Master Omics

Продолжается прием документов в магистратуру «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток»! Если вы хотите развиваться в области современной биоинформатики, у вас есть возможность подать документы до 16 августа (на платные места – до 10 сентября). ⏳ Срок обучения: 2 года 🎓 Количество бюджетных мест: 12 💼 Количество платных мест: 10 Документы можно подать в электронной форме через Единый портал государственных и муниципальных услуг. 🎓 Подробнее о магистратуре По всем вопросам можно обращаться в сообщения сообществ Telegram и Вконтакте.

⚡️ Магистрант Томского НИМЦ: «К пониманию биологии через анализ больших данных» Ирина Герман, магистрант Томского НИМЦ по направлению «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток», в интервью рассказала о пути в профессию, о том, как анализ больших данных помогает понимать механизмы развития лейкоза, почему мультиомика открывает новые горизонты в онкологии и как активный отдых помогает перезагружаться после работы. 🔸 Читать материал 📍Узнать больше о магистратуре в Томском НИМЦ: master-omics.ru 📍Информация для поступающих: https://tnimc.ru/obrazovanie/applicants/magistracy/ Прием документов идет до 16.08.2026!

Идет прием документов в магистратуру Томского НИМЦ!  Первая в России программа "Биоинформатика. Мультиомика единичных клеток". Подготовка востребованных профессионалов, высококлассных специалистов-биоинформатиков, которые смогут проводить анализ мультиомиксных данных в соответствии с современными трендами развития биологии. Три этапа подготовки: от погружения в информационные методы обработки до специализированных направлений по анализу различных типов мультиомиксных данных с фокусом на единичные клетки. Прием документов идет до 16.08.2026!  🎓 Подробнее о магистратуре 📖 Информация для поступающих

Эльвира Муслимова: «Обучение в магистратуре Томского НИМЦ помогло по-новому взглянуть на результаты исследований» О своем профессиональном пути, выборе магистратуры и новых горизонтах в науке рассказала Эльвира Муслимова – кандидат медицинских наук, научный сотрудник НИИ кардиологии Томского НИМЦ, в 2025 году поступившая на программу магистратуры «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток». «Выбор магистратуры именно в Томском НИМЦ был для меня естественным – родная среда и сильная школа. При этом программа по биоинформатике – это и новая для меня область знаний, и развитие, повышение компетенций», - комментирует она.

Сейчас я вовлечена в ряд научных проектов, и хотя они не включают анализ данных секвенирования («чтения») РНК единичных клеток, тем не менее, полученные знания помогли по-новому взглянуть на результаты исследований, появились идеи для углубления и расширения научных задач.

📖 Подробнее в материале 🎓 Подробнее о магистратуре Томского НИМЦ

Преподаватель магистратуры Томского НИМЦ Вадим Чечехин: «Ошибки - наши лучшие учителя!» В рубрике «Наставники» - Вадим Чечехин, канд. мед. наук, преподаватель магистратуры Томского НИМЦ, старший преподаватель кафедры биохимии и регенеративной биомедицины факультета фундаментальной медицины медицинского научно-образовательного института МГУ имени М.В. Ломоносова. - Расскажите о Вашем курсе. Чему он посвящен? Какие навыки освоят магистранты по окончании курса?

Мой курс «Определение клеточных типов по данным транскриптомики единичных клеток» посвящен освоению методов определения типов, подтипов и состояний клеток в scRNA-seq данных. Магистранты научатся использовать различные варианты методов автоматического типирования клеток, а также освоят концепцию ручного типирования с точки зрения составления атласа ткани.

- Как Вы думаете, какие потенциальные возможности открывает магистратура в Томском НИМЦ?

Магистратура позволяет освоить навыки работы с большими данными и поможет студентам в построить дальнейшую карьеру в науке и получить конкурентное преимущество на рынке труда в области обработки данных scRNA-seq.

- Что бы Вы пожелали абитуриентам и первокурсникам программы?

Не бояться пробовать и ошибаться. Свои ошибки — это наши лучшие учителя!

🎓 Подробнее о магистратуре 📑 Прием документов на обучение идет до 16 августа 2026 г. (на платные места – до 10 сентября 2026г.)

🎓Приглашаем присоединиться к лекции в рамках магистерской программы Томского НИМЦ “Биоинформатика: Мультиомика единичных клеток”. 🧬 Тема: Предсказание времени возникновения хронических болезней на основании геномных данных 🧑‍🔬Лектор: Mykyta Artomov, Assistant Professor at the Institute for Genomic Medicine, Nationwide Children's Hospital 📅 Дата: 7 июля 🕒 Время: 20:00 Тск (16:00 Мск) 💻 Платформа: Zoom Врожденные риски хронических болезней, как правило, имеют полигенную природу. Это подразумевает небольшой или средний вклад большого количества генетических вариантов. В этой лекции, мы обсудим основы GWAS, который используется для поиска вариантов, ассоциированных с заболеванием, и то, как они могут быть интегрированы в персонализированную оценку риска. 🔗 Регистрация по ссылке 🎓 Подробнее о магистратуре

Приглашаем присоединиться к лекции в рамках магистерской программы Томского НИМЦ “Биоинформатика: Мультиомика единичных клеток”. 🧬 Тема: Клональный анализ на уровне индивидуальных клеток на службе биологии развития 🧑‍🔬Лектор: Игорь Адамейко, Венский медицинский университет 📅 Дата: 26 июня 🕒 Время: 11:30 Мск 💻 Платформа: Zoom На лекции будут рассмотрены возможности клонального анализа на уровне индивидуальных клеток как инструмента для прослеживания происхождения, судьбы и дифференцировки клеток в процессе формирования тканей и органов. Будет показано, как современные методы генетического мечения, высокопроизводительного секвенирования и анализа единичных клеток позволяют с беспрецедентной точностью исследовать процессы принятия клеточных решений. Особое внимание будет уделено интеграции клонального анализа с одноклеточной транскриптомикой и пространственной биологией для изучения эмбрионального развития, регенерации и пластичности клеточных популяций, а также установлению причинно-следственных связей между генетическими программами и формированием функциональных структур организма. 🔗 Регистрация по ссылке 🎓 Подробнее о магистратуре

Стартует приемная кампания в магистратуру «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» C 20 июня открывается набор на магистерскую программу Томского НИМЦ «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток» по направлению подготовки 06.04.01 Биология. Программа посвящена современным методам биоинформатического анализа биомедицинских данных, включая геномику, транскриптомику, технологии единичных клеток и пространственные омики. В реализации программы участвуют преподаватели и исследователи из ведущих научных центров России и мира. 📚 Формат обучения: очное (с использованием дистанционных технологий) ⏳ Срок обучения: 2 года 🎓 Количество бюджетных мест: 12 💼 Количество платных мест: 10 📅 Прием документов на бюджетные места с 20 июня по 16 августа 2026 года. Документы можно подать в электронной форме через "Единый портал государственных и муниципальных услуг (функций)". Вступительные испытания: • клеточная биология • английский язык Экзамены проводятся в форме онлайн собеседования. Подробная информация о программе и правилах приема доступна на сайте Томского НИМЦ, а также можете задавать вопросы в сообщениях в vk группе или в телеграм. Будем рады видеть среди наших магистрантов всех, кто интересуется современной биологией, биоинформатикой и передовыми омиксными технологиями! 🎓 Подробнее о магистратуре

🧬Если любовь к науке и в твоей ДНК… Создавай будущее медицинской науки вместе с нами!   Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук: живое пространство науки, где рождаются открытия и где каждый шаг ведет к улучшению жизни людей   📍Наша миссия: Передовая биомедицина во имя здоровья и жизни человека   Томский НИМЦ ведёт полноценную образовательную деятельность, охватывающую три ступени — магистратуру, ординатуру и аспирантуру. Подробнее в карточках!

Анализ транскриптомных данных 📚 В этом семестре магистерской программы проходит курс «Анализ транскриптомных данных», который ведет Павел Ямщиков, руководитель Центра системной биоинформатики Томского НИМЦ. Курс направлен на знакомство обучающихся с концепцией анализа транскриптомных данных, включая как теоретические основы, так и практические навыки. Павел Ямщиков рассказывает:

Особенностью курса является возможность для студентов выбрать общедоступные или собственные данные тотального РНК-секвенирования и выполнить под руководством преподавателя полный биоинформатический анализ: от обработки FASTQ-файлов до получения результатов дифференциальной экспрессии и функциональной аннотации. Таким образом, еще до окончания магистратуры студенты приобретают индивидуальный реальный опыт, сопоставимый с профессиональной практикой, который, в том числе, можно уверенно включить в резюме.

🎓 Подробнее о магистратуре

Открыт набор на онлайн-программу переподготовки «Биостатистика и анализ медицинских данных»! bioinf.me/education/stat | Регистрация до 16 июля, 23:59 МСК Эта программа подойдёт тем, кто планирует развиваться в биомедицинских исследованиях, уже владеет начальными навыками статистического анализа в R, но чувствует недостаток глубины понимания применяемых методов. Мы поможем систематизировать знания, укрепить теоретическую базу, овладеть необходимыми техническими навыками и увидеть, какие профессиональные перспективы открывает современная биостатистика! 🌑 Стоимость: • 97 000 рублей – для физических лиц • 82 000 рублей – для выпускников программы переподготовки Института биоинформатики • 107 000 рублей – для юридических лиц 🐚По итогам конкурсного отбора участники могут получить грант в виде скидки на обучение🐚 🌑 Процесс поступления: • заполнить анкету до 16 июля, 23:59 МСК • пройти тестирование 18 или 25 июля Ждём ваших заявок! ❤️ ✨ Мы в VK | Мы в почте | Мы в Telegram #bioinf_online #bioinf_education @bioinformatics_institute

🎓Приглашаем на открытую онлайн-лекцию! Приглашаем всех заинтересованных присоединиться к очередной лекции в рамках магистерской программы Томского НИМЦ “Биоинформатика. Мультиомика единичных клеток”. 🧬 Тема: Eye1k: многомерный атлас единичных клеток сетчатки и зрительного нерва мыши 🧑‍🔬Лектор: Эмиль Крюков, Senior Bioinformatician, Schepens Eye Research Institute of Mass Eye and Ear Department of Ophthalmology, Harvard Medical School Department of Ophthalmology, University of Pittsburgh 📅 Дата: 16 июня 🕒 Время: 9:00 Мск 💻 Платформа: Zoom На лекции будет рассмотрен проект, финальной целью которого является создание комплексного мышиного атласа сетчатки и зрительного нерва. Мы рассмотрим как получить данные из разных источников, унифицировать метаданные, провести индивидуальный процессинг каждого набора данных, контроль качества, фильтрацию клеток и генов, а также привести данные к сопоставимому формату. Также рассмотрим современные методы машинного обучения, включая scvi-tools, scVI и scANVI, и как качество интеграции оценивается с помощью scIB. Отдельное внимание уделим масштабированию анализа, принципам аннотации и обсуждению того, как комплексный атлас помогает сравнивать заболевания, реконструировать временные линии повреждения и старения, находить редкие популяции и определять пробелы в существующих данных. 🔗 Регистрация по ссылке 🎓 Подробнее о магистратуре

«Я бы пожелал не бояться ошибок» В рубрике «Наставники» - Дмитрий Тычинин, преподаватель магистратуры Томского НИМЦ «Биоинформатика: мультиомика единичных клеток», аналитик лаборатории эпигенетических методов исследований Центра стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью Федерального медико-биологического агентства (ФГБУ «ЦСП» ФМБА России). О курсе “AI технологии в транскриптомике единичных клеток”

- Я создавал курс, чтобы минимизировать технический порог входа между имплементацией, тестом и рефлексией учащихся с, на первый взгляд, сложными программными решениями, включающие алгоритмы машинного и глубокого обучения. AI (искусственный интеллект) - на самом деле всеобъятный термин, любые методы биоинформатики, даже задачи линейной регрессии, подпадают под него. В рамках курса мы освоим практические подходы к интеграции данных, оценке генных сигнатур, реконструкции генных регуляторных сетей, анализу лиганд-рецепторных взаимодействий и другим задачам, которые ежедневно решают ведущие специалисты в этой области. По окончании курса магистранты смогут самостоятельно применять методы AI в биоинформатических исследованиях, критически оценивать полученные метрики и грамотно адаптировать инструменты в собственные научные проекты.

О практической пользе курса

 - Подобная технологическая самостоятельность позволяет не просто получать готовые результаты и «радоваться красивой картинке», а осознанно интерпретировать их, делать важные акценты, генерировать и фальсифицировать гипотезы, критически сравнивать результаты работы инструментов. Хотя образовательная программа имеет узкую специализацию, именно это становится ее преимуществом. Выпускники получат не только базовые компетенции junior-биоинформатика, но и продвинутые хард-скилы, которые позволят сразу претендовать на позиции среднего и высокого уровня. Это дает возможность быстрее интегрироваться в исследовательские лаборатории или биотех-компании, минуя этап длительного адаптационного периода, и с первого дня участвовать в решении самостоятельных научных задач.

Пожелания будущим магистрантам

  - Абитуриентам и первокурсникам я бы пожелал не бояться ошибок, они обязательно будут у всех без исключений. При усидчивости и терпении - решения приходят, но для этого нужна большая внутренняя мотивация. Черпайте вдохновение в современных научных публикациях, обращайте внимание на визуальную эстетику научной инфографики и старайтесь искренне любить то, чем занимаетесь. Эта область многогранна, и за два года вы обязательно найдете направление, которое откликнется именно вам. Главное - сохраняйте исследовательский интерес, не останавливайтесь на полпути и смело экспериментируйте.

🎓 Подробнее о магистратуре

🎓 Продолжаем цикл открытых онлайн-лекций. Приглашаем всех заинтересованных присоединиться к четвертой лекции. 🧬 Тема: Multimodal data integration 🧑‍🔬Лектор: Dr. Roman Sankowski, University Medical Center Freiburg 📅 Дата: 2 июня 🕒 Время: 11:00 Мск/10:00 CEST 💻 Платформа: Zoom Как объединять разные типы single-cell данных, и зачем это нужно современной биоинформатике? Мы поговорим о подходах к интеграции данных транскриптомики, эпигеномики, пространственных и других single-cell технологий, и о том, какие новые биологические выводы можно получить благодаря их совместному анализу. 🔗 Регистрация по ссылке 🎓 Подробнее о магистратуре

Магистрант Александр Чайковский: «Никогда не скучно учиться чему-то новому»

Свой путь в науку я начал с аспирантуры в 2009 году. Сейчас являюсь научным сотрудником лаборатории патофизиологии и экспериментальной терапии НИИ фармакологии и регенеративной медицины им. Е.Д. Гольдберга Томского НИМЦ.  Мои научные интересы сконцентрированы на поиске новых препаратов при нейродегенеративных состояниях, и, в частности, на фармакологической стимуляции нейрогенеза при болезни Альцгеймера и алкогольной энцефалопатии. Отчасти решение поступить в магистратуру было неожиданным даже для самого себя. Главный стимул – получение принципиально новых знаний в области биоинформатики, которые могут сильно помочь в научных изысканиях нашей лаборатории. Никогда не скучно учиться чему-то новому! В рамках магистерской диссертации я планирую изучить, какие изменения на уровне генов происходят в разных клетках мозга из-за хронического недосыпа. Известно, что одни клетки при недосыпе «испытывают стресс, работают плохо», а другие, наоборот, «активизируются» — именно этот дисбаланс приводит к нарушениям памяти, психоэмоциональным проблемам, а также повышает риск сосудистых катастроф и онкологических заболеваний. Наша цель — найти универсальный генетический ответ мозга на депривацию сна, общий как для лабораторной мыши, так и для человека. В перспективе это исследование может быть полезно при разработке новых лекарственных препаратов для лечения бессонницы и сопутствующих ей проблем. Обучение в магистратуре очень интенсивное. Большой плюс сама программа:  максимум необходимых предметов и ничего лишнего. За время обучения я значительно расширил свой кругозор. Например, раздел по основам программирования стал для меня абсолютно новым опытом. По окончании обучения в магистратуре есть планы применить полученные знания  в рамках исследований в области фармакологической стратегии регенерации нервной ткани.

🎓 Подробнее о программе магистратуры

🎓 Продолжаем цикл открытых онлайн-лекций! Приглашаем всех заинтересованных присоединиться к третьей лекции. 🧬 Тема: Применение технологий единичных клеток в онкологии 🧑‍🔬Лектор: Константин Оконечников, руководитель лаборатории биоинформатики и анализа больших данных, НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина 📅 Дата: 19 мая 🕒 Время: 11:00 Мск 💻 Платформа: Zoom На лекции будет рассказано, как технологии анализа единичных клеток помогают изучать опухоли на новом уровне: видеть различия между отдельными клетками, выявлять редкие клеточные популяции и понимать устройство опухолевого микроокружения. Отдельное внимание будет уделено тому, как single-cell подходы применяются в онкологических исследованиях для поиска механизмов прогрессии опухоли, устойчивости к терапии и потенциальных диагностических или терапевтических мишеней. 🔗 Регистрация по ссылке 🎓 Подробнее о магистратуре

Новый сервер для биоинформатических вычислений студентов ✨Хорошие новости! Для студентов магистерской программы "Биоинформатика: мультиомика единичных клеток" теперь доступен вычислительный сервер для анализа данных и работы с биоинформатическими задачами. В распоряжение магистрантов предоставлен сервер HPE ProLiant DL380 Gen10, оснащённый двумя процессорами Intel Xeon Gold 6252, 256 ГБ оперативной памяти и дисковым пространством около 5 ТБ. Сервер позволит студентам выполнять ресурсоёмкие вычисления, работать с большими биомедицинскими данными и запускать собственные аналитические пайплайны в рамках учебных и исследовательских проектов. 🎓 Подробнее о программе магистратуры

Продолжается приём заявок на интенсив по статистике для биологов и медиков, который пройдёт с 20 мая по 13 июня! bioinf.me/education/workshops/stat | Регистрация открыта до 18 мая, 23:59 МСК Если вы давно хотели разобраться в статистике, но не знали, с чего начать – этот интенсив для вас! За месяц участники пройдут путь от основ биостатистики до многофакторного анализа данных, познакомятся с языком программирования R и научатся грамотно визуализировать и интерпретировать данные. Для участия необходимо до 18 мая, 23:59 МСК: 🌱 пройти вводный курс на Stepik 🌱 заполнить анкету, которая станет доступна после прохождения курса Ждём ваших заявок! ❤️ ✨ Мы в VK | Мы в почте | Мы в Telegram #bioinf_education #bioinf_online #bioinf_workshop @bioinformatics_institute

#мероприятиеотколлег

🎓 Продолжаем цикл открытых онлайн-лекций! Приглашаем всех заинтересованных присоединиться ко второй лекции. 🧬 Тема: 3D-геномика единичных клеток 🧑‍🔬Лектор: Никита Ваулин, Медицинский университет Вены 📅 Дата: 12 мая 🕒 Время: 11:00 Мск 💻 Платформа: Zoom На лекции обсудим, что конформация хроматина — ключ к пониманию и механистическому описанию регуляции экспрессии генов. Single-cell Hi-C и родственные методы позволяют увидеть, как разные ген-регуляторные программы реализуются в разных клеточных типах, а комбинация scHi-C с мультиомиксными подходами даёт возможность изучать эти программы сразу на нескольких уровнях. 🔗 Регистрация по ссылке 🎓 Подробнее о магистратуре