آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی

آمینواسیدهایی که از سه مسیر اصلی متابولیسم سلولی ساخته می‌شوند عبارتند از: #گلیکولیز: ⦁ آلانین (از پیرووات) ⦁ سرین، گلایسین و سیستئین (از 3-فسفوگلیسرات) ⦁ آسپارتات و آسپاراژین (از اگزالواستات، البته اگزالواستات در گلیکولیز مستقیماً ساخته نمی‌شود ولی از پیرووات می‌تواند تولید شود). #چرخه_کربس (اسید سیتریک): ⦁ گلوتامات، گلوتامین، پرولین و آرژینین (از آلفا-کتوگلوتارات) ⦁ آسپارتات و آسپاراژین (از اگزالواستات) ⦁ والین، لوسین و ایزولوسین (از سوکسینیل کوآ). #مسیر_پنتوز_فسفات: ⦁ هیستیدین (از ریبوز-5-فسفات) ⦁ آروماتیک‌ها مثل فنیل‌آلانین، تیروزین و تریپتوفان (از اریتروز-4-فسفات و فسفوئنول پیرووات).

آشنایی با PubChem پایگاه داده PubChem یک آرشیو عمومی شامل سه پایگاه داده اصلی (BioAssay، Compound، و Substance) است که اطلاعات گسترده‌ای درباره ترکیبات شیمیایی، از جمله مولکول‌های کوچک، لیپیدها، کربوهیدرات‌ها و توالی‌های اصلاح‌شده اسیدهای آمینه و نوکلئیک ارائه می‌دهد. این پایگاه داده شامل میلیون‌ها ساختار شیمیایی و نتایج آزمایش‌های زیستی است. بسیاری از رکوردهای PubChem شامل ارجاعات علمی به مقالات PubMed هستند و برخی مشارکت‌کنندگان اطلاعات زیست‌فعالیت را از متون علمی استخراج می‌کنند. همچنین، PubChem ارتباطی بین داده‌های موجود و مقالات علمی از طریق MeSH فراهم می‌کند که امکان جستجوی گسترده‌تر در منابع علمی را برای کاربران مهیا می‌سازد.

#ترپن‌ها گروهی از ترکیبات آلی هستند که از واحدهای hashtag#ایزوپرنی تشکیل شده‌اند و نقش مهمی در hashtag#متابولیسم گیاهان و برخی میکروارگانیسم‌ها دارند. hashtag#بیوسنتز ترپن‌ها از دو مسیر اصلی انجام می‌شود: مسیر hashtag#مِوالونات (MVA) که در سیتوزول رخ می‌دهد و مسیر متیل‌اریتریتول‌فسفات (MEP) که در hashtag#پلاستیدها فعال است. این دو مسیر از طریق تولید ایزوپنتنیل دی‌فسفات (IDP) و دی‌متیل‌آلیل دی‌فسفات (DMADP) به هم مرتبط می‌شوند و پیش‌سازهای لازم برای تولید مونوترپن‌ها، سزکویی‌ترپن‌ها و دی‌ترپن‌ها را فراهم می‌کنند. تنظیم بیان ژن‌های کلیدی این مسیرها تأثیر مستقیمی بر میزان و نوع ترپن‌های تولید شده دارد، که در گیاهان دارویی مانند بابونه‌کبیر مشاهده شده است. دانلود فصل

توسعه کشت سلولی CHO تا 2000 لیتر شامل چندین چالش مهم است: محدودیت انتقال اکسیژن با طراحی اسپارگر و تنظیم kLa حل می‌شود. استرس برشی با انتخاب پروانه مناسب و افزودن Pluronic F-68 کاهش می‌یابد تغییر کیفیت محصول (مانند گلیکوزیلاسیون) از طریق ردیابی CPP/CQA و انتخاب کلون کنترل می‌شود. گرادیان‌های pH و مواد مغذی با بهبود زمان اختلاط و تغذیه توزیع‌شده مدیریت می‌شوند و پارامترهای غیرقابل توسعه با مدل‌های کوچک‌سازی و مدل‌سازی پیش‌بینی‌کننده تطبیق داده می‌شوند تا پایداری و کیفیت محصول حفظ شود.

انتخاب فیلتر سرنگی مناسب برای محلول های ازمایشگاهی ✔️ فیلتر مناسب رو بر اساس نوع محلول انتخاب کنید، نه فقط سایز منافذ. ✔️ فیلتر PES برای محلول‌ های آبی عالیه. اما اگه با حلال‌ های آلی یا محلول‌ های غلیظ کار می‌ کنی، سراغ PTFE یا PVDF برید.

واکنش های تک سوبسترایی نوعی از واکنش های انزیمی هستند که می توان از طریق‌مدل انزیمی میکائلیس-منتن انها را توصیف کرد، اما همه ی واکنش های انزیمی تک سوبسترایی نیستند و غالب واکنش های زیستی به صورت دو یا چند سوبسترایی هستند که از معادله Lineweaver-Burk بایستی برای توصیف انها استفاده کرد. در ویدیو پیوست اساس واکنش های دو سوبسترایی و پینگ پنگی توضیح داده شده است که علاقه مندان به مباحث آنزیمی می توانند از محتویات آن استفاده نمایند. لینک مشاهده 🧩 https://t.me/IRBioinformatics

در مقاله ای که چند روز پیش در ژورنال نیچر چاپ شده است اثرات مخرب AI در حوزه پژوهشی علوم پزشکی و علوم زیستی بررسی شده است. براساس این مقاله، تکنولوژی هوش مصنوعی به شدت باعث افزایش تولید مقاله های بی کیفیت و فرمالیته و کلیشه ای شده است که صرفا برای پر کردن رزومه هستند و در افزایش کیفیت علمی علوم مربوطه هیچ نقشی ندارند.... https://www.nature.com/articles/d41586-025-01592-0

هوش مصنوعی Perplexity به صورت رایگان در تلگرام در دسترس قرار گرفت. با استفاده از بات این هوش مصنوعی در تلگرام می توانید بدون‌مراجعه به سایت آن از امکانات این ابزار استفاده کنید. برای استفاده از این بات می توانید از ای دی زیر استفاده کنید. @askplexbot

How To Use ChatGPT As Your Personal Assistant 2025 There are times when everyone feels like they could do with a personal assistant to help lift the burdens of work and everyday life. ChatGPT is the answer for people who can’t afford to hire a real PA. We’ll show you how you can turn ChatGPT into the perfect PA, helping you to manage work and personal projects and brainstorm ideas. Inside, you’ll find sections that cover managing projects, doing research, writing reports, helping around the house, and much more.

هوش مصنوعی grok بدون فیلترشکن در دسترس است و کاربران ایرانی نیز می توانند به صورت رایگان از آن استفاده کنند برای دسترسی وارد لینک زیر شوید. https://grok.com/

محققان دانشگاه کپنهاگ به یک دستاورد مهم در درمان سرطان دست یافته‌اند: آن‌ها مراحل نهایی سنتز بیوسنتزی #تاکسول، یک داروی شیمی‌درمانی پرکاربرد را رمزگشایی کرده‌اند. با مهندسی سلول‌های مخمر برای تولید تاکسول، این نوآوری می‌تواند هزینه تولید دارو را به نصف کاهش دهد و دسترسی جهانی به آن را افزایش دهد. علاوه بر کاهش هزینه، این روش بیوسنتزی جدید پایدارتر است، زیرا وابستگی به مواد شیمیایی مضر را کاهش داده و نیاز به برداشت درختان سرخدار که دهه‌ها طول می‌کشد تا بالغ شوند، از بین می‌برد. این پیشرفت نمونه‌ای از نقش بیوتکنولوژی در پیشبرد همزمان پیشرفت پزشکی و پایداری زیست‌محیطی است. لینک خبر

Science – 15 May 2025 Science is the academic journal of the American Association for the Advancement of Science and is considered one of the world’s most prestigious scientific journals.