Бластим: курсы и работа в биотехе

Environmental scientist, P&G, Germany We are inviting applications from Master or Ph.D. level environmental scientists and engineers with experience in Life Cycle Assessment (LCA) to work in Environmental Stewardship and Sustainability (ESS) as part of P&G’s Global Product Stewardship (GPS) organization. Requirements: - Ph.D. or Master’s degree in environmental science or related fields, experience on Life Cycle Assessment (LCA) is preferred. Knowledge and experience in science-based sustainability metrices and measures would be a plus. - Leadership experience in leveraging environmental science expertise for complex environmental and sustainability reviews in an industrial, government, and/or academic setting. - Working knowledge in allied fields such as environmental chemistry and toxicology, environmental fate and exposure, analytical chemistry is beneficial. - Strong communication and partnership skills to enable seamless collaboration with customers and collaborators inside and outside the Company. - Fluency in English More info: https://clck.ru/32dZHf

Кто расскажет про RNA-seq? Евгений Герасимов больше 8 лет занимается анализом данных в биологии и специализируется на сравнительной геномике. Закончив биофак МГУ и защитив кандидатскую, он стал заниматься биоинформатикой и сейчас является старшим научным сотрудником лаборатории геномики простейших кафедры молекулярной биологии биофака МГУ. А ещё Евгений регулярно преподает на курсах Бластим и проведет два первых занятия на программе «Анализ данных RNA-seq». Рассказываем, о чем они будут. 16 ноября в 19:00. Вводная лекция про технологии секвенирования РНК с платформ Illumina и Oxford Nanopore. Обсудим источники данных и рассмотрим этапы планирования эксперимента по транскриптомике. После занятия вы: — разберетесь со специфическими терминами — парноконцевые чтения, плотность кластера, fastq, индекс и т.д.; — узнаете особенности технологии Illumina «Секвенирование путем синтеза» (SBS); — будете знать о нюансах планирования эксперимента по секвенированию. 23 ноября в 19:00. На этом занятии вы научитесь использовать Hisat2 и STAR для выравнивания сырых ридов на референсный транскриптом. Обсудим суть этих программ и как они соотносятся с другими методами выравнивания. По итогу вы научитесь: — картировать данные; — изучать референсный транскриптом из Ensembl; — использовать Hisat2 для создания индекса к рефернсу; — использовать STAR, чтобы сопоставить сырые риды с этим индексом; — считать покрытие на генах и оценивать корреляцию между репликами. Записаться на курс можно по ссылке Посмотреть вебинар по введению в анализ NGS-данных с участием Евгения можно на нашем ютуб-канале. #бластим_курсы

Восполним дефицит рассказов о спикерах наших курсов и их профессиональном пути. Бластим приглашает людей с академическим бэкграундом, самой релевантной информацией, солидным багажом знаний и международным опытом. Светлана Закирова — один из лучших тому примеров. Светлана Анатольевна биолог по образованию: закончив аспирантуру по молекулярке, она успешно защитила кандидатскую, прошла стажировки в Италии и США. А после ушла в фарминдустрию. Поначалу работала в AVVA Pharmaceuticals, что стало для нее ценной международной практикой. Затем в течение 5 лет Закирова возглавляла департамент разработки SPLAT, постигая специфику FMCG. Сегодня Светлана Анатольевна — заместитель генерального директора по исследованиям и разработке компании «Нанолек». «Нанолек» — один из немногих представителей российской биофармы, который планирует создавать новые препараты и уже налаживает производство полного цикла. Компания стремится стать лидером в создании вакцин и вкладывает миллионные инвестиции в свой RnD-департамент. Еще Закирова — лектор интенсива «Из исследований в разработку фармпрепаратов». В рамках курса она прочитала вводную лекцию, где рассказала о трендах в фармбизнесе, специфике российских компаний, управленческих моментах, а также поделилась личными прогнозами и инсайтами. Подписывайтесь на Светлану Закирову в линкедине, а также следите за нашими новостями в соцсетях — совсем скоро мы проведем вебинар с ее участием. #бластим_курсы

❗️❗️❗️ Внимание, коллеги ! Если Вы знаете Питон/R и/или молекулярную биологию, хотите "спасти мир", получить фан от нетворкинга, поупражняться в Дата Сайнс и/или Биоинформатике по сингл-селл данным, написать научную статью, то есть отличная возможность: Присоединяйтесь к нашей активности вокруг Каггл соревнования по мультимодальным данным ! Требования достаточно минимальны - Питон/R или мол.био (одно из двух - и то и другое - НЕ обязательно) и некоторое свободное время. Наша цель - провести некоторый дата-сайнс анализ этих данных и вместе с биологами проинтерпретировать его и написать статью. Занимать топ места в сореве - не обязательно, (но не помешает). Это НЕ "приват шаринг" - все что делается - вначале выкладывается в публичный доступ на Каггл, только потом обсуждается. Часть задач/вопросов - описано там же на Каггл: линк. Присоединяйтесь ! Пишите @zabis13 (Юрий Барамыков - ДС, Питон, R) , @alexander_v_c (Александр Червов - биологи) или отметьтесь в голосовалке: https://t.me/sberlogacompete/2548 Предлагаем начать с такого: https://t.me/sberlogacompete/2805 https://t.me/sberlogacompete/2806

Новости и события Бластим в одном месте! Открыты записи на курсы: 16 ноября — 14 декабря (даты сдвинулись на неделю!) Анализ данных RNA-seq. Онлайн курс по анализу транскриптомов для всех, кто занимается обработкой NGS-данных по экспрессии генов. 11 ноября завершение нашей хэллоуинской истории и новые скидки! 23 — 27 января, 30 января — 3 февраля 2023 года Анализ NGS-данных. Наш классический большой курс по NGS. Вы научитесь всем основным видам обработки данных секвенирования. Самая низкая стоимость места до 11 ноября. Предварительные анонсы: В начале декабря хотим провести конференцию вместе с экспертами фармы и биотеха. Пишите в комментариях, если вам интересен такой формат. Думаем над новым потоков экспресс-курса по подготовке CV и мотивационного письма для работы за рубежом в декабре. Предзапись по ссылке Ближайший курс по Python в новом формате запланирован на февраль. Новости компании: Теперь мы можем выдавать сертификаты государственного образца, а наши курсы засчитываются как повышение квалификации! #бластим_курсы

Расскажем историю одного популярного препарата. О том, как случайность стала закономерностью, принесла фармкомпании-разработчику миллиарды долларов и совершила настоящую социальную революцию. #бластим_выходные #бластим_курсы

Сделали подборку лекций, конференций и программ в науке и индустрии: NYU Langone Health Scholar Support Program. Стипендиальная программа поддержки для PhD и постдоков. Лекция представителей компании YADRO «Система хранения данных для программистов — Data Path». Дата проведения: 8 ноября. Формат: очно (Санкт-Петербург). МедтехМитап «Как выстроить партнерство с ОАЭ российским медтех-стартапам». Дата проведения: 8 ноября. Формат: очно (Москва). Презентация новой магистерской программы МГУ «Искусственный интеллект в биологии». Дата проведения: 6 ноября. Формат: онлайн. Школа молодых ученых «Редокс регуляция в биологических системах». Дата проведения: 8 ноября. Формат: онлайн. VI Сеченовский Международный Биомедицинский саммит (SIBS-2022). Даты проведения: 8 — 9 ноября. Формат: очно (Сеченовский Университет, Москва), участие бесплатное. Мультиконференция-выставка «LifeScience, биотехнологии и аналитическая химия в современных условиях. Взгляд на Восток?». Дата проведения: 9 ноября. Формат: очно (Москва) The Wiley Analytical Science Conference. Даты проведения: 9 — 17 ноября. Формат: онлайн. Конференция молодых ученых «Геномика, матегеномика и молекулярная биология микроорганизмов». Регистрация: до 10 ноября. Даты проведения: 19 — 20 ноября. Формат: очно (Москва, Сколково). Образовательный проект для врачей «Школа профессионального роста». Дедлайн: до 11 ноября. Всероссийская конференция по естественным и гуманитарным наукам с международным участием «Наука СПбГУ — 2022». Регистрация: до 11 ноября. Дата проведения: 21 ноября. Формат: онлайн. Зимние стажировки в BIOCAD 2023. Регистрация: до 14 ноября Формат: очно и онлайн. Nano-architectures for Chemical, Biological and Therapeutic Applications. Регистрация: до 15 ноября. Даты проведения: 25 — 27 ноября. Формат: очно-заочно (Индия). Семинар «Регистрация медицинских изделий: пошаговая инструкция для стартапа». Дата проведения: 15 ноября. Формат: очно и онлайн (Москва). XIII Молодежная школа-конференция «Актуальные аспекты современной микробиологии». Даты проведения: 16 — 18 ноября. Формат: очно и онлайн (Москва). The 16th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies. Дедлайн: 17 ноября. Формат: очно и онлайн (Лиссабон). Научная школа для молодых ученых «Структурная биология: основные проблемы и подходы к их решению». Регистрация: до 18 ноября, участие бесплатное Дата проведения: 22 ноября. Формат: очно (Москва). Премия Nanomaterials 2022 Young Investigator. Дедлайн: до 30 ноября. #бластим_подборка

#бластим_рекомендации Life Sciences, биотехнологии и аналитическая химия в современных условиях. Взгляд на Восток? Мультиконференция-выставка Диаэм пройдет 9 ноября 2022 г. по адресу Холидей Инн, Москва, Лесная 15. На повестке дня вопросы оснащения лабораторий в условиях санкций: — Что сохранилось из старых и проверенных брендов? — Оборудование и реактивы, призванные заменить ушедшие марки. — Уникальная возможность протестировать новые приборы. В программе научные доклады, выставка оборудования, презентации и мастер-классы в специализированных рабочих секциях: — Химический синтез и анализ. — Биотехнология и Микробиология. — Белки и Клетки. — Геномика и Молекулярная биология. Увидеть новинки не на картинке, а своими глазами — это решающий критерий выбора! Успейте зарегистрироваться, количество мест ограничено. Участие бесплатное: http://amp.gs/jGXTw

Метод РНК-секвенирования позволяет изучать различия экспрессии генов в течение времени и/или в разных тканях организма, находить места альтернативного сплайсинга, диагностировать патологии, изучать возможности редактирования РНК и много чего ещё. На сегодняшний день это один самых перспективных методов секвенирования. Мы сделали онлайн курс «Анализ данных RNA-seq», чтобы помочь вам разобраться со всеми этапами работы с результатами РНК-секвенирования. На курсе поговорим про источники данных, обсудим нюансы «мокрых» экспериментов, расскажем как качать данные с SRA, картировать с Hisat2 и STAR и другими тулами, какими метриками оценивать качество картирования и т.д. Вас ждут данные разных организмов и прикладные задачи — это сделает полученные знания более универсальными. Помимо насыщенной программы, вы получите: — спокойный темп обучения и помощь с освоением лично вам; — место на сервере BlastimCloud и полное программное обеспечение на время курса; — сертификат. Это программа считается курсами повышения квалификации, и в дальнейшем вы сможете получить налоговый вычет; — хакатон! Командное соревнование с призами и яркими эмоциями. Подать заявку #бластим_курсы

Дисклеймер: все совпадения случайны и не имеют отношения к реальности. Ужасы биофака. Часть 4. В кабинете находится холодильник и вы решаете исследовать его содержимое. Вас встречают половинка лимона и наполовину полная бутылка коньяка. «Годится!» — командует аспирант и предлагает разделить с ним трапезу. Где-то за разговорами вы замечаете, что уровень жидкости в бутылки не изменяется. Но почему-то это уже не так важно. Время остановилось. Есть только кабинет, аспирант, бутылка коньяка и вы. \____ Вы предлагаете воду и шоколадку. Аспирант на секунду задумывается и замечает, что шоколадка будет приятнее, если запивать её коньяком. Он предлагает поискать по кабинету. *Теперь прочтите предыдущую часть. _____ Утренняя шаурма незамедлительно появляется из кармана. Взгляд аспиранта будто бы проясняется. Он сжевывает импровизированный завтрак и объявляет: «Идём!». Бродя по коридорам вы выясняете, что университет стал пристанищем всевозможной нечести. Профессора математики в открытую пожирают страдания студентов, вы это уже наблюдали. У генетиков оборотни и кошкодевочки занимаются изменением форм ушей и хвостов. Физики летают между корпусами на всем, что смогли поднять и смогли на это сесть. Из корпуса ихтиологии льётся вода и слышны песни. Аспирант показывает вам местное подземелье, которое связывает все корпуса университета. Он предлагает идти в ректорат, чтобы найти источник этого безумия. По пути вы встречаете компанию университетских ролевиков, которые, кажется, адаптировались и получали удовольствие от происходящего. Помогать вам они на отрез отказались. Вы оказываетесь в огромном конференц-зале. Он заполнен людьми так, будто на этой лекции будут отмечать присутствующих. Все галдят и размахивают какими-то табличками с цифрами. В центре зала вы видите… лепрекона?! Он призывает всех к тишине и объявлет, что дома окажутся только те, кто закроет пересдачу. А он, не последний лепрекон в этом здании, может помочь договориться, но только с одним студентом. Начинается аукцион. _____ А у нас тоже аукцион! Мы разыгрываем место на абсолютно любой курс Бластим. Их список можно посмотреть тут: http://amp.gs/jGwbo Как в нем участвовать? Вы можете оставить свою ставку в комментариях под этим постов [в группе Бластим Вконтакте.](http://amp.gs/jGwb5) Минимальный шаг в повышении ставки — 100 рублей. Начальная цена — 1000 рублей. «Торги» мы закроем в 20:00 по московскому времени. Последний комментарий с суммой, написанный до 20:00 включительно, будет итоговой ценой для покупки места на любой из курсов. Аукцион объявляется открытым! #бластим\ужаснаяигра

Дисклеймер: все совпадения случайны и не имеют отношения к реальности. Ужасы биофака. Часть 3. Взяв листочек вы быстрым шагом направляетесь к своему месту. И как это решать? ______ Если вы взялись решать ĤΨ=EΨ или доказывать гипотезу Римана, то долго всматриваетесь в листок. Вам попались очень знакомые символы/фамилия, но никак не получается вспомнить, что с ними делать. С каждым усилием придумать решение на вас накатывает слабость. Сквозь почти закрытые веки вы отмечаете слабое зелено-синее свечение и слышите еле слышный шепот: «Oh, the sweet tones of misery». ______ Кажется ночной думскролинг оказался не бесполезным! Накануне вы точно видели это уравнение. Кажется байка про студента, случайно решившего нерешаемую задачу, спасет вашу зачетку. Записав ответ, вы понимаете голову и видите замерших профессора и студентов. А со стороны кафедры все наплывающий и наплывающий зелено-синий туман. Кто-то хватает вас за шиворот и быстро утаскивает сначала из аудитории, а потом дальше в глубь коридора. Это же П., знакомый аспирант с кафедры беспозвоночных. Где-то уже совсем далеко от аудитории пересдачи, он ногой распахивает один из кабинетов, пинает вас в него, забегает сам и захлопывает дверь. Минуту вы просто тяжело дышите, ещё минуту обмениваетесь впечатлениями непубликуемыми словами. Разговор становится более интеллектуальным. Вы узнаете, что П. накануне посетил выходной семинар своей кафедры в честь полученного гранта. Он настолько преисполнился достижениями своей научной группы, что остался ночевать в университете. А утром стали происходить зловещие вещи. Вспомнив, что на другом семинаре факультета вы жаловались ему на пересдачу, П. решил вас разыскать. Вовремя. Кажется, он знает как можно выбраться. Но в ответ на помощь, П. просит его накормить. Вы соглашаетесь и предлагаете П.: 1) Воду и шоколадку. Экзамен же. 2) Пошарить в холодильнике в кабинете и что-то приготовить. 3) Шаурму. Вы не успели её доесть, и половина все ещё лежит у вас в кармане. ______ Сделайте выбор в гугл форме по ссылке: http://amp.gs/jGwDF. Первые три человека, выбравшие верный шаг, получат скидку 35% на наш курс «Нутрициология для всех: научный подход к организации питания» http://amp.gs/jGwDX Следующая часть выйдет завтра (31.10) в 12:00 по Москве. #бластим_ужаснаяигра

Дисклеймер: все совпадения случайны и не имеют отношения к реальности. Ужасы биофака. Часть 2. \__ Вы умоляете пропустить вас, показывая конспекты, паспорт и все содержимое рюкзака, доказывая вашу принадлежность к студентам. Даже читательский билет оказывается с собой. Охранник упирается пускать вас без студенческого. Кажется охранную организацию снова поменяли, и это его первое дежурство. Вы спорите, а охранник звонит по разным номерам, чтобы выяснить, как с вами поступать. На это уходит больше 10 минут и вы оставляете надежды успеть. ___ Нет времени спорить, нужно бежать! Вы показываете пальцем куда-то за спину охранника и делаете удивленное лицо. Когда он поворачивается, со всех ног бежите в сторону турникета. Кто-то из одногруппников рассказывал, как он так делал. Но уже на первых метрах такого забега охранник перехватывает вас. И с позором возвращает за турникет. Он начинает активно куда-то звонить и ругаться. Время упущено. ___ Кто-то же должен ещё сегодня пересдавать? Вы принимаете решение дождаться человека, который вас пропустит. Полминуты тишины и на посту охранника раздается звонок. В трубке слышно шуршание, а затем кто-то отчётливо называет вашу фамилию. Вы тут же суете охраннику под нос паспорт, и дежурный, не прекращая разговор, пропускает вас. На бегу вы оборачиваетесь и замечаете, как он испуганно смотрит вам в след. Странно. Если бежать, то до нужной аудитории можно добраться за 3 минуты. Кажется в этот раз рекорд побит. От резкой нагрузки кажется, что стены немного двигаются. Но это не важно, главное что вы успеваете. Ассистент у двери узнает вас и пропускает в аудиторию без вопросов. Вы падаете на первое свободное место. Что-то не так. Пожилой профессор будто бодрее и молодее обычного. Чего не скажешь о студентах в аудитории: пустые взгляды, никто не пытается заговорить с соседом. Переживают наверное. Вы первый идете за билетом, отгоняя от себя нехорошее предчувствие. Неестественно весёлый преподаватель разрешает вам выбрать одно из трёх заданий: 1) ĤΨ=EΨ 2) Докажите гипотезу Римана 3) β (ξ,σ) = P{E є ω | ξ,σ} Какой билет выбрать? ___ Это снова #бластим\ужаснаяигра. Свой ответ оставляйте в гугл-форме по ссылке. Первые три человека, выбравшие верный билет, получат скидку 35% на курс «Статистика, R и анализ данных». Следующая часть выйдет сегодня (30.10) в 20:00 по Москве.