from PhD import *

🌻 Немного взаимных рекомендаций Если вам интересно чем вообще сейчас живут молодые ученые - добавляйте себе каналы из нашей подборки! https://t.me/addlist/cLOHXvGLiSM5OGVi 👨‍🏫

Продолжается хроника обживания рабочего места. Вы посмотрите как было и как стало! Бесконечно кайфую. Катализировало это всë вчерашнее лабное празднование Рождества: 1) Карина подарила мне коврик для мыши с Охотниками на снегу Брейгеля 2) Тайный Санта подарил мне гирлянду и лайтбокс с буквами Посмотрев на это всë я понял что не выдерживаю и очень хочу заменить обстановку на стене. Сорвался и поехал в музей истории искусств Вены за постерами Брейгеля. Попутно раздобыл у коллеги старый ящик от микроскопа. Функциональности для меня в нём пока нет, чистый элемент дизайна и атмосферы. Как восхитительно карие тона деревянной истории сочетаются с черно-серебристым минимализмом 21 века!

Иван родил девчонку... 👨‍💻 Немного цифровой безопасности 👨‍💻 Занялся тут тем чтобы навести у себя небольшой порядок, и захотелось поделиться этим здесь.

💳 “All credit card PIN numbers in the World leaked”

➡️PIN codes Какой пин-код стоит на вашей карточке? Пишите свои ответы в комментарии. Еще лет 10 назад Nick Berry сделал интересный анализ использования пин-кодов (пикрил). Понятное дело, в топе по популярности 1234, 0000 и ко. А еще ярко выделяется 2580 (интересно, почему?). Вообще Ник дает хорошую идею для выбора пинкода. Не знаете какой придумать? Возьмите из наименее используемых! Самый последний с конца - 8068 (кажется, из-за этого факта именно его брать не стоит). ➡️Пароли Все мы знаем что пароли от всех сервисов должны быть уникальные и желательно случайные. А еще длинные, со смешанным регистром, включая цифры и символы. Но как их всех тогда запомнить? Запоминать не надо, используйте менеджеры паролей. Всё это время я довольно неосознанно пользовался Google Password Manager. Вчера решил опробовать Bitwarden. Пишут он безопаснее. Не знаю, посмотрим. Как минимум гугловский хорош тем что: 1) Минималистичен и компактен 2) Предупреждает об (1) утечках, (2) дубликатах и (3) слабых паролях! Собственно, пишу я этот пост потому что потратил вчера весь причесывал всю свою парольную историю. Генерил по-дедовски, в баше:

tr -dc 'A-Za-z0-9!?' < /dev/random | head -c 15

А доступ ко всему этому богатству идет через мастер-пароль который должен быть (1) сложным, (2) длинным и (3) легко запоминающимся. Вот есть хороший комикс на эту тему. Если коротко, 10 случайных символов гораздо хуже, чем запоминающаяся длинная но непредсказуемая фраза из вашей жизни. Дарю: Ivan_gave_birth_to_a_girl . ➡️Двухфакторная аутентификация Да-да, все тоже слышали. Подтверждение входа доп. способом: смс, другое устройство, ... . Обязательно сделайте её как минимум для основных сервисов: Google, Telegram, GitHub, ... . Из интересного: оказывается 2FA по смс тоже не рекомендуют. Мол при желании смс могут перехватить, а вообще доверяете ли вы своему сотовому оператору 🤨? Я лично настроил все через Google Authenticator. ➡️Резервная почта А вот тут интересно. Очень часто помимо основной почты просят указать еще и резервную - на случай потери доступа. И если спереди всё защищено так что на 2 метра не подойти, а к черному входу лежит ковровая дорожка - всё тщетно) Проверьте что ваша резервная почта не менее, а то и более защищена чем основная! Я лично для этих целей завел себе Proton Mail со сложным уникальным паролем и двухфакторкой. 👨‍💻 Мораль? Если вам реально есть чего опасаться, то это лишь первые шаги. Но это базовый этикет который полезно соблюдать в любом случае. Здесь цель не чтобы похитители не смогли ничего достать из украденных вашего копьютера и вас. А чтобы за 100 рублей слитая база клиентов Суши Мастер Шоп Химки не привела по цепочке к вашему банковскому аккаунту. Ivan_gave_birth_to_a_girl (видите как легко запомнить 25-и символьный пароль!)

Наверное уже почти лет 10 назад я увидел этот фанатский ролик. Как они в 98 секунд вложили весь спектр от мечты до задачи. И, знаете, дарит он какую-то надежду и вдохновение. upd термины на всякий: polaris (полярная звезда), jupyter (юпитер), orions belt (пояс ориона), big dipper (большой ковш)

На днях у нас в CBR (Center for Brain Research) был новогодний КоРпОрАтИв. Дата кстати совпала с праздником Крампуса - новогоднего чëрта. Поэтому лук был подобран соответствующий 💙🔥

Шок-контент: снег в Вене!

Я не знаю что там происходит у австрийских строителей. Какой-то бесподобный рождественский флекс 🎄🤌

Вчера мы с Телеграмом знатно напугали друг друга. Ситуация, в целом, довольно банальная. Но от того не менее увлекательная. Мне нужно было разослать по персональному уникальному сообщению каждому из 60 студентов. Общение у нас основное идёт в телеге, поэтому я решил что можно все автоматизировать с помощью Telegram API. В любимом питончике подтянул user_id реципиентов, сгенерировал соотвествующие сообщения и запустил цикл с отправкой. Даже добавил некоторый таймаут, чтобы наверняка. Тем не менее, как вы понимаете, чуткий глаз антиспама спустя минуту-две внезапно обратил внимание на данную радостную активность. После чего все мои сообщения за последнее время начали стираться (не только разосланные, в т.ч. и в других чатах), а за этим меня выкинуло со всех устройств. Я на самом деле уж было подумал что меня забанили, так как в Terms of Service на случай спама есть только такой механизм. Но, как видите, я тут и кажется пронесло. Хотя писать что-то в телегу все равно немного стремно.

Учёные развлекаются как могут. Возможно, вы слышали что Нобелевскую премию по химии 2024 года дали за вычислительный дизайн белков. Nature даже сделали подборку статей для тех кому интересно посмотреть на исследования вокруг этой области. Но вы посмотрите до чего всё это дошло!

Люди задизайнили белки в форме букв, а потом проверили результат с помощью трансмиссионного электронного микроскопа.

И они действительно 😊👍😁😝☺️➖😊🤣😝🙄😚. Чем то похоже на кукурузные хлопья для завтрака 😅 А вообще если вспомнить про ДНК-оригами и про запись GIFки в геном бактерий - открывается безграничный простор фантазии для всего от незримых носителей информации до подарков на день рождения

Кто ставит какашки?? 😡 UPD: Юле и Артему можно, остальным нельзя!

💡 Наука 💡 Всем привет! Возможно, пришло время рассказать чем же я занимаюсь 🥸. Сейчас у меня три научные аффилиации:

🔬 Группа Игоря Адамейко, MedUni Wien

Здесь я изучаю механизмы принятия клеточных решений при развитии организма. Основной объект изучения - клетки нервного гребня. Прямо сейчас (под невероятной ценности менторством Петра Харченко) строю ML-модель регуляции нервного гребня на основе данных scRNA-seq и scATAC-seq. Точнее, применяю богоизбранные Enformer и Borzoi под интересующие нас гипотезы.

🔬 Группа Екатерины Храмеевой, Сколтех

Здесь я делал свой магистерский диплом, и остаётся несколько проектов которые хочется довести до статьи. Во-первых, я изучаю как трёхмерная структура хроматина формирует уникальность нейронов мозга человека 🧠. Во-вторых, я участвую в проекте про систематическое сравнение реальных нейронов 🧠 (post-mortem) с их моделями выращенными в пробирке 🧫. Делаем мы это всё на геномном, эригеномном, транскриптомном, и 3D-геномном уровнях

🔬 Институт биоинформатики

Last but not least, есть ИБ где я уже руковожу некоторыми студенческими работами. И вот одна из работ кажется таки получает шансы дойти до статьи. Простая but still underexplored тема - автоматическая разметка оперонов в геномах бактерий 🧫 Здесь я скорее ко-супервизор. Основная идея дана нам Полиной Кучур (AgLab ITMO) и сейчас движется Оксаной Котовской (Сколтех). А работают непосредственно прекрасные студенты Юля и Артем. Ребята, я знаю вы это читаете. На 100% вам говорю уже хочется это опубликовать и отпустить вас! 😀 💗 Вот такой вот вышел дайджест. Буду обязательно рассказывать более подробно по мере новостей!

🏠Жильё🏠

Где живёт переехавший в Вену PhD-студент?

Что-ж, вообще есть две основные классические опции: 1) Съёмная квартира / комната 2) Общежитие В целом Вена довольно студенческий город, здесь много-много общаг, от каких-то локальных вариантов до сетевых студ.городов. Но, как это и происходит, первое - дорого, второе - все занято.

В этом плане огромная удача быть студентом MedUni Wien. Сотрудники университета могут баловать себя огромным количеством плюшек за счет главной городской больницы (AKH). В том числе, великолепным общежитием Personalwohnhaus B 🏢. Вот несколько фактов:

1) Тебе дают отдельные апартаменты с ванной (душ), кухней (холодильник+плита) и жилой комнатой 2) В подвале находится общий стиральный блок. Чтобы постираться надо заранее записаться на временной слот. Фан-факт: надо еще забрать ключ у ленд-лорда, для этого надо прийти к нему в офис в день стирки в 7 утра 🥰 3) Общага располагается почти в самом центре Вены. При этом здание стоит на холме и является одним из самых высоких (если не самым) зданием в округе. То есть вид реально стоит того. Я вот, как вы могли понять, живу на 14 этаже, и в ясный день можно увидеть даже малые Карпаты 🏔. Из-за такой высоты эту общагу все называют "tower" 🏰 (или "prison") 4) Вся эта радость (реально радость) стоит всего 133 (сто-тридцать-три) 💶 в месяц! 5) Ложка дегтя - дают ее всего на пол-года с возможным продлением на год. За это обычно все находят себе удовлетворяющую съемную квартиру 6) А еще она чем-то похожа на ДАС МГУ (но это мне рассказали) Ниже несколько фотографий всего этого счастья⬇️

Встречайте новый тип графика, ребус-plot

Ощущения: вау, буквально только что прям полноценно по-смол-токались с женщиной в лифте. Факты: - Ого, ×××× ×× ××× 14 этаж ×× ××× ××× красивый вид! - Да, действительно! (пауза) Но когда лифт поломка ... (пауза) - ×××× ×× ×××× ××××× ××× ××××× (грустным голосом) - Нет, это спорт - Ахаха, ××× ×××× ×× ××××× (выходит из лифта). Хорошего вечера! - (замешательство) Пока!