Бластим: курсы и работа в биотехе

Настоящие ученые не скроллят бездумно ленту, не смотрят рилсы и тиктоки. И даже в свободное время их мысли — только о науке, свежих публикациях, которые надо скорее прочесть, и новых знаниях. Не так ли? 😏 🎉 Именно поэтому в честь праздников сегодня мы открываем доступ к разным видеоурокам и другим образовательным материалам в личном кабинете на сайте Blastim! Совершенно бесплатно угощаем кучей полезностей по Python, статистике, искусственному интеллекту, анализу NGS и карьерным стратегиям. Переходите по ссылке и забирайте всё это счастье: ссылка Всем отличного отдыха — ну и будьте бдительны к ИИ-фейкам 🍢

Устали от датасета iris? Ничего, у Бластим есть calendula 🌼 📺Если вы еще не выбрали сериал на выходные — у нас готов сюрприз для тех, кто в ламинаре и все пропустил. Мы решили выпустить в свободный доступ мини-сериал по мотивам недавнего вебинара. В кадре — Дарья Бородко и Елена Рыбина не щадят выбросы, строят графики и вообще показывают обработку данных высокого полета. Это просто невероятное интеллектуальное удовольствие от кодинга. В первой серии мы разбираем датасет с растениями, которые обрабатывали разными веществами. А хотите маленький приквел о Дарье Бородко?

Сегодня Даша — биоинформатик, статистик, преподаватель Бластим. А всего несколько лет назад была обычной студенткой на нашей же программе по статистике. Тогда, впервые открыв R, она ещё не знала, что это начало большого приключения. Иван Поздняков заметил её прогресс и подбил попробовать себя уже по другую сторону экрана — ассистировать и преподавать. Так Дарья стала постоянной частью команды и любимицей публики. За несколько лет это невероятный рост. Акции NASDAQ так не растут...

Хороший пример заразителен, поэтому скорее смотреть видео: VK video | Rutube | YouTube А эту часть открывать только после просмотра: Видео, конечно, никто смотреть не собирался... все сразу открыли спойлер 😘 Но мы все равно скажем: полный курс по R — это без двух минут занятия с репетитором. Как и на вебинаре, мы будем подробно разбирать ваши данные и внимательно их анализировать. Хотя на самом деле после 3–4 лекций вы уже сможете сделать детальную обработку и датавиз самостоятельно. А к концу курса станете совсем независимым исследователем. Прям таким как Дарья? Прям таким как Дарья!

«„Плохим” дааааааным не сдааается наааааш гордыыыый варяг!» ⛵️ 🫣 Спрятаться от статистики современному исследователю уже не получится. Куда не глянь, абсолютно всё требует статанализа разной степени сложности: от азов до машинки. Даже те области, которые раньше считались сугубо качественными, сегодня обретают количественное измерение. Поэтому если хочешь быть убедительным — надо уметь считать. Ради чего только не осваивают статистику и R! Чтобы доказать неожиданные гипотезы, увидеть закономерности там, где раньше был только шум, разобраться в сотнях таблиц, визуализировать структуру сложных систем. Или просто понимать раздел «Материалы и Методы» в чужих статьях. Мы собрали карточки с историями наших любимых подписчиков — они рассказали, как приплыли в статистическую гавань. Почитайте, это действительно вдохновляет ❤️ А Бластим готов не просто учить статистике, но и копаться с вами в ваших же данных. На очно-онлайный курс «Статистика, R и анализ данных» вы можете прийти в охапку со своими табличками и практиковаться прямо на них. Ведь на своем, знакомом и родном ботать гораздо эффективнее. Программируйте, анализируйте, задавайте вопросы и получайте экспертную поддержку. Можно хоть диссер написать при помощи наших преподавателей и ассистентов 😎 Обещаем, если не разберем ваши данные на курсе — вернем деньги!

⚡️ Понедельник. И опять: статьи, отчеты, заявки, анализ данных, поиск литературы, перевод... Вся рутина обрушивается на вас и пожирает ресурсы и фокус? А ведь еще хочется оставить время для личной жизни? Blastim подготовил мини-курс по интеграции AI в научную деятельность, чтобы показать, как искусственный интеллект уже сейчас может существенно облегчить многие этапы повседневной рутины 🤖 Вы узнаете о ситуации в AI-сфере, получите представления о взаимодействии с чат-ботами и увидите, как AI может стать вашим подспорьем в решении однообразных задач. На практике это значит: 📍 Литературное ревью, отчеты, письма пишутся быстрее 📍 Не нужно отдельно гуглить сложные термины 📍 Перевод и шлифовка текстов на английском — в пару кликов 📍 Генерация кода и дебаггинг — теперь с поддержкой нейросети 📍 Данные визуализируются автоматически 📍 Время на рутину сокращается в разы Чтобы получить доступ к мини-курсу — нужно просто заполнить короткую анкету (3–5 минут). Мы собираем обратную связь от нашей аудитории, чтобы делать еще более полезные продукты — а за ваше мнение дарим готовый инструмент. ✅ Ссылка на анкету ⏳ AI в науке — давно не будущее, а настоящее

А какой градус отдыха у вас?

Безумный Макс, Каци трилогия, Матрица и Звездные войны. Список фильмов на выходные? Нет, кино для подопытных мышей 🎞 В начале апреля в журналах Nature-family вышло сразу 10 статей проекта MICrONS. Это кульминация семи лет работы нейробиологов, которые сделали крупнейший на сегодня коннектом участка мозга млекопитающего. Хотя фрагмент был размером с песчинку, кто-то уже сравнил проект по значимости с Геномом Человека, а другие окрестили его Google Map мозга. Раньше о таком можно было только мечтать. В 1979 г. Фрэнсис Крик заявил, что невозможно создать точную схему соединений нейронов в мозге. 46 лет спустя — это реальность. И не последнюю роль сыграло развитие ИИ. 🪰 Нынешняя работа не просто больше, чем коннектом дрозофилы FlyWire 2023 г. Ныне речь идет о функциональной коннектомике! Коннектомику ругали за статичность, тогда как мозг динамичен. Вот сейчас ученые начали закрывать брешь между структурой и функцией. 🐀 Исследование стартовало в марте 2018 г. и проводилось международным консорциумом из 150 ученых из 22 институтов с разделением труда. Сперва ученые из Baylor College of Medicine с помощью двухфотонного кальциевого имиджинга записали in vivo активность 76 тыс нейронов 1 мм³ мозга зрительной коры одной ГМ-мыши, у которой нейроны флуоресцируют при возбуждении. Животное в это время получало зрительные стимулы — смотрело фильмы и видео на ютуб. 🔬 Далее грызуна отправили в Allen Institute. Специалисты извлекли мозг и буквально 12 дней и ночей потратили на то, чтобы нарезать тот же 1 мм³ участок на 28 тыс тончайших слоев! И следующие полгода изучали каждый срез с помощью просвечивающей электронной микроскопии, чтобы получить фотографии в высоком разрешении и разглядеть анатомию нейронов и глии. 🖼 Наконец, принстонские нейросайентисты под руководством Себастьяна Сеунга провели реконструкцию, превратив микроизображения в 3D-карту клеток и нейронных связей с помощью ИИ! Они использовали сверточные нейросети, чтобы выделить контуры и раскрасить каждую клеточку (задача сегментации). Итоговая диаграмма — это 84 тыс нейронов, 500 млн синапсов, 4 км аксонов. В процессе пришлось создать ряд инноваций: ✍️ Автоматический пруфридинг ML-алгоритмы сегментации хороши, но тоже ошибаются. Поэтому ученые потратили много часов на ручную корректуру. Однако им в помощь был разработан фреймворк на Python NEURD (Neuronal Decomposition) для автоматического разрешения ложных слияний нейронов. 🤖 ML для аннотации типов клеток По молекулярным данным, в коре ~90 типов клеток. Поэтому классификация тысяч нейронов — архисложная задача. Ученые использовали кластеризацию и каскад классификаторов (SVM и многослойный перцептрон). Алгоритмы научились различать 10 типов по ультраструктурным свойствам — ядру и перисоматической области нейрона. Для обучения брали данные, вручную размеченные нейроанатомами. В итоге удалось узнать новое о тормозных нейронах, а также соотнести транскриптомные и морфологические цитотипы. В обеспечении гибкой параллельной работы при корректуре и аннотации типов помогла специальная система контроля версий и управления данными коннектомики, CAVE. 🧠 Функциональная информация Наконец, ученые сопоставили кальциевую визуализацию и 3D-реконструкцию. Это позволило проверить, склонны ли нейроны, паттерны активности которых скоррелированы, чаще соединяться синапсами. Оказалось, да, что подтверждает правило Хебба, важное как для нейронауки, так и для ИИ. Еще машинлернеры обучили Brain Foundation Model предсказывать реакцию и тип нейронов на разные видео, а также создали цифрового двойника зрительной коры мыши, где каждый нейрон получил функциональный штрихкод. 🔍 Все данные в свободном доступе. Открыт MICrONS Explorer — виртуальная обсерватория, где можно всё покрутить-повертеть. А также доступны инструменты на Python. И хотя получилась карта менее 1% мозга, данных собралось 1,6 петабайта, что эквивалентно 22 годам нон-стоп видео 🤯 Как и всякий прорыв в нейросайенс, исследование пригодится для изучения и излечения Паркинсонизма, шизофрении, аутизма. естественный + искусственный нейрон = 💪 #бластим_технологии

Первомайский эксклюзив: человек наук подкинул нам не отдых, а работу 🚩 Владимир Шитов — машинлернер, синглселлщик, преподаватель ML в Blastim и просто человек наук — помогает подбирать крутые вакансии в биотехе специально для наших подписчиков. Спешим поделиться праздничной порцией: 📌 Scientist / Postdoc in Cell and Molecular Biology — Центр молекулярной медицины Макса Дельбрюка MDC (Германия) Для желающих разрабатывать методы исследования синтеза белка в физиологически релевантных условиях с использованием геномного редактирования, синтетической биологии и сингл селл скрининга. Ищут кандидатов с PhD в молекулярной/клеточной биологии, опытом в работе с iPSC и NGS-методами. Дедлайн: 31 мая 2025 Ссылка: clck.ru/3LnbkY 📌 Group Leader in AI and Image Analysis in Biology — Университет Лозанны UNIL (Швейцария) Международный центр в области вычислительной биологии ищет молодого ученого с опытом в моделировании биологических систем и разработке вычислительных подходов с упором на AI и анализ изображений. Приветствуются проекты, связанные с эволюционным анализом, оmics-данными и large-scale датой. Дедлайн: 29 июня 2025 Ссылка: clck.ru/3LnbmR 📌 Any career stage — IRCBC, Chinese Academy of Sciences, Шанхай (Китай) Междисциплинарный исследовательский центр по биологии и химии (IRCBC) приглашает специалистов в области молекулярной и клеточной биологии, нейродегенеративных заболеваний, химической биологии, а также AI-дизайна молекул. Предлагается долгосрочная поддержка, высокая зарплата, современные лаборатории и международная рабочая среда. Особенно приветствуются заявки от молодых исследователей в AI-компьютейшнл биологии, желающих создать независимую группу. Дедлайн: заявки принимаются до заполнения позиции, рассмотрение начнется в июне 2025 Ссылка: clck.ru/3Lnbov 📌 PhD Position in AI for Drug Discovery — Nanyang Technological University (Сингапур) Проект посвящён разработке и применению методов диплернинга для задач в области медицинской химии, персонализированной медицины и здравоохранения. Ищут кандидата с опытом в машинном обучении, знанием языковых моделей и навыками программирования на Python. Начало: август 2025 Ссылка: clck.ru/3Lnbpd 📌 Data Scientist — Scientific AI, Life Sciences, McKinsey (США) Вакансия для специалистов, желающих применять передовые методы AI и машинного обучения для решения сложных задач в сфере здравоохранения, фармацевтики и материаловедения. Роль включает разработку моделей, участие в клиентских проектах, создание прототипов и развитие внутренних инструментов компании. Ищут кандидатов с опытом в ML/AI, математике и статистике, владеющих Python и современными ML-библиотеками. Ссылка: clck.ru/3Lnbq4 📌 PhD Position — AI for Environmental Decision-Making, Monash University (Австралия) Лаборатория профессора Iadine Chades предлагает полностью финансируемые позиции для аспирантов, интересующихся разработкой AI-решений для задач охраны окружающей среды и биоразнообразия. Ссылка: clck.ru/3LnbqZ #бластим_вакансии

⚡️ РАСПАКОВКА В БЛАСТИМ ⚡️ Друзья, прямо перед затяжными весенними выходными Александра из Бластим открывает у нас на канале новую рубрику #бластим_распаковка 🎁 И в первом выпуске — анбоксинг отзывов выпускников прошлого потока курса «Статистика, R и анализ данных» 🤩 Любопытно, как оценивают программу сами участники? Тогда скорее включайте ролик здесь, в телеграм, или на рутуб. А также обязательно посмотрите вчерашний вебинаR с Иваном Поздняковым, если еще не. Идеально для майских каникул 🌼

🔴 C минуты на минуту начинается горячий вечер вторника с маэстро Иваном Поздняковым Друзья, спешите занять ваши удобные кресла, налить себе чай (или что-то покрепче) и подзарядить ноутбуки. Программирование на R, анализ данных, статистика и, конечно, зарплатные ветки вилки ждут вас в прямом эфире 💰 Мы будем кодить в режиме риалтайм и проанализируем самые реальные данные, которых нет в свободном доступе. Вы сможете повторять все действия за опытным датасайентистом и учиться премудростям. Датасет зп уже доступен в личном кабинете всем зарегистрировавшимся. Джойнтесь скорее тоже: ссылка Если у вас есть срочные вопросы по вебинару, то пишите нам в чат @blastim_chat или Варваре @varvara_blastim. Если вы столкнулись с неполадками в боте из-за блэкаутов, то мы рекомендуем перезапустить его (жмякните сюда для перезапуска) И ждем всех в онлайне с вашими вопросами и готовностью включить мозги на 110% 🧠 Этот вечер не забудется никогда 🦁 Rrrrr...

Всех с началом сокращенной рабнедели 🥰 Если у вас все мысли о майских — не переживайте. Мы собрали для вас простой и понятный дайджест самого важного: ключевые курсы и вебинары — без философии, коротко и по делу. 🌻 29 апреля (уже завтра) Бесплатный вебинар «От сырой таблицы до инсайтов: твоя первая обработка данных на R за один вечер» Настройка R-studio, весь базовый R (операторы, функции, присваивание, векторизация, индексирование векторов и NA, приведение типов, матрицы, списки, датафреймы), препроцессинг данных в dplyr, статистические тесты, визуализация на датасете реальных зарплат* под чутким руководством Ивана Позднякова. Такого никогда не было и вот опять: t.me/BlastimR_bot?start=222577 * — мы будем использовать закрытые, но обезличенные данные, без привязки к конкретным компаниям. Никакого разглашения конфиденциальной информации не планируется, просим работодателей не беспокоиться 🌻 С 26 мая Статистика, R и анализ данных Поднатоскайтесь в R для анализа больших биомедицинских и лабораторных данных: научитесь выбирать корректные модели, визуализировать и получать достоверные результаты для диссертации или публикации. Еще больше экспертности от хорошо знакомой команды: Ивана Позднякова, Дарьи Бородко, Елены Рыбиной и других. Ссылка: clck.ru/3Lj9Fb 🌻 С 7 июня Ученый Будущего: интеграция ИИ в научную работу Мощный перезапуск программы. Начните добросовестно применять ИИ для повседневного ресерча. Автоматизируйте анализ биомедданных и узнайте, как еще нейросети помогают в рутине современного ученого. Среди прочего Дмитрий Безжовчий расскажет про «вайб-кодинг», развитие ИИ-агентов, выход ИИ в чебурнет, самые современные ИИ-модели (Gemini 2.5, Claude 3.7 Thinking, GPT 4.1 Sonar) и даже немного DeepSeek. На курсе с мастер-классами выступят: спец по инвестициям в биофарму Андрей Афанасьев, «наш в Оксфорде» Евгений Аккуратов и человек наук Владимир Шитов. Ссылка: clck.ru/3Lj9Gq 🌻 С 8 июля Машинное обучение на Python для решения биоинформатических задач Разберитесь в основах машинного и глубинного обучения для биоисследований и научитесь использовать продвинутый Python и ML на кейсах из актуальной науки (NGS, bulk и single cell RNAseq, мультиомиксные данные). Ссылка: clck.ru/3Lj9JM 🌻 23 – 24 августа Экспресс Linux для NGS Проникнитесь командной строкой, научитесь взаимодействовать с сервером, запускать пайплайны и автоматизировать задачи. Эти навыки — база для работы с вездесущими NGS-данными и в биоинформатике в целом. Двухдневный курс ведет опытный сисадмин Андрей Томаровский. Ссылка: clck.ru/3Lj9L3 🌻 С 8 сентября Анализ NGS-данных Практический курс по ключевым областям NGS: сборка и аннотация геномов, снип-коллинг, транскриптомика, эпигеномика, метагеномика. Прокачайте навыки в R, Python, командной строке и передовых биоинформатических тулах под руководством звездной команды преподавателей. Ссылка: clck.ru/3Lj9MY 🌻 Осень 2025 Python для анализа данных в науке С нуля приручите Python, разберитесь с самыми популярными библиотеками, научитесь обрабатывать большие данные, визуализировать их и находить закономерности. В конце вы получите универсальные навыки, проекты в портфолио и удостоверение гособразца. Ссылка: clck.ru/3Lj9TJ #бластим_дайджест

А теперь — карты на стол 🃏

🥇Ожидаемый лидер В настоящее время сохраняется спрос на специалистов в биоинформатике. У них был наибольший прирост медианных зарплат (+39%) за 2022–23 года. Этот тренд связан с продолжающимся развитием технологий и их активной интеграцией в научные исследования, разработку новых продуктов. Работодатели ищут квалифицированных специалистов, готовых адаптироваться к быстро меняющимся условиям.

🤨 Почему медиана, а не среднее? Медиана устойчивее к выбросам. Пара топ-менеджеров с заоблачными зарплатами может исказить среднее, сделав его нерепрезентативным для реального рынка.

🤯 Неочевидное наблюдение Медианная зарплата в Москве и Санкт-Петербурге оказалась ниже, чем в регионах. Наша гипотеза: в регионах работают крупные компании, готовые платить больше. В столицах же доминируют НИИ и университеты с куда более скромными зарплатами 🥲

👍 При этом есть и радостные вести для столичных жителей: в Москве и Московской области за 2022–23 гг. наблюдался наибольший прирост зарплат — на 12%. В регионах — без изменений.

🧮 Как мы считаем? Всё благодаря Ивану Позднякову — нашему аналитическому папе. Он проводит эксплораторный анализ, проверяет гипотезы и строит обалденно красивые графики в R. Угадать тренды трудно и наша интуиция часто подводит. Правду помогает узнать статистика 😍 И у нас невероятная новость 😍 29 апреля на вебинаре «От сырой таблицы до инсайтов: твоя первая обработка данных на R за один вечер» мы дадим доступ к эксклюзивным сырым данным о зарплатных вилках, указанным работодателями в закрытом режиме за последние годы на blastim.ru 📌 Вы сможете сами сделать анализ трендов под руководством Ивана, даже если никогдашеньки не кодили 📌 Вы построите с нуля свои первые графики в R 📌 Вы узнаете все скрытые тенденции рынка биотеха и обсудите их с коллегами Идеальный план на вечер вторника? Тогда регистрируйтесь скорее, пока все места на вебинар по анализу зарплат не разобрали эйчары: t.me/BlastimR_bot?start=222577

🍴 Бластим снова покусился на святое, на зарплаты Уже много лет наша команда делает обзоры зарплат в российском биотехе. Благодаря порталу с вакансиями blastim.ru мы получаем доступ к зарплатным вилкам и другой закрытой информации 🧜 Мы знаем рынок изнутри, без прикрас. За нашим обзором зарплат охотятся и HR, и соискатели. Там, где мы показываем результаты, собираются сотни людей, а в зале только и щелкают камеры смартфонов. Давайте проверим, насколько хорошо вы чувствуете рынок. Угадаете тренды последних лет?

🙏 Вера в identity(), надежда на join() и любовь к mutate(): вебинар с настоящим Pipe-тификом Да, мы держали вас в напряжении, но it was well worth the wait. Уже 29 апреля произойдет поистине божественное: статистик c даром свыше Иван Поздняков проведет сакRальный вебинар «От сырой таблицы до инсайтов: твоя первая обработка данных на R за один вечер». Впервые похожую встречу Иван провел год назад. Это должен был быть «мягкий интродакшн». Но все правила были снесены энергией Ивана: он выдал такой поток информации, что участники до сих пор вспоминают тот день с загадочной улыбкой. Головы кипели, но глаза горели. И вот, мы возвращаемся. Только теперь с новой фишкой 😶 ❓А мне точно нужен этот мастер-класс? R — популярнейший язык программирования, специально заточенный под анализ данных в науке. Универсальный навык, который приятно иметь при себе для любых поворотов судьбы. С первого взгляда R может вызвать ощущение бардака: словно сумка, полная важных мелочей. Нужное всегда оказывается где-то на дне. На вебинаре мы как раз все достанем и разложим по полочкам. За 3 часа от отрицания к принятию и полная исповедь: ❕установка rstudio (posit) ❕базовый R — загрузка данных и первые таблицы ❕dplyr и ggplot2 — главные инструменты для толкового анализа ❕Quarto — волшебные отчёты, которые хочется показывать ❕фишки, приемы и житейские советы от Ивана Позднякова — проверенные, понятные и местами гениальные ❓А стоит ли идти, если я был(а) в прошлом году? Конечно. Потому что знания — как глазурь на куличе. С каждым новым слоем только вкуснее. Да и каждый вебинар Ивана — неповторимая авторская проповедь. Даже мы не знаем, куда он уведет нас на этот раз. ❕А вот с чего начнем — знаем. Но о данных, с которыми будем работать, расскажем завтра. Только намекнем: это точно то, что интересует любого подписчика нашего канала. Есть идеи? Делитесь в комментариях (пасхалки ищите на картинке) 🤫 Когда? 29 апреля, 19:00 мск Регистрация тут: t.me/BlastimR_bot?start=222577 На вебинаре мы обратим вас в R-ство 😇 ВНИМАНИЕ: хотите больше, чем один вебинар? Не надо молиться на ночь, Дездемона, надо регистрироваться на полный курс «Статистика, R и анализ данных». Ведь сегодня последний вечер действует самая минимальная цена. Плановое повышение уже на пороге — не трагедия Шекспира, конечно, но цена взлетит драматично.

У нас есть pope pipe %>%