BioinformaticsCollege

☄مدرسه بیوانفورماتیک آنالیز داده های بیان ژن (NGS) #دوره_تخصصی_بیوانفورماتیک در این دوره بطورکامل نحوه انجام یک پروژه بیوانفورماتیکی درحوزه سرطان برای تشخیص بیومارکرها با جمع آوری دیتاهای بیان ژن نمونه های سرطانی مقالات مختلف آنالیز بیان ژنهای مایکرواری و ان جی اس بطورکامل تئوری وهم با کدنویسی آموزش داده میشود. ⚡️هر نفر روی یک نوع سرطان یا بیماری کار میکند و در نهایت نتایج در قالب مقاله چاپ خواهد شد. ⚡️هزینه: ۹۵۰۰ 🎓 باارائه ۳ سرتیفیکیت انگلیسی از دانشگاه علوم پزشکی شهیدبهشتی ⚡️فرصتی بینظیر برای پرکردن گپ تحصیلی و حرفه ای شدن ⚡️این دوره هیچ پیش نیازی ندارد ⚡️در صورت نیاز براتون توصیه نامه صادر خواهد شد ⚡️مهمتر از همه اینکه 💥مقاله بیوانفورماتیکی💥 خواهید داشت ⏳ از ۲۲ آبان تا ۱۲ دی جمعه ها ساعت ۷ الی ۸:۳۰ شب بصورت آنلاین از طریق گوگل میت لینکهای کانال کالج بایوانفورماتیک یوتیوب www.youtube.com/c/BioinformaticsCollege اینستاگرام Instagram.com/bioinformaticscollege تلگرام t.me/BioinformaticsCollege پکیجهای آموزشی t.me/BioinformaticsCollegePackages

شروع مدرسه بیوانفورماتیک از همین جمعه ساعت ۶:۳۰ الی ۸ شب. برای ثبتنام به این آیدی پیام دهید: @BioinformaticsCollegeAdmin

آموزش الگوریتمهای بیوانفورماتیک قسمت اول، معرفی الگوریتم تقسیم و غلبه #الگوریتم_تقسیم_و_غلبه https://youtu.be/-Lz9b2xkhXs 🆔@BioinformaticsCollege

برای دو مقاله بیوانفورماتیکی چند پوزیشن خالی موجود میباشد. متقاضیان لطفا هر چه سریعتر به ادمین تلگرام کانال کالج بیوانفورماتیک پیام دهند t.me/BioinformaticsCollegeAdmin

🧬 Variant Calling Analysis | Step 2: Alignment to Reference 🧬 Once you’ve cleaned and filtered your sequencing data, the next essential step in the variant calling pipeline is sequence alignment! 🎯 📍 What happens during alignment? 1️⃣ Read Mapping: Each sequence read (from your FASTQ file) is compared against a reference genome. 2️⃣ Finding the Location: The aligner determines the best matching location on the genome (forward or reverse strand). 3️⃣ Tracking Differences: Any mismatches, insertions, or deletions relative to the reference are identified and recorded. 4️⃣ Output Storage: Results are saved in standardized formats like SAM or BAM files.  🛠️ Popular Alignment Tools: BWA (ideal for short reads/DNA)  Bowtie2 (fast short-read mapper)  Minimap2 (great for long reads & spliced alignments)  💡 Key Takeaway: Alignment maps raw sequence reads to genomic coordinates, generating the SAM/BAM files necessary for downstream variant detection! 🆔@BioinformaticsCollege

#مقاله_های_کالج_بیوانفورماتیک Enhancing ischemic stroke management: leveraging machine learning models for predicting patient recovery after Alteplase treatment, Brain Injury https://doi.org/10.1080/02699052.2025.2472188 Ischemic stroke remains a leading global cause of morbidity and mortality, emphasizing the need for timely treatment strategies. This study aimed to develop a machine learning model to predict clinical outcomes in ischemic stroke patients undergoing Alteplase therapy. Data from 457 ischemic stroke patients were analyzed, including 50 demographic, clinical, laboratory, and imaging variables. Five machine learning algorithms – k-nearest neighbors (KNN), support vector machines (SVM), Naïve Bayes (NB), decision trees (DT), and random forest (RF) – were applied for constructing models. Additional feature importance analysis were p to identify high-impact predictors. The Random Forest model showed the highest predictive reliability, outperforming ... 🆔️@BioinformaticsCollege

برای دو مقاله بیوانفورماتیکی چند پوزیشن خالی موجود میباشد. متقاضیان لطفا هر چه سریعتر به ادمین تلگرام کانال کالج بیوانفورماتیک پیام دهند t.me/BioinformaticsCollegeAdmin

#دوره_تخصصی_بیوانفورماتیک 💥 ۳۰ درصد تخفیف ویژه بمناسبت دهمین سالگرد تاسیس کالج بیوانفورماتیک فقط بمدت ۳ روز💥 بیش از ۸۰ دوره تخصصی بیوانفورماتیک ⚡️برنامه نویسی R(۵دوره) ⚡️ماشین لرنینگ در R(۶دوره) ⚡️سروایول آنالیسیس در R(۵دوره) ⚡️آمار زیستی(۳دوره) ⚡️لینوکس(۲دوره) ⚡️آنالیز داده های مایکرواری(۱دوره) ⚡️آنالیز داده NGS(بالک آر ان ای سک)(۴دوره) ⚡️آنالیز داده سینگل سل(۵دوره) ⚡️متاآنالیز داده های RNAseq(۱دوره) ⚡️واریانت کالینگ(۵دوره)(whole exome sequencing) ⚡️آنالیز شبکه های زیستی(۲دوره) ⚡️آموزش پکیج wgcna(۱دوره) ⚡️آنالیز شبکه ژن بیماری(۵دوره) ⚡️متاژنومیکس(۴دوره) ⚡️برنامه نویسی پایتون(۵دوره) ⚡️ژنومیک محاسباتی(۲دوره) ⚡️هوش مصنوعی(۵دوره) ⚡️طراحی دارو(۵دوره) ⚡️طراحی دیتابیسهای زیستی(۴ دوره) ⚡️طراحی پرایمر(۱دوره) ⚡️پی سی آر(۱دوره) ⚡️ریل تایم پی سی آر(۲ دوره) ⚡️سیستماتیک ریویو(۱دوره) ⚡️متاآنالیز(۱دوره) ⚡️مقاله نویسی(۲دوره) 🎓با ارائه سرتیفیکیت انگلیسی از دانشگاه علوم پزشکی شهیدبهشتی ⚡️هزینه هر دوره: ۹۹۰ هزار تومان ⚡️برای دیدن اطلاعات پکیجها و نحوه ثبتنام به کانال زیر مراجعه کنید t.me/BioinformaticsCollegePackages

☄مدرسه بیوانفورماتیک آنالیز داده های بیان ژن NGS #دوره_تخصصی_بیوانفورماتیک در این دوره بطورکامل نحوه انجام یک پروژه بیوانفورماتیکی درحوزه سرطان برای تشخیص بیومارکرها با جمع آوری دیتاهای بیان ژن نمونه های سرطانی مقالات مختلف آنالیز بیان ژنهای مایکرواری و ان جی اس بطورکامل تئوری وهم با کدنویسی آموزش داده میشود. نتایج در قالب مقاله چاپ خواهد شد. پکیجهای زیر هم در این مدرسه ارائه خواهد شد ⚡️برنامه نویسی R ⚡️آنالیز داده های مایکرواری ⚡️آنالیز داده های NGS در R ⚡️هزینه: ۹۹۰۰ 🎓 باارائه ۳ سرتیفیکیت انگلیسی از دانشگاه علوم پزشکی شهیدبهشتی ⚡️فرصتی بینظیر برای پرکردن گپ تحصیلی و حرفه ای شدن ⚡️این دوره هیچ پیش نیازی ندارد ⚡️در صورت نیاز براتون توصیه نامه صادر خواهد شد ⚡️مهمتر از همه اینکه 💥مقاله بیوانفورماتیکی💥 خواهید داشت ⏳ از ۸ آبان تا انتهای پاییز جمعه ها ساعت ۶ الی ۷:۳۰ بعدازظهر بصورت آنلاین از طریق گوگل میت t.me/BioinformaticsCollege

برای دو مقاله بیوانفورماتیکی چند پوزیشن خالی موجود میباشد. متقاضیان لطفا هر چه سریعتر به ادمین تلگرام کانال کالج بیوانفورماتیک پیام دهند t.me/BioinformaticsCollegeAdmin

Variant Calling Analysis Step 1: Sequencing & Quality Control Before we can start finding genetic variations (variant calling), we have to make sure our raw sequencing data is clean. Today's infographic breaks down the very first step in the pipeline: Sequencing & Quality Control (QC). Here's the data flow: 1️⃣ Sequencing: Platforms like Illumina generate raw data. 2️⃣ Raw Output: These are usually FASTQ files, containing billions of DNA reads and their quality scores. 3️⃣ Quality Control: We use tools (like FastQC or Cutadapt) to find adapters, low-quality bases, and sequencing artifacts. 4️⃣ Clean Data: The result is a high-quality FASTQ file ready for mapping! 💡 Check out the graphs! Notice how the "Before" quality score drops off at the end of the reads? That’s normal for sequencing, but we need to trim those bad bases. The "After" graph shows the power of QC, leaving us with reliable, high-quality data. Accurate science starts with accurate data. Don't skip your QC steps! 🧬✨ 🆔@BioinformaticsCollege

#مقاله_های_کالج_بیوانفورماتیک Comprehensive transcriptomic analysis of hepatocellular Carcinoma: Uncovering shared and unique molecular signatures across diverse etiologies, Biochemistry and Biophysics Reports https://doi.org/10.1016/j.bbrep.2025.102123 Hepatocellular carcinoma (HCC) is a leading cause of cancer mortality, often diagnosed at advanced stages where treatment options are limited. This study undertakes a comprehensive meta-analysis of gene expression profiles from 19 independent datasets sourced from the Gene Expression Omnibus (GEO), encompassing a diverse range of HCC etiologies, including HBV and HCV infections, cirrhosis, and normal liver comparisons. Our analysis identified 125 genes consistently altered across all datasets (e.g., CYP2C9, SLC22A1, RDH5) that represent a pan-etiology HCC signature, implicating retinol metabolism and solute transport as key pathways in HCC pathogenesis. Notably, 14 HBV-specific differentially expressed genes (DEGs) and ... 🆔@BioinformaticsCollege

#دوره_تخصصی_بیوانفورماتیک 💥 فرصتی بینظیر برای حرفه ای شدن، تقویت رزومه و پرکردن گپ تحصیلی💥 بیش از ۸۰ دوره تخصصی بیوانفورماتیک ⚡️برنامه نویسی R(۵ دوره) ⚡️ماشین لرنینگ در R(۶ دوره) ⚡️سروایول آنالیسیس در R (۵ دوره) ⚡️آمار زیستی(۳ دوره) ⚡️لینوکس(۲ دوره) ⚡️آنالیز داده های مایکرواری(۱دوره) ⚡️آنالیز داده NGS(بالک آر ان ای سک)(۴ دوره) ⚡️آنالیز داده سینگل سل(۵ دوره) ⚡️متاآنالیز داده های RNAseq(۱دوره) ⚡️واریانت کالینگ(۵ دوره)(whole exome sequencing) ⚡️آنالیز شبکه های زیستی(۲ دوره) ⚡️آموزش پکیج wgcna(۱دوره) ⚡️آنالیز شبکه ژن بیماری(۵ دوره) ⚡️متاژنومیکس(۴ دوره) ⚡️برنامه نویسی پایتون(۵ دوره) ⚡️ژنومیک محاسباتی(۲ دوره) ⚡️هوش مصنوعی(۵ دوره) ⚡️طراحی دارو(۵ دوره) ⚡️طراحی دیتابیسهای زیستی(۴ دوره) ⚡️طراحی پرایمر(۱دوره) ⚡️پی سی آر(۱دوره) ⚡️ریل تایم پی سی آر(۲ دوره) ⚡️سیستماتیک ریویو(۱دوره) ⚡️متاآنالیز(۱ دوره) ⚡️مقاله نویسی(۲ دوره) 🎓با ارائه سرتیفیکیت انگلیسی از دانشگاه علوم پزشکی شهیدبهشتی ⚡️هزینه هر دوره: ۸۹۰ هزار تومان ⚡️برای دیدن اطلاعات پکیجها و نحوه ثبتنام به کانال زیر مراجعه کنید t.me/BioinformaticsCollegePackages

🔬 RNA-seq Pipeline Phase 4 — Differential Expression & Functional Insights DESeq2, edgeR, limma-voom apply for normalizing counts. Differential Expression (DE) Analysis: Generalized Linear Models (GLMs) based on Negative Binomial distributions is used to tests for significant differences in expression between conditions (e.g., Control vs. Treated). p-value and Adjusted p-value (FDR): Corrected for multiple hypothesis testing (typically Benjamini-Hochberg) to control false positives. Results are visualized via MA plots and Volcano plots. A list of statistically significant DE genes is queried by GSEA against functional databases to understand the underlying biological pathways. Pathway Analysis: Canonical cascades via KEGG or Reactome. Clustering & Heatmaps: Hierarchical dendrograms displaying sample grouping and expression patterns across conditions. Output: List of validated, biologically meaningful candidate genes and mechanistic pathways driving the observed phenotype. 🆔@BioinformaticsCollege

#مقاله_های_کالج_بیوانفورماتیک Longitudinal Associations Between Plasma GFAP, Cognition, Amyloid Burden, and Neurodegeneration in Preclinical Alzheimer’s Disease, Neurology, 2026 https://doi.org/10.1212/WNL.0000000000216442 Objective To examine whether plasma glial fibrillary acidic protein (GFAP), a marker of astrocytic activation, predicts cognitive decline, clinical progression, and biomarker changes in preclinical Alzheimer’s disease (AD), and whether these associations differ by sex or amyloid status. Background GFAP reflects astrocyte reactivity associated with amyloid pathology and neurodegeneration in AD, but its prognostic role in the preclinical stage remains unclear. Design/Methods Data were analyzed from 949 cognitively unimpaired participants in the Anti-Amyloid Treatment in Asymptomatic Alzheimer’s Disease (A4) Study, a 240-week, multicenter, placebo-controlled trial of solanezumab in amyloid-positive older adults, and the companion amyloid-negative LEARN ... 🆔@BioinformaticsCollege

🎥فیلم کامل پکیج ساخت و آنالیز شبکه ژن بیماری ⚡️کار با انواع دیتابیسهای بیوانفورماتیکی ژن بیماری ⚡️کار و آنالیز داده های TCGA ⚡️بدست آوردن بیومارکرهای بیماریها ⚡️دیتا منیپیولیشن در آر ⚡️متاآنالیز و انریچمنت ژنهای دخیل در بیماری ⚡️ساخت و آنالیز شبکه ژن بیماری ⏳طول پکیج: ۴ دوره ⚡هزینه هر دوره: ۸۹۰ هزار تومان 🎓 با ارائه سرتیفیکیت انگلیسی از دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی ⚡️برای دیدن لیست کامل دوره ها و نحوه ثبتنام به کانال زیر مراجعه فرمایید t.me/BioinformaticsCollegePackages لینکهای کانال کالج بایوانفورماتیک یوتیوب http://www.youtube.com/c/BioinformaticsCollege اینستاگرام Instagram.com/bioinformaticscollege تلگرام t.me/BioinformaticsCollege لینکدین https://www.linkedin.com/company/bioinformaticscollege

برای دو مقاله بیوانفورماتیکی چند پوزیشن خالی موجود میباشد. متقاضیان لطفا هر چه سریعتر به ادمین تلگرام کانال کالج بیوانفورماتیک پیام دهند t.me/BioinformaticsCollegeAdmin

🔬 RNA-seq Pipeline Phase 3 — Trimming & Mapping Quality Filtering: Raw sequencing reads often contain synthetic adapter sequences or poor-quality base calls toward the 3' ends.Tools like fastp, Cutadapt, or Trimmomatic clip adapter sequences, remove low-quality bases (commonly Phred score < 20), and discard reads that fall below a minimum length threshold. Splice-Aware Alignment (Mapping):Eukaryotic mRNA contains spliced exons, meaning single sequencing reads may span non-contiguous genomic regions across large introns. Splice-aware aligners like STAR or HISAT2 map reads back to the reference genome in SAM/BAM format. Aligned BAM reads are matched against reference genomic annotations (GTF/GFF files) to quantify how many reads overlap each specific gene or transcript feature. Summarization tools like featureCounts or HTSeq-count generate an integer matrix of raw counts per gene across all samples. Output: Gene Count Matrix 🆔@BioinformaticsCollege پکیجهای آموزشی t.me/BioinformaticsCollegePackages

#مقاله_های_کالج_بیوانفورماتیک Cerebrospinal fluid inflammatory cytokines as prognostic indicators for cognitive decline across Alzheimer's disease spectrum, Journal of Alzheimer’s Disease, 2025 https://doi.org/10.1177/13872877251335915 Neuroinflammation actively contributes to the pathophysiology of Alzheimer's disease (AD); however, the value of neuroinflammatory biomarkers for disease-staging or predicting disease progression remains unclear. Objective To investigate diagnostic and prognostic utility of inflammatory biomarkers in combination with conventional AD biomarkers. Methods Data from 258 participants in the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) with cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers of amyloid-β (Aβ), tau, and inflammation were analyzed. Clinically meaningful cognitive decline (CMCD) was defined as a ≥ 4-point increase on the Alzheimer's Disease Assessment Scale Cognitive Subscore 11. Predictor variables included demographics (D: age, sex, education), APOE4 ... @BioinformaticsCollege

☄مدرسه بیوانفورماتیک ماشین لرنینگ سرطان ⚡️در این دوره بطورکامل نحوه انجام یک پروژه بیوانفورماتیکی ماشین لرنینگ درحوزه سرطان برای پیش بینی استیج بیماری، تایپ بیماری، و زمان مرگ بطورکامل تئوری و با کدنویسی آموزش و نتایج در قالب مقاله چاپ خواهد شد ⚡️در این دوره انواع روشهای ماشین لرنینگ، فیچر کریشن، فیچرسلکشن، کلسیفیکیشن، کلاسترینگ، مدلسازی و انواع معیارهای ارزیابی مدلها آموزش داده خواهد شد ⚡️هر نفر روی یک نوع سرطان یا بیماری کار میکند که در نهایت نتایج در قالب مقاله چاپ خواهد شد ⚡️از اونجا که تمام مراحل پروژه را آقای دکتر هر هفته گام به گام پیش میبرند، بطور کامل نحوه انجام یک پروژه واقعی بیوانفورماتیکی را آموزش خواهید دید ⚡️هزینه دوره: ۹۵۰۰ ⚡️دوره آنلاین در گوگل میت برگزار میشود 🎓 باارائه ۳ سرتیفیکیت انگلیسی از دانشگاه علوم پزشکی شهیدبهشتی ⚡️فرصتی بینظیر برای پرکردن گپ تحصیلی و حرفه ای شدن ⚡️این دوره هیچ پیش نیازی ندارد ⚡️در صورت نیاز براتون توصیه نامه صادر خواهد شد ⚡️مهمتر از همه اینکه 💥مقاله بیوانفورماتیکی💥 خواهید داشت ⏳ از ۱۳ شهریور تا انتهای مهر جمعه ها ساعت ۶ الی ۷:۳۰ بعدازظهر t.me/BioinformaticsCollege