from PhD import *

Сегодня впервые участвовал в публичном забеге: 10К в рамках Vienna City Marathon 🏃‍➡️ Нам супер повезло с погодой, было солнечно и прохладно (после обеда обещают грозу!). И в целом в такой большой компании, на таком удобном маршруте - мне никогда так легко не бежалось. Буду ждать фоток, я там везде кайфую по полной. Моя прошлая десятка была за 54 минуты, поэтому я сегодня был вообще в полном шоке увидев что пробежал за 47! (официальное время по транспондеру 47:12) В общем несколько личных рекордов, и юбилейная 75я активность в Strava! (Начал трекать ~год назад) Ну все, теперь появился азарт, будем ловить слоты дальше 😆

Принёс вам еще один способ убить полчаса рабочего времени. Особенно если вы любите красивые визуализации. Project Backbone — энто детальная 3D-визуализация физической инфраструктуры интернета, карта того, как мир связан проводами прямо сейчас. Можно подсветить маршруты кабелей, посмотреть, где плотность дата-центров зашкаливает (США и Европа это один сплошной хаб), и даже глянуть на всё это с высоты спутника. А ещё понравился блок "Вес облака". Там оценивают всю интернет-инфраструктуру примерно в 35 миллионов тонн. Очень полезное напоминание о том, что “облако” это не магия, а чудовищный шмат железа, меди, оптоволокна, бетона и электроники, размазанный по всему земному шару. Идеально, чтобы позалипать под музыку и осознать, насколько монструозную хреновину мы построили вокруг планеты ради возможности генерировать картинки с котами в 4К и отправлять их друг другу.

Поездка в Армению аккуратно фланкировалась двумя преподавательскими активностями: В пятницу для коллег из St. Anna CCRI сделал небольшой воркшоп про AlphaGenome. Посмотрели как им можно пользоваться, но самое главное - ребята поняли что этот метод, хоть и выглядит очень крутым, не подойдет для ответа на большинство вопросов которые есть у них. Это тоже хороший результат. А сегодня мы с Сережей Исаевым и Петром Харченко устроили воркшоп по анализу scRNA-seq для коллабораторов из IMBA. Был план как можно сильнее интегрировать в анализ общение с LLMками - чтобы упростить жизнь биологам и заодно выровнять воркшоп с тем куда нынче движется наука. Не все получилось, не все прошло без греха, но для первого раза все равно вышло неплохо.

Устроили тут удивительные выходные в Армении. Вопреки погоде добрались до "Симфонии камней" - огромный базальтовый массив, который сформировался когда лава стекала в ущелье реки Азат около 40 млн лет назад 🌋. Выглядит невероятно, особенно учитывая что эти "стержни" ещё разнообразно причудливо извиваются. Люди ещё говорят это "Базальтовый орган", хотя как по мне оочень похоже на управляющие стержни в ядре атомного реактора. А вечером открыли для себя очень классное пространство прямо в центре Еревана, 13:20. Закончилось все тем что я немного постоял на мойке и заготовках, ахах 🤪

Смотрите что крутое у нас тут будет через полгода!

💡 TAD AI 2026 | Oct 28-30, Vienna

Среди спикеров: ✨ Джеффри Хинтон✨ - один из крутейших ученых в области ИИ, его еще называют Godfather of AI. В 2024м году он вместе с Хопфилдом получил Нобелевскую премию, а в 2018 - премию Тьринга вместе с Лекуном и Бенжио. Они с Бенджио, кстати, 2 информатика с >1млн цитирований! ✨Питер Штейнбергер✨- основатель OpenClaw, про которого я уже упоминал здесь месяц назад. ✨Окуясу Камитани✨- профессор из Киото занимающися декодированием мозговой активности с помощью ИИ Помимо докладов также заявленны воркшопы по использованию ИИ от создания фильмов до персонального подбора лекарств (никого ни к чему не призываю, просто интересно). Еще и пройдет все в Хофбурге! Это императорский дворец Габсбургов и нынешняя резиденция президента. Единственное что - проходка стоит полтора килоЕвро 🫠🫠. У Early birds есть еще 3 дня чтобы купить всего за тысячу. Ищу богатых подписчиков готовых поддержать молодого и талантливого студента😂

Лабные будни

✨Ученые из отделения нейробиологии Эдинбургского университета вчера опубликовали работу в Brain Communications (IF=4.5) целью которой было воспроизвести и перепроверить результаты австралийского лонгтитьюдного когортного исследования проведенного 20 лет назад.

📍За 10 месяцев наблюдений в департаменте бесследно исчезли 66% купленных чайных ложечек! 😨

Более того, золотые ложки воровали чаще серебренных - период полужизни составил 182 дня у первых и аж 280 у вторых. Это, кстати, противоречит результатам из Австралии - там ценность ложечки не влияла на скорость ее пропажи. Хотя, предполагаю, в том случае дорогие и дешевые ложки может не так сильно отличались. Также один из ревьюеров отметил что разница может быть связана с (1) кульутрным фактором, если в этих странах разные предпочтения касательно напитков, например кофе или чая; и (2) недостаточным контролем за возможным появлением дополнительных чайных ложечек извне. Авторы даже получили одобрение этического коммитета (пост-фактум, через WhatsApp) 😁 Тем не менее, jokes aside, в целом работа даже по-научному хорошая. Например, в введении авторы явно проговаривают нулевую и альтернативную гипотезы (часто ли вы видите такое в статьях?)) ), а в методах описывают построенную линейную модель. 🎁 В качестве бонуса для подписчиков этого канала (и для продвижения воспроизводимости в науке) - в комментариях публикую 🎀 Rmd-файл с линейной моделью 🎀 который мне любезно предоставили авторы исследования. References: 1. Replication study: the case of disappearing teaspoons in a Scottish neuroscience department, BrainComms, 2026 2. The case of the disappearing teaspoons: longitudinal cohort study of the displacement of teaspoons in an Australian research institute, BMJ, 2005

Год назад писал здесь про выборы в союз студентов (ÖH) - и вот анекдотическим образом до нас докатываются страсти оттуда. Партия AktionsGemeinschaft (AG) разослала всем новость о том что партии VSStÖ (социалисты) и GRAS (зеленые), взявшие тогда контроль, неправильно вели документооборот в результате чего министерство BMFWF удержало финансирование на 700к€, а федеральное ÖH потребовало вернуть 300к€. В общем обвиняют их в том что они опростоволосились на миллион евро. А веселая часть ситуации заключается в том что они даже сделали сайт: https://ihrschuldetuns.at/ Где можно покликать-пособирать "корзину" чтобы оценить сколько обедов / проездных / ноутбуков / подписок на ChatGPT/ ... можно купить на эту сумму. 😁

Немного восхищения Claude'ом. 🌸В этом месяце они добавили интерактивные диаграммы, и это абсолютно непереоценимая штуковина для учебы. Я, например, намедни разбирал статью с каким-то новым методом для link prediction на графах, и клод был невероятно хорош в том чтобы наглядно объяснить базу по теории графов. | Visuals that appear as you study with Claude 🌸А еще они наконец-то добавили память. Было забавно там увидеть:

Communication: uses "ккк" as acknowledgment shorthand

Это было вообще очень забавно - я однажды использовал эту реакцию при нем и он ее не понял. Но спустя какое-то время на какое-то из моих сообщений он так же ответил. Получается научил клода чему-то... 🌸В целом мне нравится что Anthropic начинает все больше развиваться в сторону науки. Особенно они делают фокус на Life Sciences. Например, у них появилась интеграция с PubMed, Benching, BioRender, bioRxiv etc. В их учебной базе уже есть туториалы по всем этим применениям Claude для наук о жизни.

Кафедра медицинской генетики в первом меде в мои студенческие годы считалась довольно мемной из-за присутствия там тетеньки, которая на полном серьезе заливала нам, что телегония существует.

Телегония — это опровергнутая теория о том, что все половые партнёры женщины, особенно первый, передают свои признаки детям от последующих мужчин.

А вот вам еще одно явление, которое покажется вам антинаучным. Встречайте, (гетеропатернальная) суперфекундация - оплодотворение 2 (или более) яйцеклеток разными отцами. Это, представьте, рождает женщина двойню, а дети у нее разных национальностей. Для такого события должны совпасть сразу два фактора: - В один и тот же менструальный цикл у женщины вслед за одной яйцеклеткой должна максимум в течение нескольких дней выйти вторая; - Разница между двумя половыми актами с двумя предполагаемыми отцами тоже должна быть не более нескольких дней. Происходит это двойное оплодотворение* достаточно редко, но достоверно делать выводы о статистике сложно: в одном исследовании указано, что на 39000 открытых дел по установлению отцовства у разнояйцевых близнецов, в 2.4% из них имеет место суперфекундация. Но это только открытые данные, и те только для случаев, когда люди дошли до суда с целью установить родство. И, соответственно, это не частота в популяции. Суперфекундация, кстати, свойственна многоплодным животным, по типу собак или кошек: после сезона спаривания мы можем увидеть помет с разными отцами. Этот факт красиво используется сторонниками телегонии в качестве ее подтверждения: ведь если достоверно известно, что женщина может родить сразу от двух (или более?)** мужчин, то она может родить и от тех, кто был у нее ранее? *имеет место также монопатернальная суперфекундация - разнояйцевые близнецы, имеющие одного отца. **я нашла упоминание тризиготной беременности от трех разных отцов в нескольких разных научпопных статьях, но так и не смогла найти научной статьи-подтверждения. P.S. Пока писала, вспомнила, как учительница биологии в школе на уроках генетики рассказывала нам про абсолютно реальный случай рождения черного ребенка от белого отца. Есть вероятность, что она попутала рамсы забыла еще одного ребенка в этом уравнении... P.P.S. На 2 фотографии - заявляется, что разнояйцевые близнецы от одного отца, но я приложила ее как потенциальный пример суперфекундации. Не каждая мать открыто призналась бы в соцсетях, что имеет двух детей, зачатых примерно в одно и то же время от разных отцов

Прикупил тут (взрослый!) велосипедный шлем, сразу пошел хвастаться коллеге и не упущу возможности похвастаться здесь

Внезапная лингвистическая находка: решение задачи по немецки это Lösung и какой-нибудь Тантум-Верде для горла это тоже Lösung. Ровно как в английском solution и solution 👀🧐 Так прикольно когда одни и те же разные смыслы кодируются в одно слово в разных языках. Как замок - Schloss, и замок - Schloss.

Продолжаем путешествие по весенним конференциям - на этой неделе симпозиум посвященный стволовым клеткам SY-stem в Vienna BioCenter 🤵 Несколько хайлайтов: ➡️Меня очень поразила работа где ребята из Кембриджа собрали органоид из человеческих нейронов in vitro и потом растили его 5(!!) лет. Не представляю, как за 5 лет у них ничего не прервалось из-за какой нибудь замены проводки или пожарной тревоги 😄. Там, например, только через 9 месяцев он начинает быть похожим на реальные мозги на уровне транскрипции и метилирования (что так-то make huuge sense...). Это в целом отлично дополняет и наш анализ in vitro нейронов. ➡️Познакомился с Мариан Броннер! Она один из главных и самых крутые учёных в области излучения нервного гребня и биологии развития в целом. ➡️Как обычно повыпендривался со своим постером. На этот раз у нас Лукас Кранах - живописец дунайской школы 15-16 века. Долой скучные постеры! В комменты приложу пдфкой :) ➡️На последней фотке Надя презентует свою работу по изучению эволюции генной регуляции лежащей под капотом формирования человеческих лиц. Надя пришла к нам работать со мной как мастер-студент, теперь она и студент и мастер независимо и работает тоже независимо. В общем ждите, где нибудь к лету будет какой-нибудь мощный манускрипт про это дело! Сегодня последний день, а следующая конфа уже через неделю 😅👀

Посмотрите этот мультик, меньше минуты всего. Как думаете, что это? 2 года назад учёные из Eon Systems опубликовали в Nature компьютерную модель мозга мухи Дрозофилы: 125 тыс. нейронов с 50 млн контактами между ними. Масштаб модели огромный, но как и с любыми компьютерными штуками: бенчмарки бенчмарками по понять насколько оно реально работает 🤷‍♂🤷‍♂ И вот теперь ребята делятся этим видео. То что вы видите - это простенькая симуляция физического мира в программе МиJiСо, и в нём оцифрованный мушиный мозг которому дали оболочку в виде модельки тела 🪰. И этот мозг начал этим телом управлять! Эта муха тем че-то бегает, трёт лапками и что-то попивает. Ещё раз: если достаточно точно воспроизвести мозг мухи в компьютере он сам по себе начинает вести себя как обычная нормальная муха!!! Поразительно. Такими темпами и цифровое бессмертие не за горами

Только что посмотрел The Thinking Game - документальный фильм про DeepMind и ее основателя Демиса Хассабиса. Знаете, насколько же он банально вдохновляюще на меня подействовал. Там есть момент где маленький Демис играет в шахматы и вдруг решает их бросить со словами мол: если так много умных людей могут в такие сложные задачи, быть может их мозги нам пригодятся для чего-то большего. И учитывая весь этот прогресс есть вера что это большее реально возможно на нашем веку. И отдельно всё таки растопил сердце момент где команда AlphaFold2 узнает их абсолютный рейтинг на соревновании CASP14 и понимает что они таки решили проблему фолдинга 🥹🥹 Мы родились слишком поздно для великих географических открытий и слишком рано для межгалактического покорения космоса. Но кажется, мы всё-таки родились в очень и очень удачный момент.