Эпидстатус🌡

"Да вы что, издеваетесь" Сложно удержаться от подобной мысли, видя сообщение о изоляции ~1700 пассажиров и членов экипажа теперь уже классического круизного лайнера во французском Бордо из-за кишечных симптомов у 49 из них и смерти 92-летнего мужчины на борту. Распоряжение об ограничении схода на берег принято префектом региона Новая Аквитания, но судно по крайней мере стоит у причала. При этом со ссылкой на компанию-судовладелец европейские СМИ сообщают, что умерший, вроде бы, даже не жаловался на те симптомы инфекционного энтерита, которые поразили других. На борт поднялись медики, заболевших попросили оставаться в каютах. Взяты образцы, и пока сообщалось, что норовирус не подтверждён. Эти негативный результат может быть ещё не окончательным, но также это может быть ротавирус или пищевая токсикоинфекция (бактериальный токсин). В отличие от вояжа "хантавирусного" Hondius'a, здесь — короткий 14-дневный круиз. Предполагается, что строгость мер смягчится, когда будут получены результаты микробиологической диагностики.

Поправка: пару составляют не человек с положительным тестом и человек с симптомами, а человек с лёгкими симптомами и ещё один пассажир. Эти двое находятся в Атланте, тесты не дали положительного результата. Остальные 16 эвакуированных граждан США остаются в Омахе, включая пациента с положительным результатом теста. Таким образом, число подтверждённых и предполагаемых случаев — пока 11.

Получен положительный тест у одного пассажира из Испании. Итого по максимальным оценкам пока 12 случаев (считая человека с ПЦР+ без симптомов, и его/ее партнёра с симптомами, но без ПЦР+). Состояние французской пассажирки, у которой симптомы появились после схода с судна, и ПЦР подтвердил вирус, к сожалению, ухудшается. Планируется медицинская эвакуация британского пациента с острова Тристан-да-Кунья. Лайнер движется в Роттердам, на борту вместе с 25 членами экипажа остаются 2 медицинских специалиста. Тело умершей пассажирки также остаëтся на борту судна до его прибытия, ориентировочно, 17 мая.

Ареал длиннохвостого рисового хомячка (Oligoryzomys longicaudatus). Данные: IUCN Red List, 2025-2. Карта/рельеф: см. атрибуцию на изображении. На изображении — границы обитания основного вида-хозяина вируса Андес, которого местные также называют colilargo. Как можно видеть, ареал не распространяется на острова Огненной Земли (архипелаг на южной оконечности материка). Да, есть пара других видов-хозяев, один точно есть на островах, но это тоже не синантропные виды (точно не живут на судах и вряд ли — на свалках). Как упоминал раньше, отлов грызунов и анализ близ Ушуайи все равно анонсировали, но натуралист-орнитолог заразился почти наверняка ранее прибытия туда (симптоматика с 6 апреля). Наверно, приветствуется переслать пост тем, кто повторяет про свалку. #хантавирусы #эпидрасследование

А, нет, вижу комментарий д-р Оливье, эпидемиолога и сотрудника ВОЗ — они не посчитали этот случай подтверждённым именно из-за неубедительных результатов тестирования. Таким образом, для ВОЗ — 9 случаев, из них 7 подтверждены лабораторно.

Интересно, что это рассогласуется с более ранним заявлением, а также с рекомендациями Европейского центра контроля инфекционных заболеваний по организации работы с пассажирами лайнера, согласно которым тестирование бессимптомных лиц не предполагается в силу его ограниченной полезности. При этом тесты для лиц с проявившимися симптомами должны были быть проведены по прилёту пассажиров, но заявляется о изоляции бессимптомного случая ещё во время перелета. По всей видимости, это результат сортировки по результатам опросов о контактах с подтвержденными случаями на судне в соответствии с рекомендациями (не исключено что и анализа данных видеонаблюдения в общественных пространствах лайнера).

Речь не о сомнениях в результате теста ("mildly PCR positive"), скорее всего, а о том, что вирусная нагрузка не является высокой — эта деталь понятно почему интересна (высокая ассоциирована с большей заразностью).

UPD: хантавирус подтвердился у французской пассажирки. Её состояния ухудшается. У остальных тестирование дало отрицательный результат, симптомы у них отсутствуют. По всей видимости, тестирование было проведено у всех пассажиров, вывезенных спецрейсами по крайней мере во Францию и США. Число заболевших, считая умерших, достигло 10 человек.

У одного гражданина США, вылетевшего вчера репатриационным рейсом, ПЦР-тест дал положительный результат. Об этом сообщает Министерство здравоохранения США в официальном аккаунте в соцсети. При этом у него пока отсутствуют симптомы, тогда как у ещё одного пассажира симптомы отмечены. Сообщается, что оба на борту рейса в США находились в изолированном отсеке. Интересно, что у бессимптомного пассажира имеются результаты тестирования, а у человека с симптомами о результатах не сообщается. Таким образом, известно предварительно (в заявлении Министерства упоминается об "умеренной" позитивности теста, и ПЦР, как любой тест, может быть ложноположительным), что всё это время на борту оставался человек с инфекцией. В силу этого сроки самоизоляции и наблюдения для пассажиров, скорее всего, не будут учитывать время, проведённое на судне с момента эвакуации 3 человек 6 мая, у двоих из которых диагноз подтвердился. Премьер-министр Франции также в соцсети рассказал о гражданине страны, у которого появились симптомы во время перелёта. Он был отделён от остальных. На остров Тристан-да-Кунья, самое отдалённое владение Великобритании, где проживает гражданин Великобритании, сошедший с борта HV Hondius, высадилась группа из шести десантников и двух врачей из 16-й воздушно-десантной бригады. Я сначала хотел написать о 8 десантниках, 2 из которых — врачи, но в исходном тексте BBC все точно: 2 десантника осуществили прыжок в связке с врачом и медицинской сестрой отделения интенсивной терапии. Также на остров сброшены баллоны с кислородом (и всего 3,3 тонны медицинского груза). Симптомы у местного жителя проявились 28 апреля в виде диареи и затем лихорадки два дня спустя, но сейчас он нуждается в кислороде, хотя, как сообщается, его состояние стабильно. Всего на острове проживает 221 человек.

Апдейт по результатам тестирования и клинического наблюдения За прошедшее время число случаев заражения хантавирусом Андес, подтверждённых или вероятных*, не изменилось — 8. Только произошла рокировка. У ранее эвакуированной с борта судна гражданки Германии, путешествовавшей вместе с пассажиркой, скончавшейся во время круиза, не развились симптомы, а результаты тестирования (как ПЦР, так и серологии) в госпитале Дюссельдорфа показали отрицательный результат. Так как прошло уже более 5 недель с момента контакта, что близко к максимальной известной продолжительности инкубационного периода, после получения отрицательных результатов тестов она считается здоровой. Сошедший на берег в Тристан-да-Кунья 14 апреля пассажир лайнера сообщил о симптомах, появившихся 28 апреля — в виде диареи, а два дня спустя – лихорадки. Такое сочетание неспецифично, но весьма подозрительно, пассажир находится в изоляции. Результатов тестирование пока ещё не получено, видимо, из-за недоступности тестов на месте пребывания. UPD: отрицательный (весьма ожидаемо) тест у гражданки Испании, летевшей в одном самолёте с о. Св.Елены с умершей в Йоханнесбурге женщиной. ------------------------------------------------------------------ * ВОЗ использует следующую систему ранжирования для этой вспышки: Подозрение на заражение: любой человек, который находился в транспортном средстве, в котором побывало лицо-подтвержденный или предположительный случай заражения вирусом Андес, и у которого имеются острые (или имеющиеся в анамнезе) симптомы, соответствующие инфекции, включая лихорадку (38°C или выше), миалгию, озноб, острые желудочно-кишечные (например, тошнота, рвота, диарея, боль в животе) или острые респираторные (кашель, одышка, боль в груди, затрудненное дыхание) симптомы. Вероятный случай: человек с признаками и симптомами предполагаемого случая, обследованный медицинским работником, и с известной историей эпидемически значимого контакта с подтвержденным или вероятным случаем заболевания вирусом Андес, для которого лабораторные исследования не проводились. Подтвержденный случай: человек с лабораторным подтверждением наличия вируса Андес методом ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) или позитивным серологическим тестом. Неслучай (non-case): предполагаемый или вероятный случай заболевания, у которого тест на хантавирус Андес методом ОТ-ПЦР или серологическим методом дал отрицательный результат. Лица, не являющиеся больными, но у которых после отрицательного теста и в течение максимального инкубационного периода после последнего контакта с вероятным или подтвержденным случаем заболевания развиваются симптомы, соответствующие определению предполагаемого случая, должны быть повторно протестированы и соответствующим образом переклассифицированы.  #вспышка #хантавирусы

MV Hondius прибыл сегодня около 8:30 по МСК в испанский порт Гранадилья на Тенерифе. Пассажиров высаживают с соблюдением строгих мер биобезопасности Трансляция Associatied Press Судно бросило якорь в технической зоне порта, не у причала. Пассажиров перевозят группами к медицинскому лагерю на берегу на небольших лодках катерах. Организован защищённый санитарный коридор. Вывоз групп граждан с судна координируется с готовностью чартерных санитарных рейсов для репатриации. Самолёты для эвакуации своих граждан направили Германия, Франция, Бельгия, Ирландия и Нидерланды, США и Великобритания. Испания также заберёт своих граждан с Канарских островов на континент. Сообщалось, что ещё 2 самолёта будут направлены за гражданами других стран ЕС. Последний самолет должен вылететь в Австралию. Вывоз пассажиров должен занять 2 дня. По прибытии на родину люди с борта судна будут оставаться под наблюдением (наблюдние не означает изоляцию в госпитале, каждая страна будет сама определять санитарный режим для своих граждан, но, вероятно, все будут задействовать карантин на первом этапе). Глава Всемирной организации здравоохранения д-р Гебреисус находится на Тенерифе, чтобы лично следить за процедурой. Багаж пассажиров остаëтся на судне. Примерно половина экипажа (около 30 человек) останется на борту, чтобы осуществить технический рейс в порт приписки Роттердама, где судно пройдёт дезинфекцию. В составе экипажа есть один гражданин России и 5 граждан Украины. Ни у кого на борту на момент прибытия судна нет симптомов заболевания.

Поправил пост, теперь он читаем, но потом может быть ещё раз отредактирую, когда появится время на Ч. 2

Удивительные подробности о диагностике южноамериканского хантавируса. Ч. 1 Для меня это стало открытием, но оказывается, лабораторные службы даже в развитых странах не могут просто взять и поставить точный микробиологический диагноз — ортохантавирус Андес. У них просто отсутствуют для этого валидированные диагностические инструменты (наборы реактивов, также называемые диагностикумами). Поскольку Андес эндемичен для Южной и Центральной Америки, и он не вырывался за свои географические пределы, что в целом характерно для ортохантавирусов (это, напомню, связано с прочностью их связи со своими основными природными хозяевами — определёнными видами грызунов), в других регионах мира поддерживалась разработка и производство тестов, адаптированных к местным хантавирусам. Например вирусы "мышиной лихорадки" Европе и России. Благодаря тому, что и в геноме, и, как следствие, в структуре белков есть консервативные участки, сходные внутри семейства, такие тесты могут обладать достаточно широкой перекрёстной специфичностью, благодаря которой и удаётся установить или предположить рамочный диагноз "хантавирус". Но это не обеспечивает надёжность таких тестов. Для последнего (обеспечения наивысшей надёжности, то есть чувствительности и специфичности), а также для распознавания конкретного хантавируса, в этом случае —Андеса, требуются разработанные под конкретный вирус тестовые панели. Причём в случае ПЦР для не слишком изученного* РНК-вируса (РНК-вирусы — наиболее генетически нестойкие объекты, из-за специфики работы, а, проще говоря, низкой точности их полимераз**, их геном постоянно "плывёт", как иногда "плывут" мои посты, если я по 6 раз в день исправляю в них опечатки) очень желательно регулярно проводить сопоставление референсной генетической последовательности для теста с актуальной картиной циркулирующих вирусных геномов. Иначе есть риск, что один из этапов ПЦР-теста — точное комплементарное связывание искусственно синтезированной и последовательности вируса в образце, — станет работать хуже. В этой связи кто-то из читателей может вспомнить, что некоторые наборы для ПЦР-диагностики ковида одно время даже перестали срабатывать в отношении наиболее быстро меняющейся мишени, гена S-белка, и это даже позволяло (при условии наличия в подобном наборе ещё 2 резервных мишеней, по которым сигнал сохранялся) отличать начавший циркулировать омикрон от более ранних вариантов. Осуществлять такую работу могут страны, на чьей территории вирус циркулирует в естественных условиях (и откуда и попал на борт лайнера). В данном случае Аргентина отправила в европейские страны, Сенегал и ЮАР материалы для проведения 2500 тестов согласно своим одобренным протоколам для Андеса — это как минимум эталоны для контроля ПЦР, а также ИФА-планшеты с сорбированным антигеном именно этого вируса. Речь идёт не о коммерчески доступных продуктах ("коробках"), которые могут использовать любые медицинские лаборатории, а о компонентах набора "сделай сам", пользоваться которыми будут только наиболее высокоуровневые лаборатории в вовлечённых странах, чтобы минимизировать риск ошибок. Интересно, что теоретически такие лаборатории могли бы и сами синтезировать необходимые генетические последовательности для ПЦР, просто получив от Аргентинского министерства здравоохранения нужный файл в электронном письме (подобное было реализовано в начале пандемии COVID-19). Но централизация производства в Аргентине и всеобщая приверженность использованию протоколов и образцов оттуда должна существенно повышать сопоставимость результатов между лабораториями во всех странах. * — в отношении поведения его генома, но не в смысле возможной мутации, которая, например, сделает вирус гораздо заразнее (это уже другой уровень), а в смысле районирования участков генома, как более стабильных и подверженных изменениям. ** — ферменты, синтезирующие нуклеиновые кислоты (НК; в данном случае РНК, РНК-полимеразы) на матрице материнской молекулы.

Предупреждение: пост про не про эпидемиологию как таковую. Ещё когда дописал этот пост, хотелось высказать несколько слов о пожилой нидерландской путешественнице. Представляете, каким тяжёлым и драматичным был последний отрезок её жизни? Вы с супругом вместе отправляетесь в необычный вояж на необычном судне после путешествия по Южной Америке, вы в окружении интересных людей, и многие — ваши соотечественники... Но вот ваш муж внезапно заболевает и умирает за тысячи километров от дома и вообще большой земли. Вы сходите на берег острова, сопровождая его тело, вероятно — уже сами достаточно нездоровы, вас ждёт сложный маршрут... То, чего вы хотите, вероятно, сильнее всего — это быстрее добраться домой. Но в аэропорте чужой страны вас ссаживают с рейса (ради вашего же блага, и, надеюсь, сразу — к бригаде медиков). В итоге ваша жизнь обрывается, но её последние дни становятся причиной сложностей и волнений других людей на родине и в других странах. Вирус с лайнера не несёт никакой реальной угрозы для абсолютного большинства людей в Евразии и где бы то ни было за пределами Южной Америки, исключая само судно. Но значимость трагедии определяется не только еë масштабом, но и теми страданиями, которая она причинила — даже отдельным людям. И да, наверное, именно просто отпустить эту женщину в путь со Святой Елены без какого-либо привлечения внимания медицинских служб — это самая серьёзная ошибка судового врача (если, конечно, она не скрыла от него свое недомогание).

Так как ситуация развивается по вполне контролируемому сценарию, канал на данный момент прекращает работу в режиме часто обновляемой ленты актуальных новостей. Новые посты об этой мультитранснациональной чрезвычайной ситуации в области здравоохранения, без сомнений, ещё планируются, и в случае каких-то внезапных смен тренда будет возврат к жанру ежедневного обновления ленты текущих событий, но наверняка ничего такого просто не произойдёт (возможен, правда, вторичный кластер из нескольких случаев, если окажется заражённым ещё кто-то из сошедших на Св. Елене). Пользуясь случаем, я благодарю Алексея Валерьевича Водовозова, Альфа всея Руси и просто великолепного медицинского писателя и журналиста, а также профессора Анчу Баранову, самородка Пензенской земли в чудовищном, как мне представляется из своего дальнего Подмосковья, по сложности мире американских институтов, за упоминание этого канала, и приветствую всех новых читателей! Канал обычно не обновляется так часто, как это было в последние дни (поэтому, кстати, его легко пролистать выше и найти что-то ещё, что, может быть, окажется интересным), но если речь идёт о каких-то актуальных событиях, я стараюсь делать посты как можно более информативными и опирающимися на источники, надёжность которых либо подтверждается их статусом, либо самим содержанием.

Ждал обновления от Oceanwide Expeditions по ситуации на борту судна, чтобы закрыть пост, но они скорее всего разумно решили не отчитываться слишком часто о состоянии пассажиров. А вот о чем они могли бы рассказать: врач на скриншоте из канала CNN выше, д-р Стивен Корнфилд, был одним из отдыхающих на борту, но с 1 мая фактически сменил судового врача, когда узнал от команды, что тот болен. Таким образом, умершая на борту пожилая женщина и два члена экипажа, включая судового доктора, оказались его пациентами. Разумеется, когда доктор узнал о болезни коллеги, он понял, что они могли столкнуться с заразным инфекционным заболеванием, поэтому старался по возможности пользоваться средствами защиты (халат, маски, что-то для защиты глаз — может быть очки для плавания или маска для снорклинга — то, что было в доступе), часто мыл руки. На борту судна чрезвычайно ограничены возможности по оказанию медицинской помощи, поэтому доктор рисковал заразиться, возможно, не столько ради проведения каких-то значимых медицинских вмешательств (может быть, если в канале есть врачи, они меня поправят), сколько ради того, чтобы заболевшие в десятках дней пути от мест, где им смогут оказать помощь, не чувствовали себя оставленными. Очевидно, на момент интервью доктор Корнфилд чувствует себя хорошо.

Хантавирус Андес: результаты тестов контактных лиц предсказуемые и обнадеживающие Результаты ПЦР-тестирования нидерландской стюардессы, работавшей с умершей от хантавируса участницей круиза на борту MV Hondius, отрицательные. Еë серологический анализ на IgM (ранние антитела) к хантавирусам также отрицательный. Результаты ПЦР-тестирования немецкой пассажирки лайнера, путешествующей с умершей от хантавируса на борту соотечественницей, также отрицательные. Поправка: результаты не были оглашены, но так как прошло достаточно времени даже с учётом потребности в доставке референсной РНК*, можно с высокой уверенностью предпологать, что они пока негативны. ------------------------------------------------ * нет готовых ПЦР-наборов для диагностики вируса Андес, поэтому тестирование возможно в ограниченном количестве центров и занимает больше времени. Жена швейцарского пациента, также находившаяся с ним на борту лайнера, остаётся под наблюдением. О появлении у неё симптомов не сообщалось. Тесты будут проведены повторно у всех лиц, находившихся в длительном контакте с заболевшими на борту, и у всех контактных лиц, у которых отмечались неспецифические симптомы (помимо стюардессы, известно ещё о двух лицах с борта рейса в Нидерланды, прошедших тестирование из-за симптомов). Француз, находящийся под наблюдением — один из 8 граждан Франции, контактировавших с всё той же несчастной пожилой пассажиркой во время её пути со Святой Елены в Йоханессбург. Тестирование проводится из-за лёгких симптомов, но мы не знаем даже, был ли этот человек наиболее близко контактировавшим с покойной. Чем более широкий круг контактных лиц будет рассматриваться, тем, разумеется, выше вероятность того, что в нём окажутся люди с каким-либо недомоганием. Если круг отслеживаемых контактов людей с подтверждённым заражением (не пассажиров лайнера как таковых) будет расти, исчезнет смысл обращать большое внимание на сообщения о лёгких симптомах у кого-либо из них. Обновление по результатам тестирования: отрицательно и у двух контактных лиц с борта рейса в Нидерланды. #вспышка #хантавирусы

Пост для апдейтов по ситуации с вспышкой хантавируса на экспедиционном лайнере MV Hondius: #хантавирусы #вспышка #эпидрасследование 1. В релизе ВОЗ указано, что лайнер отплыл из Ушуайи (Аргентина) 1 апреля. На самом деле это было повторное отплытие после возвращения в порт 31 марта из похода к берегам Антарктиды. Эта предыдущая часть круиза началась 20 марта. Тем не менее какие-то пассажиры закончили круиз на этом этапе, а какие-то поднялись на борт, в том числе пожилая пара из Нидерландов, ставшая индексными пациентами. 2. Сообщается, что стюардесса нидерландской авиакомпании KLM госпитализирована после контакта с умершей в Йоханнесбурге 69-летней соотечественницей. Женщины контактировали, когда умершая села на самолёт в Нидерланды, с которого её затем сняли из-за еë состояния. Проводится тестирование. Тревожно, что сообщается о лёгких симптомах. Но ранние симптомы неспецифичны, поэтому это может быть что-то другое. 3.

именно самолёт с бессимптомным пассажиром испытывает трудности. Видимо, речь действительно о отказе системы, обеспечивающей изоляцию/биобезопасность на борту. 2 больных члена экипажа встречены медицинскими службами

Не буду исправлять пост в третий раз, но все-таки бессимптомный пассажир (сообщается, что это 65-летняя женщина, сопровождавшая третьего умершего пассажира, оба из Германии) прилетел(а) в Нидерланды на первом самолёте вместе с заболевшим судовым врачом. Второй член экипажа, чей самолёт столкнулся с проблемами, уже тоже доставлен в пункт назначения. Все госпитализированы. Гражданка Германии — в госпиталь Дюссельдорфа. Симптомов у неё всё ещё не отмечается. 4. В 17:00 по Мск должен состояться брифинг главы ВОЗ по ситуации. Всё ещё считаю, что это продиктовано избыточной реакцией (не столько общественности, сколько властей — региональных на Канарских островах, правительства Кабо-Верде, именно их реакция создаëт основной резонанс). Буду сильно удивлён, если хантавирус подтвердится у голландской стюардессы. 5. Компания-оператор круиза и судовладелец утверждает в своём очередном релизе (публикуют в среднем два в день здесь), что после эвакуации троих человек на борту нет бессимптомных людей с вирусов. Природа такой уверенности загадочна, и скорее всего не основывается ни на чем, кроме того, что с момента объявления режима изоляции уже прошло какое-то время, за которое ни у кого не появилось новых симптомов. Лайнер снялся с рейда у Кабо-Верде в 21:15 по Мск и лёг на курс к о. Тенерифе, в порт которого должен зайти через 3-4 дня, если власти Канарских островов не создадут препон. 6. В релизе выше компания Oceanwide Expeditions также прилагает список пассажиров из разных стран, завершивших круиз 24.04. на Св. Елене. Это 28 человек (30 за вычетом умершей пары), которые отправились разными маршрутами домой или куда-либо ещё. Опасность может грозить в первую очередь их здоровью и жизни, а не кому-то ещё. Oceanwide Expeditions разослала письма-предупреждения — получив такое письмо, пассажир из Швейцарии, у которого был обнаружен вирус, обратился в медицинское учреждение. 7. У эвакуированного с судна члена экипажа подтверждён хантавирус. На брифинге ВОЗ упомянули о подтверждении диагноза и у второго эвакуированного. По контактным лицам, у которых не отмечено симптомов, результатов либо ещё нет, либо они не будут объявлены до тех пор, пока тестирование не будет проведено повторно (этого требует протокол, что обосновано в том числе коротким окном позитивности РНК вируса в крови — говоря просто, единичный тест легко может оказаться ложнонегативным).

Нидерландский медицинский самолёт, перевозивший, по всей вероятности, обоих заболевших членов экипажа, включая судового врача, как сообщается, получил отказ электроснабжения систем пациента (речь наверняка не о ИВЛ, состояние больных не было критически тяжёлым, скорее системы мониторинга и/или подачи лекарств, либо систем биозащиты). Самолёт остался в аэропорте Канарских островов, где внепланово приземлился, подключенный к электроснабжению аэропорта. Источник в министерстве здравоохранения Испании заявил, что для транспортировки потребуется новый самолёт. Второй борт, перевозивший бессимптомного пассажира, сопровождавшего умершего на судне гражданина Германии, прибыл в Амстердам. UPD: согласно обновлению, выпущенному компанией-судовладельцем, именно самолёт с бессимптомным пассажиром испытывает трудности. Видимо, речь действительно о отказе системы, обеспечивающей изоляцию/биобезопасность на борту. 2 больных члена экипажа встречены медицинскими службами в Нидерландах. UPD-2: см. следующий пост.