Бластим: курсы и работа в биотехе

✨ Как тебе такое, Бертолуччи? Конкурс БИОмечтателей продолжает прием заявок. Мы знаем, что сформулировать задачу для конкурса может быть сложнее, чем казалось на первый взгляд. В помощь вам мы собрали целый пост с эталонными примерами, на которые стоит ориентироваться при подаче заявки — и по амбициозности, и по оформлению. 💕 Своими сокровенными идеями поделились участницы нашей команды: Кристина Крицкая — к.б.н., научный сотрудник, исследовательница механизмов старения, Ира Евдокимова — ведущая проекта БИОмечтатели и медиа Femtech Force о технологиях женского здоровья и Вита Степанова, директор Бластима! Свайпайте карточки, чтобы вдохновиться и понять, как правильно формализовать свою самую безумную научную мечту, да и просто познакомиться с нами поближе. Напоминаем, что подать свою заявку можно по ссылке: https://forms.yandex.ru/cloud/693c1a93e010db35fd797439/ Мы принимаем до 5 заявок от одного участника ⚠️ Дедлайн — 20 января ⚠️

Митохондрии помнят все ⚡️ Когда говорят о геноме человека, чаще всего имеют в виду только ядерную ДНК. При этом о митохондриальной ДНК (мтДНК) длиной чуть более 16.5 тысяч пар оснований нередко забывают. Давайте восстановим справедливость! ❓ Что делает мтДНК особенной? • В мтДНК есть множество полиморфизмов, связанных с гаплогруппами. • Практически отсутствуют некодирующие области. • Частота мутаций выше, чем в ядерной ДНК, из-за меньшей защищенности и слабых механизмов репарации. • МтДНК наследуется по материнской линии, что делает ее удобным маркером для изучения родства и миграций. • В одной клетке может присутствовать несколько вариантов мтДНК. Это явление называется гетероплазмией. • Нарушения митофагии (утилизации поврежденных митохондрий) связаны с хроническими и нейродегенеративными заболеваниями. ❗️Основные области применения анализа мтДНК • Медицина • Популяционная генетика и антропология • Криминалистика и судебная экспертиза • Палеогенетика Главное преимущество мтДНК при работе с древними образцами — ее количество. В каждой клетке содержатся тысячи копий митохондрий. Благодаря этому мтДНК можно анализировать даже тогда, когда ядерная ДНК сильно разрушена, плохо извлекается или присутствует в минимальных количествах.

👑 «Царская» гетероплазмия МтДНК сыграла важную роль в идентификации останков императорской семьи Романовых. На первых этапах экспертизы у исследователей не было заведомо подлинных образцов ДНК Николая II для прямого сравнения. Однако при анализе мтДНК из костных останков была обнаружена редкая гетероплазмия — присутствие двух вариантов мтДНК, отличающихся одной мутацией (замена C→T в позиции 16169). Поскольку мтДНК наследуется строго по материнской линии, эта особенность должна была присутствовать и у его родственников по матери. После эксгумации останков брата Николая II, великого князя Георгия, было выявлено полное совпадение мтДНК, включая ту самую редкую «царскую» гетероплазмию. Позднее эта же мутация была обнаружена и у правнучки сестры Николая II. Таким образом, мтДНК стала одним из первых ключевых доказательств подлинности останков.

Кстати, прошлым летом у нас проходил вебинар «От ридов к интерпретации: анализ NGS-данных митохондриальной ДНК» с Дарией Бородко — биоинформатиком, сотрудником НИИ общей патологии и специалистом по эпигенетике и анализу древней ДНК. ✉️ Хотите получить конспект с пайплайном анализа NGS-данных и памяткой по полезным веб-сервисам? Просто напишите Варваре @varvara_blastim: «Хочу конспект по мтДНК»

🧐 Всё или ничего? Извольте дать ответ Клетки постоянно получают поток информации из внешнего мира. Но как они решают — запустить в ответ сигнальный путь или оставить всё как есть? Это вопрос, который выходит за рамки простой схемы «стимул — реакция», превращаясь в запутанную молекулярную логику. Что ж, в ее тонкостях разберемся 19 января в 19:00 МСК вместе с Мариной Уткиной.

Марина — старший научный сотрудник Эндокринологического НЦ, эксперт по CRISPR и single-cell, PhD по молекулярной генетике (Институт генетики РАН), автор в Frontiers, Nucleic Acids Research.

На лекции узнаем, как изучить и проследить путь от множества стимулов к клеточным решениям на конкретных примерах. 🔗 Регистрация по ссылке в боте: https://t.me/BioEventsBot

⚡⚡⚡ Очень трудно сделать точный прогноз, особенно в том, что касается будущего... Друзья, чтобы скрасить ожидание вебинара с Алексеем Зарубиным и проверить себя, предлагаем ответить на несколько задачек Голосуйте в опросах ниже, а подробный разбор, конечно же, будет сегодня в 19:00 мск Ждем всех! 🔗 Зарегистрироваться на вебинар

❓ 10 вопросов БИОИНФОРМАТИКУ Почти три года минуло с прошлого интервью с преподавателем курса «Анализ NGS-данных» и просто очень крутым ученым Алексеем Зарубиным. Что с тех пор изменилось в карьере и жизни Алексея? Как повлияла на его повседневную работу ИИ-революция? Что помогает выдерживать много часов за компьютером и не выгорать? И даже: какое надо железо, чтобы делать серьезную науку? Это и многое другое мы спросили у Алексея. Читайте эксклюзив на нашем сайте А свои вопросы, особенно про ИИ, готовьтесь задавать на вебинаре — уже завтра в 19:00 мск

↗️ Маленький шаг сегодня, большие данные завтра Участники курсов часто приходят к нам по совету коллег. Для нас это очень ценно. Но многие не останавливаются на одной программе, а продолжают обучение и дальше. А это, пожалуй, даже более показательный фидбэк для нас. Спасибо огромное за доверие! Чаще всего выпускники остаются с Бластим из-за комьюнити, где все говорят на одном языке и с которым легче влиться в новую среду. Кроме того, преподаватели и ассистенты буквально вытягивают вас за руку на основную ступень понимания предмета. С нее уже яснее видно, куда двигаться дальше. В итоге слушатели частенько открывают для себя новые направления и нередко кардинально меняют взгляд на свою карьеру и возможности. Поэтому делимся тем, как прошел осенний поток курса: https://rutube.ru/plst/1414377 Самый же частый совет новичкам: не бояться пробовать и действовать. Даже если пугает объем информации или страх ошибок заставляет прокрастинировать. С каждым шагом путь становится понятнее, проще и даже веселее. А благодаря записям занятий можно пройти по одной и той же тропинке столько раз, сколько нужно для полного освоения. Тем, кто все-таки не уверен в себе (или в нас?), мы советуем попробовать самый доступный мини-курс по Linux уже в эти выходные. На нем вы получите универсальные и востребованные навыки для любой сферы. Пора почувствовать свободу и уверенность в том самом черном терминале. Кто знает, возможно, это станет вашим билетом в мир больших данных

Миллион, миллион, миллион алых VUS Отсеквенировать быстро и много? Без проблем. Биоинформатически обработать? Пожалуйста. А вот клиническая интерпретация NGS-данных до сих пор остается бутылочным горлышком в воркфлоу. Эксперты денно и нощно фильтруют и анализируют тысячи найденных вариантов, сопоставляя информацию из баз данных и других источников. Это тяжкий труд, требующий высокой квалификации, опыта и смекалки. К тому же вердикты разных специалистов могут конфликтовать, да и профессионалов не всегда легко найти, когда приходит пул новых данных секвенирования. А пациенты ждут диагноза... ❗️ Но сейчас есть тот, кто готов пахать 24/7 и на кого можно свалить рутину. Поэтому — внимание: 15 января в 19:00 мск биоинформатик Алексей Зарубин покажет практикум ИИ-автоматизации в задачах геномики. Мы потестим большие языковые модели (GPT, Gemini) и узнаем:

🧬 как запромтить задачу классификации генетических вариантов по критериям ACMG? 🧬 совпадут ли оценки патогенности ИИ с консенсусом живых экспертов? 🧬 где и почему нейросети ошибаются, а когда они хороши?

💡 Бонусом рассмотрим новый инструмент от Google, который релизнули в начале декабря Онлайн-семинар будет полезен всем, кто занимается клинической интерпретацией, медицинской генетикой и интересуется БАМами и БЯМами 🔗 Регистрироваться по ссылке: https://sbsite.pro//web150126_1 Пропускать такой веб — не вариант

❄️ Ямщик, погоняй! Друзья, праздники подходят к концу и Адвент-кониндарь Бластим вместе с ними. Давайте заложим капсулу времени. Напишите короткое письмо себе: ❤️за что вы можете поблагодарить себя по итогам 2025 года; ❤️какие решения, подходы или состояния вы не хотели бы повторять в дальнейшем; ❤️какие обязательства вы готовы взять на себя как исследователь и как человек в 2026 году. Сохраните это письмо и вернитесь к нему через год — при подведении следующих итогов. Тому, кто первым 🎄🎄 отправит скрин всех 🎄🎄 написанных заданий 🎄🎄 в @varvara_blastim — мы подарим скидку 90% на любой курс 💬 Мы искренне верим, что осознанная научная карьера строится шаг за шагом — и рады быть частью этого пути

💨 От топота копыт пыль по полю летит Переворачиваем очередную страницу Адвент-кониндаря. Сформулируйте в письменном виде: 🌲один ключевой фокус следующего года (приоритетный навык, направление деятельности или профессиональная позиция); 🌲две–три вторичные цели, поддерживающие основной вектор; 🌲результат, который вы хотели бы зафиксировать при подведении итогов в январе 2027 года. Ориентируйтесь не на идеальные сценарии, а на реалистичные цели. 💬 Если для их достижения вам понадобится начать лучше разбираться в данных, автоматизировать рутину или почувствовать себя увереннее в статистике — вы знаете, где нас найти

Трудности перевода: почему у растений геном ≠ функция? У «зеленых» всё не как у людей. Посудите сами. Растения могут спокойно пережить удвоение генома (но могут и умереть). Да и геном у них не один, а целый тройничок — ядро-пластиды-митохондрии. А энергетические станции в их клетках — вообще самые странные в биологии. Эти и другие фичи делают функциональную аннотацию генома растений затруднительной. Как быть? На помощь спешит транскриптомика! Именно этим вопросам посвятим встречу 13 января в 19:00 МСК с Максимом Макаренко — ведущим научным сотрудником Университета «Сириус», PhD по генетике подсолнечника, автором 30+ статей в Plant J, Genes, BMC Biology. Вы узнаете, что такое гибридная сила, почему single-cell ломается об растения, как найти полезные гены и применить их в агротехе. Доступ на лекцию по ссылке: sbsite.pro//BioEvents_1 Присоединяйтесь🌻 P.S. Участвуйте в конкурсе БИОмечтателей: https://forms.yandex.ru/cloud/693c1a93e010db35fd797439/

От работы кони дохнут Пришло время задать себе неудобные вопросы: ➡️ вам всё еще интересно то, чем вы занимаетесь? ➡️ вы развиваетесь по инерции или осознанно? ➡️ если ничего не менять, где вы будете через 2–3 года? Запишите ответы без цензуры 💡 Иногда обучение становится не обязательством, а инструментом переосмысления — оно помогает по-новому взглянуть на свои задачи, роль в науке и возможные направления дальнейшего развития

🦷 Дареному коню в зубы не смотрят Неделя нового года пролетела. Отдышались и садимся считать! Задача этого дня Адвент-кониндаря — провести аудит финансовой стороны вашей профессиональной деятельности за прошлый год: 🤍определите основные источники дохода (гранты, стипендии, проектная работа, консультации, репетиторство, подработки); 🤍отметьте ситуации, в которых ваш вклад и экспертиза были недооценены или оплачены ниже их реальной стоимости; 🤍проанализируйте проекты и активности, в которые вы инвестировали время и ресурсы, но которые не дали ожидаемой отдачи. Этот анализ необходим для выстраивания более устойчивой и управляемой траектории в 2026 году. 💬 Дополнительные навыки статистики, программирования и создания ИИ-агентов открывают новые источники дохода — это то, зачем многие приходят в Бластим Обнимаем всех 🫂

ИИтоги 2025 года Решил широкими мазками описать, что происходило в мире искусственного интеллекта за год. Смотрите дайджест (с мемами!) в статье на Хабре #программирование@chelovek_nauk

Нет ничего естественнее, чем начать год с искусственного интеллекта 2025 был пересыщен иишными событиями и новыми модельками, которые эксперты еле успевали отрефлексировать — а уже надо было бежать разбирать следующую. Но никто так и не подвел итоги сумасшедшего для ИИ-сферы прошлого года с высоты птичьего полета над гнездом кукушки. Наш преподаватель, биоинформатик, машинлернер и блогер Владимир Шитов взял на себя эту нелегкую ношу. И написал емкий и максимально живой, а не чатжипитишный лонгрид, где с фактами, графиками и мемами проанализировал всё — от дикпика дипсика и нанобананы до подкастов Лекса Фридмана, чипов Nvidia и законов ЕС. Обязательно прочитайте статью, если хотите оставаться в тренде, а еще лучше — подпишитесь на канал Владимира: там не только ИИ, но и программирование, статистика, физика, лингвистика и много биологии. Бластим сам давно следит за @chelovek_nauk и не перестает восхищаться его автором ❤️ #бластим_рекомендует

🚬 Капля никотина убивает лошадь Сегодня — про неудачи. Очень важно их проговорить и не повторять. Итак, зафиксируйте письменно: 🎄три ключевые ошибки или факапа в научной деятельности в 2025 году; 🎄какие выводы и практические уроки вы из них извлекли. Затем попробуйте сформулировать три совета, которые вы могли бы дать другу, чтобы избежать аналогичных ошибок. Цель этого шага — не самокритика, а осознанное преобразование опыта в профессиональный рост. 💬 Многие из этих ошибок мы регулярно разбираем на вебинарах: от статистики «на автомате» до неверной интерпретации результатов Счастливо!

Секретный супербиоматериал — менструальная кровь Менструальная кровь окутана множеством табу и мифов. Однако для науки она — уникальный биоматериал, полный настоящих сокровищ! Почему этот «скрытый ресурс» может открыть двери к новым диагностикам и исследованиям женского здоровья? Разбираем с Яной Азнавур — врачом-гинекологом, к.м.н., фаундером и CEO фемтех-стартапа Endometrics. Яна с отличием выучилась в Сеченовке, защитила PhD по генетике эндометриоза, подтвердила диплом в США, схватила премию AAGL и ворвалась в биотех Кремниевой долины. В 2022 году основала Endometrics — тест по менструальной крови, который привлек $500K и вышел в финал NIH RADx® Tech ACT ENDO Challenge. 12 января в 19:00 МСК на онлайн-лекции пройдем путь от табу к триумфу. Разберемся: ✨в чем кроется биологическая уникальность менструальной крови; ✨диагностические и исследовательские направления, актуальные сейчас; ✨что из существующих тестов и разрабатываемых платформ уже работает; ✨как клинический и трансляционный потенциал менструальной крови способен изменить гинекологию; ✨открытые вопросы и нерешенные проблемы: обсудим, где наука еще спотыкается. Регистрация доступна по ссылке в боте: sbsite.pro//BioEvents_1 💫 Участвуйте в конкурсе БИОмечтателей: https://forms.yandex.ru/cloud/693c1a93e010db35fd797439/

🐴 Коней на переправе не меняют Продолжаем открывать новые дни в нашем Адвент-кониндаре. Сегодня постарайтесь письменно ответить на следующие вопросы: ❄️кто стал для вас наиболее значимым профессиональным контактом в прошедшем году и почему; ❄️кому из коллег вы сами принесли ощутимую пользу (экспертиза, помощь в проектах, совместная работа); ❄️с кем целесообразно поддерживать и развивать профессиональное взаимодействие в 2026 году. Научная карьера формируется не только публикациями и проектами, но и нетворкингом

🐴 — сегодня в ударе, выполнил/а задание 🍾 — вторник день тяжелый

💬 Сообщество — большая ценность. Именно поэтому вокруг курсов и вебинаров Бластим часто формируются живые профессиональные чаты и связи: ML, работа в биотехе, чат канала До завтра!