Бластим: курсы и работа в биотехе

🏆 Хит-парад статей тысячелетия В 2025 году Nature представил топ-25 самых цитируемых статей и препринтов за четверть века, собрав информацию из пяти наукометрических баз (WoS, Scopus и др.). Что это за публикации такие? Давайте разбираться. Возможно, вы разочаруетесь, но среди лидеров нет ни CRISPR, ни Генома человека, ни других нашумевших прорывов. Зато — тихое, но тотальное доминирование методов, особенно машинного и глубокого обучения. №1. Deep Residual Learning for Image Recognition 🖼

В 2015 году ученые Microsoft во главе с Каймином Хэ представили новаторскую архитектуру ResNet, которая совершила революцию глубины нейросетей, преодолев проблему затухающих градиентов с помощью остаточных связей. До боли простая идея теперь повсюду — вплоть до ChatGPT. Оригинальный ResNet выиграл конкурс на датасете ImageNet, нарастив число слоев в ~7 раз по сравнению с предыдущими победителями. Сегодня файнтюнить ResNet под свои задачи с картинками — обыденная практика, вот кейс с распознаванием древней латыни.

№6. Random Forests 🌲

Статья 2001 года про удобный и понятный алгоритм — случайный лес, придуманный американским статистиком Лео Брейманом. Под RF подразумевается ансамбль множества деревьев решений, которые обучаются параллельно на сэмплах объектов и признаков. Потом их оценки агрегируются. Отличная иллюстрация пословицы «Одна голова хорошо, а две — лучше».

№7. Attention is all you need 🤖

Краеугольный труд для сферы обработки естественного языка от Ашиша Васвани и коллег из Google Brain датируется 2017 годом. Именно в ней описан «трансформер» — хребет нынешних LLM. Название перекликается с песней The Beatles. Сегодня трансформеры вошли и в биологию, например, обучают белковые языковые модели. Одну из них, ESM3, мы скоро отпрепарируем на вебинаре, не пропустите.

№8. ImageNet classification with deep convolutional neural networks 👀

Работа 2012 года Крижевского, Суцкевера и Хинтона про культовый AlexNet. Первая сверточная нейронка, убедительно доказавшая превосходство глубокого обучения над другими подходами в компьютерном зрении. Точка отсчета эры дипленинга и бума GPU. Подробности.

№12. U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation 🔬

U-Net — нейросеть, предложенная в 2015 году Олафом Роннебергером именно для биомедицины — сегментации клеток на микроскопических снимках. U-Net хватает малой выборки для тренировки. Ныне U-Net подобная архитектура лежит в основе диффузионных моделей для генерации картинок.

№15. Scikit-learn: Machine learning in Python 🛠

Публикация 15-летней давности про sklearn — популярную питонячную библиотеку для классического ML с уймой реализованных функций и алгоритмов.

№16. Deep learning 🧠

Обзор от сразу трех крестных отцов AI — Бенджио, Хинтона и ЛеКуна. Кстати, Хинтон в январе 2026 стал вторым ученым в истории, достигшим 1 млн цитирований!

Что еще в топе? Биоинформатика и статистика. Например, №18 — статья о DESeq2, золотом стандарте для оценки диффэкспрессии. На последней строчке расположился инструмент G*Power для расчета статмощности. Чуть-чуть не дотянули до попадания в рейтинг SAMtools, Trimmomatic и Bowtie 2 (№27–29) 🥲 Цитируемость намекает, что вычислительные методы и AI-модели очень востребованы. Их освоение выгодно превращает вас в мультидисциплинарных специалистов. В Бластим на занятиях по ML мы тоже опираемся на нетленные классические рукописи, но сразу практикуемся на примерах из лайфсаейнс. Подписывайтесь на ML-чат и приходите на наш курс по ML #бластим_технологии

🍩 Несладкая жизнь с сахарным диабетом Сахарный диабет 1-го типа (СД1) — заболевание, приводящее к разрушению β-клеток поджелудочной железы и потере способности к выработке инсулина. К 2040 году в мире ожидается до 17,5 млн пациентов. При этом патогенез СД1 — сложный и не до конца изученный процесс. Однако очевидно, что первую скрипку в нем играют самые разные иммуноциты, которые и участвуют в атаке на островковые клетки. Отсюда вытекает необходимость изучать гетерогенность в поджелудочной железе и выявлять минорные субпопуляции. Но как? Транскриптомикой одиноких клеток, разумеется 30 января в 19:00 мск на заключительной встрече лектория БИОмечтателей мы погрузимся в проблему диабета 1-го типа. А нашим проводником будет Василий Акимов, аналитик лаборатории эпигенетических методов исследований ФГБУ ЦСП ФМБА Адженда:

➤ принципы и возможности метода scRNA-seq ➤ как scRNA-seq помогает познать гетерогенность: Т- и В-лимфоциты, моноциты, дендритные клетки и другие ➤ поиск диагностических биомаркеров и оценка эффективности терапии ➤ изучение осложнений: нефропатия, ретинопатия и нейропатия ➤ выводы и будущее технологии scRNA-seq в исследовании диабета 1-го типа

Лекция бесплатная, регистрация по ссылке: sbsite.pro/BioEvents_1 Участвуйте в конкурсе БИОмечтателей до 1 февраля: agency.blastim.ru/biodreamers

📣 Камера, мотор… ой, мы уже в эфире Сегодня для Бластим особенный день. Официально стартовал курс «Анализ NGS-данных», и он вошел в историю как самый популярный из всех 11 потоков 🥳 В программе дня плавный разгон. Участники знакомятся, осваиваются и проходят предобучение по R, Python и Linux. Энергия в чате зашкаливает, но это только начало. Уже завтра — первое полноценное занятие. И если уж бить рекорды, то чего мелочиться: да, к нам еще можно присоединиться — мы увеличили количество мест! А нагнать программу пока реально и комфортно 💯 Регистрация и подробности: agency.blastim.ru/ngs Следующий запуск будет только в сентябре… столько проектов и вакансий может пройти мимо…

📚 Что самое главное в жизни студента? Поздравляем всех с Татьяниным днем и желаем смелых целей, сильных резюме и поддерживающих научных руководителей! Делитесь в комментариях: что для вас значит быть студентом и зачем сегодня нужно высшее образование? В университет в первую очередь идут за корочкой знаниями. Но студенчество — это самый удобный и плодотворный период для нетворкинга, поиска возможностей и формирования профессионального окружения. Поэтому помимо учебы важно выбираться на мероприятия и участвовать в разных активностях. Даже когда очень хочется поспать или тема кажется не слишком интересной. Никогда не знаешь, какая встреча приведет к неожиданным и ценным карьерным последствиям. ℹ️ Если вам интересно, как проходит жизнь студентов ВНЕ учебы в Университете искусственного интеллекта имени Мохаммеда бин Заида (MBZUAI), вам могут быть полезны эти ресурсы: • сайт университета mbzuai.ac.ae/student-resources/campus-facilities/ • официальный YouTube-канал youtube.com/@MBZUAI/videos Но если кратко, в MBZUAI есть все для комфортной жизни и среда, которая напрямую влияет на будущие возможности: • спортивные залы и зоны отдыха • студенческие клубы и регулярные мероприятия • активное комьюнити ➡️ А если у вас еще остались вопросы или вы задумываетесь о поступлении — просто заполните короткую анкету до 1 февраля. Мы проконсультируем и поможем бесплатно подготовить сильную заявку. Ссылка на подробности и форму: agency.blastim.ru/uae

😀 Мечтать не вредно: объявляем о продлении конкурса научных идей Друзья, рады сообщить, что ждем ваши заявки на конкурс БИОмечтателей до 1 февраля включительно Отметим, что принимаем максимум 5 заявок от одного участника — так мы сможем уделить достаточно внимания каждому ⛄️Если анонс свалился как снег на голову: воть пост с целями, структурой и деталями, а здесь примеры задач от нашей команды — для вдохновения и старта Призовой фонд: 300К рублей 🌹 Все подробности на сайте проекта: agency.blastim.ru/biodreamers

Мода приходит из городов, а мудрость — из пустыни Вы биолог или биоинформатик — но не по-детски любите математику и программирование? Вы упорны и мечтаете попасть на международную ИИ-арену, чтобы остаться там всерьез и надолго? Бластим не может не рассказать о такой возможности и поддержать ▶️ Ждем на вебинаре «Advance your future in AI at the world’s first AI university» через 1,5 часа 🔗 регистрация Язык встречи: английский Спикер: 🎨🎨🎨 Chloe Zhang 🎨🎨🎨 Head of Graduate 🎨🎨🎨 Student Recruitment Отправляйте заявки через Бластим — мы поспособствуем поступлению 🔗 agency.blastim.ru/uae Дедлайн: 1 февраля

🤖 Ой-ой-ой, этот пост писал Эй-АЙ Мы в Бластим давно решили, что не можем победить ИИ революцию, поэтому возглавляем ее. И заявляем официально: на конкурсе БИОмечтателей не просто можно, но и нужно использовать большие языковые модели, ИИ-агентов, вайбкодинг. Мы и сами этим занимаемся — одну из оценок вашим конкурсным заявкам будет ставить ИИ-эксперт. А пока хотим дать общие советы, которые помогут сформулировать задачу. Так что листайте карточки и отправляете заявки ✏️ Дедлайн до 1 февраля Чтобы мечта стала реальностью, ей нужна встреча с наукой ✨ 🔗 agency.blastim.ru/biodreamers

💊 Здесь есть доктор? Я доктор физико-математических наук Почему сегодня разработка инновационных лекарств не идет без точных цифр и сложных расчетов? Можно ли заменить подопытных кроликов ин силико моделями? Как правильно подобрать дозу для первой фазы клинических исследований? Какова роль ИИ в современной фарме? 28 января в 19:00 мск Виктор Соколов, к.ф.-м.н, старший научный сотрудник M&S Decisions FZ LLC, технический директор «СимургФарм» расскажет, как фармакология превратилась в сплошную математику и почему это хорошо. Бонусом разберем реальный кейс: принимаем решение о старте клинических исследований гипохолестеринемических препаратов. Лекция бесплатная, регистрация по ссылке: sbsite.pro/BioEvents_1 Участвуйте в конкурсе БИОмечтателей до 1 февраля: agency.blastim.ru/biodreamers

In English, please ▶️ Вебинар «AI-революция в бионауках. Открой MBZUAI» получился очень насыщенным. Но, кажется, у слушателей осталось еще много вопросов. Давайте коротко ответим на самые популярные:

❓ Что покрывает стипендия MBZUAI? • 100% оплата обучения • Ежемесячная стипендия (MSc — 15 500 AED, PhD — 17 500 AED) • Виза ОАЭ • Медицинская страховка ❓ А где живут студенты? • На кампусе (7 500 AED вычитаются из стипендии) • Вне кампуса (студенты самостоятельно выбирают и оплачивают жилье) ❓ А стажировки будут? Да, стажировки обязательны: • MSc — 6 недель • PhD — 12 недель Университет помогает с поиском компаний. ❓ Как подтвердить уровень английского? MBZUAI не проводит собственные языковые тесты. Популярный вариант среди кандидатов из России — тест Duolingo. Можно подать заявку без сертификата и предоставить его позже (до 15 марта). ❓ Планируется ли запуск других направлений? Университет активно развивается. Сейчас основной фокус на Computational Biology и Human–Computer Interaction, но в дальнейшем планируется расширение и запуск новых программ. ❓ Много ли мест? Конкурс на программу очень высокий, но финальное количество мест во многом зависит от качества поданных заявок. Это значит, что шанс есть у каждого кандидата с сильным и хорошо подготовленным профилем. 👉 Если вы подаетесь с Бластим до 1 февраля, то мы поможем вам: • трезво оценить свои шансы • усилить заявку и правильно расставить акценты • избежать ошибок, которые снижают шансы даже у сильных кандидатов

❗️ А если у вас остались вопросы, то у нас отличная новость! 24 января в 10:00 мск мы снова встречаемся на вебинаре «Advance your future in AI at the world’s first AI university» Спикер: Chloe Zhang Язык встречи: английский Обсудим: • университет MBZUAI в целом и в деталях • магистерские и PhD-программы • карьерные перспективы после выпуска • поступление, обучение и жизнь в ОАЭ 🏖️ Регистрация здесь: ссылка Магистратура и PhD в MBZUAI

Вам кто-нибудь когда-нибудь предлагал крутую лабу за границей, где вам обеспечивают бесплатное проживание и еще сверху платят стипендию более 300К RUB, ваши профессора — ведущие ученые с мировым именем и заоблачным Хиршем, а вы занимаетесь самым передовым ИИ-рисечем в биологии? Теперь это реально. Приходите послушать опыт Юлии Медведевой сегодня и не упустите свою возможность. 🔗 Крч, очень ждем вас, вебинар начинается в 20:00 мск: ЗАРЕГИСТРИРОВАТЬСЯ Магистратура и PhD в MBZUAI

🌾Новости с полей Друзья, думаем, что среди нас немало тех, кто в детстве был подписан на какое-нибудь печатное издание и ждал каждый свежий выпуск на почте. Что ж, в наши дни не нужно отправляться в отделение или ждать почтальона Коллеги из @agrarianscience делают еженедельный электронный журнал «Аграрная наука» — новости отрасли, актуальные события, публикации, исследования и статьи — от почв и семян до техники, животноводства и агротехнологий. Старая добрая эстетика сохранена, а проблематика — самая современная. 📕 Новый выпуск доступен для скачивания: ознакомиться Если неравнодушны к цветам, полям и братьям нашим меньшим, то #бластим_рекомендует

🔴🔴🔴🔴 Вышел новый №1/2026 журнала «Аграрная наука» 📖 Читайте в выпуске: 🟦Мукомольно-крупяная отрасль: итоги и прогнозы; 🔳Кормовая эффективность как главный ресурс: генетика, экономика и будущее стада; 🟦Как выявлять мастит у коров; 🔳Современные методы дератизации на производственных объектах АПК; 🟦Общеклинические показатели крови служебных собак на фоне влияния гумата калия; 🔳Тестостерон в волосах как прогностический маркер мясной продуктивности бычков; 🟦Особенности молочной продуктивности коров в зависимости от возраста и подбора; 🔳Эффективность трехкомпонентных фунгицидов на основе ингибиторов биосинтеза стерина первого и второго классов против листовых болезней яровой пшеницы; 🟦Урожайность зеленой массы, структура и качество урожая гибридов кукурузы при разных сроках посева в условиях Республики Тыва; 🔳Влияние листовых подкормок на биометрические показатели деревьев яблони; 🟦Агрокластер как эффективный механизм развития растениеводства на региональном уровне; 🔳Белое вино в России: регионы, сорта и стратегические векторы роста. 📄 И много других научных и отраслевых статей. ⬇️Скачать журнал бесплатно

⚡️ Вакансия дня: научный консультант Проект БИОмечтатели запускает программу экспертного консалтинга, чтобы описать научные задачи и разработать концептуальные протоколы их решения по ряду передовых направлений. Что для нас важно? Глубокая экспертиза в одном из этих треков ⤵️

➤ Эпигенетические программы развития ➤ Морфогенез и искусственные органы ➤ Нейронные сети и формы разума ➤ Синтетические клетки ➤ Мультиомная карта человека ➤ Микробиом как управляющая система ➤ Выживание в экстремальных средах ➤ Биоэкосистемы и формы живого ➤ Метатеория старения ➤ Инженерные методы в биологии

При отклике обязательно укажите, в каком треке вы эксперт Требования: 

• Кандидат наук / PhD / MD в биологии, биотехнологии, медицине, вычислительных науках и других • Опыт руководства исследовательскими группами (академия и/или индустрия) • Релевантные публикации, патенты или индустриальные проекты по тематике одного или нескольких треков • Глубокая экспертиза минимум в одном треке • Междисциплинарная коммуникация • Продвинутые навыки работы с LLM для сложных запросов и валидации • Английский B2+

Будет плюсом:

➤ Опыт участия в SAB/научных советах, международных атласах и консорциумах ➤ Проекты или публикации на стыке нескольких треков​ ➤ Опыт наставничества молодых исследователей, участия в стандартизации процессов и данных

Условия:

• Консультационный контракт на 1–3 месяца, гибкий формат, удаленка • Вознаграждение обсуждается индивидуально • Возможно продление сотрудничества, участие в пилотах и международных коллаборациях

Прочитать подобности вакансии и откликнуться можно по ссылке: blastim.ru/job/6484/ #бластим_вакансии

⌛Песок сыплется: наука ищет смысл в закате жизни Почему одни виды живут десятилетиями, а другие лишь несколько часов? Можно ли свести всё многообразие процессов старения к единому принципу и что даст нам такая теория? 23 января в 19:00 мск идем на встречу с Дмитрием Крюковым (AIRI, Сколтех) искать ответы на животрепещущие вопросы! Что будет:

• поговорим о том, в чем различие между биологией старения и медициной долголетия • обсудим эволюционные и механистические теории • выясним, насколько старение универсально и как отличить долгоживущую теорию от однодневки • перечислим критерии хорошести теорий и наметим путь к интеграции

🔗 Регистрация туть: sbsite.pro/BioEvents_1 ❗️Конкурс БИОмечтатей продлен до 1 февраля, дерзайте: ссылка на форму

Last but not least Друзья, лекции БИОмечтателей подходят к концу, однако впереди еще много зажигательных и загадочных анонсов. А пока три заключительные лекции, которые точно стоит отметить в календаре. Регистрируйтесь заранее — участие бесплатное через бота ✨ 23 января в 19:00 мск | Дмитрий Крюков «На пути к универсальной теории старения» Как и почему организм с возрастом меняется, чем антиэйдж-медицина отличается от биологии долголетия, какие гипотезы старения есть и можно ли интегрировать их в одну стройную теорию. ✨ 28 января в 19:00 мск | Виктор Соколов «Быть или не быть — принятие решений в разработке лекарств на основе системно-фармакологических моделей» Могут ли математические модели адекватно подбирают дозы для клиники, прогнозировать действие лекарств и в итоге полностью заменить животных и человеков в испытаниях? ✨ 30 января в 19:00 мск | Василий Акимов «Single cell в изучении диабета 1-го типа: от механизмов к терапии» Как single-cell подходы помогают увидеть клеточные состояния и траектории болезни, отделить сигнал от шума и связать механизмы с потенциальными терапевтическими мишенями. Подробности — скоро. 🔗 Запись и доступ — через бот, участие бесплатное: sbsite.pro/BioEvents_1 Если вам нравятся БИОмечтатели, то поставьте пожалуйста ❤️ чтобы мы продолжали делать подобные активности в будущем

💪 Стать в один ряд с Пашей Дуровым Сегодня ОАЭ — место притяжения технологий, ресурсов и умных людей. Например, туда массово переносят свои штаб-квартиры айти-предприниматели, тот же создатель Телеграм. Если вы хотите оказаться в эпицентре LLM-революции, учиться и делать авангардную науку с потенциалом трудоустройства в Broad Institute, Roche, Google или Nvidia, то приглашаем вас в эту среду 21 января в 20:00 МСК на День открытых дверей в пионерском AI-университете в солнечном Абу-Даби! Спикер: Юлия Медведева, профессор MBZUAI Формат: онлайн Мы расскажем: 🤖 как ИИ помогает решать сложнейшие задачи в лайфсайенс 💡 что такое research-first обучение в MBZUAI под руководством профессоров мирового уровня 💫 к каким проектам Юлии Медведевой можно присоединиться ✍️ как подать документы через Бластим и получить преимущества в рассмотрении вашего досье 💬 Q&A-сессия 🔗 Скорее регистрируйтесь на ДОД: sbsite.pro//web210126_1 #бластим_рекомендует

Как у вас начинается год? У нас, например, с рекордов 🏆 Набор на курс «Анализ NGS-данных» уже превысил 110%... Мы могли бы предложить остальным подождать следующий запуск, но в науке и медицине время — критический ресурс. И Бластим это очень хорошо понимает. Кто мы такие, чтобы ставить на паузу наше дорогое комьюнити! Особенно когда оно настолько заряжено, мотивировано и точно знает, зачем пришло. Почему же всем так срочно нужен NGS? Потому что это уже не «желательный» навык, а бутылочное горлышко многих проектов. NGS-данные есть у всех, а вот умение понимать их, контролировать анализ и интерпретировать результаты по-прежнему остается редкостью. Наши слушатели хотят: • не ждать свободного биоинформатика • видеть весь путь данных от ридов до выводов • уверенно читать статьи • соединять «мокрую» и «сухую» части исследования самостоятельно • чувствовать контроль над своим проектом Курс стартует уже 26 января. И да, если потребуется, мы вместим всех. Именно в такой заряженной компании учеба становится максимально эффективной и зарождаются новые коллаборации. Со своей стороны мы сделаем все возможное, чтобы каждый получил обещанное внимание и поддержку. Если вы думаете присоединиться, лучше сделать это как можно раньше 🙏 Чтобы мы успели подготовиться и привлечь необходимое количество ассистентов для вашего комфортного обучения. Подробнее о курсе и регистрация: agency.blastim.ru/ngs

🐧 Линуксоиды, ждите — мы бежим в вашу пати Друзья, вот и настал второй день изучения Linux, также проходим теорию, но скоро будет практика на сервере План сегодня:

🐧 Подключение по SSH-ключу 🐧 Скачивание и загрузка файлов 🐧 Процессы в Linux 🐧 Tmux. Работаем с комфортом 🙂 🐧 Conda. Виртуальные окружения

Настрой боевой, несмотря на страх и привычку работать с «удобными» интерфейсами. Однако, в биоинформатике иначе никак (если думаете по-другому, напишите в комментариях) Но самое главное — работа команды 🔤Андрей Томаровский и учебный ассистент всегда помогают разобраться и отвечают на все вопросы. Поэтому недопонимания не накапливаются, а обучение идет постепенно и комфортно🔤

Присоединиться к курсу 🎨🎨 🎨🎨 🎨🎨🎨 🎨🎨🎨🎨 🎨🎨🎨🎨 🎨🎨🎨🎨

✨ Ближневосточный Стэнфорд распахнул свои двери для бластимовцев Первый в мире Университет Искусственного Интеллекта имени Мохаммеда бен Заида (MBZUAI) объявил о наборе талантливых иностранных кандидатов на полностью финансируемые магистерские и PhD-программы по вычислительной биологии. MBZUAI — это передовой ИИ-хаб, где ведут исследования и преподают топовые ученые, в том числе из России. Если вы давно мечтали влиться в глобальный айти-движ, а от фразы «ИИ + Биология» ваше сердечко начинает биться быстрее, то приглашаем узнать подробности из первых уст на вебинаре «ИИ-революция в бионауках. Открой MBZUAI». Встреча пройдет 21 января, 20:00 мск онлайн на площадке Бластима. 🤩 Проведет ее Юлия Медведева, к.б.н., специалист в регуляторной геномике, транскриптомике и эпигеномике (scRNA-seq, ATAC-seq), эксперт в области lncRNA, автор в Nature, Nature Communications, PLoS, BMC genomics, Nucleic acids research (h-index = 28 по Google Scholar), профессор в MBZUAI Программа:

📍 напоминалка об ИИ-революции в бионауках 📍 новая магистратура в MBZUAI: что, где, когда и сколько 📍 проекты под руководством Юлии Медведевой, к которым можно присоединиться 📍 сессия ответов на вопросы

✅ Зарегистрироваться тут: sbsite.pro//web210126_1 ✅ Больше о маге и аспе в MBZUAI: blastim.ru/job/6467/ Подавайте заявку прямо сейчас — Бластим окажет помощь в подготовке документов и поступлении. Дедлайн: 10 февраля

🔤🔤🔤🔤 🔤🔤🔤🔤🔤🔤 🔤 🔤🔤🔤 🔤🔤🔤🔤🔤 Друзья, тайный агент Бластим вновь на этом канале, чтобы показать внутрянку мини-курса по Linux. Сегодняшний день посвящен теории и плавному входу в практику на сервере Наш план:

🐧 Понять, что такое линукс и в чем его преимущества 🐧 Ознакомиться с устройством системы, работой сервера и командами для навигации 🐧 Пообщаться с текстовыми файлами 🐧 Сделать первые шаги в потоки данных и пайплайны в Linux

Фанфакт: на днях выложил Линус Торвальдс выложил на GitHub AudioNoise — небольшую утилиту для обработки аудио на гитаре, созданную при участии AI-помощника. 😈 Отец официально вайб кодит?! Это что же? Подрыв устоев? Так или нет, но факт, что Торвальдс — крутой программист, неоспорим. Хотите стать таким же? Сначала выучите Linux и снесите винду! 🐧 Но если серьезно, то текущие выходные очень насыщены: практика с 10 до 15 мск и постепенное погружение в биоинформатику Если решитесь вступить в наши ряды, то вот ссылка, а больше и не нужно До встречи в чате курса 🔤