Конспекты Юджина 📗
前往频道在 Telegram
Делаю конспекты на тему медицины и науки. Разбираю данные из научных журналов и других качественных источников. Поблагодарить: https://boosty.to/eugenes_notes/ https://www.patreon.com/cw/eugenes_notes/ Связь: @eugene_time
显示更多5 415
订阅者
-224 小时
-87 天
-1730 天
帖子存档
5 415
📖 22 свежих публикаций о COVID-19 в лучших научных журналах за первую неделю августа
Я решил возобновить рубрику, в которой разбираю самое интересное про COVID-19 и SARS-СoV-2 в лучших мировых научных журналах за неделю 😊. Кратко разобрал 13 наиболее интересных публикаций и ещё 9 оставил для самостоятельного чтения, рассказав, чем они могут быть интересны. А ещё для удобства поделил представленные публикации на категории. Весь обзор получился большим, поэтому опубликую его по частям в ближайшие часы.
I. Вакцины и омикрон.
1. Вакцинация может сильно уменьшить вероятность развития MIC-C при омикроне у детей в возрасте 5–18 лет
* MIS-С (мультисистемный воспалительный синдром) — опасное осложнение при COVID-19 у детей, приводящее к воспалительным процессам в различные частях тела, в частности, в сердце, легких, почках, головной мозге, глазах, ЖКТ. Вызывает более тяжёлое течение инфекции и может привести к летальному исходу.
• Выборка: основная группа из 304 детей с MIS-С (280 или 92% из них были непривиты), контрольная группа из 502 детей с отрицательным тестом на SARS-CoV-2.
• Вакцина: две дозы Pfizer.
• Результаты: при заражении омикроном вероятность развития MIS-С у ребенка 5–18 лет, вакцинированного за последние 3 месяца, в ~5 раз (OR 0.22) ниже, чем у невакцинированного ребёнка.
Источник: Clinical Infectious Diseases / Oxford University Press (04.08.22)
2. После третьей дозы Pfizer у 81% вакцинированных сохраняются Т-клетки CD4+ и CD8+ против омикрона
Кроме того, что озвучено в заголовке, после третьей дозы Pfizer антитела к SARS-СoV-2 снижаются медленнее, чем после второй. Защитные антитела против омикрона обнаруживаются в течение не менее 3 месяцев после ревакцинации третей дозой. Таким образом, вакцина Pfizer в качестве бустерной (дополнительной) дозы восстанавливает упавший уровень антител после предыдущей вакцинации и усиливает Т-клеточный ответ на омикрон. (Частота прорывных инфекций довольно большая даже у ревакцинированных, но у них гораздо меньший шанс развития осложнений и тяжёлого течения COVID-19.)
Источник: Cell Reports Medicine (04.08.22)
2. Четвертая доза Pfizer помогает предотвращать заражение омикроном, исследование в Израиле
Выборка: 5.519 медицинских работников из Израиля, которые ранее получили в сумме три дозы вакцины от COVID-19, а в январе 2022 года — четвёртую.
Результаты. Частота прорывных инфекций (заражений у вакцинированных):
• привитые 3 дозами: 19,8%;
• привитые 4 дозами: 6,9%.
Источник: JAMA Network Open (02.08.22)
4. Даже если учитывать предыдущий иммунитет и другие факторы, омикрон вызывает в 3 раза меньше смертей, чем дельта
Ранее выcзывались предположения о том, что омикрон приводит в среднем к более лёгкой инфекции (менее вирулентный вариант), чем дельта. Но они часто парировались тем, что у заразившихся омикроном уже был предыдущий иммунитет к вируса в результате вакцинации и/или болезни, что не учитывали в исследования, как и не учитывали другие переменные, которые могли сильно исказить результаты. Теперь же доступны результаты исследования, учитывающее предыдущий иммунитет после инфекции и/или вакцинации, и социально-демографические переменные. При учёте этих переменных результаты следующие: риск летального исхода у зараженных омикроном BA.1 в среднем в 3 раза (на 66%, HR 0,34) ниже, чем у зараженных дельтой.
Источники:
British Medical Journal (02.08.22)
British Medical Journal (02.08.22)
Поблагодарить: 5536 9138 3126 656
5 415
В какое время дня (чаще всего) вам удобнее всего читать длинные тексты?
5 415
Сезон гриппа 2022/2023 может начаться раньше и быть более тяжёлым, как это уже происходит в Южном полушарии
В Северном полушарии сезонные вспышки гриппа происходят чаще всего с ноября по апрель. В Южном полушарии вспышки происходят с июня по октябрь. Смотря на интенсивность вспышки в Южном полушарии, можно примерно предсказать, какой может быть вспышка в Северной полушарии. И сейчас здесь есть тревожный сигнал.
Сейчас в Австралии наблюдается быстрый рост числа заражений гриппом А (H3N2), который обычно вызывает более серьёзные вспышки. При этом сезон гриппа начался раньше обычного, и достигает рекордно высоких показателей. Резкий рост количества заражённых, скорее всего, связан с ослаблением ограничительных мер при пандемии и низкой долей населения, которые вакцинированы или переболели гриппом за последние 2 года. Эти данные показывают нам, что, возможно, стоит ожидать в Северном полушарии более ранней и тяжёлой вспышки сезонного гриппа.
5 415
Появились первые экспериментальные подтверждения двух гипотез: эффективности вакцины от натуральной оспы против оспы обезьян на клинических данных и половой передача вируса оспы обезьян.
1. Первые клинические данные на людях, показывающие эффективность вакцины MVA против оспы обезьян
Против оспы обезьян применяют вакцины, которые разрабатывались не против оспы обезьян, а для борьбы с натуральной оспой, потому что это вирусы сильно похожи. До недавнего времени не было клинических данных на людях (только иммунологические) о том, что вакцины против натуральной оспы эффективны и против оспы обезьян. Людей прививали уже после контакта с заражёнными оспой обезьян, при этом только у 4% привитых развились симптомы инфекции. Далее кратко разберу подробности исследования...
— Время исследования: с 27 мая по 13 июля 2022 года.
— Выборка: 276 контактирующих с заражёнными оспой обезьян, с положительным тестом ПЦР. Среди них: мужчины (91%), относящиеся к группе МСМ (88%), вакцинированы от натуральной оспы в период с 1955 по 1981 года (11%). У 53,7% контактирующих был незащищённый половой акт с заражённым оспой обезьян.
— Вакцина: MVA, вакцина третьего поколения (подробнее про разные вакцины против оспы обезьян).
— Когда введена вакцина: в среднем через 11 (8–14) дней после симптомов оспы обезьян, 11% заражённых получили вакцины в день появления симптомов. Вторая доза вводилась в среднем через 29 (28–33) дней.
Результаты
Прорывная инфекция у вакцинированных после контакта с заражёнными оспой обезьян составила только 4% (12) вакцинированных. При этом 50% людей с прорывной инфекцией сделали прививку только через 13 дней после контакта с заражённым. Ни одна прорывная инфекция не была тяжёлой и не вызывала осложнений. 1 из 12 прорывных инфекций случилась у медицинского работника в результате профессионального контакта с заражённым.
Характеристики заражённых:
— Средний возраст: 24 года (16–27 лет)
— Сексуальное поведение: 11 из 12 относились к группе МСМ.
— Количество половых партнёров: в среднем 11 (4–12) за последний месяц.
— Сексуальное здоровье: в среднем 1–2 ИППП за последний год.
— Время между введением вакцины и появлением симптомов: в среднем 4 дня (диапазон 1–25 дней), в 10 из 12 случаев симптомы начались через 5 дней.
Также авторы напоминают, что домашние животные могут успешно переносить оспу обезьян и заражать её людей.
Источник: medRxiv (препринт, 04 августа 2022 года)
2. Первые данные, предполагающие половую передачу оспы обезьян
Как я уже писал ранее, у многих заражённых обнаруживается ДНК оспы обезьян в семенной жидкости. Исследователи собрали семенную жидкость спустя 6 дней после начала симптомов у заражённого оспой обезьян (который также был ВИЧ-инфицированным). Затем вирусные частицы поместили в среду (инокулировали в клетки Vero E6), где они могли бы "размножаться" (реплицироваться). Оказалось, что выделенный вирус смог успешно реплицироваться. Таким образом авторы исследования показали, что семенная жидкость в острой фазе инфекции может содержать в себе вирус, способный реплицироваться.
По итогу исследования учёные обнаружили ДНК оспы обезьян в образцах семенной жидкости 11 (79%) из 14 заражённых. При этом в отличии от семенной жидкости, в образцах мочи и крови не было обнаружена ДНК оспы обезьян.
Теперь модно сказать, что вероятность передачи вируса оспы обезьян половым пётом довольно высока. Но всё же лучше дождаться воспроизводимости результатов в других исследованиях.
Источник: The Lancet Infectious Diseases (02 августа 2022 года)
За поддержку моих конспектов спасибо одному человеку, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов. Благодаря вашей поддержке у меня появляется больше свободного времени для создания конспектов 😊. Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
5 415
Новые симптомы и проявления при заражении оспой обезьян
При текущей вспышке обезьян симптомы отличаются от тех, которые встречались при предыдущих вспышках вируса. Информация о том, что сыпь при заражении оспой обезьян проявляется чаще на лице, ступнях и ладонях, уже не соответствует действительности. Более того, появились новые симптомы, о которых начали говорить относительно недавно. Чтобы лучше понять ситуацию я разберу результаты трёх свежих исследований и прослежу в них общие детали.
Содержание:
• 1. Исследование 528 заражённых в 16 странах
• 2. Исследование 197 заражённых в Великобритании
• 3. Исследование 54 заражённых в Великобритании
• Предварительные выводы
• Подозрение на бессимптомную передачу
Читать: https://telegra.ph/Novye-simptomy-i-proyavleniya-pri-zarazhenii-ospoj-obezyan-08-04
Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
5 415
Что вам было бы интересно почитать на канале?
Чем я здесь занимаюсь? Напомню, что суть моей работы в следующем. Сперва я нахожу большой массив научных публикаций (чаще всего свежих) в лучших мировых журналах на какую-то актуальную медицинскую тему. Затем перевожу английскую информацию в формат конспекта на русском, который удобно и быстро читается. Кроме этого, мне интересно разбирать мифы, писать про когнитивные искажения, конспектировать лекции и книги и др. Многими своими конспектами я сам пользуюсь, поэтому пишу их так, чтобы легко было просканировать глазами текст и найти нужную информацию.
В чём цель канала? Мне нравится помогать людям и вместе с этим развиваться самому. Занимаюсь я этим прежде всего потому, что на английском языке уйма полезной информации, много из которой не доходит до рунета. А если и доходит, то часть из неё искажается, поскольку есть довольно сложные темы, требующие определенных знаний для перевода с английского на русский. Например, иммунология — довольно сложная тема. А рассказ про препараты обычно требует навыка анализа исследований. Без него даже очевидно некачественный метаанализ с кучей ошибок (с пиаром неэффективного против COVID-19) может восприниматься как качественная информация. А если кто-то уже поверил в заведомо ложную информацию, то часто его сложно переубедить. Поэтому гораздо эффективнее изначально давать базу, с помощью которой он сможет самостоятельно не покупаться на мифы сложнее чем "коронавируса не существует, а в вакцинах чипы".
А если вдруг я чего-то не знаю (например, для меня сложна нейроиммунология, и я всё никак не допишу материал по этой теме), то среди моего окружения и читателей есть талантливые учёные, которые могут исправить мои ошибки или помочь. Таким образом, получаются интересные материалы на специфичные темы.
5 415
Почему оспой обезьян заражаются чаще всего мужчины, у которых был секс с другими мужчинами?
Содержание:
• 1. Оспа обезьян, возможно, передаётся половым путём
• 2. МСМ чаще диагностируют
• 3. У МСМ в среднем чаще половые контакты и больше половых партнёров
• Какая тактика может только ухудшить ситуацию?
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-ospoj-obezyan-zarazhayutsya-chashche-vsego-muzhchiny-u-kotoryh-byl-seks-s-drugimi-muzhchinami-08-03
За помощь паблику спасибо Людмиле и ещё двум людям, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов. Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
5 415
Почему объявление ВОЗ чрезвычайной ситуации из-за распространения оспы обезьян так важно?
23 июля глава ВОЗ объявил текущую вспышку оспы обезьян чрезвычайной ситуацией PHEIC. Всего чрезвычайные ситуации объявлялись 7 раз (включая этот раз), но впервые генеральный директор ВОЗ сделал это вопреки мнению комиссии по чрезвычайным ситуациям. Что такое PHEIC и почему это событие так важно для мира и для борьбы с оспой обезьян?
Содержание:
• 1. Что такое чрезвычайная ситуация PHEIC?
• 2. Почему большинства участников комиссии не хотели объявлять чрезвычайную ситуацию PHEIC?
• 3. Из-за каких вирусов ранее объявляли PHEIC?
• 4. Почему PHEIC так важна при вспышке оспы обезьян?
• Резюме.
Читать: https://telegra.ph/Pochemu-obyavlenie-VOZ-chrezvychajnoj-situacii-iz-za-rasprostraneniya-ospy-obezyan-tak-vazhno-08-02
Спасибо за помощью каналу Елене и ещё трём людям, чьё имя не отобразилось при пересылке донатов. Если вы хотите, чтобы я сослался на вас при благодарности, можете написать мне в личку (@eugene_time). Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
***
Из основного по теме оспы обезьян осталось разобрать заражение (здесь интересны несколько моментов, например, почему вирусом заражается определённая группа людей, а ещё появились данные про бессимптомное носительство), симптомы (они отличаются от предыдущих вспышек вируса) и генетику (вирус оспы обезьян довольно сильно мутировал), ещё можно рассказать про препараты. После чего можно переходить к разбору темы о COVID-19.
А ещё хочу успевать выкладывать конспекты лекций по темам из топовых мировых ВУЗов. Прямо сейчас прохожу открытый Йельский курс "Introduction to Psychology" (введение в психологию). Что особенно приятно, после первой же лекции в качестве домашнего задания предлагают материал, в котором с иллюстрациями поясняется, какие бывают научные исследования по дизайну и учат их оценивать. И в целом даёт полезные основы, узнал много интересного. А ещё можно продолжать делать конспект по Стэнфордскому курсу "Биология поведения человека".
5 415
Оспа обезьян у беременных и кормящих грудью
Чаще всего оспой обезьян в текущей вспышке заражаются мужчины, у которых за последнее время был половой контакт с другими мужчинами. Однако инфекцией могут заражаться в том числе женщины и дети. Инфицирование оспой обезьян у беременных женщин, скорее всего, несёт высокий риск развития внутриутробной инфекции, выкидышей, осложнений для материи, включая повышенную вероятность летального исхода.
В полном материале разберу следующее:
1. Риски при заражении оспой обезьян у беременных.
2. Как обстоят дела в вакцинацией беременных и кормящих грудью от оспы обезьян.
3. Диагностика оспы обезьян у беременных (информация для практикующих врачей) .
4. Препараты против оспы обезьян у беременных (кратко).
Читать: https://telegra.ph/Ospa-obezyan-u-beremennyh-i-kormyashchih-grudyu-08-01
Спасибо Василию за донат несколько часов назад! Поблагодарить за конспект: 5536 9138 3126 6560
5 415
Уже не хватает достаточного количества вакцин от оспы обезьян. Чтобы решить проблему, учёные предлагают вакцинировать одной вместо двух доз вакцины. При этом имеющиеся данные показывают, что одна доза вакцины MVA от Bavarian Nordic может обеспечить защиту от вируса до двух лет.
В материале разобрано следующее:
1. Какие группы населения уже вакцинируют от оспы обезьян в разных странах?
2. Почему же не хватает вакцины? Сравнение двух популярных вакцин от оспы обезьян. Какое количество вакцин есть сейчас?
3. Приведу результаты исследований, которые предполагают защиты от оспы обезьян всего на основе одной дозы;
4. Почему учёные решили, что вакцины от натуральной оспы будут эффективны и против оспы обезьян?
Читать: https://telegra.ph/Uzhe-ne-hvataet-vakcin-ot-ospy-obezyan-Uchyonye-predlagayut-vakcinirovat-odnoj-vmesto-dvuh-doz-vakciny-08-01
Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
5 415
Грабли, на который мы снова и снова наступаем — это недооценка экспоненциального роста. Тысяча заражённых сегодня может стать миллионом зараженных пандемией через полгода. Даже в случае вируса, которых обладает меньшей способностью распространяться, чем SARS-СoV-2.
Статистика взята отсюда: https://ourworldindata.org/monkeypox
Кроме того, отслеживать количество заражений оспой обезьян можно здесь: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1CEBhao3rMe-qtCbAgJTn5ZKQMRFWeAeaiXFpBY3gbHE/edit?mc_cid=73764eb731&mc_eid=afd8ccb9bc#gid=0
5 415
Оспа обезьян: большое обновление.
Ещё в середине июля, когда я начинал делать большое обновление по оспе обезьян, количество заражённых вирусом было порядка 10 тысяч. К 1 августа количество заражённых оспой обезьян перевалило за 23 тысячи человек. 23 июля ВОЗ наконец-то признала распространение вируса чрезвычайной ситуацией. Наконец-то — это потому что уже больше месяца множество эпидемиологов, вирусологов и других специалистов критиковали организацию за её медлительность и говорили, что уже пора бы объявить чрезвычайное положение. Ещё 12 июля было стало известно о первом случае заражения оспой обезьян в России. Нет сомнений, что распространение оспы обезьян — эта очень важная тема, пока не настолько важная как COVID-19, но уже давно требующая пристального внимания.
За то время, пока я не вёл конспекты, вышло масса интересных публикаций по теме. Я как всегда подробно подбираю материалы: сперва публикации по теме в лучших мировых научных журналах, таких как NEJM, The Lancet, JAMA, Nature, Science, Cell, BMJ, Oxford University Press, PLOS и др. Затем выписываю себе вообще все ссылки, которые нашёл по теме, после чего отмечаю практически полезные публикации, читаю от начала и до конца каждую из них и конспектирую наиболее значимые моменты. Таким образом можно охватит большинство наиболее качественной и полезной информации из имеющейся по теме.
При описанном выше подходе у меня собралось примерно полсотни интересных публикаций по теме, которые стоит разобрать. Думаю, что лучше всего разобрать каждую тему в отдельном материале, а затем подвести итог всего обновления. Информации по теме оспы обезьян всё больше, но пока мало конкретных данных, на которые можно опереться. Например, какие есть исследования, на основании которых можно сказать, что вакцины от натуральной оспы будут работать и против оспы обезьян? Какие есть данные о том, что для защиты от оспы обезьян достаточно одной прививки вместо плановых двух? Какие исследования показывают риск заражения оспы обезьян для беременных? В каких исследованиях показано в процентном соотношении, кто именно заражается оспой обезьян? И т.д. Обо всём этом я расскажу в следующих материалах. А сейчас начну с тем про текущую статистику заражений и вакцинацию...
5 415
Оспа обезьян: краткая заметка для практикующих врачей
Как показал свежий систематический обзор, опубликованный в качестве препринта в medRxiv 9 июня, на данный момент вовсе отсутствуют научно обоснованные клинические рекомендации по ведению пациентов с оспой обезьян. Похожий вопрос поднимался заметке в The Lancet, опубликованной буквально вчера, 15 июня. Авторы показали, что даже на английском языке на данный момент доступно очень мало практически полезной научной литераторы на тему оспы обезьян. Между тем, как отмечается в этой же заметке, кожные проявление оспы обезьян легко спутать с другими заболеваниями (ветряной оспой, простым герпесом, сифилитическим шанкром, гонореей, контагиозным моллюском). Учения в США показали, что примерно в половине случаев заражённым оспой обезьян ставится изначально неверный диагноз. Поэтому я решил отдельно упомянуть, чтобы информация не затерялась в массе другой информации по теме, что в одном из лучших научных журналов The New England Journal of Medicine, вчера, 15 июня, опубликовано подробное описание оспы обезьян у 31-летнего мужчины. Кстати, изначально ему также не диагностировали оспу обезьян. Кроме этого, 13 июня в JAMA Network опубликована информация для практикующих клиницистов, которые в будущем могут столкнуться к заражёнными оспой обезьян, в том числе по симптомам, профилактике, диагностике и уходу за пациентами с оспой обезьян. Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
5 415
Женщина болела COVID-19 более 7 месяцев, за это время SARS-CoV-2 успел накопить 22 мутации, примерно половина из них есть в омикроне
Выделение SARS-СoV-2 у людей с ослабленным и нормальным иммунитетом, сравнение
Как уже давно известно, SARS-СoV-2 в организме людей с ослабленным иммунитетом может сохраняться намного дольше, чем у людей с нормальным иммунитетом. В большинстве случаев заражённые люди с нормальным иммунитетом выделяют инфицирующие вирусные частицы через дыхательную пути до 9 дней после начала симптомов инфекции [2]. Но в редких случаях даже люди с нормальным иммунитетом могут передавать вирус в течение нескольких недель [1]. Ещё какое-то относительно недолгое время заражённые могут выделять части вируса (а не цельный вирус, способный заражать клетки), в том числе вирусное РНК. Из-за этого тесты по методу ПЦР могут показывать положительный результат на SARS-СoV-2 у выздоровевших, которые никого не заразят. В то же время люди с ослабленным иммунитетом иногда могут выделять инфицирующие вирусные частицы многие недели после заражения, а порой даже месяцы.
Про один из первых зафиксированных случаев долгого выделения SARS-CoV-2 я писал ещё в 2020 году. Тогда я рассказывал, что женщина с иммунопатологией выделяла инфицирующие вирусные частицы до 70 дней, а РНК SARS-CoV-2 — до 105 дней после постановки диагноза [3]. Сегодня расскажу про ещё более интересный случай...
Женщина, болевшая COVID-19 более 7 месяцев
Пожилая женщина в Австрии принимала иммунодепрессанты при рецидиве лимфомы. Она заразилась SARS-СoV-2 в конце 2020 года. Симптомы инфекции и положительный результат на SARS-СoV-2 у неё сохранялись более 7 месяцев. Симптомы были лёгкими, включая утомляемость и кашель. За время инфекции у неё собирали образцы SARS-СoV-2 более 20 раз.
В результате за время болезни SARS-СoV-2 в организме женщины накопил 22 изменения. Что интересно, примерно половина этих изменений есть в субвариантах омикрона, которые распространились намного позже того времени, когда она переболела COVID-19. Как отмечают авторы, омикрон возник не из-за заражения SARS-СoV-2 у этой женщины! То есть через время вирус пошёл по тому же эволюционному пути. Этот случай демонстрирует, что заражённые с иммунопаталогиями могли быть важным звеном в возникновении омикрона [1].
Важно упомянуть, что не все случаи долгого заражения SARS-CoV-2 протекают легко или бессимптомно. Долгая инфекция на протяжении нескольких недель или месяцев может заканчиться летальным исходом.
Другой интересный момент заключается в том, что женщина выздоровела после 7-месячная инфекции после вакцинации от COVID-19. Это уже не первый случай, когда после вакцинации исчезали симптомы «хронической COVID-19» у людей с ослабленным иммунитетом [1].
Происхождение омикрона
Итого, сейчас у нас есть два наиболее вероятных фактора для возникновения опасных вариантов SARS-СoV-2 и есть данные, подкрепляющие оба варианта:
1. Животный резервуар для SARS-СoV-2, в котором предок омикрона мог набрать много миутаций. Об этом я недавно писал [4].
2. Заражённые люди с ослабленным иммунитетом, в организме которых предок омикрона мог накопить ещё значительную часть изменений. Только с ВИЧ-инфекцией в мире около 140 млн человек.
Чем больше заражённых SARS-СoV-2, тем выше шанс, что вирусом могут заразиться животные или же люди с ослабленным иммунитетом.
Источники:
1. Nature News (15.06.22, про случай с женщиной, которая болела COVID-19 более 7 месяцев)
2. https://t.me/eugenes_notes/108 (как долго в течение болезни выделяется SARS-CoV-2)
3. https://t.me/eugenes_notes/71 (бессимптомная носительница SARS-CoV-2 выделяла инфицирующие вирусные частицы до 70 дней с момента постановки диагноза)
4. https://t.me/eugenes_notes/629 (омикрон мог произойти от мышей)
Благодарю всех, кто поздравил меня с днём рождения в личных сообщениях или в комментариях. И особенное спасибо Денису и ещё 10 людям, чьём имя не отобразилось при пересылке, за донаты 8 июня! И, конечно же, спасибо всем тем, кто делится моими материалами с другими. Поблагодарить за разбор: 5536 9138 3126 6560
5 415
Вот такие мутации накопились в S-белке SARS-СoV-2 всего у одной женщины с иммунопатологией, которая болела COVID-19 более 7 месяцев. За это время пребывания в её организме SARS-СoV-2 приобрёл 22 различных изменений. Что ещё интересно, часть из этих мутаций есть в омикроне. Подробнее про случай, если успею, расскажу сегодня вечером.
5 415
Три поколения вакцин от оспы
Для оценки существующих вакцин от оспы важно знать про три поколения вакцин. В мире сейчас имеются вакцины второго и третьего поколения против оспы.
• Первое поколение: содержат «живой» вирус коровьей оспы, который может реплицироваться в клетках. Применялись с 1966 по 1977 года до полного искоренения ветряной оспы. Могли приводить к серьезным побочных эффектам. Однако это не самая первая вакцина против оспы. Вообще самая первая в истории вакцина как раз и была первой вакциной от оспы, разработанной Эдвардом Дженнером в 1796 году.
• Второе поколение: как и первое поколение содержат тот же штамм «живого» вируса коровьей оспы, способный реплицироваться в клетках. Они произведены с использованием современных методов культивирования в клетках. Поскольку вирус коровьей оспы обычно не приносит серьезного ущерба организму и это родственный вирус, такие вакцины могут применяться против натуральной оспы или оспы обезьян. Но эти вакцины могут вызвать редкие побочные эффекты, как и вакцины первого поколения.
• Третье поколение, MVA (Modified Vaccinia Ankara): аттенуированные вакцины, то есть содержат ослабленный вирус оспы коров. Они разрабатывались специально для того, чтобы вызывать минимум побочных эффектов.
Какие есть сложности при вакцинации от оспы обезьян?
• Вакцин третьего поколения пока мало. Массовая вакцинация от оспы обезьян пока не планируется, потому что основные запасы сейчас приходятся на вакцины второго поколения. Из-за побочных эффектов вакцины второго поколения не рекомендуется вводить детям, беременным, людям с ослабленным иммунитетом и людям с некоторыми кожными заболеваниями. Вакцины третьего поколения есть у меньшего количества стран и в меньших объемах [35].
• Низкое желание вакцинироваться. К сожалению, пока даже в богатых странах с высоком уровнем образования среди людей многие контактирующие люди не считают нужным привиться от оспы. Например, в Великобритании привились от оспы только 15 из 107 контактирующих с заражёнными и 169 из 245 медицинских работников [35].
• Вакцины проверялись против натуральной оспы, но не против оспы обезьян. Пока нет клинических данных на людях об эффективности текущих вакцины от натуральной оспы против оспы обезьян. Поскольку вакцины были высокоэффективными у людей во время борьбы с натуральной оспой, ожидается, что они будут высокоэффективными и против оспы обезьян, однако нужны данные, чтобы показать, что это действительно так [35].
• Как минимум два штамма оспы обезьян и сложность отслеживания контактов.
Эти обновления уже добавлены в постоянно обновляющийся сборник о натуральной оспе: https://telegra.ph/Vspyshka-ospy-obezyan-za-predelami-Afriki-sbornik-05-23
5 415
Оспа обезьян: обновление сборника
Вспышка оспы обезьян продолжает распространяться. Сейчас число заражённых приближается к 2000 человек. Напоминаю, что количество заражённых можно отслеживать в Google Документах или в GitHub. За последние две недели добавил ещё 16 новых источников полезной новой информацией в постоянно обновляющийся сборник про оспу обезьян. Туда же добавил несколько новых иллюстраций.
Основные новости следующие:
1. У распространяющейся оспы обезьян за пределами Африки есть как минимум 2 штамма. Эти последние данные за июнь полагают, что оспа обезьян начала распространяться за пределами Африки заметно раньше, чем предполагалось.
2. Не у всех заражённых оспой обезьян проявляются гриппоподобные симптомы. А ещё важно учитывать, что инкубационный период у вируса оспы обезьян довольно большой и может достигать трёх недель. Все это понижает шансы на обнаружение вируса до заражения других людей.
3. Начинает медленно внедряться вакцинация от оспы среди узких групп. Например, в канадской провинции Квебек уже стали предлагать вакцину от оспы мужчинам, у которых был половой контакт с другими мужчинами за последние 2 недели. Но есть и ряд проблем с вакцинацией, их разберу ниже.
4. Учёные опасаются, что сильное распространение оспы обезьян может создать животный резервуар с вирусом за пределами Африки. Опыт прошлых эпидемий чумы и жёлтой лихорадки показал, что люди заражали в том животных, создавая животных резервуар для патогена. Из этих резервуаров опасные патогены через время снова распространялись на людей, приводя к новым вспышкам и эпидемиям. Вирус натуральной оспы, скорее всего, не имел животных резервуаров, поэтому его удалось полностью искоренить. Однако коровья оспа или оспа обезьян передаются различным животным, поэтому их распространение особенно опасно.
Мелкие животные (хомяки, морские свинки, белки, землеройки крысы) в первую очередь могут заражаться оспой обезьян от людей, это может создать резервуары с заразными животными в странах за пределами Африки. Заражение диких грызунов особенно вероятно, потому что они часто приходят к мусоркам, в которых могут быть вещи зараженных людей. Если это произойдёт, бороться с распространением вируса станет ещё тяжелее. К тому же, у зараженных животных не проявляются такие видимые симптомы, как у человека, что сильно усложняет обнаружение оспы у животных.
5 415
А ещё мне сегодня исполнилось 30 лет.
Приятно осознавать, что я могу не только самостоятельно развиваться, но и приносить пользу всем вам рассказывая о чём-то важном из мира науки. Один из элементов счастья — это быть кому-то полезным.
Поздравить с днём рождения: 5536 9138 3126 6560
Если вы не из России, то можете прислать Юре, он перешлёт донаты мне: https://www.paypal.me/erofeevyury
Кроме донатов лучшая помощь для канала — это распространение моих конспектов и статей, которые показались вам полезными, среди других источников информации и среди своего окружения. Или любая помощь с публикациями. Например, вчера мне помогли оформить иллюстрации к этой интересной публикации про иммунитет мозга. Это уже значимая помощь. Чуть позже разберу эту публикацию здесь. В том числе полезна и критика. Даже если вы исправляете описки у меня в тексте, это уже делает этот канал лучше.
За поледнюю неделю вышло много интересных публикаций, вот некоторые из них.
Омикрон:
— Omicron BA.1 breakthrough infection drives cross-variant neutralization and memory B cell formation against conserved epitopes https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.abq2427 (02.06.22)
— Immune memory to SARS-CoV-2 Omicron BA.1 breakthrough infections: To change the vaccine or not? https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.abq5901 (02.06.22)
Постковидный синдром:
— A systematic review and meta-analysis of long term physical and mental sequelae of COVID-19 pandemic: call for research priority and action https://www.nature.com/articles/s41380-022-01614-7 (06.06.22)
— A systematic review and meta-analysis on prevalence of and risk factors associated with depression, anxiety and insomnia in infectious diseases, including COVID-19: a call to action https://www.nature.com/articles/s41380-022-01638-z (06.06.22)
— Long term implications of covid-19 in pregnancy https://www.bmj.com/content/377/bmj-2022-071296 (31.06.22)
Препараты:
— Covid-19: Doctor who sold hydroxychloroquine as “magic bullet” treatment is jailed https://www.bmj.com/content/377/bmj.o1395 (06.06.22)
— The black market for covid-19 antiviral drugs https://www.bmj.com/content/377/bmj.o1282 (31.06.22)
Опыт разных стран в борьбе с COVID-19:
— Population-level implications of the Israeli booster campaign to curtail COVID-19 resurgence https://www.science.org/doi/10.1126/scitranslmed.abn9836 (01.06.22, Израиль)
— Zeroing out on zero-COVID https://www.science.org/doi/10.1126/science.add1891 (02.06.22, Китай)
А ещё в роговице глаза нашли иммунные клетки, хотя раньше считалось, что там нет иммунных клеток:
https://www.nature.com/articles/d41586-022-01578-2 (03.06.22)
Если вам что-то из этого интересно и хотите, чтобы я разобрал эту публикацию здесь — дайте знать.
5 415
Омикрон мог произойти от мышей
Точнее, предложенный исследователями эволюционный путь SARS-СoV-2 следующий: человек —> кошка —> мышь —> человек [1, 2].
Омикрон и животные. Как уже давно известно, омикрон эволюционировал отдельно от многих других вариантов SARS-СoV-2. Вирус долгое время развивался в каких-то популяциях, накопил в себе большое количество мутаций, после чего начал очень быстро распространяться среди людей. Ещё в начале распространения омикрона одна из гипотез происхождения была следующей: вирус передался от человека к животному, мутировал в животной среде, а затем животное передало изменённый вирус человеку (о ней я писал ранее [3]). Новые исследования предоставляют интересные данные, которые подкрепляют это гипотезу.
Связывание омикрона с АСE2 у мышей. S-белок омикрона BA.1 и BA.2 может с высокой аффинностью (силой связи) связываться с рецептором ACE2 на клетках человека. При этом омикрон хорошо связывается с ACE2 кошек и с ACE2 мышей. Тот факт, что мы можем заражать коронавирусом кошек и собак, известен ещё в первые месяцы пандемии, при уханьском SARS-CoV-2 [4, 5]. Однако способность заражать мышей у омикрона значительно улучшилась по сравнению с уханьским вариантом. Вирус приобрёл мутации Q493R, Q498R и N501Y, которые помогают ему связываться с мышиным ACE2. Что ещё интересно, именно эти же мутации обнаружены в адаптированном под мышей SARS-СoV-2.
Происхождение омикрона. На основании полученных данных исследователи предложили следующую гипотезу. SARS-CoV-2 передался от человека кошке (такая передача происходила очень много раз, поскольку хозяева нередко заражают своих животных [4]). После этого вирус от кошки передался мыши, в организме которой он какое-то время развивался. Затем мышь заразила эволюционирующим вирусом человека, в результате чего появился омикрон, успевший накопить в себе множество мутаций.
Трансмиссивность омикрона BA.1 и BA.2. Кроме того, исследователи определили, что у омикрона BА.2 аффинность S-белка с человеческим АСE2 в 2 раза выше, чем у омикрона BА.1 и в 11 раз выше, чем у уханьского SARS-СoV-2. А рецептор-связывающий домен (RBD) у BА.2 более стабилен, чем у омикрона BА.1, что ещё сильнее увеличивает вероятность связывания S-белка с АСЕ2 на поверхности клеток. За счёт улучшенной способности омикрон BА.2 лучше передаётся между людьми (более трансмиссивен), чаще заражает их клетки и чаще приводит к возникновению инфекции.
Источники:
1. Cell Research / Nature (31.05.22, основное исследование)
2. Cell Research / Nature (31.05.22, краткое обсуждение исследования)
3. https://t.me/eugenes_notes/401 (как и где мог возникнуть омикрон)
4. Nature Communications (04.12.20, про частое заражение SARS-СoV-2 домашних кошек и собак).
5. Science (14.08.20, про заражение SARS-СoV-2 и симптомы у кошек и собак).
Поблагодарить за работу: 5536 9138 3126 6560
现已上线!2025 年 Telegram 研究 — 年度关键洞察 
