Мир глазами биолога (Eka Vnizgolovoi)

Новость для тех, кто секвенирует. Ну или для тех, кто варится в кухне изучения геномов. Компания Roche объявила о том, что продолжает работать над своим нанопоровым секвенатором. И я не знаю, как к этому отнесётся Oxford Nanopore, которые прям вот сейчас проводят свою огромную конференцию London Calling. Суть нового метода мне пока не особо понятна. Если у Оксфорда все зависело от того, как меняется ток, если засунуть ДНК в маленькую дырочку, то методика Roche (а точнее стартапов, которые они выкупили в 2020 году, основывается на неких экспандосомах, которыми можно прочитать ДНК большими фрагментами. Посмотрим, как будет работать эта тема. Если взлетит, то здорово, потому что будет закрывать средний сегмент рынка. Если нет, то жаль, также как жаль пиросеквенирование, с которым я когда-то работала.

Глубоководные кальмары Taningia danae дорастают до 2,3 метра в длину и обладают светящимися органами размером с человеческий кулак — самыми крупными в природе. Несмотря на то, что этот вид был описан еще в 1931 году, он остается малоизученным. Однако недавно австралийским и британским зоологам удалось запечатлеть одну особь на видео во время изучения фауны Самоанского прохода в Тихом океане. Кальмар напал на погружаемую установку и попытался запугать расположенные на ней камеры вспышками света #Зоология | *2.1

Update по поводу ИППИ РАН. Меня вроде еще не уволили, зато уволили Михаила Сергеевича Гельфанда. Цитата из Телеграм-канала Михаила Сергеевича: «Тем временем, с 7 мая я уже не сотрудник ИППИ - по статье 288 ТК РФ. Есть серьезные основания надеяться, что это еще не финал. Пока не скажу, какие, - не время, - так что запасайтесь очередным попкорном :-)» Напомню, что Михаил Гельфанд это самый цитируемый ученый в ИППИ РАН и один из самых цитируемых ученых в России. Его индекс Хирша по Scopus равен 61. Он доктор биологических наук, кандидат физико-математических наук и член престижной Европейской Академии. При этом еще и классный популяризатор науки. Забавно, что с проклятыми «уехавшими» учеными борются, увольняя прежде всего тех, кто не уехал, но смеет возражать дирекции. У меня тоже есть основания думать, что это все не финал и справедливость все-таки восторжествует. Если вы не в курсе всей ситуации, посмотрите мое видео «голая вечеринка в Российской науке», чтобы офигевать вместе со мной. Я все больше убеждаюсь, что решение публиковать это видео было правильным. Ссылку на Телеграм Михаила оставлю в комментариях к посту.

Я уже много лет не варюсь в академической жизни РФ, и ничему уже не удивляюсь, наверное, но тут я просто выпала. Если вы все пропустили, посмотрите видео Александра Панчина о е**нине, которая происходит в его родном институте https://youtu.be/EVBwYFQwPaU?si=hMTwyY8m5vgkcryx

Делюсь своей болью, как человек, который постоянно ищет иллюстрации для работы. Неправильная форма ДНК! ДНК обычно закручена направо. Есть и левозакрученная, но это редкость. Как определить? Представьте, что вы поднимаетесь по винтовой лестнице. Если держитесь правой рукой, то вы на право закрученной спирали. Вот хорошее видео, которое иллюстрирует, как понять, в какую сторону закручена ДНК. 10 пар оснований на оборот. С этим ещё большая беда... • Если разрезать ДНК вдоль, то половинки не симметричны. У них есть малая и большая бороздка. Эту ошибку я вижу чуть ли не чаще всего, и она, наверное, для профессионалов. То, что азотистые основания это не полоски, а кольца, которые взаимодействуют друг с другом к этому я уже привыкла В общем, всем правильных иллюстраций и счастливого дня ДНК!

Милота из Нидерландов

​В новом дайджесте — необычная эволюция бабочек, новые методы борьбы с инвазивными видами и то, что отзывать статьи нормально, если у вас появилась новая интерпретация данных. Читайте на нашем сайте. Автор: Екатерина Грачева #Биомолекула_дайджест

Невозможно читать новости, невозможно. Берегите себя!

Франс де Вааль умер. Не знаю, как эти слова вообще могут стоять рядом. Повторяю со вчерашнего вечера, и не могу понять. Приматолог моего сердца, один из лучших в мире спецов по поведению и социальному интеллекту обезьян, автор великолепных книг, которые регулярно перечитываю. С Де Ваалем это каждый раз как лично поговорить, всегда оказывается о разном. Как раз сейчас перед лекцией перечитываю его "Difference", свеженькую, 2022 года. И тут оказывается, она последняя.  Кажется, за эти годы я все уши всем прожужжала Де Ваалем. Он огромная фигура в моем мире и очень повлиял на меня. Я никогда не общалась с ним, но мечтала, что однажды это случится.  Выдающийся ученый, блестящий писатель и очень добрый человек. Миру будет страшно его не хватать. Особенно сейчас.