BIOHACK | БИОТЕХНОЛОГИИ
Ir al canal en Telegram
Для того, чтобы изменять код живых существ, нужно понимать законы жизни. Мы за свободу информации и популяризации науки в области биотехнологий и генной инженерии. По рекламе пишем @biohack777
Mostrar más7 221
Suscriptores
Sin datos24 horas
-37 días
-1530 días
Archivo de publicaciones
Бактериальный «Троянский конь» дал бой глиобластоме
В отличие от многих лекарственных препаратов, бактерии легко преодолевают гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) и забираются в мозг. Обычно это заканчивается инвалидностью или смертью, но в Университете Сучжоу нашли в этом положительный момент, разработав метод доставки лекарств на основе бактерий для фототермической иммунотерапии глиобластомы.
Бактерий под завязку нагрузили полимером глюкозы и светочувствительными кремниевыми наночастицами ICG. При облучении лазером с длиной волны 808 нм фототермические эффекты, создаваемые ICG, разрушают как опухолевые клетки, так и самих бактерий. Кроме того, остатки бактерий и ассоциированные с опухолью антигены способствуют противоопухолевым иммунным ответам, которые продлили жизнь лабораторных мышей с глиобластомой.
Подробности в данной статье
Благодаря более эффективному фотосинтезу урожайность новой трансгенной сои выросла на 25 %
Генетически модифицированная соя, способная более эффективно поглощать свет, дала на 25 % больше урожая, что может стать значительным вкладом в решение проблемы нехватки продовольствия в мире.
Подробности в статье.
НЕТИПИЧНЫЕ Т-КЛЕТКИ, ЛИМФОУЗЛЫ И ИММУННЫЙ ОТВЕТ
Лимфатические сосуды — это иммунологические магистрали, соединяющие лимфатические узлы с периферическими тканями.
Ataide с коллегами в новом выпуске Cell Immunity с помощью группы методов: трансплантации лимфатических узлов, single-cell РНК-секвенирования, спектральной проточной цитометрии и трансгенных мышей показали, что тканевые, нетипичные Т-клетки (НТК, т.е клетки с нетипичным иммунофенотипом) могут также мигрировать по лимфатическим сосудам в локальные, дренирующие лимфоузлы.
При этом НТК имеют уникальное адаптированное состояние дифференцировки и репертуар Т-клеточных рецепторов. Но, самое важное, что функциональные единицы, формирующиеся из этих НТК, имеют различные особенности адаптивного и врожденного иммунного ответа в зависимости от лимфатических узлов, дренирующих ткани.
Получается, что лимфатическая миграция НТК определяет специфический иммунитет, связанный с разными лимфатическими узлами, что может быть новой мишенью для иммуннотерапии или отличным подходом к стратегиям вакцинации.
Например, многие вакцины вводятся подкожно, поэтому антигенную нагрузку получают лимфоузлы, дренирующую кожу. Но, возможно другие лифмоузлы, которые не получают при подобной вакцинации антигены, могли бы обеспечить более эффективный иммунный ответ? Тот же самый вопрос можно задать и в отношении противоопухолевой иммунотерапии. И можно ли как-то влиять на состояние лимфоузлов?
Подробно с работой можно ознакомиться здесь.
Коленные модули с микропроцессором «Актив 2» готовятся к массовому производству
В начале июля корпорация «Системы прецизионного приборостроения» (НПК СПП) (входит в ГК «Роскосмос») заявила, что по мере готовности предприятия планирует производить до 500 отечественных коленных модулей с микропроцессорной системой управления «Актив 2» под электронные протезы нижних конечностей. В конце августа 2022 года «Актив 2» уже готовится к массовому производству. По заявлению разработчиков, на фоне ухода из России западных компаний, занимающихся поставками в медицинской сфере, эта разработка предприятий космической кооперации имеет все шансы стать лидером на рынке. К массовому производству его готовит эксклюзивный дистрибьютор в России ООО «Ортопедическая индустрия Москва Энергия» (также входит в ГК «Роскосмос»).
Первая официальная демонстрация протеза «Актив 2» состоялась в 2020 году. Поставки потребителям должны были начаться в том же году, но из-за пандемии их пришлось отложить. В конце апреля 2022 года изделие как серийное и готовое к массовому производству было представлено отраслевому сообществу на презентации в ФГБУ «Федеральное бюро медико-социальной экспертизы».
Как говорят разработчики, протез является единственным серийным изделием подобного класса, полностью разработанным и производимым в России. Самое важное в таком модуле — микропроцессорная система управления, позволяющая точно подстраиваться под антропометрические особенности человека. В традиционных конструкциях механическая система (пружина) сгибается и разгибается по одинаковой амплитуде. Если брать пневматические и гидравлические аналоги, они поддаются определённой регулировке и настройке, но с ограниченным диапазоном. И как раз микропроцессор позволяет менять настройки автоматически, в зависимости от вида активности человека, начиная от медленного шага до бега, причём перемещение как в лесу, так и на открытой местности. Сами пользователи протезов разделены по категориям активности: низкая, средняя, высокая. Протезы с микропроцессорным управлением ставят пациентам с высоким уровнем активности, чаще всего молодым людям, но противопоказаний для установки людям в зрелом возрасте нет.
Следующим шагом разработки может стать создание модуля различных стоп и других элементов высокотехнологичных протезов. Модуль стопы должен будет максимально близко повторять её естественные характеристики с выполнением всех биомеханических функций.
Но есть и нюанс — из-за загрузки по основной ракетно-космической тематике РКК «Энергия» начала рассматривать варианты вывода своей «дочерней» фирмы за пределы компетенций предприятия. В ГК «Роскосмос» понимают ценность актива, и прорабатывают варианты юридического оформления внутри одного из холдингов корпорации.
Меланома является одним из наиболее распространенных видов опухолей, где заболеваемость продолжает расти. До 2011 года метастатическая меланома считалась приговором: менее 5% пациентов выживали более 5 лет. С внедрением иммунотерапии примерно половина пациентов с метастатической меланомой, в настоящее время, живет более 5 лет. Это также означает, что половина пациентов с меланомой не реагируют на современные методы лечения и живут менее 5 лет после постановки диагноза.
В апреля в журнале Frontiers in Oncology вышла статья, как раз обсуждающая эту группу пациентов и причины неудач терапии, в том числе и развитие резистентности к текущим типам терапии.
Авторы делают акцент, на том что одним из основных факторов, который способствует низкому ответу в этой популяции, является приобретенная или первичная устойчивость к иммунотерапии из-за уклонения опухоли от иммунного ответа. Чтобы улучшить общую выживаемость пациентов с меланомой, необходимо разработать новые стратегии лечения, уменьшающие риск приобретенной резистентности и преодолеть существующую первичную резистентность.
В последние годы был достигнут ряд успехов в выявлении и понимании путей, которые способствуют ускользанию опухоли от иммунного ответа на протяжении всего курса лечения.
Вопрос который ставят авторы в статье:
Что вызывает устойчивость к иммунотерапии у пациентов с меланомой кожи? Они выделили системные иммунные факторы, в попытке объяснить это явление.
На схеме молекулярные механизмы, которые по мнению авторов связаны с развитием резистентности. TIM-3 и TIGIT являются двумя широко изученными иммунными контрольными точками, ответственными за резистентность клеток меланомы против PD-1. Также комплексы HLA I и HLA II, IDO, микроокружение объединяется в единую систему обороны против терапии.
Подробности в данной статье.
«Акселератор Возможностей» и «Альгимед Техно» открывают набор на инвестиционную программу для стартапов и команд в сфере Biotech!
Что дает участие в программе?
-Пилотные внедрения в компании «Альгимед Техно»;
-Создание совместных предприятий или проведение научных проектов и исследований с отобранными командами;
-Приглашение специалистов и команд на работу;
-Инвестирование в проекты.
Мы ждем проекты (и команды!) по направлениям:
-Новые подходы, решения и применения метода ИФА в различных отраслях;
-Технологическое оборудование для оснащения лабораторий и автоматизации проведения медицинских исследований;
-Роботизированные платформы для автоматизации микробиологических и клинико-лабораторных исследований;
-Портативные приборы для сбора и обработки медицинских данных.
Требования к участникам программы:
-Наличие продукта / прототипа / сформированной команды;
-Инновационность решения;
-Соответствие технологическим направлениям.
Успей подать заявку до 31 августа
Принять участие и зарегистрироваться в программе
Ключевые нейромедиаторы.
Этот курс настоящая жемчужина, для тех, кто в теме ☝️
Данный курс позволит вам погрузиться в удивительный мир нейромедиаторов и узнать их функцию в норме и при патологии.
Несмотря на то, что поднимаемые темы достаточно сложны, курс написан легким и приятным языком.
Автор также умело разбавляет описание взаимодействий лигандов и рецепторов шутками и историческими сведениями, что способствует улучшению понимания сложных взаимодействий на уровне синапсов.
Скачать курс
Противники Жизни
Антибиотики – это вещества, которые человек использует для борьбы с бактериальной инфекцией (часто бывает, что и при вирусной инфекции назначают антибиотики, но это не врач дурак, а ты не шаришь, т.к. во время вирусной инфекции иммунитет ослаблен и подвержен любым опасностям, поэтому и прописывают антибиотики). У человека в организме есть и свой антибиотик – лизоцим, он содержится в слюне, на слизистых кишечника и т.д. и нужен для того чтобы частично обеззараживать пищу. Механизм действия заключается в том, что лизоцим разрушает муреин, который входит в состав клеточной стенки, и бактерия погибает. Некоторое время его пытались получать из куриных яиц и использовать как лекарство, но действует он медленно и малоэффективно.
Первым широко известным антибиотиком стал пенициллин. Открыл его Александр Флеминг. Интересно то, что Александр уже тогда понимал какие проблемы, могут принести антибиотики. Я постараюсь простым языком изложить его речь на получении нобелевской премии.
«Миссис N заболела стафилококком, ей назначают антибиотики, она проходит половину курса лечения, ей становится лучше, и она прекращает курс, думая, что уже здорова. Но на самом деле в её организме осталось еще некоторое количество болезнетворных бактерий, причем остались только те, кто мог противостоять данному антибиотику, эти бактерии попадают в организм Мистера N и ему уже не помогают антибиотики, и он умирает.»
Ученый уже тогда понимал, что такое резистентность к антибиотикам. Многие люди и сейчас этого не понимают.
Чтобы разобрать как именно работают антибиотики, разберем один из них.
Грамицидин S (S- значит советский).
Данный антибиотик – это пептид, механизм его работы заключается в том, что он взаимодействует с фосфолипидными мембранами, разрушая их, и может нарушать трансмембранный транспорт нуклеотидов.
Смысл работы большинства антибиотиков заключается в том, что они либо нарушают репликацию ДНК или РНК, либо разрушают липидный слой или клеточную стенку. Примечательно то, что антибиотики не различают «плохие» и «хорошие» бактерии (да, спойлер у вас в толстой кишке огромное количество полезных бактерий), и когда вы пьете антибиотики, они уничтожают и микрофлору кишечника (поэтому можно наблюдать диарею).
Антибиотиками могут представлять из себя белки, пептиды, непротеиногенные аминокислоты, производные аминокислот и т.д. По большому счету антибиотики – это оружие одних бактерий против других, но человек смог научиться использовать его для своей пользы.
Ищем медработников, чтобы с нуля обучить профессии Data Scientist в медицине.
С помощью машинного обучения, вы научитесь обрабатывать данные по сердечно-сосудистым заболеваниям, онкологии, сигналам ЭЭГ, рентгеновским изображениям, сможете ставить диагнозы,обнаруживать болезни и персонализировать лечение.
Курс прекрасно подойдет:
Медработникам
Освоите IT-специализацию в знакомой нише, увеличите доход и сможете улучшать жизнь сотен людей с помощью искусственного интеллекта.
Новичкам в Data Science
Станете специалистом по Data Science с нуля: освоите аналитику в медицине, бизнесе и других направлениях.
IT-специалистам
Поможем систематизировать знания в Data Science, ускорить карьерный рост и больше зарабатывать.
Вашими преподавателями станут эксперты из таких компаний как: Parexel, X5 Retail Group, NVIDIA, Минобороны России, Pirogov AI.
Если после успешного обучения вы не найдёте работу, мы вернём вам деньги, ведь гарантия трудоустройства закреплена в договоре.
Узнать подробности и зарегистрироваться:
https://clc.to/RVEQtA
НОВАЯ ГЕННАЯ СИГНАТУРА ДЛЯ ОЦЕНКИ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ ТЕРАПИИ И ПРОГНОЗА ПРИ САРКОМАХ
Саркомы — гетерогенная группа редких мезенхимальных опухолей, для которой наблюдается недостаток биомаркеров ответа на терапию. Попыткой найти эти биомаркеры ценна статья от немецкой группы, под руководством Florian Bösch.
В журнале Molecular Therapy Oncolytics вышла их работа о разработке сигнатуры генов, связанных с иммунным ответом, для прогнозирования исхода и ответа на противоопухолевое лечение
Если посмотреть на саркомы, то системы стратификации риска не существует — имеющиеся подходы не позволяют точно прогнозировать выживаемость пациентов и их ответ на терапию. Интересно, что роль гистологического подтипа как маркера ответа, минимальна.
Поэтому давно стоит вопрос по разработке прогностических моделей, позволяющих управлять лечением.
Авторы работы проанализировали экспрессию генов и исходы у 980 пациентов с саркомами из семи открытых наборов данных. В каждом случае изучалось количество иммунных клеток и ответ на иммунотерапию. Гены, связанные с иммунитетом (IRG), были отобраны с помощью анализа ко-экспрессии генов. Полученная сигнатура включает 14 генов: NT5DC2, REC8, GBP2, APOL2, CMA1, TAPBPL, TNFSF15, DHX58, ZNFX1, SLC25A20, FCER1A, CRIP1, TNF, TRIM21.
Подробнее о ней можно узнать в полной версии статьи.
Авторы делают вывод, что их сигнатура является надежным биомаркером для прогнозирования исходов и реакции на лечение у пациентов с саркомой. Время покажет насколько это применимо в клинической практике.
На МКС отправят робота-хирурга для автономного проведения операций в космосе
Отправить роботизированную платформу в невесомость для хирургических вмешательств за пределами Земли планируется уже в 2024-ом.
Австралийский журнал о научных исследованиях ScienceAlert рассказал о роботе-ассистенте MIRA, разработанном специалистами из американского Университета Небраски-Линкольна (UNL) для автономного проведения хирургических вмешательств в космосе. Отправить в невесомость роботизированную платформу для операций за пределами Земли планируется уже в 2024-ом.
MIRA будет вводить инструменты хирургического комплекса в тело нуждающегося в помощи астронавта через небольшие разрезы. Причем сообщается, что роботизированная платформа сможет проводить малоинвазивные операции как под управлением находящихся на Земле хирургов, т. е. станет еще одним решением в телемедицине, так и самостоятельно.
Впрочем, до того, как роботу доверят операции на человеческом теле в космосе, MIRA придется продемонстрировать в невесомости свои хирургические умения на туго натянутых резиновых лентах, имитирующих кожу, и пройти другие испытания.
МИКРОБИОМ И ОПУХОЛИ
Роль микроорганизмом в образовании, прогрессии, диагностики и терапии опухолей обсуждается несколько десятилетий. Недавние исследования показывают, что бактерии, вирусы и/или грибы встречаются в опухолевой ткани, влияют на эффективность иммунотерапии и могут использоваться для лечения метастазов. Эта связь настолько прочно установлена, что микробиом стал одним из компонентов Hallmarks of cancer.
Подробно об этом в обзоре, вышедшем в журнале Science ⬇
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abc4552
Авторы обзора пытаются оценить существующие доказательства роли микробиома и понять причинно-следственные связи между микроорганизмами и биологией опухолей.
Отдельный раздел посвящен вопросам влияния микроорганизмов на иммунную систему, создающую ось «иммунитет-опухоль-микробиом». Например, существуют доклинические данные, показывающие возможность изменения микробиома для усиления противоопухолевого иммунитета. Метаболиты от деятельности бактерий изменяющие активность иммунной системы, микровезикулы, активные формы кислорода, микроокружение - все это показано в единой системе на понятных примерах в конкретных опухолях.
Ученые оживили клетки свиней спустя час после смерти
Можно ли остановить время или вообще направить его вспять? Не спешите с ответом! Ученые из Йельского университета смогли вдохнуть жизнь в органы умершей за несколько часов до этого свиньи путем их помещения в раствор под названием OrganEx.
Новое открытие взбудоражило умы ученых по всему миру. Вполне возможно, для трансплантологии начинается принципиально новая эра, ведь теперь будет проще сохранять органы в жизнеспособном состоянии до того, как они будут отданы донорам. Свои куда более далеко идущие перспективы видят также и специалисты других направлений, например, кардиологи.
Зачем же все нужно современной медицине и могут ли возникнуть серьезные осложнения, в том числе этического плана?
Спешим предоставить вам перевод статьи, вышедшей накануне в журнале Wired.
В Москве создали систему управления протезом кисти на основе биосигналов
Московском авиационном институте (МАИ) разработали биоэлектрическую систему управления протезом кисти, позволяющую распознавать сигналы мышечной активности с поверхности руки, в соответствии с которыми протез и приводится в движение. Система включает фиксируемые на предплечье электроды и генератор зондирующего канала, считывающие сигналы тела. Эти сведения поступают на плату сбора данных, где в режиме реального времени анализируются с помощью специальной программы и преобразуются в механические движения протеза.
По заверению ученых вуза, их разработка может стать бюджетным интерфейсом «человек – компьютер», ведь решение не требует дорогостоящих импортных вычислителей. Также в МАИ убеждены, что систему управления протезом кисти можно адаптировать и для протеза ноги. Плюс программный комплекс подойдет для реабилитации пострадавших от инсультов и парезов, когда сила мышц снижается. Более того, устройство, по мнению его авторов, можно задействовать для удаленного управления манипуляторами, в том числе в военной или космической отраслях.
Механизм, лежащий в основе эволюции тревожного расстройства
Тревожность — это свойство человека волноваться по самым разным, иногда не слишком существенным, поводам. В некоторых потенциально опасных или сложных ситуациях волнение абсолютно нормально, но когда человек волнуется всегда, есть повод заподозрить неладное.
Выделяют множество расстройств из группы тревожных: от генерализованного тревожного и обсессивно-компульсивного расстройства до посттравматического стрессового расстройства. Роль генетики в развитии данных патологических состояний обсуждалась достаточно давно, однако совсем недавно ученые обнаружили, как некоторые мутации генов серотонина и дофамина могут драматично влиять на тревожность, настроение и даже уровень агрессивности человека.
В данном материале обсудждены конкретные аминокислотные механизмы, которые определяют предрасположенность некоторых людей к тревожным расстройствам.
Композитная паутина для зашивания постоперационных ран и обнаружения патогенов
В ИТМО создали материал на основе шёлка паука, который можно использовать в качестве нитей для наложения швов после хирургических операций и — одновременно — для своевременного отслеживания возможного инфицирования полеоперационной раны.
Послеперационная рана — это разрез, который после завершения операции обычно ушивается, а иногда дополнительно фиксируется и герметизируется при помощи хирургического клея. После наложения швов на ране регулярно меняется повязка, также регулярно производится её визуальный осмотр. Те не менее оперативно отследить контаминацию патогенами после хирургического вмешательства бывает сложно, и некоторые пациенты всё равно сталкиваются с инфицированием послеоперационной раны. Когда же инфекция явно проявляется в виде, например, увеличенных выделений или изменения цвета покровов, бороться с нею уже сложнее. Это препятствует нормальному восстановлению пациента и создаёт опасность серьёзных осложнений.
Исследователи химико-биологического кластера ИТМО предложили способ преодоления этой проблемы. Они разработали гибридный материал на основе натуральной паутины, позволяющий не только ушивать раны, но и быстро отслеживать появление патогенов, провоцирующих различные заболевания. Материал годится для производства хирургических нитей для наложения послеоперационных швов. Метод отслеживания инфицирования с помощью нового материала учёные протестировали на условно патогенных бактериях (кишечная палочка, золотистый стафилококк) и грибке Candida albicans.
Материал состоит из двух компонентов: шёлка паука (паутины) и углеродных точек (класс наноматериалов), которые обладают свойством флуоресценции (то есть могут, поглощая свет с определённой длиной волны, переизлучать его с другими свойствами).
Исследователи проверили эффективность полученного материала в тестах in vitro на биосовместимость и цитотоксичность.
На следующем этапе исследователи планируют проверить разработку на биоразлагаемость и биосовместимость in vivo.
Искусственный интеллект предсказал структуры почти всех известных науке белков — это начало новой эры в цифровой биологии
Год назад компания DeepMind вызвала ажиотаж сообщением о способности раскрыть главную загадку в биологии — предсказать структуру любого белка. Одновременно с этим DeepMind создала открытую базу с данными о 350 тыс. белков, форму которых предсказал пакет AlphaFold. Сегодня компания сообщила о раскрытии форм почти всех белков, известных земной науке — это свыше 200 млн белков из всех сфер известной на Земле жизни. Это настоящая революция в биологии.
Белки представляют собой последовательности аминокислот. В зависимости от комбинаций аминокислот белки сворачиваются в очень причудливые пространственные формы. Эти формы определяют взаимодействие белков друг с другом и, в конечном итоге, регулируют биологические процессы в живых организмах: они взаимодействуют, если формы совпадают как ключ подходит замку, и остаются безучастными друг к другу, если формы не имеют совместимых пространственных структур.
Знание пространственной формы белка может помочь найти идеальное лекарство против болезней и сделать множество других открытий в биологии. До появления ИИ-алгоритмов учёные экспериментально определяли форму белков, что очень и очень сложно и долго. Предложенный компанией DeepMind алгоритм определяет пространственную форму одного белка от 10 до 20 секунд. Благодаря этому компания смогла за год довести базу пространственных форм белков с 350 тыс. до более чем 200 млн.
Следует уточнить, что предсказать форму белка не означает оказаться на 100 % точными. Тем не менее, AlphaFold показала значительную точность при определении форм, чего достаточно для начала работ. Всю рутинную работу сделал компьютер, а ведь всем учёным мира до этого потребовалось 50 лет, чтобы разгадать около лишь 10 % белковых структур.
Открытой базой по белкам уже воспользовалось около полумиллиона учёных со всего мира, отметили в компании. Раскрытие полной базы данных по белкам кратно активизирует этот процесс и приведёт в обозримой перспективе к удивительным открытиям в биологии.
Клиническое исследование подтверждает эффективность генной терапии гемофилии
Одна инъекция препарата генной терапии FLT180a избавила пациентов с гемофилией от необходимости еженедельно вводить себе факторы свертывания крови.
Исследование проводилось экспертами из Университетского колледжа Лондона (UCL), больницы Royal Free в Лондоне и биотехнологической компании Freeline Therapeutics.
В Сеченовском университете открыли лабораторию бионических систем
В Минобранауке России сообщили об открытии в Сеченовском университете единственной в стране лаборатории управляемых бионических систем, где будут обучать биоников, занимающихся разработкой современных нейропротезов, накопителей энергии и умной одежды.
Уже с первых дней запуска ученые медвуза приступили к разработке из электроактивных полимеров прототипов актуаторов (искусственных мышц), способных генерировать движения подобно биологическим мышцам за счет преобразования электрической энергии в механическую работу.
В сентябре к научным исследованиям лаборатории присоединятся студенты программ бакалавриата и магистратуры «Материаловедение и технологии материалов» и «Наноматериалы».
Это, по словам директора Института бионических технологий и инжиниринга Сеченовского университета Дмитрия Телышева, позволит получить учащимся необходимые навыки, которых сегодня ждут работодатели высокотехнологичных медицинских компаний.
Ранее iot.ru рассказывал о разрабатываемой в Сеченовском университете цифровой модели печени, которая позволит медикам анализировать действия лекарств и прогнозировать их эффективность.
Создан точный инструмент редактирования генов, который превосходит даже CRISPR
Каким бы важным ни был инструмент редактирования генов CRISPR-Cas9, он имеет относительно высокий уровень ошибок, которые могут привести к потенциально опасным мутациям. Исследователи из Германии разработали более совершенный инструмент, который уменьшает количество ошибок, взламывая ДНК, а не разрезая ее.
CRISPR — одно из самых новаторских изобретений века, способное произвести революцию в генной терапии целого ряда заболеваний, а также улучшить урожайность или питание сельскохозяйственных культур, создать полезные микробы и множество других применений. Он работает как пара «молекулярных ножниц», вырезая проблемные гены и вставляя более полезные.
Проблема в том, что иногда он может нацеливаться на неправильный участок ДНК и вносить в него изменения, известные как нецелевые мутации, которые потенциально могут вызвать проблемы со здоровьем. Даже если он получит правильную цель, процесс восстановления ДНК может пойти не так и привести к тому, что называется мутацией на цели.
Предотвращение обеих этих проблем было в центре внимания нового исследования, проведенного исследователями из Центра молекулярной медицины Макса Дельбрюка (MDC) и Берлинского университета имени Гумбольдта. Команда модифицировала эти молекулярные ножницы, сделав их более мягкими, что привело к принципиально другому типу разреза.
Вместо того, чтобы делать один разрез, который разрезает всю двойную цепочку ДНК, новый инструмент делает два меньших разреза, каждый из которых разрезает одну нить ДНК. Встроенная прокладка удерживает эти зазубрины на безопасном расстоянии друг от друга — от 200 до 350 пар оснований.
«Наши эксперименты с гемопоэтическими стволовыми клетками и Т-клетками показали, что это оптимальное расстояние для минимизации как целевых, так и нецелевых мутаций», — рассказал доктор Ван Трунг Чу, соавтор исследования. «Еще чуть короче, и мы рискуем разрезать всю молекулу ДНК — несмотря на использование двух отдельных ножниц».
При тестировании клеток в лабораторных чашках команда обнаружила, что новый инструмент «спейсер-ник» был примерно так же эффективен при внесении изменений, как и обычный CRISPR — от 20 до 50 процентов обработанных клеток были восстановлены. Но важно то, что новый инструмент значительно снижал количество ошибок: целевые мутации происходили менее чем в двух процентах правок с помощью пробела по сравнению с более чем 40 процентами для CRISPR-Cas9. Тем временем нецелевые мутации оказались «редким, если не несуществующим явлением в нашем подходе», — отметил Чу.
Команда надеется, что в будущих работах инструмент редактирования пробелов будет протестирован на животных, прежде чем переходить к испытаниям на людях. Одной из первых потенциальных целей является лечение наследственных заболеваний крови.
