Белгород был основан дважды: в 993 году князем Владимиром как город Киевской Руси и в 1593 году по указу царя Фёдора Иоанновича как крепость Московского государства.
Об основании крепости Белгород в 1596 году записано в «Разрядной книге 1475–1598 гг.». Она играла роль южного форпоста Русского государства вблизи основных татарских дорог.
Белгородская крепость была расположена на скалистой меловой горе у крутого правого берега Северского Донца. Центральной частью крепости являлся кремль в форме четырёхугольника 230х238 м. Стенами кремля были два параллельно идущих сруба, отстоящих друг от друга на 1,5 м, пространство между которыми заполнялось глиной. Вокруг кремля располагались два пояса оборонительных сооружений, где размещались военные склады, ремесленные мастерские. К реке вёл прорубленный в мелу тайный подземный ход.
Местоположение крепости трижды менялось. В 1650 году было определено окончательное местоположение крепости со слободами на правом берегу реки Донец, где сейчас находится центральная часть города.
Вскоре начинается строительство оборонительных сооружений, получивших впоследствии название Белгородская черта. Центральным военным и административным пунктом Белгородской черты являлся город-крепость Белгород.
В 1658 году формируется Белгородский полк – крупное постоянное военное соединение, включавшее в себя все вооружённые силы на Белгородской черте и подчинявшееся Белгородскому воеводе.
Главным воеводой Белгородского полка был назначен князь, боярин Григорий Григорьевич Ромодановский (?-1682). Воевода являлся полноправным хозяином и главным начальником сторожевой и станичной службы. В военное время он организовывал защиту города от неприятеля и становился во главе войска. Белгородский полк прославился в войне с Польшей, в Азовских походах Петра I (под командованием Саввы Айгустова). Многократно полк получал благодарственное слово от царей Алексея Михайловича и Петра I, а его воины – личные награды золотыми, земельными, денежными пожалованиями.
Петр I побывал в Белгороде во время русско-шведской войны. Молодой шведский король Карл XII намеревался со своей армией направиться по старинному Муравскому шляху через Белгород на Воронеж, а затем, уничтожив там русский флот, двинуться на Москву. Петр, предчувствуя эту опасность, прибыл в Белгород и распорядился поставить заслон из русских войск по Муравскому шляху, чтобы враг не смог пройти к Москве.
Формирование Белгородского полка повлекло за собой образование крупного военно-административного округа – Белгородского разряда, который просуществовал до начала XVIII века.
Памятником пребывания Петра I в Белгороде стал Успенско-Николаевский собор – сегодня это самое старое здание в Белгороде.
Согласно указу Петра I от 18 декабря 1708 г., Россия была разделена на 8 губерний. Белгородский разряд и полк были упразднены, части Белгородского полка стали полками регулярной армии, отпала необходимость содержать на Белгородской черте военную силу. Белгород стал центром уезда, который в 1708 году приписали к Киевской губернии.
1 марта 1727 года по указу императрицы Екатерины I была образована Белгородская губерния. Она занимала территорию современных Белгородской, Курской, Орловской и частично Брянской областей РФ, а также Харьковской области Украины. Первым губернатором Белгородской губернии стал представитель старинного рода князь Юрий Юрьевич Трубецкой (1668–1739 гг.). В должности губернатора он был 3 года и оставил о себе добрую память как умелый и энергичный правитель. Именно при Ю. Ю. Трубецком в 1730 году был утверждён герб города Белгорода. На синем прямоугольном щите, заострённом снизу, изображены «лев, лежащий, жёлтый, а над ним орёл чёрный одноглавый, под ним земля зелёная».
В 1779 году Белгородская губерния была упразднена. Город Белгород стал уездным городом и с окрестностями вошёл в состав Курской губернии. В 1785 году была ликвидирована Белгородская крепость, т. к. город утратил своё былое военное значение.