🔷شبکه بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی ایران🔷

دوستان عزیز. در صورت امکان چند ثانیه از وقت خود را به کودکان محک اختصاص دهید و در این کارزار شرکت فرمایید؛ به منظور حمایت از کودکان محک "درخواست ادامه همکاری با پزشکان حاذق بیمارستان محک" Karzar.net/18937 با به اشتراک گذاری این لینک و ارسال آن برای دیگران، نسبت به جمع آوری امضا اقدام کنیم.

متاسفانه یکی از مشکلاتی که در بین مردم و علی الخصوص مسئولان و مدیران کشوری وجود دارد عدم مطالعه و عبرت گیری از تاریخ هستش. برای مثال: در کتاب غرش طوفان الکساندر دوما مثال جالبی از فاصله بین تفکر مسئولان و دغدغه مردم میزنه. در سال ۱۷۹۰ قبل از انقلاب فرانسه مردم اوضاع اقتصادی خوبی نداشتن و درواقع خیلیا از گشنگی میمردن و هیزم واسه زمستون مردم پیدا نمیشد (شما مقایسه کنید با شرایط حال حاضر ما)، نمایندگان مجلس داشتن قانونی میذاشتن که آیا از این به بعد به لویی شانزدم اعلیحضرت بگن یا نه. دقیقا مثال الان ماست: - وضعیت آب خوزستان - آمار بیکاری - میزان مهاجرت نخبگان کشور - و ... ولی نمایندگان ما نشستن در مورد مسائلی تصمیم گیری می کنند که نه تنها اوضاع مردم رو بهتر نمی کنه در عوض محل نون اوری خیلیا رو قط می کنه. و اما آیا سوال اینجاست که آیا اینا عمدا میخوان مردم رو زجر بدن یا اینکه نه از سر خوشی خودشون (حقوق و مزایای بالا و ...) به این کارا دست میزنن. در کل آینده مملکت به هر سمتی که می خواد بره فقط کاش طوری باشه که زندگی مردم روبه راه بشه و خدا بهمون رحم کنه.

#توزیع_ها_ی_معروف_لینوکس Redhat: یکی از پرطرفدارترین و معروف ترین توزیع های لینوکس می باشد که کاربرد تجاری داشته و بیشتر جهت مصرف در سیستم های سرویس دهنده استفاده می شود و شرکت های بزرگ سخت افزاری مانند IBM و Dell در سیستم های خود پشتیبانی می کنند. Ubuntu: عضو تيم توسعه Debian و در آن فايرفاكس و Open Office به کاربر ارایه گردیده است. این توزیع یک توزیع رایگان می باشد و مخصوص استفاده خانگی است. Arch Linux: یک توزیع که بر پایه قوانین KISS بنا شده همراه با سیستم انتشار Rolling. Slackware: اين توزيع لينوكس بيشتر براي حرفه اي هاست چون تمام مراحل پيكربندي كاملا دستي واز طريق خط دستوري انجام میشود. CentOS: یک توزیع که از همان سورسی که redhat استفاده می‌کند، مشتق شده است، توسط یک گروه داوطلبی که به آن اختصاص داده شدند، نگهداری می‌شود همراه با سازگاری 100% با ورژن Redhat و یک ورژن به روز رسیده شده که همیشه به‌طور 100% سازگار و همراه نیست. Debian: یک توزیع غیر تجاری که توسط جامعه‌ای از توسعه دهنده‌های داوطلب نگهداری می‌شود که تعهد قوی ای به قوانین نرم ‌افزارهای آزاد دارند. Fedora: یک توزیع بر پایهٔ جامعه است که توسط Red hat سرپرستی می‌شود. اين توزيع كه مي توان گفت از Redhat گرفته شده براي كاربران معمولي لينوكس داراي پيچيدگي هاي بيشتري است، اما نقطه قوت آن را مي توان در نوآوري در طراحي و پشتیبانی گستره وسيعي از نرم افزارهاي مبتني بر لينوكس در Fedora دانست. Gentoo: روش نصب در اين توزيع اگرچه در آغاز به شکل كامپايل كردن بود اما بعدا امكان افزودن پکیچ RPM به آن افزوده شد. Knoppix: اولین توزیع سی دی زنده، که کاملا از یک رسانهٔ قابل حمل اجرا می‌شود. بدون نصب در دیسک سخت. از Debian گرفته شده و اين توزيع پس ازبوت شدن در كامپيوتر كاربر، بسياري از انواع نرم افزارهاي ريزودرشت مانند چندين مرورگر اينترنتي، چندين برنامه office را به وي ارائه مي كرد بطوري كه كمتر كاربري لازم مي دانست برنامه اي را نصب نمايد. Mandriva: یک توزیع گرفته شده از Redhat که در فرانسه و برزیل محبوب می باشد، امروزه با همان نام و به ‌وسیله یک شرکت فرانسوی اداره می‌شود. اين توزيع امروزه يكي از لينوكس هايی با محيط زيبا و قابل اطمينان است كه از برنامه Rpm Drake براي نصب آسان بسته هاي RPM استفاده ميكند. OpenSUSE: اين توزيع هم به مانند Ubuntu هم باميزكار GNOME و هم KDE ارائه مي شود. منبع: رسالینوکس @computational_science

#انتخاب_لینوکس برای اینکه بتوانید یک نسخه متناسب با نیاز خود انتخاب کنید بایستی سئوالات زیر را ابتدا از خود بپرسید و بر حسب آن توزیع لینوکس مورد نظرتان را را انتخاب کنید: آیا پایه و اساس کد توزیع مورد نظر قابل اتکا و اعتماد است؟ آیا مرتبا مورد تغییر واقع می شود؟ آیا بروزرسانی بسته های نرم افزاری آن راحت است؟ آیا بروز رسانی آن از یک نسخه به نسخه بالاتر راحت است؟ آیا برنامه نویس های زیادی برای آن نرم افزار تولید کرده اند؟ فراموش نکنید که هیچ نسخه بهترینی در لینوکس وجود ندارد. برای درک بهتر این موضوع به این مثال توجه کنید: شما وقتی که به کوهنوردی می روید، کفش کوهنوردی، کوله، لباس بادگیر و ضد آب می پوشید، وقتی برای یک مهمانی دعوت می شوید کت و شلوار و کفش رسمی می پوشید و وقتی هم که به ورزش می روید لباس گرمکن و کفش ورزشی به پا می کنید و در نهایت برای انجام کارهای روزمره خودتان هم لباس مخصوص خود را دارید. این دقیقا چیزی است که در لینوکس مشاهده می کنید، اینکه چه نسخه ای از لینوکس جوابگوی کار شما است کاملا به این بستگی دارد که شما از لینوکس چه انتظاری دارید و در کجا می خواهید از لینوکس استفاده کنید؟ لینوکس برای هر محیطی یک محصول ویژه آن دارد اکثر کاربران لینوکس ترجیح می دهند که از نسخه های شناخته شده لینوکس استفاده کنند. این نسخه ها معمولا دارای پشتوانه قویتری نسبت به تیم های پشتیبانی سایر توزیع های لینوکس هستند. منبع: رسالینوکس @computational_science

#خدمات_مرکز_زیست_محاسبات_پویا 💥خدماتی که #زیست_محاسبات_پویا تو حوزه شبیه سازی ارائه میده شامل: - روش های شبیه سازی شامل: 1- شبیه سازی All-atom 2- شبیه سازی United-atom 3- شبیه سازی coarse-grained 4- شبیه سازی SMD (Steered Molecular dynamics simulation) 5- شبیه سازی TMD (Targeted Molecular dynamics simulation) 7- شبیه سازی Normal Mode 8- و .... -سیستم های مولکولی قابل شبیه سازی 1- پروتئین 2- پروتئین-لیگاند 3- مولکول DNA 4- پروتئین-DNA 5- نانوذرات کربنی (نانولوله، گرافیت، فولرن و ...) 6- سیستم های غشایی (غشاء، وزیکول، میسل و ...) 7- نانوکریستال ها (هماتیت، مگنتیت و ...) 8- جذب و رهایش دارو 9- گلیکوپروتئین های و گلیکو لیپیدها 10 و ... با ما در ارتباط باشید @zistpooya_co www.zistpooya.com آدرس کانال: @computational_science

💥 مدرسه تابستانه کالج بیوانفورماتیک ⚡طول دوره : ۱۰ هفته ⚡️ ۲ روز در هفته ساعت ۱۷ الی ۲۰ ⚡شروع دوره : ۲۰ تیر ⚡با ارائه سرتیفیکیت انگلیسی معتبر ⚡️۴ دوره آموزش تخصصی برنامه نویسی آر یا پایتون ⚡️۱ دوره آموزش تخصصی ماشین لرنینگ ⚡️۲ دوره آموزش تخصصی لینوکس ⚡️۳ دوره آموزش تخصصی NGS یا متاژنومیکس. 💥 تعطیلات تابستان فرصتی طلایی برای حرفه ای شدن 💥۱ میلیون تومان تخفیف ویژه جشنواره تابستانی کانال کالج بایوانفورماتیک به منظور ارائه آموزش در حوزه های مختلف 🧪 متاژنومیکس، 🧬 آنالیز توالیهای نسل جدید، 🦠 آنالیز شبکه های زیستی، 💊 طراحی دارو،🪄طراحی الگوریتم،📊 آمار زیستی، 💻 برنامه نویسی پایتون، آر و سی، 🤖 ماشین لرنینگ و 🔍 دیتاماینینگ ایجاد شده و تلاش خواهد کرد با ارائه بیش از هزار 🎞 فیلم آموزشی رایگان و برگزاری ورکشاپهای تخصصی پیشگام آموزش نوین این رشته باشد. لینکهای کانال کالج بایوانفورماتیک اینستاگرام Instagram.com/bioinformaticscollege تلگرام @BioinformaticsCollege وبسایت https://BioinformaticsCollege.ir

#نرم_افزارهای_مفید LOMETS (Local Meta-Threading-Server)-UNIVERSITY OF MICHIGAN نر مافزار LOMETS یک نرم افزار آنلاین است که برای پیشگویی ساختار 3 بعدی پروتئین ها به کار می رود. این نرم افزار مدل های 3 بعدی با امتیاز بالا از آلاینمنت رشته الگو برای کاربر فراهم می کند. که برای این کار از 9 برنامه های تریدینگی که به صورت local در کامپیوتر نصب می شوند استفاده می کند. که این برنامه ها شامل (FFAS-3D, HHsearch, MUSTER, pGenTHREADER, PPAS, PRC, PROSPECT2, SP3, and SPARKS-X) است. نصب local این برنامه ها باعث می شود که سرعت مدل کردن ساختارها افزایش یابد و همچنین دقت کار بالا رود. پیشگویی ساختار 3 بعدی که وب سرور LOMETS انجام می دهد حداقل 7% دقیق تر از کامپیوترهای شخصی پیش بینی ساختار سوم است. بعد از وارد کردن اطلاعات ورودی، این وب سرویس حدود 160 مدل را به ما ارائه می دهد که از بین این مدل ها 10 مدل برتر انتخاب می شوند و آنالیزها و مطالعات بر روی این 10 مدل ادامه می یابد. انتخاب مدل های برتر بر اساس امتیاز-z (z-score) می باشد و هر مدلی که امتیاز-z کمتری داشته باشد به عنوان مدل برتر انتخاب می شود. برای مطالعه بیشتر می توانید به لینک زیر مراجعه فرمایید. http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/LOMETS/ @computational_science

پردیس علوم دانشگاه تهران, [۰۹.۰۶.۲۱ ۱۸:۵۸] [ Photo ] 🔹پردیس علوم دانشگاه تهران برگزار می‌کند: 📌وبينار شبانه‌های زيست شناسی 📌چهارشنبه هر هفته ساعت ۲۱ تا ۲۲ 🗓آغاز وبینارها: دوم تیرماه ۱۴۰۰ 📍لينك ثبت نام رايگان:👇 https://science.ut.ac.ir/web/biology/bio-night-lectures @UTSCIENCES

🎞 ذهن زیبا ۲ 🔸پنل گفت‌وگو در خصوص فرصت‌ها و چالش‌های زنان دانش‌پژوه در ایران 📌 به همراه رونمایی از اولین مستند انجمن درخصوص جایگاه زنان در علم 📆 ‌شنبه ۲۲ خرداد، همزمان با روز دختر ⏰ ساعت ۱۹-۲۱ 🏛 اتاق مجازی انجمن علمی ‼️ حضور در این رویداد برای تمام علاقه‌مندان آزاد هست اما پیش‌ثبت‌نام به @Sinagarazhian یا اینجا ضروری است! @ut_biotech

✅ همراهان گرامی کنفرانس زیست شناسی سامانه ها، شروع برنامه ها ۲۹ اردیبهشت راس ساعت ۹ صبح می باشد. شما می توانید با ورود به لینک زیر با ثبت نام و نام خانوادگی به عنوان کاربر مهمان وارد کنفرانس شوید. درصورتی که قبلا وارد این سامانه شده‌اید فقط بر روی گزینه مهمان کلیک کنید. https://www.skyroom.online/ch/nigeb/icsb2021 🇮🇷The 4th Iranian Conference on Systems Biology 🦠🧬💉💊🧫🔬 متفاوت ترین رویداد زیست-پزشکی کشور 🇮🇷🇮🇷🇮🇷 🆔 @ICSB2021

📣🔔💡دانشگاه تهران با مشارکت گسترده مراکز علمی داخلی و بین المللی برگزار می کند: 📌 دومین همایش بین‌المللی علوم و فناوری نانو زمان: ۱۶ مرداد ۱۴۰۰، دانشگاه تهران برگزار کننده: پردیس بین المللی ارس دانشگاه تهران ❎ دارای مجوز ISC و وزارت علوم ❎ اعطای گواهینامه فارسی و انگلیسی ❎ داوری زودهنگام مقالات ❎ برگزاری همایش به صورت غیرحضوری ⚠️ثبت نام و کسب اطلاعات بیشتر: 🌐 utnano.ir ☎️ 09363637590

مدعو گرامی شما هم اکنون دعوتید به متفاوت ترین رویداد بیولوژی کشور پخش آنلاین: https://www.skyroom.online/ch/nigeb/icsb2021 🇮🇷The 4th Iranian Conference on Systems Biology 🦠🧬💉💊🧫🔬 متفاوت ترین رویداد زیست-پزشکی کشور 🇮🇷🇮🇷🇮🇷 🆔 @ICSB2021

#التماس_دعا در این شب های عزیز از درگاه خداوند برای همه آرزوی سلامتی و تندرستی داریم

سفر به دنیای اتم ها

❇️ چهارمین کنفرانس زیست شناسی سامانه های ایران (سیستم بیولوژی) 🔰پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری 🔰28 و 29 اردیبهشت ماه 1400 🧑‍💻👩‍💻 برگزاری مجازی (کنفرانس آنلاین) 👈 ورود به سایت کنفرانس 🇮🇷The 4th Iranian Conference on Systems Biology 🆔 @ICSB2021

📣🔔💡دانشگاه تهران با مشارکت گسترده مراکز علمی داخلی و بین المللی برگزار می کند: 📌 دومین همایش بین‌المللی علوم و فناوری نانو زمان: ۲۶ خرداد ۱۴۰۰، دانشگاه تهران برگزار کننده: پردیس بین المللی ارس دانشگاه تهران ⚠️ثبت نام و کسب اطلاعات بیشتر: 🌐 utnano.ir ☎️ 09363637590

💢 یک مرکز تحقیقاتی در تهران اقدام به جذب نیروی امریه (خدمت سربازی) با مدرک کارشناسی ارشد و یا دکتری در رشته های علوم زیستی، بیوانفورماتیک و سایر رشته های مرتبط جهت فعالیت در حوزه تحقیقات پزشکی سرطان نموده است. 🔸از واجدین شرایط دعوت به عمل می آید تا رزومه خود را به آدرس ایمیل ذیل با قید "امریه" در عنوان ایمیل، ارسال نمایند. تاریخ انتشار درخواست ۱۴۰۰/۰۱/۱۶ 📧 cancergeneticsgroup@gmail.com

در این سال جدید آرزو داریم تمام مردم ایران به آرامش برسند و دلشون پر از شادی، تنشون سالم و زندگیشون پربرکت باشه. سال نو مبارک🌹🌹🌹🌹🌹

#I-TASSER همونطور که هممون می دونیم سرور I-TASSER برای مدلسازی ساختار سه بعدی پروتئین ها مورد استفاده قرار می گیره و از لحاظ دقت در مدلسازی یکی از بهترین سرور ها هستش. نکته جالب توجه در مورد این سرور تعداد کاربرای مختلف این سرور از کشورهای مختلف هست که ایران در رتبه ۹ از لحاظ تعداد کاربرای این سایت قرار داره (تصویر زیر نشون دهنده تعداد کاربرای این سرور واسه ۱۹ کشور اول هست.)