Ebm_base

🆓 Бесплатный курс для развития вашей врачебной онконастороженности Не только онкологи, но и специалисты других областей медицины могут столкнуться с онкологическими заболеваниями. Каждый врач должен понимать, как работает система онкологической помощи в России, чтобы вовремя распознать симптомы, направить пациента к нужному специалисту и ответить на его вопросы. Чтобы усилить онконастороженность среди студентов и молодых врачей, мы запускаем курс «Основы онкологической помощи»

Курс создан при поддержке ведущих экспертов из К+31, ПЭТ-Технолоджи, Высшей школы онкологии, Школы практической онкологии им. А. Павленко, Фонда «Вера» и многих других.

🥸 Кто может поучаствовать? — Студенты 4−6 курсов медицинских и фармацевтических специальностей; — Ординаторы любых специальностей; — Врачи и провизоры, окончившие обучение в 2021-2024 годах. ❓Что по условиям? Обучение полностью бесплатное и будет доступно с 28 октября! Заявки на участие принимаются до 25 октября на сайте курса. 🔍 В курс входят модули по:

— Образованию и карьерным возможностям в онкологии; — Маршрутизации онкологического пациента; — Сообщению диагноза и поддержке пациента; — Эпидемиологии, скринингу и биологии опухолевого роста; — Основным методам диагностики в онкологии; — Онконастороженности и ранней диагностике; — Лечению онкологических заболеваний; — Частым вопросам онкопациентов и их родственников.

🖥 Не упустите возможность дополнить свои знания и стать частью важной миссии в борьбе с онкологическими заболеваниями, проходите регистрацию на сайте и пополняйте свой багаж знаний! #полезное

А про выбросы (я как раз симулирую кривые руки, или кабель плохо воткнули) можно почитать тут Ну и подписаться можно, чтобы поддержать автора)

Вроде сделал получше и даже смог повторить версию Дамира Ильдаровича (спасибо ему за наводку) 1) создается 2 выборки. Распределение в каждой нормальное. Размер по 100 (n = 100). Истинная разница средних 5 (True MD = 5). Подробные параметры (1: rnorm (n = 100, mean =50, sd = 10); 2: rnorm(n = 100, mean = 55, sd = 10)). 2) в 1 группу добавляем выбросы, 10% случайных значений увеличивается в 2 раза. Таким образом я выравниваю средние значения между группами (т.е. Н0 о MD = 0 верна), но ранги (location shift) остаются неравны (т.е. Н0 о mean rank = 0 неверна). 3) повторяем 1000 раз, считаем как часто отклоняется Н0 4) повторяем шаги 1-3 50 раз Получается механизм Монте-Карло (если я правильно понимаю), где Н0 для t-теста верна, а Н0 для Mann-Whitney неверна. Ну и видим интересный (но вроде логичный) результат, где t-тест не может найти разницу, а MW-тест ее видит. Не уверен, что можно так представлять ранги через стандартизованную разницу рангов, но мне кажется вполне наглядно (SMD и SMR по Y - это абсолютные стандартизованные значения, t-тест и MW-тест по Y - частота отклонений Н0) В общем, «простые» тесты не так просты

Хватит это терпеть

Сказал бы я себе про свое поведение, но не скажу

Иногда бывают сложности в прочтении описания собственного курса, что уж говорить) Все это за 18 часов

А вам слабо стать таким гением за 18 часов? 😶

Походу я что-то делают не так, раз за 5 лет, так и не научился читать исследования без сомнений

Я как-то уже выкладывал это сообщением, но думаю можно повторить снова Мои ресурсы: Ютуб-канал журнального клуба (там в основном некоторые лекции и открытые заседания) https://youtube.com/@journalclubebm_base2526 Чат-флудилка блога в ТГ (не знаю кому он может понадобиться, но вдруг кто-то очень хочет общаться со мной в беседе 🤷‍♂) https://t.me/+zM0W7uxBpcA1MmVi Основной канал (там все от самых основ, площадка признана сами знаете чем) https://instagram.com/ebm_base Группа ВК журнального клуба (там сейчас новый админ и возрождение группы, пытаемся сделать интересно и вспомнить базу) https://vk.com/jcmma В общем, welcome (да, я занимаюсь переносом/переходом аудитории и мне не стыдно)

Если вы все это осилили прочитать и не потерять голову, то можно было заметить пару вещей - Ошибаться и признавать это, не стыдно и даже можно публично - В статистике много нюансов (даже в проверке "простых" тестов) - Не нужно верить первому же сообщению, надо сомневаться и перепроверять (других и даже самого себя) P.S. смешно как сразу человек 10 отвалилось от канала

Похоже реально где-то в бутстрепе MW дело Вот на МС вообще другие результаты 1. Выбросы в 10 раз в каждую выборку (по Х частота выбросов) 2. Выборсы в 1,5 раза только в одну выборку Распределение экспоненциальное, размер выборок увеличил до 1000

условия одинаковые (экспоненциальное распределение в популяции). Разница в методе сэмплинга (подписаны) Забавно… Я себе не доверяю, поэтому думаю, что я где-то скриворучил (скорее всего в бустрепе MW) и поэтому выдает такую штуку Если я действительно ошибся в нем… То и в остальных симуляциях значит тоже 😐🔫 В общем, как я и говорил, не верьте мне… Буду перепроверять и разбираться…

Симуляция симуляции рознь 🫠 Матвей в коментариях предложил, что вместо бутстреп генерации выборок, можно использовать метод Монте-Карло (ведь я сам задаю параметры популяции и верность гипотез) Ну и я по-быстрому повторил для экспоненциального распределения симуляцию, где увеличивается разница мат.ожиданий, т.е. Н0 неверна И получил картину наоборот 🤔 Теперь t-тест даже при распределении, не соответствующему нормальному, ловит лучше Чему верить? А фиг его знает теперь 😅 Мне видимо не надо верить 🥲 Матвей и другие коллеги, ваше мнение как никогда важно!)

Это, конечно, не идеальные симуляции (в дипломе и в должности откуда-то же «хирург» написано). Но это попытки поизучать даже такие «простые» вещи глубже, чем пишут в книгах или рассказывают на курсах. А там пишут в некоторых не совсем корректные вещи (а ведь с этих книг другие начинают изучать статистику)

а здесь все те же самые симуляции, как и описанные прежде, но с одним изменением! Тут данные взяты из популяции с экспоненциальным распределением признака, т.е. распределение не соответсвует нормальному. И тут уже на 1 и 2 рисунке можно увидеть новый интересный момент. MW чаще отклоняет Н0 (Expected value1 = Expected value2), которая верна. Но зато быстрее обнаруживает ситуации, когда она неверна. И случайные выбросы в двух выборках эту картину не меняют. А вот на 3 рисунке мы четко начинаем видеть, что MW начинает лучше видеть разницу. Особенно на графике A. Где граница уже «неверности» Н0 из-за выбросов в одной группе? Не находит ли он различия слишком рано? Или мб t-тест находит слишком поздно? В общем вопросов прибавилось)) Но! Важный поинт: даже при распределении, не соответсвующем нормальному, t-тест остается достаточно устойчивым при верной Н0, но слабее в сравнении с MW при неверной Н0. А в каком мире живем на самом деле, мы не знаем 🤷‍♂️ Надеюсь это поможет понять, что «простые» статистические тесты не так просты, как кажутся А вообще надо изучать свои данные (EDA), изучать предположения о данных в популяции (распределение, механизм генерации), проверять на ошибки, формулировать гипотезы заранее и подбирать тесты с учетом всех вышеизложенных факторов А не потому что на схемке нарисована стрелочка.

а тут творится… веселуха)) Здесь я сотворил какой-то абсурд (на мой взгляд) 😁 График А. 2 выборки идентичны, но в одну вносятся выбросы с силой 3 и их количество увеличивается как в предыдущей. И… это создает логичную, но мутную ситуацию. Видимо в какой-то момент (около 10% выбросов) Н0 перестает быть верной в изначальном условии (или не перестает, а мешают смоделированные кривые руки), поэтому оба теста начинают ее отклонять все сильнее. На 40% отклонений скорее всего это уже две разные выборки. Здесь интересное наблюдение, что MW начинает находить этот абсурд раньше, чем t-тест (или слишком рано). В общем есть еще над чем поиграть подумать. График В. К абсурду с выбросами в одной выборке добавляется, что Н0 точно не верна. Тут опять MW показывает тенеденцию чуть лучше отклонять Н0, но не критично. Предположение. Надо знакомиться с данными до использования тестов, вдруг найдете криворукие выбросы, которые вам сильно сместили среднее в одной группе.

А теперь начнем вносить изменения. Первое, что я попробовал, это случаной вносить выбросы в обе группы (увеличивается случайное значение в 3 раза), количество этих выбросов увеличивается от 1% до 50% (правда если их 50% можно ли это считать еще выбросами) На графике А. Н0 остается верной (mean1 = mean2). Как видим t-тест остается достаточно устойчивым, т.е. несильно увеличивается количество false-positive. А MW наиборот начинает чаще отклонять, но к 40-50% выбросам словно возвращается (но это к вопросу выборки с 50% «выбросов») График В. Я решил добавлять лишь 2% выбросов с такой же силой как выше (в 3 раза). Наверное так бывает не всегда, но я надеюсь, что более сильные выбросы или более частые исследователям получается идентифицировать и исправить (ведь так?). Так. В итоге намечается небольшой рост мощности MW, но глобально они пока до сих пор похожи. Предположение. Случайные выбросы в обоих группах при верной Н0 не являются противопоказанием к применению t-теста, если сравниваем средние. А при неверной Н0 характеристики тестов схожие.

Недавно с Лешей Титовым (да-да, тот самый) обсуждали параметрические и непараметрические тесты для 2-х выборок. И несколько сообщений спустя это привело с симуляциям. И некоторым интересным наблюдениям. Начнем! Первая симуляция (А) 1. Создаются 2 выборки по 100 наблюдений, каждая из нормального распределения с характеристиками (mean = 1, sd = 1). Т.е. в них верна нулевая гипотеза (Н0) о равенстве средних (mean1 = mean2) и такая же гипотеза о равенстве рангов 2. Из каждой берем случаный значения с повторами (бутстреп-выборки), рассчитываем на ней значение р для t-теста (параметрический) и теста Mann-Whitney (непараметрический) 3. суммируем сколько раз получили отклонений Н0 4. Повторяем 50 раз Что видим? В целом ни по одному из тестов не отмечается сильного отклонения от уровня в 5% (размер ощибки 1 рода). Но это логично) Вторая симуляция (В) 1. Те же 2 выборки по 100 наблюдений, но теперь постепенно увеличиваемся разницу между средними в популяции. А значит при MD = 0 Н0 еще верна, а дальше не верна. 2-4 так же Что видим? Тут получается мы наблюдаем как меняется мощность каждого теста. И что интересно, она растет одинаково у каждого из них. Можно сделать первое предположении на основе симуляций. При нормальном распределении данных в популяции (также одинаковой дисперсии и отсутсвии проблем в выборочных данных) независимо от верности Н0 оба теста имеют схожие характеристики.

#хиханьки

Эт прям хорошо 😂😂😂 я столкнулся с этим спустя лишь 4 года после начала погружения в статистику (видимо они были не очень продуктивными)

С вами начали связываться, кто прошел в 3 этап Ищите на почте, в соц сетях и других контактах, которые вы указывали