آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی

🧬 ویرایش ژن و ژنوم یکی از هیجان‌انگیزترین دستاوردهای زیست‌فناوری در قرن ۲۱ است که به دانشمندان اجازه می‌دهد کد حیات را مثل یک متن ✍️ ویرایش کنند! در این فناوری، بخش‌های خاصی از DNA که مسئول ویژگی‌ها یا بیماری‌ها هستند، با ابزارهایی مانند CRISPR-Cas9 🎯 شناسایی، حذف یا جایگزین می‌شوند. این کار می‌تواند ژن‌های معیوب را اصلاح کند 🧠، گیاهان را در برابر آفات مقاوم‌تر سازد 🌾 و حتی به درمان بیماری‌های ژنتیکی کمک کند 💊. جذابیت این روش در دقت بالا، سرعت زیاد ⚡ و هزینه‌ی پایین 💰 آن است. به‌بیان ساده، ویرایش ژن یعنی ویرایش جمله‌ای در کتاب حیات 📖؛ تغییری کوچک با اثری بزرگ بر آینده‌ی پزشکی، کشاورزی و زندگی بشر 🌍.

🧩 وقتی فیزیک ذرات با هنر اوریگامی هم‌صدا می‌شود! در کشفی شگفت‌انگیز، پاول گالاشین، ریاضی‌دان جوان دانشگاه کرنل، ارتباطی رازآلود میان شکل هندسی پیچیده‌ای به نام «آمپلیتوهدرون» و هنر اوریگامی (تا کردن کاغذ) پیدا کرده است. او نشان داد که الگوهای تا شدن کاغذ می‌توانند مجموعه‌ای از نقاط را تشکیل دهند که دقیقاً همان شکل آمپلیتوهدرون را می‌سازند — شکلی که پاسخ محاسبات بنیادی در فیزیک ذرات را در خود دارد. این کشف نه‌تنها پلی میان دو دنیای متفاوت زده، بلکه یکی از حدس‌های قدیمی درباره آمپلیتوهدرون را نیز اثبات کرده: اینکه این شکل واقعاً قابل تقسیم به اجزای ساده‌تری است که با محاسبات فیزیکی هم‌خوانی دارند. اکنون ریاضی‌دانان در حال بررسی این پل تازه‌ساخته‌شده‌اند تا رازهای بیشتری از جهان هستی را کشف کنند. ....ادامه داستان...

🧠 ساعت‌های مغزی و رازهای پیری و زوال عقل در جمعیت‌های متنوع پژوهشگران با بررسی ۱۳۹۹ نفر از نقاط مختلف جهان، از جمله بیماران مبتلا به آلزایمر و زوال عقل پیشانی‌-گیجگاهی، نشان دادند که «ساعت‌های مغزی» — تفاوت بین سن واقعی و سن مغزی پیش‌بینی‌شده — می‌توانند نشانه‌ای از پیری شتاب‌گرفته باشند. این تفاوت‌ها تحت تأثیر عوامل جغرافیایی (جنوب بیشتر از شمال)، درآمد (کم بیشتر از زیاد)، جنسیت (زن بیشتر از مرد) و تحصیلات (کم بیشتر از زیاد) قرار دارند. 🔬 با استفاده از مدل‌سازی زیستی و EEG، مشخص شد: - در روند پیری، مغز دچار تحریک‌پذیری بیش از حد و فروپاشی ساختاری می‌شود. - در بیماران مبتلا به زوال عقل، کاهش تحریک‌پذیری و تخریب شدید ساختار مغز مشاهده می‌شود. این مطالعه گامی مهم در درک مکانیسم‌های زیستی پیری و بیماری‌های مغزی در جمعیت‌های گوناگون است و می‌تواند به تشخیص زودهنگام و درمان‌های هدفمند کمک کند.

🏅 برندگان نوبل پزشکی ۲۰۲۵: نگهبانان صلح سیستم ایمنی جایزه نوبل فیزیولوژی و پزشکی سال ۲۰۲۵ به Mary E. Brunkow، Fred Ramsdell و Shimon Sakaguchi اهدا شد؛ برای کشف چشمگیر آن‌ها درباره سلول‌های T تنظیمی (Tregs) — نگهبانان صلح سیستم ایمنی که از حمله بدن به بافت‌های خودش جلوگیری می‌کنند. این دانشمندان با شناسایی نقش کلیدی ژن FoxP3 در کنترل تحمل ایمنی، راه را برای درمان‌های نوین در بیماری‌های خودایمنی، پیوند اعضا و سرطان هموار کردند. نوبل امسال یادآور این حقیقت است که قدرت واقعی سیستم ایمنی، گاهی در خویشتن‌داری آن نهفته است، نه در حمله. ...بیشتر بخوانید...

🎨🎶🕹️ خلاق باش تا مغزت جوان بمونه! 🧠💫 پژوهش تازه‌ای در مجله Nature Communications نشون داده که تجربه‌های خلاقانه مثل نواختن موسیقی، رقصیدن، طراحی، یا حتی بازی‌های ویدیویی می‌تونن مغز رو در برابر پیری مقاوم‌تر کنن! 🤩 دانشمندا با استفاده از مدل‌های یادگیری ماشین و داده‌های مغزی فهمیدن که آدم‌های خلاق، مخصوصاً اونایی که در زمینه‌ای متخصص هستن، سن مغزی پایین‌تری نسبت به سن واقعی‌شون دارن — یعنی مغزشون جوون‌تره! 🧩✨ جالب‌تر این‌که حتی بعد از یه دوره‌ی یادگیری کوتاه هم، مغز شروع به تغییر و افزایش کارایی می‌کنه! 🔄 به زبان ساده: هر چقدر بیشتر خلاق باشی، مغزت دیرتر پیر می‌شه. 🌱 لینک دانلود مقاله

🇺🇸 توقف بزرگ در تحقیقات واکسن‌های mRNA 🔴 رابرت اف. کندی جونیور، وزیر بهداشت آمریکا، اعلام کرد که بودجه ۵۰۰ میلیون دلاری تحقیقات واکسن‌های mRNA برای کرونا و آنفلوآنزا لغو می‌شود. این تصمیم شامل ۲۲ پروژه تحت حمایت BARDA است که پیش‌تر توسط دولت آمریکا تأمین مالی شده بودند. 📉 کندی مدعی شده که واکسن‌های mRNA در برابر عفونت‌های تنفسی فوقانی مؤثر نیستند و به مجموعه‌ای از ۳۷۵ مطالعه استناد کرده که بیشتر آن‌ها به اثرات پروتئین اسپایک در زمان ابتلا اشاره دارند، نه واکسیناسیون. دانشمندان این اقدام را "خطرناک و غیرمسئولانه" توصیف کرده‌اند. 💉 بودجه‌ها از شرکت‌هایی مانند مدرنا، فایزر، آسترازنکا و دانشگاه‌هایی چون اموری و تیبا بایوتک قطع شده و تمرکز به سمت واکسن‌های سنتی و کندتر مانند واکسن‌های ویروس کامل تغییر یافته است. ⚕️ با این حال، تحقیقات درمانی با فناوری mRNA ادامه خواهد داشت؛ به گفته مدیر NIH، این فناوری هنوز امیدهایی برای درمان سرطان دارد. 📌 این خبر می‌تواند نقطه عطفی در سیاست‌های سلامت عمومی آمریکا باشد.

معرفی کتاب عنوان: بیوانفورماتیک پدیدآورنده : دکتر قادر میرزاقادری (دانشیار دانشگاه کردستان) ناشر : انتشارات دانشگاه کردستان نوبت و سال چاپ : اول، ۱۴۰۴ شابک : ۲-۵۷-۸۲۱۱-۶۲۲-۹۷۸ تعداد صفحات: ۳۰۸، مصور. قیمت: 200 هزار تومان خرید: لینک خرید ｡⁠◕⁠‿⁠◕⁠｡⁩ ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

ابزار انقلابی CRISPR-GPT منتشر شد! سیستم CRISPR-GPT یک ابزار هوش مصنوعی پیشرفته است که برای کمک به طراحی و تحلیل آزمایش‌های ویرایش ژن با استفاده از فناوری CRISPR توسعه یافته است. این سیستم بر پایه مدل‌های زبانی بزرگ (LLMs) ساخته شده است و با آموزش‌های تخصصی در حوزه بیوتکنولوژی، توانایی انجام وظایف پیچیده را دارد. برای دانشجویان علوم زیستی یا علاقه مندانی که در حوزه بیوتکنولوژی (در تمام گرایش ها) فعالیت می کنند، ابزار CRISPR-GPT می‌تواند مانند یک دستیار هوشمند عمل کند و پنل مدیریتی یک پروژه زیستی مبتنی بر ویرایش ژن شامل انتخاب نوع سیستم CRISPR (مثل Cas9 یا Cas12a)، طراحی RNA راهنما (gRNA)، انتخاب روش انتقال به سلول، تدوین پروتکل‌های آزمایشگاهی، طراحی سنجش‌های عملکردی، تا تحلیل داده‌های حاصل از آزمایش را در اختیار قرار دهد و پژوهشگر این مراحل پیچیده را می‌تواند با کمک این ابزاربرای بهینه سازی یک پروژه ویرایش ژن یا ژنوم انجام دهد. ....آموزش نصب و راه اندازی ابزار در لینوکس.... ｡⁠◕⁠‿⁠◕⁠｡⁩ ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

ابزار CRISPR-GPT منتشر شد! ｡⁠◕⁠‿⁠◕⁠｡⁩ ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

اسامی منتخبین سی و دومین جشنواره دانشجوی نمونه کشوری سال ۱۴۰۳ وزارت علوم، تحقیقات و فناوری و وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی در مقاطع تحصیلی کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری تخصصی منتشر شد./روزنامه مدرس         لینک دانلود فایل 

در مورد پپتیدهای لگویی چه می دانید؟ پپتیدهای لگویی یا پپتیدهای خودتکمیلی یونی دسته‌ای از مولکول‌های کوچک پروتئینی هستند که معمولاً حدود ۵ نانومتر اندازه و ۱۶ اسیدآمینه دارند. این پپتیدها دو سطح مشخص دارند: یک سطح آب‌گریز که باعث خودآرایی آن‌ها در محیط آبی می‌شود و یک سطح آب‌دوست با آرایش منظم اسیدآمینه‌های باردار که الگوهای مختلفی از پیوندهای یونی را ایجاد می‌کند (مانند الگوی +−+− یا ++−−). چنین آرایشی موجب می‌شود پپتیدها در حضور کاتیون‌های قلیایی یا با افزودن محلول پپتیدی، به نانوالیاف حدود ۱۰ نانومتری خودآرا یا self-assemble شوند. این نانوالیاف سپس با برقراری تعاملات یونی، ماتریس‌هایی شبیه صفحه شطرنج ایجاد می‌کنند که به شکل یک هیدروژل سه‌بعدی با محتوای آب بسیار بالا (بیش از ۹۹٫۵٪) و منافذی در ابعاد ۱۰ تا ۲۰۰ نانومتر در می‌آید. چنین هیدروژل‌هایی بستری مناسب برای رشد و امتداد نوریت‌ها فراهم کرده و بنابراین کاربرد گسترده‌ای به‌عنوان داربست در مهندسی بافت دارند. ....مطالعه بیشتر... ｡⁠◕⁠‿⁠◕⁠｡⁩ ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

چرا در سلول های گیاهی سانتریول غایب است؟ سانتریول یک اندامک استوانه‌ای بدون غشا در سلول‌های جانوری است که از میکروتوبول‌ها ساخته شده و در نزدیکی هسته قرار دارد. این ساختار در تقسیم سلولی نقش کلیدی دارد و با سازماندهی رشته‌های دوک، به جداسازی دقیق کروموزوم‌ها کمک می‌کند. همچنین سانتریول‌ها در تشکیل مژک و تاژک نقش دارند، اما در سلول‌های گیاهی پیشرفته به‌ دلیل تفاوت‌های ساختاری و عملکردی، وجود ندارند. ｡⁠◕⁠‿⁠◕⁠｡⁩ ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

نقش آفلاتوکسین‌ها در شیوع دیابت و آلزایمر آفلاتوکسین‌ها از جمله توکسین‌های قارچی هستند که با مصرف مواد غذایی آلوده وارد بدن شده و می‌توانند عملکرد متابولیکی را مختل کنند. این ترکیبات با ایجاد استرس اکسیداتیو و آسیب به سلول‌های کبد و پانکراس، در بروز بیماری‌هایی مانند دیابت نوع ۲ و مقاومت به انسولین نقش دارند. از طرف دیگر، افلاتوکسین‌ها با عبور از سد خونی-مغزی و تحریک التهاب عصبی، ممکن است در تخریب نورون‌ها و تجمع پروتئین‌های آسیب‌زا مؤثر باشند. این فرآیندها می‌توانند حافظه و عملکرد شناختی را تحت تأثیر قرار دهند و خطر ابتلا به آلزایمر را افزایش دهند.بنابراین، کنترل آلودگی‌های غذایی و پایش سطح افلاتوکسین‌ها در زنجیره تأمین مواد غذایی، نه‌تنها برای سلامت عمومی بلکه برای پیشگیری از بیماری‌های مزمن و عصبی اهمیت حیاتی دارد. ...برای مطالعه بیشتر کلیک کنید... ｡⁠◕⁠‿⁠◕⁠｡⁩ ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

نقش آفلاتوکسین‌ها در شیوع دیابت و آلزایمر آفلاتوکسین‌ها از جمله توکسین‌های قارچی هستند که با مصرف مواد غذایی آلوده وارد بدن شده و می‌توانند عملکرد متابولیکی را مختل کنند. این ترکیبات با ایجاد استرس اکسیداتیو و آسیب به سلول‌های کبد و پانکراس، در بروز بیماری‌هایی مانند دیابت نوع ۲ و مقاومت به انسولین نقش دارند. از طرف دیگر، افلاتوکسین‌ها با عبور از سد خونی-مغزی و تحریک التهاب عصبی، ممکن است در تخریب نورون‌ها و تجمع پروتئین‌های آسیب‌زا مؤثر باشند. این فرآیندها می‌توانند حافظه و عملکرد شناختی را تحت تأثیر قرار دهند و خطر ابتلا به آلزایمر را افزایش دهند.بنابراین، کنترل آلودگی‌های غذایی و پایش سطح افلاتوکسین‌ها در زنجیره تأمین مواد غذایی، نه‌تنها برای سلامت عمومی بلکه برای پیشگیری از بیماری‌های مزمن و عصبی اهمیت حیاتی دارد. ...برای مطالعه بیشتر کلیک کنید...

‌آشنایی با طیف سنجی FTIR: بخش اول طیف‌سنجی FTIR یک تکنیک تحلیلی حیاتی برای محققان است که قابلیت تعیین همزمان اجزای آلی، شامل پیوندهای شیمیایی و محتوای آلی مانند پروتئین، کربوهیدرات، و لیپید را فراهم می‌آورد. این روش تحلیلی به دلیل سرعت، دقت خوب، و حساسیت نسبی، بسیار محبوب است و می‌تواند برای مشخصه‌یابی نمونه‌هایی در حالت‌های مختلف از جمله مایعات، پودرها، فیلم‌ها، الیاف و گازها مورد استفاده قرار گیرد. در تجزیه و تحلیل FTIR، نمونه‌ها در معرض امواج فروسرخ قرار می‌گیرند، این امواج بر ارتعاشات اتمی مولکول‌ها تأثیر گذاشته و جذب یا انتقال انرژی خاصی را ایجاد می‌کنند که برای تعیین ارتعاشات مولکولی نمونه مفید است. ...ادامه این مطلب در پست‌های بعدی... ｡⁠◕⁠‿⁠◕⁠｡⁩ ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

معرفی پایگاه داده PlantFA پایگاه داده PlantFAdb یک منبع تخصصی برای بررسی اسیدهای چرب گیاهی و مسیرهای بیوسنتزی مرتبط با آن‌هاست. این پایگاه اطلاعاتی شامل داده‌های ساختاری، بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی مربوط به ترکیبات لیپیدی در گونه‌های مختلف گیاهی است. کاربران می‌توانند با جستجوی نام گونه، نوع اسید چرب یا مسیر متابولیکی، به اطلاعات دقیق و قابل استناد دسترسی پیدا کنند. هدف اصلی PlantFAdb، تسهیل پژوهش در زمینه زیست‌شناسی گیاهی، مهندسی متابولیک و بیوتکنولوژی کشاورزی است. یکی از ویژگی‌های برجسته PlantFAdb، نمایش گرافیکی مسیرهای بیوسنتزی و ارتباط آن‌ها با گونه‌های گیاهی مختلف است. این پایگاه همچنین امکان مقایسه فیلوژنتیکی بین گیاهان تولیدکننده ترکیبات خاص را فراهم می‌کند و به پژوهشگران کمک می‌کند تا روند تکاملی تولید لیپیدها را بهتر درک کنند. با توجه به رشد روزافزون مطالعات در زمینه تولید اسیدهای چرب غیرمعمول و کاربردهای صنعتی آن‌ها، PlantFAdb به‌عنوان یک ابزار کلیدی در طراحی مدل‌های متابولیکی و تحلیل داده‌های اُمیکس شناخته می‌شود. ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram

#فروپتوزیس یک نوع مرگ سلولی غیرآپوپتوتیک وابسته به آهن است که بر اثر عدم تعادل اکسیداسیون-کاهش و پراکسیداسیون لیپیدی رخ می‌دهد. این فرایند در سطوح مختلف مولکولی تنظیم می‌شود؛ به‌طوری‌که NFE2L2 نقش محافظتی ضد فروپتوزیس دارد و اتوفاژی انتخابی می‌تواند آن را تقویت کند. اختلال در فروپتوزیس در بروز سرطان، بیماری‌های نورودژنراتیو، آسیب بافتی، التهاب و عفونت نقش دارد. ◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️◼️ 🆔 Instagram | Telegram