from PhD import *

Февраль в AI-сфере выдается жарким: 💜Anthropic (компания разработчик модели Claude) буквально вчера обвиняет DeepSeek и ряд других китайских компаний в неправомерном использовании Claude через 24к поддельных аккаунтов для тренировки своих моделей. 💜В ответ люди иронизируют над Дарио Амодеи, главой Антропика: откуда-же Claude взял данные для своей треннировки и насколько всегда это было правомерно? ❤️Неделей ранее другая новость - OpenAI (разработчик ChatGPT) покупает OpenClaw - подающий хорошие надежды персональный ИИ-ассистент австрийского разработчика Петра Камнегорова. ❤️И тут же OpenClaw в качестве ассистирования удаляет более 200 имейлов из гугл-почты Summer Yue - директора по AI Safety и Alignment в Meta AI. Саммер пишет что бот вошел во вкус и игнорировал любые попытки его остановить. 💛Где-то под радарами Perplexity просто отменяет 360 миллионов Pro-подписок. И моя личная вишенка на торте: 💛На прошлой неделе GitHub без каких-либо предупреждений и объяснений стирает аккаунт lucidrains принадлежащий Филу Вангу - OpenSource-разработчику в PyTorch. Он занимался тем что брал все подряд (в том числе научные) МЛ-модели и имплементировал их в удобном и юзабельном формате. Список его проектов огромен, я например пользовался его имплементацией Борзого. В общем, хаос нарастает как на дрожжах. Один Grok в белом пальто стоит красивый. В твиттере все чаще вспоминают чем же закончились 6 сезонов кремниевой долины 😄 С теми кто дочитал до конца делюсь тем не менее милым гайдиком от Claude про то как они настраивают работу модели под себя - The Complete Guide to Building Skills for Claude. В целом Anthropic Academy выглядит оч приятно.

Сегодня выступил на конференции / annual review. 🎓 В этом году помимо студентов нашего направления (Neuroscience) были ещё ребята с медицинских направлений - так что отдельной задачей было сделать доклад простым и понятным. Кажется, даже получилось.

Учитывая что EMBO платит мне 500 евро за 10-и минутную лекцию - надо пересмотреть свой преподавательский ценник за пары по 1.5 часа👀👀😁😁

Батюшки, мне еще и взнос оплатят и на дорогу с проживанием денег дадут

Dear Nikita, I am pleased to inform you that your abstract ​has been selected for an oral presentation at the upcoming EMBO Workshop: Brain (epi)genome, 21 - 24 April 2026.

Буквально только-что получил имейл - радости полные штаны. Очень хорошая конфа при регистрации на которую мне даже было сложно выбрать секцию так как все секции - это ровно мой магистерский диплом по главам. И первая конференция куда меня выбрали на устный доклад! Что вообще круто, особенно что там будет Joseph Ecker - крууупная шишка в эпигеномике с хиршем 150. Будет рассказывать про регуляцию генов в мозге человека. Теперь получается надо готовиться... Че-то стоящее придумать В понедельник будут еще результаты по тревел-гранту - 🤞🤞

Еще недавно младшему брату в школе был нужен минутный видеоролик о моей профессии. С собранным на коленке штативом из учебников и любимой сонькой получилось вообще профессионально! (а еще с новым блоггерским микрофоном от Оксаны ❤️) следующая станция youtube, кидайте идеи для роликов 😎😁

Забавную ловушку обнаружил для пользователей linux. Мне надо было отредактировать несколько строк в одном файле, сходу я понадеялся что можно упросить себе жизнь открыв поочереди каждое место через:

nano +1 test.txt +2 test.txt ...

(+1, +2 и т.п. как раз указывают на сколько строк перепрыгнуть вперед). Но в момент запуска такой команды вылезает предупреждение - файл пытаются изменить из нескольких процессов параллельно, что небезопасно. Удивило меня то что никакого "параллельного процесса" в списке процессов не появляется. Но linux держит файл под локом, даже если закрыть терминал и открыть новый!

Ежегодное напоминание: 1 марта - дедлайн приёма заявок на годовую программу в Институте биоинформатики ✨! Как посчитать дифф. экспрессию, чем линейная регрессия не отличается от t-теста, что означает название этого канала? И если кто не знает - здешний админ ведёт там курс по python. В общем, головой ручаюсь будет полезно и очень весело. Если есть какие-то вопросы можно писать их в комментариях или мне в личку:) Обязательно подавайте свою заявку! 🌑Telegram channel 🌑Admission page

Австрийская корова Вероника стала первой в истории коровой с зафиксированным использованием орудий труда 🐄🐄 Ее фермер заметил что она ворует швабры чтобы ими чесаться. Позже ученые даже заметили, что статистически значимо чаще она чешет спину щеткой, а брюхо - черенком.

Сегодня открыл для себя в Вене Cosmotheca - парфюмерная где помимо прочего можно приготовить свой собственный аромат из базовых нот. Если пройти тест то ИИшка подберёт приготовит 3 варианта, которые потом можно попробовать и доработать (или приготовить что-то совсем свое). Вопросы в тесте тоже прикольные, от "любите ли вы рисковать" до "кто вы больше, Кики или Буба". Самое крутое это процесс приготовления - ваш флакончик едет по конвейеру который автоматически доливает нужные ингредиенты, и при этом ещё несколько флаконов могут готовиться одновременно. При чем у них есть филиалы много где, говорят что в дубайске сейчас самый новейший аппарат.

В новом году попытаемся быть РеАлЬнЫм 🤪 Добавляйтесь:) bere.al/nvaulin

Сегодня утром сходил поставить вакцину от ВПЧ 💉 Да, я мужчина, мне 25, и это полезно сделать. Понятное дело что эффективность вакцины максимальная если поставить ее до начала половой жизни, но лучше поздно чем никогда. И мужчины тоже в теории могут страдать от последствий ВПЧ, хоть и сильно реже. Ну и для кармы тоже полезно:) В Австрии действует программа бесплатной вакцинации всех кто моложе 30 лет. И она заканчивает свое действие в 2025 году, так что по сути влетаю в последний вагон.

Google теперь во всех своих сервисах начинает продвигать пересказы с помощью ИИ. Нельзя сказать даже что в чем-то он не прав 😁 Ударим машинным обучением по регуляции нервных зародышей!

Google AI Pro бесплатно на год для студентов! https://gemini.google/students/ Только что оформил себе подписку, там у них: 📎Полный доступ к Gemini 3 Pro, включая работу с доками, картинками, почтой, CLI, ... 📎Veo для генерации видео 📎NotebookLM (иишка для резерча), и какие-то еще (Jules, Flow, Whisk) 📎 2Tб на гугл-диске (уже это того стоит!) Работает только к сожалению не во всех странах (в России, например, нет), и в некоторых уже срок прошел. Но в Австрии и Германии точно еще 4 дня есть!

Вчера Карина сводила нас в Гамаюн - очень классное русскоязычное пространство в Вене. В первую очередь студия лепки и книжная лавка. Попытался что-то вытворить в качестве подставки для палочек и всякого такого, получился удав из 38 попугаев с коловой крокодила 😁

Эту рабочую неделю мы с Серёжей Исаевым зашлифовали хакатоном по системному администрированию - сделали глобальный апдейт серверов лаборатории 🖥 Суммарно за 6.5 часов мы 5 раз обновили Ubuntu (дважды на одном сервере и трижды на другом), а потом ещё на обоих серверах обновили Cuda, JupyterHub, R и Rstudio. Никогда ещё я не видел htop в таком кристально чистом состоянии 😄 И не без приключений: после апдейтов софтвеера мы столкнулись с тем что половина оперативки вдруг перестала работать. Поэтому софтовый пятничный хакатон плавно перетек в субботний хардвеерный. Но в итоге все круто, летает работает 🚀 Но конечно загадка как люди все это делали до прихода ИИ.... (мы пользовались любой доступной нам помощью и кажется Gemini лучше всех шарил в этих айтишных приводах)

4 года назад, будучи на последнем курсе бакалавриата, я увидел лекцию Екатерины Храмеевой про упаковку хроматина и анализ данных Hi-C 🧬. Эта лекция была довольно техническая, примерно тогда же у Екатерины Евгеньевны был еще более научно-популярный доклад про биологию происходящего: 1) 📎 Новые подходы к анализу данных Hi-C об упаковке ДНК в ядрах клеток 2) 📎Секрет упаковки ДНК. Жизнь под контролем структуры Но вот ровно после просмотра первой, методологической, лекции я подумал: "как же это круто и как бы я мечтал этим заниматься". Меня очень восхитило что мы можем смотреть на какую-то матрицу стоящую из миллионов шумных пикселей и буквально видеть глазами какие процессы происходят в ядре: как там плавает молекула ДНК, какие белки где на неё садятся, как это включает или выключает экспрессию генов. Так бы это и осталось мечтой, тем более на тот момент я уже защищал бакалаварский диплом и брался продолжать свою тему в магистратуре в крутейшей команде под руководством Константина Северинова. Что-то менять значило выбросить столько хороших результатов... И уйти от хороших коллег.

Но спустя год непрерывных фантазий о матрицах я все таки решился. И у меня оставался еще год чтобы как следует окунуться в изучение укладки хроматина в клетках мозга человека.

К чему это я? Я уже в другой стране в другой группе, но вот мы таки доделали два препринта: 🌸Ultra-long-range Polycomb-coupled interactions underlie subtype identity of human cortical neurons 🌸Fetal signatures in the 3D genome of iPSC-derived neurons: implications for disease modeling Очень крутой результат для 12и месяцев работы (и еще бы не забыть про обзорную статью и мой стильный постер). Спасибо, друзья 💗 Кажется эти две публикации ставят некоторую точку в этой части моего академического пути. Но я всем сердцем надеюсь что-то у этой истории еще будет впереди. И уж точно что-то еще будет впереди у меня и у матриц Hi-C. Я убедил Игоря что нам тоже нужно их секвенировать! Но и без этого всё равно (that's why, Амина, ты нужна мне 🙏) definitely, to be continued...

Оказывается если вы в seaborn захотите построить dotplot но сделаете опечатку - получите самую милую пасхалку из тех что я встречал 🥰 Если вызывать sns.dogplot() несколько раз - будут рисоваться разные фотографии этой собаки. Видимо ее владелец кто-то из авторов пакета 🤔 Кидайте какие еще знаете пасхалки в комментарии!