Бластим: курсы и работа в биотехе

Новогодняя мини-викторина 🎄 В праздничной суете и на фоне чужих итогов легко поймать себя на мысли: «А я-то что? Я будто ничего и не сделал…» Знакомо? Мы часто сравниваем себя с другими и забываем оглянуться на собственный путь. А сколько шагов прошли, сколько непростых решений приняли, сколько раз не сдались? Важно замечать не только результаты, но и усилия, не обесценивать любой опыт. Но, как говорится, лучше любых слов — собственный пример. Поэтому сегодня мы решили немного поотчитываться и чуть-чуть похвастаться 🙈 Чтобы напомнить вам (и себе): этот год мы провели ударно. Попробуете угадать статистику Бластим за 2025 в небольшом квизе?👇

Есть многие работы, друг Горацио, что не выдержат проверку репликацией Почти 10 лет назад Nature провел опрос среди авторов журнала на предмет того, как часто они сталкиваются с проблемой воспроизводимости в своих дисциплинах. Результат шокировал: 70% не смогли повторить эксперименты других, а более половины — свои собственные 🫠 Что-то изменилось с тех пор? Сегодня нейрофизиолог, яркий лектор и по совместительству наш добрый друг и выпускник курса Бластим по Python Владимир Алипов снова поднимает этот крайне важный и тревожный вопрос о воспроизводимости в науке. И повторяет опрос Nature. Поэтому мы сердечно просим уделить немного времени и заполнить анкету: 🖥 https://forms.gle/371XoxY83DnyhP1C9 P.S. Кстати в Бластим мы подробно разбираем хорошие и читерские научные практики на курсе «Статистика, R и анализ данных» #про_карьеру_по_субботам

🎃 Заканчиваем 2025 с мечтами о сплаве на гигантских тыквах Последняя лекция БИОмечтателей этого года состоится 29 декабря, в 19:00 мск. Ее прочитает Алиса Спасельникова, младший научный сотрудник ФНКЦ ФХМ ФМБА России. Встреча будет захватывающей — мы пройдем путь от мечт по созданию растений-гулливеров до терраформирования Марса. Такие смелые планы, кажется, даже Илону Маску не снились. Аджента: — как появляются гиганты — от секвой и раффлезий до рекордных тыкв и подсолнухов; — чем отличается селекция от генетической трансформации и как ученые управляют ростом, питательностью и устойчивостью растений; — как растения могут выжить в марсианском холоду и разреженной атмосфере; — как ускорить фотосинтез при слабом свете; — зачем будущим колониям «умные» растения‑гиганты, производящие кислород и создающие почву из реголита.  🔗 Регистрация на лекцию по ссылке: https://sbsite.pro/BioEvents_1 Участвуйте в конкурсе БИОмечтателей: https://forms.yandex.ru/cloud/693c1a93e010db35fd797439/

У Blastim — свой Steam В воздухе витает предновогодняя атмосфера: вещать про учебу уже не комильфо, а вот про развлечения — самое то, согласны? Поэтому сегодня представляем самые ожидаемые игры 2026 года по версии Бластим. Открывайте теплый эль и го! 🚗 Fast and Furious Shell Пайплайны, потоки, процессы, bash без тормозов. Почувствуй, как командная строка оставляет графический интерфейс в зеркале заднего вида — вместе с Адриано Томаретто. Релиз: 17 января 2026 👉 agency.blastim.ru/expresslinux 🗡 Assassins' Read У вас есть машина для восстановления памяти предков по ДНК и лицензия на ликвидацию плохих ридов. Но хватит ли этого, чтобы забраться на крышу биоинформатики, чтобы совершить свой прыжок веры? Релиз: 26 января 2026 👉 agency.blastim.ru/ngs 🔫 Gradient Theft Auto Бешеные гонки за метрикой и перестрелки GAN’ами, роскошные автоэнкодеры и красивые модели, тюнинг машин и взрывы градиентов. Релиз: 17 февраля 2026 👉 agency.blastim.ru/pythonandml 🧩 Tetiris Неустаревающая классика: сверху на вас падают фигурки тетRамино — функции, пакеты, титаники и ирисы. Но с помощью Позднякова и компании вы успеваете их словить и аккуратно утрамбовать в голову. Релиз: весна 2026 👉 agency.blastim.ru/stat_r 👑 Prompt Royale Вы берете крепость ИИ осадой, ваше главное оружие — промты. Вы научитесь пробивать оборону ллмок и заставлять их делать то, что хочет ваше Величество. Релиз: май 2026 👉 agency.blastim.ru/scientist_of_the_future ⛏ MineN8NCraft Песочница автоматизации. Из кубиков собираем агентский workflow — для себя и на заказ. Релиз: уже в доступе 👉 agency.blastim.ru/n8n 👣 Half-Life: PhD Научная карьера — это динамичный шутер от первого лица с тотальным погружением. Но у нас есть для вас подсказки, чтобы пройти испытания и завершить свою миссию. Релиз: уже доступна 👉 agency.blastim.ru/career Если вам невмоготу дождаться официального релиза и хочется начать прохождение прямо сейчас, напишите @varvara_blastim, мы откроем вам ранний доступ — играйте и в новогодние праздники, и потом 🎮 Лор Бластима вы пишете сами, и только вам решать, каким он будет #бластим_дайджест

👑 Кто царь природы? лев? кит? человек? Не смешите мои подковы. По крайней мере, по количеству на нашей планете господствуют вирусы. Согласно оценкам специалистов, более ~10³¹ частиц насчитывается на Земле, большинство из которых — бактериофаги. И, знаете, они оказывают влияние буквально на всё: от геномных перестроек до глобальных биогеохимических циклов. Что ж, пора познакомиться с хозяевами поближе, пока они нас не выселили! Как раз сегодня на встрече биоинформатик Николай Кольжецов покажет на практике инструменты для нахождения плазмид, фагов и профагов в геномных/метагеномных сборках и их дифференциации от химерных контигов. Тема не только фундаментально любопытная, но и крайне прикладная, ведь мобильные элементы могут привносить гены токсинов опасных заболеваний (например, дифтерии) или мешать биотехнологическому производству, лизируя культуры бактерий. На семинаре вы научитесь:

🧬 работать с современными NGS-инструментами на основе машинного обучения 🧬 охотиться на МГЭ и разбираться с таксономией 🧬 оценивать правдивость предсказаний алгоритмов

💩 Если вы метагеномщик — это точно для вас 💯 Успейте зарегаться на вирусный вебинар: https://sbsite.pro//web251225_1 И до встречи в эфире в 18:30 МСК🎄

C3 или C4 — растения говорят лучше носителей языка адаптации В 2026 году исполняется целых 255 лет с открытия фотосинтеза. За это время он стал кондовой классикой школьной биологии. Но правда ли, что мы знаем об этом процессе всё? Давайте проверим! Встречаемся в четверг, 25 декабря, в 14:00 МСК на лекции «Свет, стресс и адаптация: будни фотосинтезирующего организма» 🌿 Спикер: Дарья Ветошкина, к.б.н., старший научный сотрудник Института фундаментальных проблем биологии РАН, вице-президент Российского фотобиологического общества, организатор Всероссийского студенческого БиоТурнира. ☀️ Растения не могут убежать в тень или спрятаться под крышей, но умудряются фотосинтезировать в любой непонятной ситуации. Как не сгореть под палящим солнцем и при этом получить такое важное органическое вещество? Оставаясь на месте, растения включают внутренние щиты — механизмы молекулярного кондиционера или зонтика. Дарья Ветошкина расскажет, как лучи становятся и источником жизни, и потенциальной угрозой, и почему растения — мастера адаптации, способные пережить то, что другим организмам даже не снилось. 🔗 Регистрация на лекцию по ссылке: https://sbsite.pro//BioEvents_1 Участвуйте в конкурсе БИОмечтателей

😢 Год был тяжелый, но и мы не промах! Коллеги, нажимайте на случайную карточку и получайте предсказание на 2⃣0⃣2⃣6⃣ До праздника осталось всего 8 дней

🎲 Почему иммунитет играет в кости? Неожиданно спонтанная, но очень крутая лекция уже сегодня, 23 декабря в 18:00 мск! Встречаемся с Никитой Воробьевым — серебряным призером Международной биологической олимпиады (IBO-2023), студентом The Hong Kong University of Science and Technology (HKUST) по направлению Biotechnology & Data Science и специалистом по молекулярной динамике. Поговорим о том, как организм позвоночных, и в частности человека, успевает подстраиваться под постоянно меняющийся мир вирусов? Почему иммунная система сознательно «впускает хаос», чтобы настроиться максимально точно? Один из ключевых механизмов этой адаптации — соматический гипермутагенез В‑лимфоцитов, который позволяет вырабатывать высокоаффинные антитела и превращает случайность в инструмент выживания. На лекции разберем: • чем отличаются врожденный и адаптивный иммунитеты и как они работают в связке; • когда появился адаптивный иммунитет и какие молекулярные механизмы лежат в его основе; • как именно устроен соматический гипермутагенез и почему он принципиально стохастичен; • зачем иммунная система умеет временно «отключать» гипермутагенез в В‑клетках; • как все эти процессы используются при разработке вакцин и иммунных терапий. Регистрация на лекцию бесплатно по ссылке: https://sbsite.pro//BioEvents_1 В прямом эфире можно будет задать вопросы, обсудить современные гипотезы и те самые нюансы, которые еще не скоро попадут в учебники. Это редкая возможность заглянуть в пульсирующую иммунологию и увидеть, как фундаментальные механизмы превращаются в прикладные решения.

Буду на фага охотиться, на профага 🔍 Прокариоты пребывают в бесконечной гонке вооружений с мобильными элементами. Однако плазмиды, фаги и другие эгоисты порой несут и пользу бактериям и археям. Например, они опосредуют горизонтальный перенос генов, кодирующих адаптивные признаки. Так, плазмиды часто содержат детерминанты вирулентности или резистентности к антибиотикам. Но что микробу хорошо, то человеку — 🪦 Однако сегодня благодаря технологии NGS мы можем по-настоящему исследовать прокариотический мобилом и идентифицировать потенциальных патогенов с помощью биоинформатики. В этот четверг 25 декабря 18:30 МСК присоединяйтесь к биоинформатическому онлайн-семинару с преподавателем Николаем Кольжецовым (МГУ, Институт биофизики клетки РАН). Разберем, как уверенно находить мобильные элементы в геномных/метагеномных сборках и как отличать их от хромосом и «привидений» — контигов, которые могут быть артефактами или ошибками ассемблирования👻 Спикер продемонстрирует современные инструменты на основе машинного обучения:

🎄 PlasX — определяет уровень достоверности того, что контиг — плазмида, 🎄 VIBRANT и geNomad — служат для идентификации и таксономии профагов и фагов в сборках, 🎄 MobMess — позволяет перейти на более высокий уровень и провести анализ сходства сразу большого массива плазмид и других мобильных элементов.

Ждем вас на последнем вебинаре 2025. Регистрация по ссылке Бластим — ваш геномный островок стабильности

Чародейкою Зимою Околдован, лес стоит… Несмотря на конец декабря, вас ждут две увлекательные «растительные» лекции — от парадоксов физиологии фотосинтеза до современных подходов к озеленению Вселенной. 🌻 Четверг, 25 декабря 14:00 мск | «Свет, стресс и адаптация: будни фотосинтезирующего организма» Спикер — Дарья Ветошкина: к.б.н., старший научный сотрудник ИФПБ РАН, вице-президент Российского фотобиологического общества, организатор Всероссийского студенческого БиоТурнира Как свет может быть и источником жизни, и причиной стресса? Почему растения — настоящие мастера адаптации? Погружение в биохимию стойкости, где листья становятся лабораториями выживания под солнцем. 🎃 Понедельник, 29 декабря 19:00 мск | «От гигантских овощей к марсианским лесам» Спикер — Алиса Спасельникова: младший научный сотрудник ФНКЦ ФХМ ФМБА Лекция — путешествие от земных экспериментов по созданию растений-гулливеров через секреты их генетической трансформации к грандиозной цели — терраформирования Марса. Мы посмотрим на растения не как на привычную часть пейзажа, а как на высокотехнологичный инструмент для покорения новых миров. Как тебе такое, Илон Маск? Участие во всем бесплатное, записывайтесь через бот: ссылка Пропустили прошлые лекции? Не переживайте, мы все записали специально для вас — смотрите ссылки в боте

🌟 Как мечты спасли будущее Вчера стартовал наш конкурс: мечтайте масштабно и делитесь идеями, которые перевернут мир! В науке нет пределов: смелые гипотезы часто приводят к настоящим прорывам — от сохранения миллионов жизней до переосмысления самих основ биологии. Сегодня для вдохновения — четыре гениальных открытия прошлого. Кто-то подсмотрел у природы, кто-то ждал признания десятилетиями, но все они доказали: одна мысль (а также терпение и труд) может изменить всё. Листайте карточки. А какое открытие зажигает вас больше всего? Делитесь в комментариях ⤵️

💫 Великие открытия начинались с полета фантазии. Разве нет? Когда-то вакцинация от оспы или прыгающие гены считались бредом сумасшедшего. А сегодня эти идеи прямо или косвенно влияют на жизни миллионов людей. Биология всегда жила мечтами, которые потом меняли мир! С 19 декабря по 20 января Бластим и Ко запускают конкурс передовых научных идей в биотехе — это уникальное пространство свободы для высказывания умных и безумных мыслей, которые определят будущее человечества. Без стеснения. Без ограничений. Без бюрократии. Как участвовать? Поделитесь любой биомечтой: это может быть готовый проект с публикациями и грантами, авантюрная гипотеза, которую вы давно вынашиваете, или каракуля на салфетке с потенциалом революционной технологии. Количество заявок не ограничено — мы рассмотрим все. Три лучшие идеи станут реальностью: мы поможем вывести их на рынок, а авторы получат приз — 300 000 рублей. Давайте пофантазируем? До 15 января 2026 делитесь своим видением через форму: 🔗 https://forms.yandex.ru/cloud/693c1a93e010db35fd797439/ Биотехнологии ждут своих мечтателей

Вокруг шум? Не кипишуем 😶 Даже идеальные NGS-данные не бывают «чистыми». В них встречаются варианты ридов, которые создаются особенностями методов секвенирования, а не природой. Основные источники искажений — ошибки PCR и сам процесс считывания последовательностей прибором. Такой шум может быть коварным и создавать иллюзию разнообразия, искажать статистику и приводить к ненадежным выводам. Поэтому в анализе важно не пропускать стадию денойзинга.

Денойзинг — это не фильтрация по качеству. Он статистически оценивает ошибки и позволяет отличить реальные последовательности от артефактов. Такой подход помогает восстановить исходный биологический сигнал, а не просто удалить «плохие» данные.

Популярные инструменты: • DADA2 — удобный метод с хорошей документацией • Deblur — распространенная альтернатива DADA2 • UNOISE — менее предпочтительный вариант • ChaiMeToo — инструмент для метагеномных исследований, но с рядом ограничений Но с денойзингом важно быть аккуратным. Слишком жесткие параметры могут привести к потере редких, но биологически значимых ридов. Подробнее о сложностях и нюансах анализа результатов секвенирования мы говорили на вебинаре «Как не утонуть в ошибках при анализе NGS-данных?» с Николаем Кольжецовым в августе. В преддверии праздников мы решили бесплатно поделиться материалами встречи со всеми желающими! Просто напишите Варваре @varvara_blastim: «Хочу конспект по NGS» 🎁

📌 Вдохновляющие возможности за рубежом Если энергии перед праздниками еще хватает, загляните в наш новый список вакансий. Можно подаваться, а можно просто наметить цели и встретить Новый год с идеями для следующего карьерного шага. PhD-стипендия в ML для энзимологии — Novo Nordisk Foundation Centre for Biosustainability — Дания 🇩🇰 Группа Computational Protein Engineering предлагает PhD-позицию в рамках MSCA Doctoral Network ELEGANCE. Требуется MSc в смежной области, а также опыт в молекулярной биологии и белковой инженерии. Контракт на 3 года. Зарплата: от ~ DKK 30k в месяц Дедлайн: 31/01/2026 Ссылка Research Associate/Fellow — University of Nottingham — Великобритания 🇬🇧 Deep Seq Facility ищет опытного биоинформатика для анализа и интерпретации NGS-данных с различных платформ. Обязанности включают поддержку пользователей, разработку и оптимизацию пайплайнов, подготовку отчетов и участие в публикациях. Требуется PhD или MSc в биоинформатике. Зарплата: £31,387-£46,485 в год Дедлайн: 02/03/2026 Ссылка Руководитель — AstraZeneca — США 🇺🇸 Проект в отделе Biologics Engineering, направленный на развитие NGS-платформы для поддержки AI/ML-направлений в инженерии антител. Обязанности включают руководство командой ученых и биоинформатиков. Требуется PhD в молекулярной биологии, генетике, биоинформатике или смежной области, 7+ лет опыта работы с NGS в фармацевтической или биотехнологической индустрии, а также опыт управления. Зарплата: $172,672-$259,008 в год Ссылка NGS Technician — Biomedical Sequencing Facility — Австрия 🇦🇹 Позиция предполагает выполнение широкого спектра NGS-анализов (геном, транскриптом, эпигеном, single-cell), решение технических задач и обучение коллег. Требуется MSc (кандидаты с BSc или PhD также рассматриваются) в молекулярной биологии, биохимии или смежной области, практический опыт работы с ДНК/РНК и высокая внимательность при работе в лаборатории. Зарплата: от €39k в год Дедлайн: 31/12/2025 Ссылка Постдок — Karolinska Institutet — Швеция 🇸🇪 Taras Kreslavsky group ищет кандидата для исследований молекулярных механизмов иммунной системы. Требуется PhD в биомедицине, иммунологии, клеточной биологии или смежной дисциплине, базовые навыки в биоинформатике приветствуются. Стипендия на срок до 2 лет. Дедлайн: 16/01/2026 Ссылка Scientist — St. Jude Children’s Research Hospital — США 🇺🇸 Приглашают ученого в Protein and Biologics Screening Core (Host–Microbe Interactions). Фокус на разработке и проведении кампаний по antibody discovery. Предпочтителен PhD, но сильные кандидаты со степенью бакалавра и выше также рассматриваются. Ожидаемая экспертиза: B-cell иммунология, single B-cell discovery, проточная цитометрия, ELISA, BLI/SPR, NGS и биоинформатика. Зарплата: $86,320-$154,960 в год Ссылка Биоинформатик — University of Southern Denmark — Дания 🇩🇰 Проект в области RNA Therapeutics and Cardiometabolic Disease, направленный на разработку и внедрение вычислительных методов для анализа microRNA и интеграции omics-данных. Требуется сильная база в RNA-биологии, анализе NGS-данных, программировании на Python или R, приветствуется опыт в ML. Дедлайн: 31/01/2026 Ссылка Летние стажировки — Genentech/Roche — США 🇺🇸 Genentech приглашает студентов уровня Master’s или выше на летние стажировки в различных направлениях. Relocation benefits для позиций не предусмотрены. Ссылка #бластим_вакансии

«ПУКС» — так нарек свое детище селекционер Гладышев из книги о приключениях Ивана Чонкина. По замыслу гибрид «Путь к социализму» должен был быть вершками — томатом, а корешками — картофелем… 🍀 Но это ли предел мечтаний современного агротеха? Как сейчас получают растения с желаемыми свойствами? И ради каких признаков генные инженеры готовы лезть в ДНКу? Чем отличаются трансгенные от редактированных растений? Какие они, самые передовые технологии в селекции, и есть ли у них недостатки? 19 декабря в 12:00 мск мы подробно поговорим о состоянии отрасли на лекции «Почему у нас на полках магазинов до сих пор нет генно-редактированных растений?» Спикер: Наталья Пермякова, к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории биоинженерии растений Института Цитологии и Генетики Сибирского Отделения Российской Академии Наук (ИЦиГ СО РАН), преподаватель Новосибирского Государственного Университета, эксперт компетенции «Геномная инженерия» чемпионата по профессиональному мастерству «Профессионалы». А еще загляните на образовательные программы по биотехнологиям института: ссылка Регистрируйтесь на лекцию по ссылке в боте: ссылка Ну, а мы пока пошли сыграем партию в теннис с непортящимся томатом вместо мячика

#бластим_рекомендует и участвует