Бластим: курсы и работа в биотехе

🤖 Я видел такое, чего вам, кремниевым, и не высчитать... Современные нейросети вдохновлены устройством мозга, но всё же работают иначе. Да, они тоже учатся, ошибаются, запоминают. Но за «интеллектуальностью» скрывается всё тот же бинарный код для последовательной обработки данных. 💬 А стоит ли усложнять? Сегодняшние ИИ работают на кремниевых чипах, которым трудно справляться с задачами на тысячи параллельных операций. Даже графические процессоры (GPU), ставшие основной платформой для нейросетей, далеки от пластичности живых систем. А биологические нейросети потенциально могли бы: • обрабатывать информацию параллельно при минимальном потреблении энергии • адаптироваться к новым условиям • восстанавливаться после повреждений Такие свойства делают биочипы привлекательной основой для будущих поколений ИИ. Особенно если речь идет об интеграции с живыми тканями. Звучит как sci-fi, но в 2024 году швейцарская компания FinalSpark уже представила прототип первого биопроцессора. Ещё раньше, в 2022 году, австралийский стартап Cortical Labs научил нейронную культуру играть в Понг. Весной 2025-го он же анонсировал создание первого в мире биологического компьютера CL1. Заявление вызвало волну скепсиса — отчасти из-за преувеличений в медиа для инвестиционной привлекательности. Да и речь пока идет не о компьютерах в привычном смысле. Это скорее «органы», способные чувствовать стимулы и изменяться в процессе обучения. Но наличие самого вектора развития технологий очевидно. Вот и интерфейсы «мозг — компьютер» для интерпретации сигналов, о которых мы писали, уже не кажутся чем-то фантастическим. 💬 А можно создать биокомпьютеры на уровне молекул? Интерес к молекулярным вычислениям возник ещё во второй половине XX века и стал предвестником синтетической биологии. Если традиционные компьютеры оперируют бинарным кодом, то биологические — генетическим. Изменяя ДНК, ученые могут буквально программировать клетки для выполнения конкретных задач. В 1994 году Леонард Адлеман впервые продемонстрировал потенциал ДНК-компьютеров, использовав молекулы для решения комбинаторной задачи. А в 2019 году биосистема на основе ДНК уже извлекала корень из 900. Правда, масштабирование таких решений остается крайне сложной задачей. А еще ДНК — не единственный кандидат: в 2016 году были показаны возможности параллельных вычислений на белках. Метафора «машины» помогает нам лучше изучать и понимать живые системы, даже проектировать их. Но если сводить биологию к булевым функциям, мы рискуем недооценить ее масштаб. Так что, кто знает — возможно, самый мощный компьютер не соберут, а вырастят. #бластим_технологии

⚡️ WANTED: специалист ИФА в Сколково Unigent ищет внимательного и аккуратного лаборанта для проведения иммуноферментных анализов. Обязанности: • Проведение ИФА по утвержденным протоколам • Приготовление растворов и рабочих смесей • Документирование и первичная обработка результатов в Excel • Контроль наличия расходников и реагентов, базовое обслуживание оборудования • Поддержание порядка в рабочей зоне • Поиск и анализ научной литературы Требования: • Опыт работы с ИФА от 1 года • Навыки приготовления растворов и работы с лабораторным оборудованием • Знание основ иммунологии и биохимии • Уверенное владение Excel • Аккуратность, внимательность и умение работать в команде 📌 Работа в Сколково 📌 Частичная или полная занятость 📌 Оформление по договору 📌 Зарплата обсуждается индивидуально, ориентир 60 000 – 90 000 ₽ Откликнуться: https://blastim.ru/job/6327/ #бластим_вакансии

Ваши данные не должны ждать в чужой очереди 🙅‍♂️ Результаты экспериментов уже лежат на диске, а у лабного биоинформатика свой «список приоритетов»? Когда дойдет дело до ваших ридов, никто не знает. Такими темпами конкурирующая группа вас точно заскупит... Или вы пишете грант и понимаете, что анализ NGS-данных сделал бы его сильнее? Только вот реализовать это некому... Если вы устали зависеть от чужой помощи, наш курс «Анализ NGS-данных» станет палочкой-выручалочкой. На нем вы разберетесь во всех ключевых направлениях работы с NGS и сразу примените знания на своих задачах. С чем разберемся ❓ • QC и картированием ридов • Анализом данных WGS и WES • Сборкой геномов и филогенетикой • RNA-seq и single-cell • Метагеномикой Почему именно курс от Бластим ❗️ • Преподаватели — практикующие биоинформатики из топ-вузов • Почти 400 выпускников за 3 года • Диплом гособразца • Формат обучения очно в Москве или онлайн • Поддержка кураторов и комьюнити выпускников навсегда 🔗 Все детали и программа: clck.ru/3NpLg8 🚨 Во вторник цена курса поднимется. А если вы уже прошли наш мини-курс по Linux, мы предоставим дополнительную скидку равную его стоимости! По всем вопросам пишите Наташе — @kova_24 Пора взять свой проект под свои пальцы

👩‍💻 Репортаж второго дня с мини-курса по Linux ⚠️ Attention ⚠️

Много практики! 

Что мы сделали до 12: — подключились по SSH к серверу — разобрали новые команды: scp, gzip, в общем то, что нужно, чтобы работать с файлами (архивация, разархивация, скачивание) — знаем, что нужно делать, чтобы сессия не закрывалась — поигрались с alias

🐳 — если используете их в работе комментарий — расскажи как именно)

🐧 Сегодняшний день определенно сложнее Однако преподаватель Андрей Томаровский приводит примеры из биоинформатики, отвечает на все вопросы — и в целом выходные проходят хоть и учебно, но здорово и необычно (особенно если ты раньше никогда такого не делал) Если вдруг решите присоединиться, то еще не поздно: записи и поддержка преподавателя будет: https://clck.ru/3NpNi5 👩‍💻

👩‍💻Первый день походит к концу, но впереди еще практика на сервере А пока небольшое саммари: — разобрались с основными командами и фишечками по типу * — директориями, файлами и видами ссылок — подключение по ssh к серверу — научились грепать последовательности нуклеотидов 🧬 Большой плюс мини-курса в том, что на любой вопрос можно сразу получить ответ и разобраться без провальных попыток найти информацию в сети 🥲 Все же для Linux существует порог входа, поэтому самостоятельно изучать достаточно трудно, особенно, если ты врач или биолог 🐳 — если пока не сидишь без Linux Записи занятий будут доступны целый год — и еще не поздно попасть на завтрашнее мощное занятие — https://clck.ru/3NohK2

👩‍💻 Репортаж первого дня с мини-курса по Linux ⚠️ Attention ⚠️

Курс рассчитан на пользователей без опыта

В первый час участники узнали: — историю первых компьютеров и создание Linux — что же такое терминал Linux и как с ним работать — как подключаться удаленно к серверам в том числе используя Windows Что ж, оставайтесь в нами — репортаж продолжается

🤓 Что сильнее всего запоминается студентам после наших курсов? Их ошибки! Точнее то самое удовольствие, когда баг наконец-то пофиксили. Главное, чтобы вместе с ошибками в памяти оставались и решения... А что ещё особенно нравится выпускникам курса «Анализ NGS-данных»? Мощная программа 💎 Пять крутых преподавателей не только объясняют всю базу, но и делятся самыми актуальными подходами в своих областях. В результате вы разбираетесь с рабочими задачами «здесь и сейчас» + расширяете горизонты ресерча. Записи занятий остаются с вами 📼 Можно сделать шаг назад, пересмотреть материалы и разобраться в любой теме, ничего не упустив. А ещё освежить знания уже после курса. Новички не тонут 🆘 Даже если программа сначала кажется «ого, как много», рядом всегда преподаватели, ассистенты и кураторы. Подстрахуют, вытянут и помогут разобраться. И для тех, кто уже в теме 🧐 Всё раскладывается по полочкам, серые зоны исчезают, понимание становится цельным, появляются новые интересы. Сообщество — это сила ✉️ Чат, научные мемасики, ночные дискуссии, быстрые ответы и поддержка единомышленников. Учеба веселее, а мотивация только растет. Формат подстраивается под вас 🌎 Онлайн, офлайн или гибрид — всё четко и работает в любых обстоятельствах. Проверено временем и студентами. Только начинаете погружение в анализ NGS? Необязательно сразу нырять в полный курс — начните с легкого старта. Уже завтра запускается доступный и полезный двухдневный «Экспресс Linux для NGS». Познакомьтесь с Бластим и своей новой рабочей средой лично: clck.ru/3NnUwF

Мы долго готовились, и вот — пробил час! ⚔️ 24 августа открываются врата квеста по CRISPR/Cas! Чтобы овладеть магией редактирования генома, вам предстоит пройти Испытания Академии Магии 🗺 Первая локация — Лабиринт Именно там вас ждут первые испытания:

🧩 задачи разного уровня сложности 💬 общение с другими искателями знаний в чатике ⌛️ прохождение в удобное время

🏆 Победители будут определены по количеству баллов за правильные ответы Начало квеста: 24 августа, 10:00 по мск в нашем чатике Когда встретите других игроков — расскажите о себе 😉

Artgen Seed Fund предлагает стартапам Biotech и MedTech шанс на развитие В России действительно не так много фондов, которые понимают биотех и медтех «изнутри». Artgen Seed Fund — это посевной венчурный фонд, созданный Artgen Biotech специально для поддержки стартапов в сфере здравоохранения. Фонд готов инвестировать до 150 млн рублей за первые 3 года, а дальше планирует масштабироваться за счёт привлечения сторонних инвесторов. Кого ищем? Стартапы на стадиях pre‑seed (идея, прототип) или seed (MVP, доклинические данные) В сферах: AI, Longevity, генетическая терапия, нейронаука, системы поддержки врачей, цифровое здравоохранение, персонализированная диагностика, онкология Что предлагается: Конвертируемый необеспеченный заем. Экспертное сопровождение и менторство, доступ к клиникам и инфраструктуре, помощь в масштабировании. Возможность получить акселерационную поддержку через экосистему Artgen Biotech. Сигнал для других инвесторов — «штамп качества» от Artgen. Мы в Artgen Seed Fund продолжаем изучать проекты на стыке биотеха, медицины, медтеха и ИИ. Если ваш проект решает реальные задачи, имеет научную основу и потенциал масштабирования — будем рады познакомиться. Подать заявку можно через форму на сайте: https://artgenseedfund.ru – туда же можно отправить питч-дек на seedfund@artgen.ru #Артген #Biotech #MedTech #SeedFund #Стартапы #Здравоохранение #AI #Онкология #Longevity

🎭 Без лица, но с профилем ДНК Иногда преступник уходит, не оставив следа. Почти. Остается только молчаливый свидетель — ДНК. Ранее мы рассказывали, как судебная генеалогия (IGG) помогает вычислять преступников через их дальних родственников в открытых базах данных. Но что, если нет совпадений даже там? ⌛️ Можно ли установить внешность только по генетическому коду? Мы всё больше узнаем о том, какие гены связаны с внешностью и как именно. Впервые фоторобот, созданный на основе ДНК-фенотипирования — попытки «прочитать» внешний облик человека по его генетическому коду — был обнародован в 2015 году в рамках расследования убийства. Тогда алгоритмы от компании Parabon NanoLabs сопоставили SNP-маркеры с возможными чертами лица и выдали статистически обоснованный прогноз. С развитием технологий метод начали использовать всё чаще. Но из-за невысокой точности и «размытости» портрета он редко служит решающей уликой в суде. Технологию все время апгрейдят. Так, весной этого года китайские исследователи представили Difface — мультимодальную модель ИИ нового поколения для реконструкции 3D-изображений человеческого лица. Для её обучения использовалась база данных, содержащая 3D-снимки лиц и SNP-профили почти 10 000 представителей ханьской народности. Difface с высокой точностью совмещает ДНК-данные с визуальной реконструкцией и позволяет учитывать возрастные изменения. Но, конечно, технология ещё далека от совершенства. Это впечатляет. Или пугает? Снова всплывают этические вопросы: • Можно ли использовать ДНК из открытых баз, если человек — не подозреваемый? • А если лицо получится лишь «похожим», но не точным — может ли это стать причиной ложного обвинения? • Где проходит граница между поиском справедливости и тотальной слежкой? 🐧 Одно можно сказать точно — курс по Linux стартует уже в эту субботу. А значит, пора действовать: https://clck.ru/3NjoF8

Уверенный пользователь Word? Исправим на посерьезнее 🚨 «Терминал», «командная строка», «SSH» — и всё, паника... Освоение современных инструментов для анализа данных откладывается на «потом»? Даже если вы взрослый и осознанный: вроде нужно, но слишком много деталей, легко запутаться, да и пока «не очень в ресурсе». Приближать «потом», конечно, никто не собирался 🤫 А может, обойдусь? Да, обойтись можно. Но вы лишаете себя универсального навыка, который очень скоро станет таким же базовым, как когда-то «уверенный пользователь ПК». Согласитесь, такая строчка в CV сегодня выглядит умилительно 🙂 Лайфхак: учиться в группе под руководством опытного преподавателя проще и веселее: — шаг за шагом, от простого к сложному, только самое необходимое, без перегруза — у вас выделено время в календаре → меньше шансов слинять — мотивация усиливается за счет поддержки единомышленников 🔝 Поэтому так популярен интенсив «Экспресс Linux для NGS» от Бластим За два дня вы: — перестанете бояться терминала — освоите базовые команды и работу с сервером — напишете первые скрипты на Bash А если после мини-курса захочется изучить NGS глубже, можно перейти на полный курс «Анализ NGS-данных». Цену интенсива зачтем в оплату 🛍 ◎ Для всех новичков в программировании ◎ 2 дня онлайн ◎ Discord + записи на RuTube для повторения Подробнее о программе здесь: clck.ru/3Ni9Mp

🤔 Помните MCCMB'25? Там мы встретили Дарью Бородко — биоинформатика, сотрудницу НИИ общей патологии и просто замечательного преподавателя курсов «Анализ NGS-данных» и «Статистика, R и анализ данных» В пятиминутном интервью Даша рассказала:

➤ об обновленной программе курса ➤ о своем докладе на конференции ➤ и ответила на короткий, но забавный блиц

🐕 А пока Варвара в отпуске по уходу за Яшей, по всем вопросам пишите нашей Наташе (@kova_24) — вам быстро ответят и помогут со всем разобраться ❤️ Также заботливо напоминаем, что курс по анализу NGS-данных начинается уже 8 сентября, а до 25 августа действует низкая цена

🧬 Казнить нельзя помиловать — где поставить запятую решает p-value 13 ноября 2022 года четверо студентов Университета Айдахо были жестоко убиты в съемном доме недалеко от кампуса. Единственная улика — ножны со следами ДНК, забытые на месте преступления. Лишь месяц назад обвиняемый — 30-летний аспирант криминологии Брайан Кобергер — признал свою вину. Рассказываем, почему это дело может войти в историю как прецедент в использовании судебной генеалогии. 📌 ДНК преступника не было в базах ФБР Когда традиционные криминалистические методы и базы данных не дают мэтч, следователи обращаются к судебной генеалогии (Investigative Genetic Genealogy).

ДНК с места преступления — в данном деле touch DNA с ножен — загружают на открытые генеалогические платформы, такие как GEDmatch или FamilyTreeDNA. Алгоритмы ищут совпадения с ДНК-данными пользователей. Если таковые найдены, формируется «генетический круг» — список возможных дальних родственников. Затем подключается классическая полицейская работа: наблюдение, сбор улик, проверка алиби.

Данных убийцы в коммерческих базах тоже не было, но была ДНК его родственников. Подозрение переросло в проверку: агенты изъяли ватную палочку из мусора у дома потенциального отца преступника, провели анализ и установили связь. Только после этого арестовали Брайана Кобергера, проверили его ДНК и подтвердили совпадения с образцами с места преступления. Поскольку ДНК была фрагментарной, речь шла лишь о вероятности, а не о прямом подтверждении вины. 📌 Защита оспаривала законность сбора доказательств Полиция не получала ордера ни на анализ ДНК, ни на ее загрузку в базы, ни на слежку за родственниками. Но суд постановил: если ДНК оказалась на кухне убитых — вопрос конфиденциальности не стоит. Защита также заявляла, что анализ был неоднозначным и не может с уверенностью указывать на одного подозреваемого. Все это, по их мнению, говорит о предвзятости следствия.

Могла ли ошибка привести к обвинению невиновного? Факты указывали на однобокость расследования. Следователи признали, что основная работа велась вокруг одной улики — ножен. Между тем, под ногтями жертвы, Мэдисон Моген, была обнаружена смесь ДНК трех человек. Кроме того, в доме нашли кровь «неизвестного мужчины B» на перилах и кровь «неизвестного мужчины D» на перчатках у входа. После совпадения с ДНК Кобергера эти профили больше не проверялись.

❗️Несмотря на многочисленные ходатайства, спустя два с половиной года Брайан Кобергер признал себя виновным по всем пунктам в рамках сделки со следствием. В обмен на это суд отменил смертную казнь и назначил пожизненное заключение без права на апелляцию. Но мотив остается неизвестным. Почему именно эти студенты? Почему он пощадил двух других, спавших в доме? Согласно условиям сделки, Кобергер не обязан давать объяснений. IGG — мощный инструмент. Он способен спасать жизни и помогать правосудию. Но современные методы расширяют зону ответственности за ДНК — теперь не только за свою, но и за ДНК дяди, сестры или троюродного брата, которых ты даже можешь не знать. Общественная дискуссия о том, где проходят границы между безопасностью и приватностью, только начинается. Отдельный вопрос — какой p-value допустим при вынесении смертной казни, если улики основаны на фрагментах ДНК? 👍 Кстати, на нашем курсе «Анализ NGS-данных» вы будете работать со своими данными и увидите, как методы биоинформатики позволяют извлекать из ДНК неожиданные истории. #выходные_у_бластим

🧬 Открыта регистрация на Курчатовский геномный форум (КурчатовГенТех-2025), который состоится в Москве 20 – 21 октября. ✅ В рамках форума планируется работа трех секций: - «Формирование современного облика отечественного сельского хозяйства». - «Генетические технологии для профилактики и лечения социально значимых заболеваний»; - «Генетические технологии для промышленной микробиологии»; ⚗️ Кроме того, программа КурчатовГенТех включает научно-практический симпозиум по структурной биологии. Все тезисы устных и постерных докладов, представленных авторами в рамках КурчатовГенТех-2025, будут опубликованы в сборнике трудов форума, который индексируется в РИНЦ. Организатором выступает головная научная организация Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019 – 2030 годы НИЦ «Курчатовский институт». Участие в форуме возможно в качестве слушателя, стендового или устного докладчика. ✅ Отправить заявку на участие и посмотреть программу: genrussia.ru/genforum Реклама. Буланов Сергей Сергеевич, ИНН: 391429829755, erid: 2VtzqvNtYvD

🕸 ГЕРОЙ СВОЕГО ВРЕМЕНИ: NGS СПАСАЕТ ЖИЗНИ В ноябре 2024 года на Российском онкологическом конгрессе врач-онколог выступил с невероятным докладом: 🟦Случай, который я никогда не забуду. Взаимодействие клинициста, морфолога и генетика: когда NGS меняет диагноз🟦 🔍Что же произошло? Пациент был диагностирован с диагнозом «опухоль боковой поверхности языка слева неуточненная, после биопсии» Рутинные методы не давали ответа, а после анализа методом NGS команда врачей пересмотрела диагноз и оказалось, что у пациента редкая опухоль «эпителиоидная гемангиоэндотелиома» Переформулированный диагноз позволил назначить точное нужное лечение, которое значительно улучшило прогноз. ✨ Это не единичный случай: NGS тестирование по ОМС уже применяется во многих онкоцентрах Но остается проблема 😞 Для внедрения NGS нужна биоинформатика и навыки, которые вы сможете получить на нашем курсе по анализу NGS данных Медицина ждет своего героя — пора менять этот мир

💻 Вебинар Blastim глазами слушателя

Друзья, вы тоже делаете скриншоты во время вебинара, а потом теряете их? ❤️ — если узнали себя

Занятие уже в самом разгаре, но еще можно успеть подключиться, получить запись и секретный промокод 💌 ▶️ Подключиться!

🪫 В клетке «села батарейка»? Встреча, которую все ждут, уже сегодня ❗️ В 19:00 (мск) Дарья Бородко — опытный биоинформатик и исследователь древней и современной мтДНК, мутационной нагрузки и гетероплазмии — проведет бесплатный вебинар «От ридов к интерпретации: анализ NGS-данных митохондриальной ДНК». Что будет: • готовый пайплайн анализа NGS-данных • знакомство с полезными веб-сервисами • советы по написанию скриптов 📌 Не пропустите прямой эфир с интерактивом 📌 Запись получат все зарегистрированные участники Регистрация здесь: https://clck.ru/3NdgmE Присоединяйтесь, даже если не планируете учиться кодить — это уникальный шанс обсудить самые актуальные загадки мтДНК с любимым преподавателем вживую

☀️ Солнце, море и биоинформатика: открываем неделю мощной вакансией в Сириусе С 2025 года в Научно-технологическом университете «Сириус» стартует междисциплинарная инициатива «Анализ и интерпретация геномных данных». Научная задача проекта — создание открытой модульной и расширяемой биоинформатической платформы с готовыми сценариями для анализа и интерпретации геномных данных. А еще есть задача образовательная — разработка программы магистратуры по клинической биоинформатике, где будут обучаться врачи, умеющие интерпретировать геномные и метагеномные данные на мировом уровне. 🧬 Для участия в реализации инициативы коллеги из Сириуса ищут ученого со степенью (кандидат или доктор наук) и подтвержденным опытом в биоинформатике и/или клинической генетике Чем предстоит заниматься? Вот возможные задачи: ➤ разрабатывать программные модули и аналитические инструменты ➤ создавать сценарии для анализа данных (NGS, метагеномика и др.) ➤ заниматься формализацией правил интерпретации вариантов клинически значимых мутаций ➤ проектировать учебную программу магистратуры, готовить и проводить курсы ➤ публиковаться, участвовать в конференциях и развивать научные партнерства Зарплата: кандидат наук — до 150 000 ₽ /мес, доктор наук — до 300 000 ₽ /мес Условия: ▫️ Полная занятость, очная работа в Научно-технологическом университете «Сириус», обязателен переезд ▫️ При наличии мест служебное комфортабельное жилье на 1-ой или 2-ой линии у моря по льготной ставке ▫️ При наличии мест приоритетное зачисление детей в Детский сад и Президентский лицей «Сириус» ✉️ Присылайте резюме и краткое сопроводительное письмо на адрес kolpakov.fa@talantiuspeh.ru руководителю проекта Фёдору Анатольевичу Колпакову. Коллеги будут рады ответить на вопросы и обсудить детали #бластим_вакансии #бластим_рекомендует