешательств в надежде, что вместе они сработают лучше, насколько далеко мы на самом деле ушли от алхимической логики? * Почему эффект двух вмешательств нельзя просто сложить? * Как понять, усиливают они эффект друг друга или мешают ? * Как математически оценить такие взаимодействия, если мы хотим создавать комбинированные терапии старения? Об этом и поговорим на лекции. 🔗 Подключайтесь: https://us06web.zoom.us/j/87647329442?pwd=5YtZDUJbh62MBH25JIxDwbOmcYaeKx.1