Конспекты Юджина 📗

Вот такой материал добавили в предложку моего паблика в ВК. Стоит ли надеяться, что этих людей переубедят какие-то научные доводы?

Научные публикации за пятую неделю декабря (27.12.21–02.01.22). Здесь представлено полсотни рассортированных наиболее интересных англоязычных публикаций по COVID-19 и SARS-СoV-2 из лучших мировых научных журналов, вышедших за неделю. Публикации про омикрон в этот раз вынес в отдельный раздел и поставил на первое место. Под конец года понял, что перегорел из-за большой нагрузки, даже не осталось сил написать в канал новогоднее поздравление. Поэтому дал себе время отдохнуть и восстановиться. Теперь навёрстываю упущенное. В следующие несколько часов появятся такие же материалы за первую и вторую неделю января. Читать: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-5-nedelyu-dekabrya-2021-271121020122-01-17 Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560

Влияние вакцинации от COVID-19 на беременность. Крупное исследование с участием 46 тысяч беременных женщин 4 января 2022 года опубликованы результаты исследования с большой выборкой женщин, изучавшего влияние вакцин от COVID-19 на беременность. Содержание: 1. Результаты крупных исследований 2. Риски вакцинации от COVID-19 у беременных женщин 3. Риски от заражения COVID-19 для беременных женщин 4. Снижение рисков COVID-19 при вакцинации беременных и кормящих грудью Читать: https://telegra.ph/Vliyanie-vakcinacii-ot-COVID-19-na-beremennost-Krupnoe-issledovanie-s-uchastiem-46-tysyach-beremennyh-zhenshchin-01-11-2 Поблагодарить за популяризацию науки и доказательной медицины: 5536 9138 3126 6560

Влияние COVID-19 на младенцев: обзор данных, известных на данный момент Основная информация будет касаться младенцев. В то же время будут затронуты важные составляющие влияния COVID-19 на плод у беременных матерей. В том числе разберём, как заражение COVID-19 или вакцинация беременных и кормящих грудью может повлиять на плод и на младенца. Читать: https://telegra.ph/Vliyanie-COVID-19-na-mladencev-obzor-dannyh-izvestnyh-na-dannyj-moment-01-10-2 Поблагодарить за популяризацию науки и доказательной медицины: 5536 9138 3126 6560

Интервал между вакцинацией и прорывной инфекцией влияет на шанс последующего заражения омикроном Выявлена корреляция между прорывными инфекциями и риском заражения омикроном. Вакцинированные, которые спустя несколько месяцев заражались альфа- или дельта-штаммом, лучше защищены от последующего заражения омикроном, чем вакцинированные, которые переболели COVID-19 спустя короткое время после вакцинации [1]. Иначе говоря, даже самый лучший тип иммуннитета — гибридный иммунитет, может различаться в зависимости от времени заражения. (Данные из Японии представлены пока ещё в виде препринта, их следует перепроверить в других исследованиях.) Похожая ситуация происходит с интервалом между дозами вакцины: интервал 4 месяца между двумя дозами вакцины, скорее всего, создаёт лучшую защиту от вируса, чем стандартный интервал в 3–4 недели [2]. Почему интервал имеет значение? Вакцинация или заражение SARS-CoV-2 приводит к резкому росту антител в крови, направленных против вируса. Если человек повторно заражается вскоре после вакцинации или предыдущей болезни, то именно эти антитела из крови связываются с вирусом и нейтрализуют его. Спустя месяца 2–3 после вакцинации уровень антител в крови начинает постепенно снижаться. И обычно к 6 месяцу их уровень значительно падает. Если человек повторно заражается спустя несколько месяцев после вакцинации, то основные антитела, которые борются с вирусом — это новая улучшенная партия антител, обновлённая B-клетками памяти. При таком заражении больше возможностей для создания новых долгоживущих плазматических клеток, производящих обновленные и улучшенные антитела против вируса. 1. https://www.nature.com/articles/d41586-022-00004-x (07.01.22) 2. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.21.473679v1 (23.12.21) Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560

Сравнение случаев попадания в отделение реанимации у вакцинированных и невакцинированных при заражении омикроном в Великобритании Доля невакцинированных пациентов среди попавших в отделение реанимации после заражения омикроном составила 61%. Эти данные охватывают только период до 15 декабря 2021 года. В некоторых больницах сообщают о 80–90% среди невакцинированных. Это при том, что в Великобритании большинство людей вакцинированы. У вакцинированных по сравнению с невакцинированными: — вероятность госпитализации при заражении омикрон-вариантом: в 8 раз ниже. — вероятность смерти из-за COVID-19 при заражении дельта-штаммом (с 1 января по 31 октября 2021 года): в 25 раз (на 96%) ниже. Источник: https://www.bmj.com/content/376/bmj.o5 (04.01.22) Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560

Каждую неделю я выписываю интересные публикации в журналах с высоким импакт-фактором себе в заметки. Обычно получается сборник с большим количеством материалов за неделю, многие из которых могут быть интересны для прочтения. Четвёртая неделя декабря (20.11.21–26.12.21). Более 100 англоязычных публикаций: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-4-nedelyu-dekabrya-2021-201121261221-12-31 Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560

Дальнейшая эволюция вариантов SARS-CoV-2 Наполняю большой сборник по омикрону. И по ходу работы обнаружил две интересные публикации. Спешу поделиться с вами кратким пересказом наиболее любопытных моментов из них. Есть как минимум два основных пути развития SARS-СoV-2: 1. Эффективность передачи. Способность новых вирусных вариантов передаваться лучше, чем предыдущие варианты, в какой-то момент достигнет своего пика. Вирус не может улучшать эту способность до бесконечности. Главный вопрос: когда эта эволюция достигнет своего пика и какой потенциал у вируса ещё остался? SARS-СoV-2 придётся балансировать между эффективной передачей и таким ущербом, который не помешает ему распространяться дальше. Ведь чем серьёзнее человек болеет, чем меньше шансов, что он сможет «переносить вирус на ногах», заражая других людей. * Трансмиссивность (transmissibility), или контагиозность, или заразительность, — это вероятность заражения при контакте между инфицированным и неинфицированным. * Вирулентность (virulence) — это способность патогена причинять вред хозяину: вызывать болезнь или приводить к летальному исходу у инфицированного. ❗️Однако не всегда способность лучше передаваться приводит к уменьшению тяжести заболевания! Иначе говоря, не всегда повышение трансмиссивности приводит к понижению вирулентности [1]. Эволюция вирусов сложнее! Если сильное повышение трансмиссивности коррелирует с повышением вирулентности, то в популяции может закрепиться вариант вируса, вызывающий более серьёзное заболевание. То есть сильно повышенная скорость передачи вируса компенсирует способность вызывать более тяжёлую болезнь, замедляющую передачу вируса [2]. Как раз это мы наблюдали в ситуации с дельта-штаммом, который передавался намного лучше, чем предыдущие варианты, но при этом вызывал более серьёзное заболевание. Более того, чем меньше перекрёстный иммунитет от старых вариантов к новым вариантам, тем выше шанс, что у нового повышенная трансмиссивность компенсирует повышенную вирулентность. Чем меньше иммунитет в популяции, тем выше шанс, что мы получим не только более передаваемый, но и более «злой» вариант вируса [2]. Возможно, чем больше людей в популяции переболели и вакцинировались, тем меньше шансов, что эволюционный отбор пройдёт новый более передаваемый вариант, который ко всему прочему ещё и вызывает более серьёзную инфекцию. 2. Уклонение от иммунитета. По мере того как способность SARS-CoV-2 к улучшенной передаче будет замедляться, вирус всё ещё сможет эволюционировать в сторону ухода от иммунной защиты. Самый простой способ для вируса вызывать новые вспышки — накапливать мутации, позволяющие уходить от иммунной защиты. Тут важно учитывать, что даже сезонные коронавирусы, такие как HCoV-229E, могут заражать человека снова и снова на протяжении всей его жизни за счёт мутаций, которые позволяют им уходить от иммунного ответа [1]. Некоторые мутации, способствующие лучшему уклонению от иммунной защиты, снижают способность вируса эффективно передаваться или реплицироваться. Поэтому вирусу придётся балансировать между эффективным распространением и уклонением от существующего иммунитета в популяции [1, 2]. В то же время возможны менее ожидаемые варианты развития. Например, гипотетически SARS-CoV-2 может улучшить свои характеристики за счёт рекомбинации с другими коронавирусами [1]. Источники, рекомендую прочитать в оригинале: 1. https://www.nature.com/articles/d41586-021-03619-8 (07.12.21) 2. https://www.nature.com/articles/s41559-021-01600-2 (23.12.21) Поддержать и поспособствовать созданию большего количество полезных материалов: 5536 9138 3126 6560

Если кто пропустил, сегодня сразу 3 интересных стрима. 1. От Алексея Водовозова по COVID-19: https://www.youtube.com/watch?v=4zBCT1g7BbE. 2. От Медача по итогам пандемии COVID-19: https://www.youtube.com/watch?v=YPYhQ28xb30. 3. От ANTROPOGENEZ.RU, будем выбирать главного превдоэксрперта-мракобеса, в том числе и среди ковид-диссидентов: https://www.youtube.com/watch?v=QmUq_TMiCIk.

«Паксловид» — препарат против COVID-19, снижающий риск госпитализации и смерти на 88% у людей из групп риска Наконец-то появился препарат, направленный непосредственно против самого SARS-CoV-2 и сильно снижающий риски в случае заражения. По результатам клинических испытаний «Паксловид» снижает риск госпитализации и смерти от COVID-19 на 88% среди невакцинированных людей с хотя бы одним фактором риска развития тяжёлой формы инфекции [1, 2, 3]. Для сравнения: Молнупиравир сокращает эти риски на ~30%, при этом может чаще приводить к побочным эффектам. 1. Детали клинического испытания. — Выборка: 2085 человек (1039 из них получали паксловид, а 1046 — входили в контрольную группу и получали плацебо). — Результаты. В течение 28 дней со дня приёма препарата были госпитализированы или умерли в результате инфекции: 0,8% человек в группе, получающей паксловид и 6% человек в группе, получающей плацебо. 2. Состав. Включает в себя два компонента: — Нирматрелвир: ингибирует основную протеазу SARS-CoV-2 (блокирует белок вируса), не давая ему создавать в клетках вирусные копии. — Ритонавир: также ингибирует основную протеазу SARS-CoV-2, кроме того, замедляет метаболизм нирматрелвира, позволяя ему дольше и в более высоких концентрациях оставаться в организме и выполнять свою функцию. 3. Форма применения. Принимается перорально в форме трёх таблеток (две таблетки нирматрелвира и одна таблетка ритонавива) два раза в день в течение 5 дней, начиная с 5 дня после появления симптомов COVID-19. Всего 30 таблеток. Не разрешено принимать препарат: более 5 дней, не по рецепту, для профилактики COVID-19. Также стоит учитывать, что «Паксловид» не заменяет вакцинацию или ревакцинацию. 4. Одобрение препарата. FDA (Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов) разрешило применение «Паксловида» детям в возрасте от 12 лет и взрослым с высоким риском тяжёлой инфекции, у которых есть положительный результат теста на SARS-CoV-2. 5. Дальнейшие планы. — Клинические испытания: компания Pfizer продолжает клинические испытания «Паксловида» у людей с меньшим риском развития тяжёлой COVID-19, а также в профилактических целях для людей, контактировавших с заразившимися COVID-19. — Производство: к первой половине 2022 года планируется произвести такой объём препарата, которого хватит на 30 млн курсов лечения (один курс: 30 таблеток), к концу 2022 года — на 80 млн курсов лечения. — Распространение: компания Pfizer подписала соглашение, помогающее облегчить доступ к препарату по сниженным ценам в 95 странах мира с низким и средним уровнем дохода (на которые приходится 53% населения планеты) . Ожидается, что «Паксловид» может предотвратить часть госпитализаций и смертей от COVID-19 и снизить нагрузку на систему здравоохранения при распространении омикрон-варианта. UPD: как показал опыт с другими препаратами от COVID-19, текущая эффективность «Паксловида» может уточняться и корректироваться. Поэтому только на основании испытания от Pfizer и разрешения FDA прошу преждевременно не делать далеко идущие выводы. Ждём больше данных по препарату. *** Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560 Источники: 1. https://www.science.org/content/article/fda-greenlights-pfizer-s-oral-covid-19-drug (22.12.21, в том числе источник иллюстрации) 2. https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-first-oral-antiviral-treatment-covid-19 (22.12.21) 3. https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04960202 Поиск данных и их разбор: Евгений Недильский. Оформление и перевод иллюстраций: Александр Митряшкин.

На иллюстрации изображена схема действия двух препаратов: «Паксловид» от компании Pfizer и «Молнупиравира» от компании Merck. Источник: https://www.science.org/content/article/fda-greenlights-pfizer-s-oral-covid-19-drug Разбор далее...

Напоминаю, что в журнале JAMA Network интересные иллюстрации к публикациям находятся обычно не в тексте статьи, а во вкладке «FIGURES/TABLES». Например, это относится к третьей ссылке в предыдущем разборе. Призываю вас как можно чаще заглядывать в источники. mRNA-1273 — Moderna; BNT162b2 — Pfizer; JNJ-78436735 — Johnson & Johnson.

3 важных новости из США [краткий конспект]: 1. Омикрон всего за 3 недели, скорее всего, стал доминирующим штаммом в США. На 18 декабря 2021 года омикрон обнаруживался в 73% секвенированных образцов SARS-СoV-2. По приблизительным оценкам трансмиссивность у омикрона в 2–3 раза выше, чем у дельта. В ближайшие недели в стране может возникнуть тройная угроза респираторных вирусов: дельта, омикрон и сезонный грипп. Вспышки гриппа A (H3N2) уже зафиксированы в нескольких университетских городках. 2. Вакцинация в разы уменьшила количество смертей, госпитализаций и заражений COVID-19. Рассчитанное положительное влияние вакцинации в США в период с 12 декабря 2020 года по 30 ноября 2021 года: — Летальные исходы. Вакцинация предотвратила 1,1 млн смертей. Без вакцин летальных исходов из-за COVID-19 было бы в 3,2 раза больше. — Госпитализации. Вакцинация предотвратила осложнения, требующие госпитализации у более 10 млн человек. Без вакцин госпитализаций при заражении было бы в 4,9 раза больше. — Заражения. Вакцинация уменьшила количество заражений COVID-19 на 36 млн случаев. Без вакцин новых случаев заражения было бы в 5,2 раза больше. В США было вакцинировано в этот период только 62% населения. 3. Даже при дельта-штамме привитые заражались COVID-19 гораздо реже, чем непривитые. На сколько заражались COVID-19 невакцинированные чаще по сравнению с вакцинированными в период с 1 мая по 7 августа 2021 года: — Moderna: на 412%; — Pfizer: на 287%; — Johnson & Johnson: на 159%. Расчёты велись на самой большой когорте протестированных людей в торговых точках, которая составляла более 1,2 млн человек. Поиск и разбор данных: Евгений Недильский Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560 Источники: 1. https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2787609 (22.12.21) 2. https://jamanetwork.com/journals/jama-health-forum/fullarticle/2787531 (21.12.21); более подробное сравнение: https://www.commonwealthfund.org/publications/issue-briefs/2021/dec/us-covid-19-vaccination-program-one-year-how-many-deaths-and 3. https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2787363 (22.12.21)

Иллюстрации из разобранного выше препринта.

Иллюстрации из разобранного выше препринта.

Титр нейтрализующих антител Sputnik V + Sputnik Light против омикрон-варианта Новость от Дениса Логунова и других учёных, отвечающих за разработку Sputnik V. Разберём результаты исследования, опубликованные 21 декабря в препринте. 1. Привитые Sputnik V 6–12 месяцев назад. Титр нейтрализующих антител против омикрона снижен в 11,76 раз по сравнением с вариантом B.1.1.1. 2. Привитые Sputnik V, а затем ревакцинированные Sputnik Light 2–3 месяца назад. Титр нейтрализующих антител против омикрона снижен в 7,13 раз по сравнением с вариантом B.1.1.1. Однако во всех сыворотках крови ревакцинированных были обнаружены нейтрализующие антитела IgG к RBD S-белка омикрон-варианта SARS-СoV-2. Причём, титр нейтрализующих антител к варианту B.1.1.1 у вакцинированных Sputnik V был примерно такой же, как титр нейтрализующих антител к омикрон-варианту у ревакцинированных Sputnik Light. * Проверка проводилась на нативном изоляте от пациента, прибывшего из ЮАР, а не на псевдовирусе! Резюме. Титр нейтрализующих антител против омикрон-варианта значительно снижен как у переболевших COVID-19, так и у вакцинированных. Однако высока вероятность, что ревакцинация с помощью Sputnik Light может подойти для частичного уменьшения рисков при заражении омикрон-вариантом. *** Поиск и разбор исследования: Евгений Недильский. Оформление и перевод иллюстраций: Денис Монета. Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560 Источник: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.17.21267976v1.full.pdf

Иллюстрация к данным выше.

Пресс-релиз от Moderna по эффективности бустеров против омикрон-варианта Примерно час назад представители компании Moderna опубликовали пресс-релиз с данными испытания двух бустеров против омикрон-штамма [1]. Спустя 4 недели после введения вакцины бустерная доза 50 мкг повышала уровень нейтрализующих антител против омикрона в 37 раз. Доза 100 мкг — в 83 раза. Кроме того, компания объявила о положительных результатах по безопасности и переносимости бустерной дозы 100 мкг в рамках 2/3 фазы клинических испытаний с участием 305 человек. Частота нежелательных явлений после третей дозы была примерно сопоставима с частотой после вакцинации с использованием двух доз. Сейчас Moderna тестирует несколько стратегий против омикрона [2]: 1. Более высокую дозу (100 мкг) вакцины. 2. Первое обновление вакцины mRNA-1273.211 для третей дозы — включает несколько важных мутаций в омикрон-варианте, которые также встречались в бета-варианте. 3. Второе обновление вакцины mRNA-1273.213 для третей дозы — включает многие мутации у омикрон-варианта, которые встречались у бета- и дельта-вариантов. Уже изучена на дозе 100 мкг и начинается изучение на дозе 50 мкг. 4. Новую версия вакцины mRNA-1273.529 специально для защиты от омикрона. 1. https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Preliminary-Booster-Data-and-Updates-Strategy-to-Address-Omicron-Variant/default.aspx (20.12.21) 2. https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Strategy-to-Address-Omicron-B.1.1.529-SARS-CoV-2-Variant/default.aspx (26.11.21) Поиск и разбор данных: Евгений Недильский Поблагодарить за свежие данные: 5536 9138 3126 6560

Омикрон: ревакцинация и новые свойства варианта Вышел уже ряд препринтов, подтверждающих важность ревакцинации в снижении рисков при заражении омикроном. Выборка: 48 медицинских работников, привитых второй дозой Moderna (20 человек) или Pfizer (28 человек) 3–4 недели назад. Разница в нейтрализующем титре антител против D614G (одна из первых закрепившихся мутаций SARS-СoV-2) и омикрона: — после двух доз вакцин: 22,9 раза; — после ревакцинации: 3,8 раза; Обнаружено ещё несколько интересных характеристик омикрона. Сравним омикрон с D614G SARS-СoV-2: — Омикрон в 2,4 раза ХУЖЕ связывается с ACE2 на наших клетках. Как и ожидалось, если вирус пытается уйти от антител изменяя S-белок, то это может негативно сказаться на других характеристиках вируса. — Омикрон в 4,8 раза ЛУЧШЕ передаётся от клетке к клетке. Что, скорее всего, способствует усиленному распространению вируса. Источник: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.16.472934v1.full.pdf (20.12.21) Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560